data_7LGJ
#
_model_server_result.job_id            ZRmXNRo3_UgWcQDOx8tarA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-25 15:56:15' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7lgj 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"Z","auth_seq_id":903}' 
#
_entry.id    7LGJ 
#
_exptl.entry_id    7LGJ 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    12 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    octameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      8 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 I N N 
? 3 J N N 
? 3 K N N 
? 3 N N N 
? 3 O N N 
? 3 P N N 
? 3 S N N 
? 3 T N N 
? 3 U N N 
? 3 X N N 
? 3 Y N N 
? 3 Z N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 E C 7ID 5 E 7ID 5 1_555 E N 7ID 6 E 7ID 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? 
covale ? covale2 E C 7ID 6 E 7ID 6 1_555 E N 7ID 7 E 7ID 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.479 ? 
covale ? covale3 E C 7ID 7 E 7ID 7 1_555 E N 7ID 8 E 7ID 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? 
covale ? covale4 E C 7ID 8 E 7ID 8 1_555 E N NH2 9 E NH2 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? 
covale ? covale5 F C 7ID 5 F 7ID 5 1_555 F N 7ID 6 F 7ID 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? 
covale ? covale6 F C 7ID 6 F 7ID 6 1_555 F N 7ID 7 F 7ID 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.479 ? 
covale ? covale7 F C 7ID 7 F 7ID 7 1_555 F N 7ID 8 F 7ID 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? 
covale ? covale8 F C 7ID 8 F 7ID 8 1_555 F N NH2 9 F NH2 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? 
covale ? covale9 G C 7ID 5 G 7ID 5 1_555 G N 7ID 6 G 7ID 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? 
covale ? covale10 G C 7ID 6 G 7ID 6 1_555 G N 7ID 7 G 7ID 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.479 ? 
covale ? covale11 G C 7ID 7 G 7ID 7 1_555 G N 7ID 8 G 7ID 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? 
covale ? covale12 G C 7ID 8 G 7ID 8 1_555 G N NH2 9 G NH2 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? 
covale ? covale13 H C 7ID 5 H 7ID 5 1_555 H N 7ID 6 H 7ID 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? 
covale ? covale14 H C 7ID 6 H 7ID 6 1_555 H N 7ID 7 H 7ID 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.479 ? 
covale ? covale15 H C 7ID 7 H 7ID 7 1_555 H N 7ID 8 H 7ID 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? 
covale ? covale16 H C 7ID 8 H 7ID 8 1_555 H N NH2 9 H NH2 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? 
metalc ? metalc1 A OD2 ASP 431 A ASP 431 1_555 K MG MG . A MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLU 450 A GLU 450 1_555 K MG MG . A MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.796 ? 
metalc ? metalc3 A OG1 THR 500 A THR 500 1_555 J MG MG . A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? 
metalc ? metalc4 A OG1 THR 522 A THR 522 1_555 J MG MG . A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.807 ? 
metalc ? metalc5 A OE1 GLU 558 A GLU 558 1_555 J MG MG . A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? 
metalc ? metalc6 I MG MG . A MG 901 1_555 L O2G ACP . A ACP 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? 
metalc ? metalc7 J MG MG . A MG 902 1_555 L O1B ACP . A ACP 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? 
metalc ? metalc8 J MG MG . A MG 902 1_555 L O1G ACP . A ACP 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? 
metalc ? metalc9 B OD2 ASP 431 B ASP 431 1_555 P MG MG . B MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? 
metalc ? metalc10 B OE1 GLU 450 B GLU 450 1_555 P MG MG . B MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.797 ? 
metalc ? metalc11 B OG1 THR 500 B THR 500 1_555 O MG MG . B MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? 
metalc ? metalc12 B OG1 THR 522 B THR 522 1_555 O MG MG . B MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.807 ? 
metalc ? metalc13 B OE1 GLU 558 B GLU 558 1_555 O MG MG . B MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? 
