data_7L8U # _model_server_result.job_id fzUcNVFSChXBPCL627Hyjw _model_server_result.datetime_utc '2025-03-01 20:30:20' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7l8u # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"JB","auth_seq_id":610}' # _entry.id 7L8U # _exptl.entry_id 7L8U _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 9 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 47 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7L8U _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7L8U _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 9 U N N ? 9 V N N ? 9 W N N ? 9 X N N ? 9 Y N N ? 9 Z N N ? 9 AA N N ? 9 BA N N ? 9 CA N N ? 9 DA N N ? 9 EA N N ? 9 FA N N ? 9 GA N N ? 9 HA N N ? 9 IA N N ? 9 JA N N ? 9 KA N N ? 9 LA N N ? 9 MA N N ? 9 NA N N ? 9 OA N N ? 9 PA N N ? 9 QA N N ? 9 RA N N ? 9 SA N N ? 9 TA N N ? 9 UA N N ? 9 VA N N ? 9 WA N N ? 9 XA N N ? 9 YA N N ? 9 ZA N N ? 9 AB N N ? 9 BB N N ? 9 CB N N ? 9 DB N N ? 9 EB N N ? 9 FB N N ? 9 GB N N ? 9 HB N N ? 9 IB N N ? 9 JB N N ? 9 KB N N ? 9 LB N N ? 9 MB N N ? 9 NB N N ? 9 OB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 6 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 5 ? 6 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 6 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 7 ? 7 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 8 ? 7 4 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 9 ? 7 5 4 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 10 ? 7 6 4 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 11 ? 7 7 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 12 ? 8 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 13 ? 8 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 14 ? 8 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 15 ? 8 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 5 n I NAG 1 G 1 NAG C 512 NAG 5 n I NAG 2 G 2 NAG C 513 NAG 5 n J NAG 1 I 1 NAG C 518 NAG 5 n J NAG 2 I 2 NAG C 519 NAG 5 n K NAG 1 J 1 NAG C 525 NAG 5 n K NAG 2 J 2 NAG C 526 NAG 5 n L NAG 1 K 1 NAG A 512 NAG 5 n L NAG 2 K 2 NAG A 513 NAG 6 n M NAG 1 M 1 NAG A 518 NAG 6 n M NAG 2 M 2 NAG A 519 NAG 6 n M BMA 3 M 3 BMA A 520 BMA 6 n M MAN 4 M 4 MAN A 521 MAN 6 n M MAN 5 M 5 MAN A 522 MAN 5 n N NAG 1 N 1 NAG A 525 NAG 5 n N NAG 2 N 2 NAG A 526 NAG 5 n O NAG 1 O 1 NAG B 668 NAG 5 n O NAG 2 O 2 NAG B 678 NAG 7 n P NAG 1 P 1 NAG B 671 NAG 7 n P NAG 2 P 2 NAG B 672 NAG 7 n P BMA 3 P 3 BMA B 673 BMA 7 n P MAN 4 P 4 MAN B 681 MAN 7 n P MAN 5 P 5 MAN B 683 MAN 7 n P MAN 6 P 6 MAN B 682 MAN 7 n P MAN 7 P 7 MAN B 680 MAN 5 n Q NAG 1 Q 1 NAG E 504 NAG 5 n Q NAG 2 Q 2 NAG E 505 NAG 5 n R NAG 1 R 1 NAG E 512 NAG 5 n R NAG 2 R 2 NAG E 513 NAG 8 n S NAG 1 S 1 NAG E 518 NAG 8 n S NAG 2 S 2 NAG E 519 NAG 8 n S BMA 3 S 3 BMA E 520 BMA 8 n S MAN 4 S 4 MAN E 521 MAN 8 n S MAN 5 S 5 MAN E 523 MAN 5 n T NAG 1 T 1 NAG E 525 NAG 5 n T NAG 2 T 2 NAG E 526 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 56 C CYS 54 1_555 A SG CYS 75 C CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.131 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 76 C CYS 74 1_555 B SG CYS 42 D CYS 561 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 121 C CYS 119 1_555 A SG CYS 207 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 128 C CYS 126 1_555 A SG CYS 198 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 133 C CYS 131 1_555 A SG CYS 151 C CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 230 C CYS 228 1_555 A SG CYS 241 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 298 C CYS 296 1_555 A SG CYS 332 C CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 379 C CYS 378 1_555 A SG CYS 445 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 386 C CYS 385 1_555 A SG CYS 418 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 501 C CYS 501 1_555 B SG CYS 86 D CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 79 D CYS 598 1_555 B SG CYS 85 D CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf12 C SG CYS 56 A CYS 54 1_555 C SG CYS 75 A CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf13 C SG CYS 76 A CYS 74 1_555 D SG CYS 42 B CYS 561 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? disulf ? disulf14 C SG CYS 121 A CYS 119 1_555 C SG CYS 207 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf15 