data_7L89 # _model_server_result.job_id q4Ax3XsyhEWknXsSN1s_dA _model_server_result.datetime_utc '2025-03-01 20:04:24' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7l89 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"BB","auth_seq_id":604}' # _entry.id 7L89 # _exptl.entry_id 7L89 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 7 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 17 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7L89 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7L89 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 TA N N ? 7 UA N N ? 7 VA N N ? 7 WA N N ? 7 XA N N ? 7 YA N N ? 7 ZA N N ? 7 AB N N ? 7 BB N N ? 7 CB N N ? 7 DB N N ? 7 EB N N ? 7 FB N N ? 7 GB N N ? 7 HB N N ? 7 IB N N ? 7 JB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 6 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 5 ? 6 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 5 n I NAG 1 G 1 NAG E 606 NAG 5 n I NAG 2 G 2 NAG E 607 NAG 5 n J NAG 1 I 1 NAG E 609 NAG 5 n J NAG 2 I 2 NAG E 610 NAG 5 n K NAG 1 J 1 NAG E 611 NAG 5 n K NAG 2 J 2 NAG E 648 NAG 6 n L NAG 1 K 1 NAG E 612 NAG 6 n L NAG 2 K 2 NAG E 613 NAG 6 n L BMA 3 K 3 BMA E 614 BMA 6 n L MAN 4 K 4 MAN E 615 MAN 6 n L MAN 5 K 5 MAN E 617 MAN 5 n M NAG 1 M 1 NAG E 618 NAG 5 n M NAG 2 M 2 NAG E 619 NAG 5 n N NAG 1 N 1 NAG E 620 NAG 5 n N NAG 2 N 2 NAG E 621 NAG 5 n O NAG 1 O 1 NAG E 623 NAG 5 n O NAG 2 O 2 NAG E 649 NAG 5 n P NAG 1 P 1 NAG E 624 NAG 5 n P NAG 2 P 2 NAG E 625 NAG 5 n Q NAG 1 Q 1 NAG E 635 NAG 5 n Q NAG 2 Q 2 NAG E 636 NAG 5 n R NAG 1 R 1 NAG E 637 NAG 5 n R NAG 2 R 2 NAG E 638 NAG 5 n S NAG 1 S 1 NAG E 643 NAG 5 n S NAG 2 S 2 NAG E 644 NAG 5 n T NAG 1 T 1 NAG E 645 NAG 5 n T NAG 2 T 2 NAG E 646 NAG 5 n U NAG 1 U 1 NAG F 762 NAG 5 n U NAG 2 U 2 NAG F 764 NAG 5 n V NAG 1 V 1 NAG A 606 NAG 5 n V NAG 2 V 2 NAG A 607 NAG 5 n W NAG 1 W 1 NAG A 609 NAG 5 n W NAG 2 W 2 NAG A 610 NAG 5 n X NAG 1 X 1 NAG A 611 NAG 5 n X NAG 2 X 2 NAG A 648 NAG 6 n Y NAG 1 Y 1 NAG A 612 NAG 6 n Y NAG 2 Y 2 NAG A 613 NAG 6 n Y BMA 3 Y 3 BMA A 614 BMA 6 n Y MAN 4 Y 4 MAN A 615 MAN 6 n Y MAN 5 Y 5 MAN A 617 MAN 5 n Z NAG 1 Z 1 NAG A 618 NAG 5 n Z NAG 2 Z 2 NAG A 619 NAG 5 n AA NAG 1 a 1 NAG A 620 NAG 5 n AA NAG 2 a 2 NAG A 621 NAG 5 n BA NAG 1 b 1 NAG A 624 NAG 5 n BA NAG 2 b 2 NAG A 625 NAG 5 n CA NAG 1 c 1 NAG A 635 NAG 5 n CA NAG 2 c 2 NAG A 636 NAG 5 n DA NAG 1 d 1 NAG A 637 NAG 5 n DA NAG 2 d 2 NAG A 638 NAG 5 n EA NAG 1 e 1 NAG A 643 NAG 5 n EA NAG 2 e 2 NAG A 644 NAG 5 n FA NAG 1 f 1 NAG A 645 NAG 5 n FA NAG 2 f 2 NAG A 646 NAG 5 n GA NAG 1 g 1 NAG C 762 NAG 5 n GA NAG 2 g 2 NAG C 765 NAG 5 n HA NAG 1 h 1 NAG C 763 NAG 5 n HA NAG 2 h 2 NAG C 766 NAG 5 n IA NAG 1 i 1 NAG B 614 NAG 5 n IA NAG 2 i 2 NAG B 615 NAG 5 n JA NAG 1 j 1 NAG B 616 NAG 5 n JA NAG 2 j 2 NAG B 659 NAG 5 n KA NAG 1 k 1 NAG B 617 NAG 5 n KA NAG 2 k 2 NAG B 618 NAG 6 n LA NAG 1 l 1 NAG B 620 NAG 6 n LA NAG 2 l 2 NAG B 621 NAG 6 n LA BMA 3 l 3 BMA B 622 BMA 6 n LA MAN 4 l 4 MAN B 623 MAN 6 n LA MAN 5 l 5 MAN B 625 MAN 5 n MA NAG 1 m 1 NAG B 626 NAG 5 n MA NAG 2 m 2 NAG B 627 NAG 5 n NA NAG 1 n 1 NAG B 628 NAG 5 n NA NAG 2 n 2 NAG B 629 NAG 5 n OA NAG 1 o 1 NAG B 631 NAG 5 n OA NAG 2 o 2 NAG B 657 NAG 5 n PA NAG 1 p 1 NAG B 632 NAG 5 n PA NAG 2 p 2 NAG B 633 NAG 5 n QA NAG 1 q 1 NAG B 643 NAG 5 n QA NAG 2 q 2 NAG B 644 NAG 5 n RA NAG 1 r 1 NAG B 645 NAG 5 n RA NAG 2 r 2 NAG B 646 NAG 5 n SA NAG 1 s 1 NAG B 651 NAG 5 n SA NAG 2 s 2 NAG B 652 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 C SG CYS 51 E CYS 54 1_555 C SG CYS 71 E CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? disulf ? disulf2 C SG CYS 116 E CYS 119 1_555 C SG CYS 202 E CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? disulf ? disulf3 C SG CYS 123 E CYS 126 1_555 C SG CYS 193 E CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf4 C SG CYS 128 E CYS 131 1_555 C SG CYS 146 E CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf5 C SG CYS 215 E CYS 218 1_555 C SG CYS 244 E CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf6 C SG CYS 225 E CYS 228 1_555 C SG CYS 236 E CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf7 C SG CYS 293 E CYS 296 1_555 C SG CYS 327 E CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf8 C SG CYS 374 E CYS 378 1_555 C SG CYS 440 E CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf9 C SG CYS 381 E CYS 385 1_555 C SG CYS 413 E CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf10 C SG CYS 496 E CYS 501 1_555 D SG CYS 87 F CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf11 D SG CYS 80 F CYS 598 1_555 