metalc ? metalc14 N MG MG . B MG 901 1_555 Q O2G ACP . B ACP 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? 
metalc ? metalc15 O MG MG . B MG 902 1_555 Q O1B ACP . B ACP 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? 
metalc ? metalc16 O MG MG . B MG 902 1_555 Q O1G ACP . B ACP 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? 
metalc ? metalc17 C OD2 ASP 431 C ASP 431 1_555 U MG MG . C MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? 
metalc ? metalc18 C OE1 GLU 450 C GLU 450 1_555 U MG MG . C MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.796 ? 
metalc ? metalc19 C OG1 THR 500 C THR 500 1_555 T MG MG . C MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? 
metalc ? metalc20 C OG1 THR 522 C THR 522 1_555 T MG MG . C MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.808 ? 
metalc ? metalc21 C OE1 GLU 558 C GLU 558 1_555 T MG MG . C MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.431 ? 
metalc ? metalc22 S MG MG . C MG 901 1_555 V O2G ACP . C ACP 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? 
metalc ? metalc23 T MG MG . C MG 902 1_555 V O1G ACP . C ACP 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? 
metalc ? metalc24 T MG MG . C MG 902 1_555 V O1B ACP . C ACP 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? 
metalc ? metalc25 D OD2 ASP 431 D ASP 431 1_555 Z MG MG . D MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? 
metalc ? metalc26 D OE1 GLU 450 D GLU 450 1_555 Z MG MG . D MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.797 ? 
metalc ? metalc27 D OG1 THR 500 D THR 500 1_555 Y MG MG . D MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? 
metalc ? metalc28 D OG1 THR 522 D THR 522 1_555 Y MG MG . D MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.808 ? 
metalc ? metalc29 D OE1 GLU 558 D GLU 558 1_555 Y MG MG . D MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? 
metalc ? metalc30 X MG MG . D MG 901 1_555 AA O2G ACP . D ACP 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? 
metalc ? metalc31 Y MG MG . D MG 902 1_555 AA O1G ACP . D ACP 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? 
metalc ? metalc32 Y MG MG . D MG 902 1_555 AA O1B ACP . D ACP 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     7LGJ 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
I 3 MG A 1 901 901 MG MG . 
J 3 MG A 1 902 902 MG MG . 
K 3 MG A 1 903 903 MG MG . 
L 4 ACP A 1 904 904 ACP ACP . 
M 4 ACP A 1 905 905 ACP ACP . 
N 3 MG B 1 901 901 MG MG . 
O 3 MG B 1 902 902 MG MG . 
P 3 MG B 1 903 903 MG MG . 
Q 4 ACP B 1 904 904 ACP ACP . 
R 4 ACP B 1 905 905 ACP ACP . 
S 3 MG C 1 901 901 MG MG . 
T 3 MG C 1 902 902 MG MG . 
U 3 MG C 1 903 903 MG MG . 
V 4 ACP C 1 904 904 ACP ACP . 
W 4 ACP C 1 905 905 ACP ACP . 
X 3 MG D 1 901 901 MG MG . 
Y 3 MG D 1 902 902 MG MG . 
Z 3 MG D 1 903 903 MG MG . 
AA 4 ACP D 1 904 904 ACP ACP . 
BA 4 ACP D 1 905 905 ACP ACP . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MG 
_atom_site.label_atom_id         MG 
_atom_site.label_comp_id         MG 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         Z 
_atom_site.label_entity_id       3 
_atom_site.Cartn_x               132.535 
_atom_site.Cartn_y               189.932 
_atom_site.Cartn_z               165.694 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        30 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MG 
_atom_site.auth_comp_id          MG 
_atom_site.auth_seq_id           903 
_atom_site.auth_asym_id          D 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              17 
_model_server_stats.parse_time_ms           9 
_model_server_stats.create_model_time_ms    46 
_model_server_stats.query_time_ms           305 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           1 
#