C SG CYS 128 A CYS 126 1_555 C SG CYS 198 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf16 C SG CYS 133 A CYS 131 1_555 C SG CYS 151 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf17 C SG CYS 220 A CYS 218 1_555 C SG CYS 249 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf18 C SG CYS 230 A CYS 228 1_555 C SG CYS 241 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? disulf ? disulf19 C SG CYS 298 A CYS 296 1_555 C SG CYS 332 A CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf20 C SG CYS 379 A CYS 378 1_555 C SG CYS 445 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf21 C SG CYS 386 A CYS 385 1_555 C SG CYS 418 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf22 C SG CYS 501 A CYS 501 1_555 D SG CYS 86 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf23 D SG CYS 79 B CYS 598 1_555 D SG CYS 85 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf24 E SG CYS 56 E CYS 54 1_555 E SG CYS 75 E CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf25 E SG CYS 121 E CYS 119 1_555 E SG CYS 207 E CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf26 E SG CYS 128 E CYS 126 1_555 E SG CYS 198 E CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf27 E SG CYS 133 E CYS 131 1_555 E SG CYS 151 E CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf28 E SG CYS 220 E CYS 218 1_555 E SG CYS 249 E CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf29 E SG CYS 230 E CYS 228 1_555 E SG CYS 241 E CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.148 ? disulf ? disulf30 E SG CYS 298 E CYS 296 1_555 E SG CYS 332 E CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf31 E SG CYS 379 E CYS 378 1_555 E SG CYS 445 E CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf32 E SG CYS 386 E CYS 385 1_555 E SG CYS 418 E CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf33 F SG CYS 79 F CYS 598 1_555 F SG CYS 85 F CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 90 C ASN 88 1_555 U C1 NAG . C NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 135 C ASN 133 1_555 GA C1 NAG . C NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 150 C ASN 156 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 154 C ASN 160 1_555 EA C1 NAG . C NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 199 C ASN 197 1_555 FA C1 NAG . C NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.53 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 236 C ASN 234 1_555 V C1 NAG . C NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 243 C ASN 241 1_555 W C1 NAG . C NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 264 C ASN 262 1_555 J C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 278 C ASN 276 1_555 X C1 NAG . C NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 291 C ASN 289 1_555 IA C1 NAG . C NAG 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 297 C ASN 295 1_555 BA C1 NAG . C NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 303 C ASN 301 1_555 DA C1 NAG . C NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.531 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 333 C ASN 332 1_555 AA C1 NAG . C NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 340 C ASN 339 1_555 Z C1 NAG . C NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 356 C ASN 355 1_555 HA C1 NAG . C NAG 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 387 C ASN 386 1_555 I C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale17 A ND2 ASN 393 C ASN 392 1_555 Y C1 NAG . C NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale18 A ND2 ASN 448 C ASN 448 1_555 CA C1 NAG . C NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale19 C ND2 ASN 90 A ASN 88 1_555 JA C1 NAG . A NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale20 C ND2 ASN 135 A ASN 133 1_555 VA C1 NAG . A NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale21 C ND2 ASN 150 A ASN 156 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale22 C ND2 ASN 154 A ASN 160 1_555 TA C1 NAG . A NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale23 C ND2 ASN 199 A ASN 197 1_555 UA C1 NAG . A NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.53 ? covale ? covale24 C ND2 ASN 236 A ASN 234 1_555 KA C1 NAG . A NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale25 C ND2 ASN 243 A ASN 241 1_555 LA C1 NAG . A NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale26 C ND2 ASN 264 A ASN 262 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale27 C ND2 ASN 278 A ASN 276 1_555 MA C1 NAG . A NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale28 C ND2 ASN 291 A ASN 289 1_555 XA C1 NAG . A NAG 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale29 C ND2 ASN 297 A ASN 295 1_555 QA C1 NAG . A NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.53 ? covale ? covale30 C ND2 ASN 303 A ASN 301 1_555 SA C1 NAG . A NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.537 ? covale ? covale31 C ND2 ASN 333 A ASN 332 1_555 PA C1 NAG . A NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale32 C ND2 ASN 340 A ASN 339 1_555 OA C1 NAG . A NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 356 A ASN 355 1_555 WA C1 NAG . A NAG 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 387 A ASN 386 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 393 A ASN 392 1_555 NA C1 NAG . A NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 448 A ASN 448 1_555 RA C1 NAG . A NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? covale ? covale37 D ND2 ASN 92 B ASN 611 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale38 D ND2 ASN 99 B ASN 618 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale39 D ND2 ASN 106 B ASN 625 1_555 ZA C1 NAG . B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale40 D ND2 ASN 118 B ASN 637 1_555 YA C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale41 E ND2 ASN 90 E ASN 88 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale42 E ND2 ASN 135 E ASN 133 1_555 KB C1 NAG . E NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale43 E ND2 ASN 150 E ASN 156 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale44 E ND2 ASN 154 E ASN 160 1_555 IB C1 NAG . E NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale45 E ND2 ASN 199 E ASN 197 1_555 JB C1 NAG . E NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.533 ? covale ? covale46 E ND2 ASN 236 E ASN 234 1_555 AB C1 NAG . E NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.5 ? covale ? covale47 E ND2 ASN 243 E ASN 241 1_555 BB C1 NAG . E NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale48 E ND2 ASN 264 E ASN 262 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale49 E ND2 ASN 278 E ASN 276 1_555 CB C1 NAG . E NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? covale ? covale50 E ND2 ASN 291 E ASN 289 1_555 LB C1 NAG . E NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale51 E ND2 ASN 297 E ASN 295 1_555 FB C1 NAG . E NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.534 ? covale ? covale52 E ND2 ASN 303 E ASN 301 1_555 HB C1 NAG . E NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.536 ? covale ? covale53 E ND2 ASN 333 E ASN 332 1_555 EB C1 NAG . E NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale54 E ND2 ASN 387 E ASN 386 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.529 ? covale ? covale55 E ND2 ASN 393 E ASN 392 1_555 DB C1 NAG . E NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale56 E ND2 ASN 448 E ASN 448 1_555 GB C1 NAG . E NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale57 F ND2 ASN 92 F ASN 611 1_555 OB C1 NAG . F NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale58 F ND2 ASN 99 F ASN 618 1_555 MB C1 NAG . F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale59 F ND2 ASN 118 F ASN 637 1_555 NB C1 NAG . F NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.531 ? covale ? covale60 I O4 NAG . G NAG 1 1_555 I C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale61 J O4 NAG . I NAG 1 1_555 J C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale62 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale63 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? covale ? covale64 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale65 M O4 NAG . M NAG 2 1_555 M C1 BMA . M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? covale ? covale66 M O3 BMA . M BMA 3 1_555 M C1 MAN . M MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? covale ? covale67 M O2 MAN . M MAN 4 1_555 M C1 MAN . M MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale68 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.5 ? covale ? covale69 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale70 