D SG CYS 86 F CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf12 E SG CYS 51 A CYS 54 1_555 E SG CYS 71 A CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf13 E SG CYS 116 A CYS 119 1_555 E SG CYS 202 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? disulf ? disulf14 E SG CYS 123 A CYS 126 1_555 E SG CYS 193 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf15 E SG CYS 128 A CYS 131 1_555 E SG CYS 146 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf16 E SG CYS 215 A CYS 218 1_555 E SG CYS 244 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf17 E SG CYS 225 A CYS 228 1_555 E SG CYS 236 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf18 E SG CYS 293 A CYS 296 1_555 E SG CYS 327 A CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf19 E SG CYS 374 A CYS 378 1_555 E SG CYS 440 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf20 E SG CYS 381 A CYS 385 1_555 E SG CYS 413 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf21 E SG CYS 496 A CYS 501 1_555 F SG CYS 87 C CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf22 F SG CYS 80 C CYS 598 1_555 F SG CYS 86 C CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf23 G SG CYS 51 B CYS 54 1_555 G SG CYS 71 B CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? disulf ? disulf24 G SG CYS 116 B CYS 119 1_555 G SG CYS 202 B CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? disulf ? disulf25 G SG CYS 123 B CYS 126 1_555 G SG CYS 193 B CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf26 G SG CYS 128 B CYS 131 1_555 G SG CYS 146 B CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf27 G SG CYS 215 B CYS 218 1_555 G SG CYS 244 B CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf28 G SG CYS 225 B CYS 228 1_555 G SG CYS 236 B CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf29 G SG CYS 293 B CYS 296 1_555 G SG CYS 327 B CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf30 G SG CYS 374 B CYS 378 1_555 G SG CYS 440 B CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf31 G SG CYS 381 B CYS 385 1_555 G SG CYS 413 B CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf32 G SG CYS 496 B CYS 501 1_555 H SG CYS 87 D CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf33 H SG CYS 80 D CYS 598 1_555 H SG CYS 86 D CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? covale ? covale1 C ND2 ASN 85 E ASN 88 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? covale ? covale2 C ND2 ASN 130 E ASN 133 1_555 TA C1 NAG . E NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale3 C ND2 ASN 134 E ASN 137 1_555 WA C1 NAG . E NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale4 C ND2 ASN 145 E ASN 156 1_555 I C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale5 C ND2 ASN 149 E ASN 160 1_555 UA C1 NAG . E NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale6 C ND2 ASN 194 E ASN 197 1_555 J C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale7 C ND2 ASN 231 E ASN 234 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale8 C ND2 ASN 259 E ASN 262 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale9 C ND2 ASN 273 E ASN 276 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale10 C ND2 ASN 292 E ASN 295 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? covale ? covale11 C ND2 ASN 298 E ASN 301 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale12 C ND2 ASN 328 E ASN 332 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale13 C ND2 ASN 335 E ASN 339 1_555 VA C1 NAG . E NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? covale ? covale14 C ND2 ASN 382 E ASN 386 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale15 C ND2 ASN 388 E ASN 392 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale16 C ND2 ASN 443 E ASN 448 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale17 D ND2 ASN 93 F ASN 611 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? covale ? covale18 D ND2 ASN 119 F ASN 637 1_555 XA C1 NAG . F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale19 E ND2 ASN 85 A ASN 88 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale20 E ND2 ASN 130 A ASN 133 1_555 YA C1 NAG . A NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.531 ? covale ? covale21 E ND2 ASN 134 A ASN 137 1_555 CB C1 NAG . A NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale22 E ND2 ASN 145 A ASN 156 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale ? covale23 E ND2 ASN 149 A ASN 160 1_555 ZA C1 NAG . A NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale24 E ND2 ASN 194 A ASN 197 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? covale ? covale25 E ND2 ASN 231 A ASN 234 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale26 E ND2 ASN 259 A ASN 262 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale27 E ND2 ASN 273 A ASN 276 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale28 E ND2 ASN 292 A ASN 295 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale29 E ND2 ASN 298 A ASN 301 1_555 AB C1 NAG . A NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.53 ? covale ? covale30 E ND2 ASN 328 A ASN 332 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? covale ? covale31 E ND2 ASN 335 A ASN 339 1_555 BB C1 NAG . A NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? covale ? covale32 E ND2 ASN 382 A ASN 386 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? covale ? covale33 E ND2 ASN 388 A ASN 392 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale34 E ND2 ASN 443 A ASN 448 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale35 F ND2 ASN 93 C ASN 611 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale36 F ND2 ASN 100 C ASN 618 1_555 HA C1 NAG . h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale37 F ND2 ASN 119 C ASN 637 1_555 DB C1 NAG . C NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale38 G ND2 ASN 85 B ASN 88 1_555 GB C1 NAG . B NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale39 G ND2 ASN 130 B ASN 133 1_555 EB C1 NAG . B NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.525 ? covale ? covale40 G ND2 ASN 134 B ASN 137 1_555 HB C1 NAG . B NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale41 G ND2 ASN 145 B ASN 156 1_555 IA C1 NAG . i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale42 G ND2 ASN 149 B ASN 160 1_555 JA C1 NAG . j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale43 G ND2 ASN 194 B ASN 197 1_555 KA C1 NAG . k NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale44 G ND2 ASN 231 B ASN 234 1_555 FB C1 NAG . B NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale45 G ND2 ASN 259 B ASN 262 1_555 LA C1 NAG . l NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale46 G ND2 ASN 273 B ASN 276 1_555 MA C1 NAG . m NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale47 G ND2 ASN 292 B ASN 295 1_555 NA C1 NAG . n NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? covale ? covale48 G ND2 ASN 298 B ASN 301 1_555 OA C1 NAG . o NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale49 G ND2 ASN 328 B ASN 332 1_555 PA C1 NAG . p NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale50 G ND2 ASN 382 B ASN 386 1_555 QA C1 NAG . q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale51 G ND2 ASN 388 B ASN 392 1_555 RA C1 NAG . r NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? covale ? covale52 G ND2 ASN 443 B ASN 448 1_555 SA C1 NAG . s NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale53 H ND2 ASN 93 D ASN 611 1_555 IB C1 NAG . D NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale54 H ND2 ASN 119 D ASN 637 1_555 JB C1 NAG . D NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale55 I O4 NAG . G NAG 1 1_555 I C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.5 ? covale ? covale56 J O4 NAG . I NAG 1 1_555 J C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale57 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale58 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale59 L O4 NAG . K NAG 2 1_555 L C1 BMA . K BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale60 L O3 BMA . K BMA 3 1_555 L C1 MAN . K MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale61 L O6 BMA . K BMA 3 1_555 L C1 MAN . K MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.5 ? covale ? covale62 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale ? covale63 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale64 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale65 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale ? covale66 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale67 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale68 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale69 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale70 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? covale ? covale71 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale72 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale73 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale74 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? covale ? covale75 Y O4 NAG . Y NAG 2 1_555 Y C1 BMA . Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale76 Y O3 BMA . Y BMA 3 1_555 Y C1 MAN . Y MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale77 Y O6 BMA . Y BMA 3 1_555 Y C1 MAN . Y MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? covale ? covale78 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale79 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale80 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale81 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale82 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale83 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale84 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale85 GA O4 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 NAG . g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? covale ? covale86 HA O4 NAG . h NAG 1 1_555 HA C1 NAG . h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale87 IA O4 NAG . i NAG 1 1_555 IA C1 NAG . i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? covale ? covale88 JA O4 NAG . j NAG 1 1_555 JA C1 NAG . j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale89 KA O4 NAG . k NAG 1 1_555 KA C1 NAG . k NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale90 LA O4 NAG . l NAG 1 1_555 LA C1 NAG . l NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale91 LA O4 NAG . l NAG 2 1_555 LA C1 BMA . l BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale92 LA O3 BMA . l BMA 3 1_555 LA C1 MAN . l MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale93 LA O6 BMA . l BMA 3 1_555 LA C1 MAN . l MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale94 MA O4 NAG . m NAG 1 1_555 MA C1 NAG . m NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? covale ? covale95 NA O4 NAG . n NAG 1 1_555 NA C1 NAG . n NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale96 OA O4 NAG . o NAG 1 1_555 OA C1 NAG . o NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale97 PA O4 NAG . p NAG 1 1_555 PA C1 NAG . p NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale98 QA O4 NAG . q NAG 1 1_555 QA C1 NAG . q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale99 RA O4 NAG . r NAG 1 1_555 RA C1 NAG . r NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale100 SA O4 NAG . s NAG 1 1_555 SA C1 NAG . s NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7L89 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code TA 7 NAG E 1 601 601 NAG NAG . UA 7 NAG E 1 602 608 NAG NAG . VA 7 NAG E 1 603 634 NAG NAG . WA 7 NAG E 1 604 650 NAG NAG . XA 7 NAG F 1 701 763 NAG NAG . YA 7 NAG A 1 601 601 NAG NAG . ZA 7 NAG A 1 602 608 NAG NAG . AB 7 NAG A 1 603 623 NAG NAG . BB 7 NAG A 1 604 634 NAG NAG . CB 7 NAG A 1 605 650 NAG NAG . DB 7 NAG C 1 701 764 NAG NAG . EB 7 NAG B 1 601 609 NAG NAG . FB 7 NAG B 1 602 619 NAG NAG . GB 7 NAG B 1 603 653 NAG NAG . HB 7 NAG B 1 604 658 NAG NAG . IB 7 NAG D 1 701 762 NAG NAG . JB 7 NAG D 1 702 763 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . BB 7 235.263 157.235 200.321 1 67.63 ? C1 NAG 604 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . BB 7 235.974 156.686 201.645 1 76.72 ? C2 NAG 604 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . BB 7 237.488 157.092 201.597 1 80.65 ? C3 NAG 604 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . BB 7 238.153 156.484 200.313 1 89.53 ? C4 NAG 604 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . BB 7 237.39 157.003 199.043 1 80.7 ? C5 NAG 604 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . BB 7 237.915 156.393 197.737 1 86.54 ? C6 NAG 604 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . BB 7 234.551 156.601 203.689 1 74.89 ? C7 NAG 604 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . BB 7 233.924 157.307 204.854 1 75.15 ? C8 NAG 604 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . BB 7 235.323 157.294 202.837 1 76.29 ? N2 NAG 604 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . BB 7 238.156 156.589 202.771 1 82.82 ? O3 NAG 604 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . BB 7 239.522 156.895 200.254 1 89.71 ? O4 NAG 604 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . BB 7 235.941 156.656 199.145 1 73.01 ? O5 NAG 604 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . BB 7 237.833 154.968 197.709 1 82.99 ? O6 NAG 604 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . BB 7 234.337 155.387 203.536 1 73.53 ? O7 NAG 604 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 12 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 17 _model_server_stats.query_time_ms 276 _model_server_stats.encode_time_ms 15 _model_server_stats.element_count 14 #