data_7LEZ # _model_server_result.job_id 1DktLvZSvlIZNUjLVUa6iw _model_server_result.datetime_utc '2024-10-25 20:36:23' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7lez # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"W","auth_seq_id":1001}' # _entry.id 7LEZ # _exptl.entry_id 7LEZ _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 54.938 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MANGANESE (II) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 12 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7LEZ _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7LEZ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetradecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 14 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 O N N ? 4 P N N ? 4 Q N N ? 4 R N N ? 4 S N N ? 4 T N N ? 4 U N N ? 4 V N N ? 4 W N N ? 4 X N N ? 4 Y N N ? 4 Z N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 22 D CYS 22 1_555 A SG CYS 96 D CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 152 D CYS 152 1_555 A SG CYS 207 D CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf3 B SG CYS 23 E CYS 23 1_555 B SG CYS 88 E CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 134 E CYS 134 1_555 B SG CYS 194 E CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf5 C SG CYS 23 I CYS 23 1_555 C SG CYS 88 I CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf6 C SG CYS 134 I CYS 134 1_555 C SG CYS 194 I CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf7 G SG CYS 23 P CYS 23 1_555 G SG CYS 88 P CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf8 G SG CYS 134 P CYS 134 1_555 G SG CYS 194 P CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf9 H SG CYS 23 O CYS 23 1_555 H SG CYS 88 O CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf10 H SG CYS 134 O CYS 134 1_555 H SG CYS 194 O CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf11 L SG CYS 22 G CYS 22 1_555 L SG CYS 96 G CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf12 L SG CYS 152 G CYS 152 1_555 L SG CYS 207 G CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf13 M SG CYS 22 R CYS 22 1_555 M SG CYS 96 R CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf14 M SG CYS 152 R CYS 152 1_555 M SG CYS 207 R CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf15 N SG CYS 22 Q CYS 22 1_555 N SG CYS 96 Q CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf16 N SG CYS 152 Q CYS 152 1_555 N SG CYS 207 Q CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? metalc ? metalc1 D NE2 HIS 101 A HIS 101 1_555 O MN MN . A MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.659 ? metalc ? metalc2 D OD2 ASP 124 A ASP 124 1_555 O MN MN . A MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? metalc ? metalc3 D OD1 ASP 124 A ASP 124 1_555 P MN MN . A MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.905 ? metalc ? metalc4 D ND1 HIS 126 A HIS 126 1_555 P MN MN . A MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.558 ? metalc ? metalc5 D OD2 ASP 128 A ASP 128 1_555 O MN MN . A MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.104 ? metalc ? metalc6 D OD2 ASP 232 A ASP 232 1_555 P MN MN . A MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc7 D OD1 ASP 234 A ASP 234 1_555 P MN MN . A MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? metalc ? metalc8 D OD2 ASP 234 A ASP 234 1_555 P MN MN . A MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.614 ? metalc ? metalc9 E OD2 ASP 124 B ASP 124 1_555 Q MN MN . B MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc10 E OD1 ASP 124 B ASP 124 1_555 R MN MN . B MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.212 ? metalc ? metalc11 E ND1 HIS 126 B HIS 126 1_555 R MN MN . B MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? metalc ? metalc12 E OD2 ASP 128 B ASP 128 1_555 Q MN MN . B MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.893 ? metalc ? metalc13 E OD2 ASP 232 B ASP 232 1_555 R MN MN . B MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.723 ? metalc ? metalc14 E OD1 ASP 234 B ASP 234 1_555 R MN MN . B MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.62 ? metalc ? metalc15 E OD2 ASP 234 B ASP 234 1_555 R MN MN . B MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? metalc ? metalc16 F OD2 ASP 124 C ASP 124 1_555 S MN MN . C MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? metalc ? metalc17 F OD1 ASP 124 C ASP 124 1_555 T MN MN . C MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? metalc ? metalc18 F ND1 HIS 126 C HIS 126 1_555 T MN MN . C MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? metalc ? metalc19 F OD2 ASP 128 C ASP 128 1_555 S MN MN . C MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? metalc ? metalc20 F OD2 ASP 232 C ASP 232 1_555 S MN MN . C MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.703 ? metalc ? metalc21 F OD2 ASP 232 C ASP 232 1_555 T MN MN . C MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.642 ? metalc ? metalc22 F OD1 ASP 234 C ASP 234 1_555 T MN MN . C MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? metalc ? metalc23 F OD2 ASP 234 C ASP 234 1_555 T MN MN . C MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? metalc ? metalc24 I NE2 HIS 101 M HIS 101 1_555 U MN MN . M MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.659 ? metalc ? metalc25 I OD2 ASP 124 M ASP 124 1_555 U MN MN . M MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? metalc ? metalc26 I OD1 ASP 124 M ASP 124 1_555 V MN MN . M MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.905 ? metalc ? metalc27 I ND1 HIS 126 M HIS 126 1_555 V MN MN . M MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.559 ? metalc ? metalc28 I OD2 ASP 128 M ASP 128 1_555 U MN MN . M MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? metalc ? metalc29 I OD2 ASP 232 M ASP 232 1_555 V MN MN . M MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc30 I OD1 ASP 234 M ASP 234 1_555 V MN MN . M MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? metalc ? metalc31 I OD2 ASP 234 M ASP 234 1_555 V MN MN . M MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.614 ? metalc ? metalc32 J ND1 HIS 126 N HIS 126 1_555 X MN MN . N MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.793 ? metalc ? metalc33 J OD2 ASP 128 N ASP 128 1_555 W MN MN . N MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.477 ? metalc ? metalc34 J OD2 ASP 232 N ASP 232 1_555 X MN MN . N MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.471 ? metalc ? metalc35 J OD1 ASP 234 N ASP 234 1_555 X MN MN . N MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? metalc ? metalc36 J OD2 ASP 234 N ASP 234 1_555 X MN MN . N MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.854 ? metalc ? metalc37 K ND1 HIS 101 J HIS 101 1_555 Y MN MN . J MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.628 ? metalc ? metalc38 K ND1 HIS 126 J HIS 126 1_555 Z MN MN . J MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.731 ? metalc ? metalc39 K OD2 ASP 128 J ASP 128 1_555 Y MN MN . J MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? metalc ? metalc40 K OD2 ASP 234 J ASP 234 1_555 Z MN MN . J MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? metalc ? metalc41 K OG1 THR 246 J THR 246 1_555 Z MN MN . J MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.725 ? # _chem_comp.formula 'Mn 2' _chem_comp.formula_weight 54.938 _chem_comp.id MN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MANGANESE (II) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7LEZ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code O 4 MN A 1 1001 1001 MN MN . P 4 MN A 1 1002 1002 MN MN . Q 4 MN B 1 1001 1001 MN MN . R 4 MN B 1 1002 1002 MN MN . S 4 MN C 1 1001 1001 MN MN . T 4 MN C 1 1002 1002 MN MN . U 4 MN M 1 1001 1001 MN MN . V 4 MN M 1 1002 1002 MN MN . W 4 MN N 1 1001 1001 MN MN . X 4 MN N 1 1002 1002 MN MN . Y 4 MN J 1 1001 1001 MN MN . Z 4 MN J 1 1002 1002 MN MN . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MN _atom_site.label_atom_id MN _atom_site.label_comp_id MN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id W _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 219.095 _atom_site.Cartn_y 214.27 _atom_site.Cartn_z 208.507 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 12.24 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MN _atom_site.auth_comp_id MN _atom_site.auth_seq_id 1001 _atom_site.auth_asym_id N _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 21 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 52 _model_server_stats.query_time_ms 318 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 1 #