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale71 P O4 NAG . P NAG 2 1_555 P C1 BMA . P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? covale ? covale72 P O6 BMA . P BMA 3 1_555 P C1 MAN . P MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.479 ? covale ? covale73 P O3 BMA . P BMA 3 1_555 P C1 MAN . P MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale74 P O3 MAN . P MAN 4 1_555 P C1 MAN . P MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale75 P O6 MAN . P MAN 4 1_555 P C1 MAN . P MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale76 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale77 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? covale ? covale78 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale79 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale80 S O3 BMA . S BMA 3 1_555 S C1 MAN . S MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale81 S O6 BMA . S BMA 3 1_555 S C1 MAN . S MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.49 ? covale ? covale82 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7L8U _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code U 9 NAG C 1 601 504 NAG NAG . V 9 NAG C 1 602 506 NAG NAG . W 9 NAG C 1 603 507 NAG NAG . X 9 NAG C 1 604 509 NAG NAG . Y 9 NAG C 1 605 511 NAG NAG . Z 9 NAG C 1 606 514 NAG NAG . AA 9 NAG C 1 607 515 NAG NAG . BA 9 NAG C 1 608 516 NAG NAG . CA 9 NAG C 1 609 517 NAG NAG . DA 9 NAG C 1 610 524 NAG NAG . EA 9 NAG C 1 611 527 NAG NAG . FA 9 NAG C 1 612 528 NAG NAG . GA 9 NAG C 1 613 529 NAG NAG . HA 9 NAG C 1 614 530 NAG NAG . IA 9 NAG C 1 615 531 NAG NAG . JA 9 NAG A 1 601 504 NAG NAG . KA 9 NAG A 1 602 506 NAG NAG . LA 9 NAG A 1 603 507 NAG NAG . MA 9 NAG A 1 604 509 NAG NAG . NA 9 NAG A 1 605 511 NAG NAG . OA 9 NAG A 1 606 514 NAG NAG . PA 9 NAG A 1 607 515 NAG NAG . QA 9 NAG A 1 608 516 NAG NAG . RA 9 NAG A 1 609 517 NAG NAG . SA 9 NAG A 1 610 524 NAG NAG . TA 9 NAG A 1 611 527 NAG NAG . UA 9 NAG A 1 612 528 NAG NAG . VA 9 NAG A 1 613 529 NAG NAG . WA 9 NAG A 1 614 530 NAG NAG . XA 9 NAG A 1 615 531 NAG NAG . YA 9 NAG B 1 701 669 NAG NAG . ZA 9 NAG B 1 702 679 NAG NAG . AB 9 NAG E 1 601 506 NAG NAG . BB 9 NAG E 1 602 507 NAG NAG . CB 9 NAG E 1 603 509 NAG NAG . DB 9 NAG E 1 604 511 NAG NAG . EB 9 NAG E 1 605 515 NAG NAG . FB 9 NAG E 1 606 516 NAG NAG . GB 9 NAG E 1 607 517 NAG NAG . HB 9 NAG E 1 608 524 NAG NAG . IB 9 NAG E 1 609 527 NAG NAG . JB 9 NAG E 1 610 528 NAG NAG . KB 9 NAG E 1 611 529 NAG NAG . LB 9 NAG E 1 612 531 NAG NAG . MB 9 NAG F 1 701 668 NAG NAG . NB 9 NAG F 1 702 669 NAG NAG . OB 9 NAG F 1 703 671 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . JB 9 173.883 204.586 218.921 1 115.49 ? C1 NAG 610 E 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . JB 9 172.496 204.526 218.137 1 115.46 ? C2 NAG 610 E 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . JB 9 172.141 205.96 217.614 1 115.11 ? C3 NAG 610 E 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . JB 9 172.045 206.952 218.82 1 116.14 ? C4 NAG 610 E 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . JB 9 173.418 206.957 219.583 1 120.04 ? C5 NAG 610 E 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . JB 9 173.398 207.829 220.842 1 121.93 ? C6 NAG 610 E 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . JB 9 172.215 202.299 217.066 1 116.96 ? C7 NAG 610 E 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . JB 9 172.327 201.39 215.878 1 117.91 ? C8 NAG 610 E 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . JB 9 172.596 203.587 216.983 1 113.88 ? N2 NAG 610 E 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . JB 9 170.873 205.923 216.931 1 115.06 ? O3 NAG 610 E 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . JB 9 171.742 208.262 218.331 1 118.34 ? O4 NAG 610 E 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . JB 9 173.749 205.566 220.025 1 118.43 ? O5 NAG 610 E 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . JB 9 173.341 209.223 220.546 1 118.3 ? O6 NAG 610 E 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . JB 9 171.755 201.849 218.127 1 113.24 ? O7 NAG 610 E 1 # _model_server_stats.io_time_ms 13 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 40 _model_server_stats.query_time_ms 304 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 14 #