data_7LRT # _model_server_result.job_id fg1wmIu-Xon7yw0dOv1dHA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 08:38:36' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7lrt # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"JA","auth_seq_id":1305}' # _entry.id 7LRT # _exptl.entry_id 7LRT _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 7 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 27 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7LRT _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7LRT _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 FA N N ? 7 GA N N ? 7 HA N N ? 7 IA N N ? 7 JA N N ? 7 KA N N ? 7 LA N N ? 7 MA N N ? 7 NA N N ? 7 OA N N ? 7 PA N N ? 7 QA N N ? 7 RA N N ? 7 SA N N ? 7 TA N N ? 7 UA N N ? 7 VA N N ? 7 WA N N ? 7 XA N N ? 7 YA N N ? 7 ZA N N ? 7 AB N N ? 7 BB N N ? 7 CB N N ? 7 DB N N ? 7 EB N N ? 7 FB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 4 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 6 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 7 ? 6 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n J NAG 1 I 1 NAG F 214 NAG 4 n J NAG 2 I 2 NAG F 215 NAG 4 n J BMA 3 I 3 BMA F 216 BMA 4 n K NAG 1 J 1 NAG H 214 NAG 4 n K NAG 2 J 2 NAG H 215 NAG 4 n K BMA 3 J 3 BMA H 216 BMA 4 n L NAG 1 K 1 NAG D 214 NAG 4 n L NAG 2 K 2 NAG D 215 NAG 4 n L BMA 3 K 3 BMA D 216 BMA 5 n M NAG 1 M 1 NAG A 2529 NAG 5 n M NAG 2 M 2 NAG A 2553 NAG 5 n N NAG 1 N 1 NAG A 2530 NAG 5 n N NAG 2 N 2 NAG A 2544 NAG 5 n O NAG 1 O 1 NAG A 2531 NAG 5 n O NAG 2 O 2 NAG A 2549 NAG 5 n P NAG 1 P 1 NAG A 2532 NAG 5 n P NAG 2 P 2 NAG A 2533 NAG 5 n Q NAG 1 Q 1 NAG A 2538 NAG 5 n Q NAG 2 Q 2 NAG A 2548 NAG 5 n R NAG 1 R 1 NAG A 2546 NAG 5 n R NAG 2 R 2 NAG A 2547 NAG 6 n S NAG 1 S 1 NAG A 2555 NAG 6 n S NAG 2 S 2 NAG A 2556 NAG 6 n S BMA 3 S 3 BMA A 2557 BMA 6 n S MAN 4 S 4 MAN A 2558 MAN 6 n S MAN 5 S 5 MAN A 2559 MAN 5 n T NAG 1 T 1 NAG B 2530 NAG 5 n T NAG 2 T 2 NAG B 2544 NAG 5 n U NAG 1 U 1 NAG B 2531 NAG 5 n U NAG 2 U 2 NAG B 2547 NAG 5 n V NAG 1 V 1 NAG B 2532 NAG 5 n V NAG 2 V 2 NAG B 2533 NAG 5 n W NAG 1 W 1 NAG B 2537 NAG 5 n W NAG 2 W 2 NAG B 2546 NAG 5 n X NAG 1 X 1 NAG B 2549 NAG 5 n X NAG 2 X 2 NAG B 2550 NAG 6 n Y NAG 1 Y 1 NAG B 2555 NAG 6 n Y NAG 2 Y 2 NAG B 2556 NAG 6 n Y BMA 3 Y 3 BMA B 2557 BMA 6 n Y MAN 4 Y 4 MAN B 2558 MAN 6 n Y MAN 5 Y 5 MAN B 2559 MAN 4 n Z NAG 1 Z 1 NAG C 2529 NAG 4 n Z NAG 2 Z 2 NAG C 2547 NAG 4 n Z BMA 3 Z 3 BMA C 2548 BMA 5 n AA NAG 1 a 1 NAG C 2530 NAG 5 n AA NAG 2 a 2 NAG C 2550 NAG 5 n BA NAG 1 b 1 NAG C 2531 NAG 5 n BA NAG 2 b 2 NAG C 2551 NAG 5 n CA NAG 1 c 1 NAG C 2532 NAG 5 n CA NAG 2 c 2 NAG C 2533 NAG 5 n DA NAG 1 d 1 NAG C 2537 NAG 5 n DA NAG 2 d 2 NAG C 2552 NAG 6 n EA NAG 1 e 1 NAG C 2555 NAG 6 n EA NAG 2 e 2 NAG C 2556 NAG 6 n EA BMA 3 e 3 BMA C 2557 BMA 6 n EA MAN 4 e 4 MAN C 2558 MAN 6 n EA MAN 5 e 5 MAN C 2559 MAN # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 22 F CYS 22 1_555 A SG CYS 96 F CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 101 F CYS 97 1_555 A SG CYS 106 F CYS 100 1_555 ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf3 B SG CYS 23 G CYS 23 1_555 B SG CYS 89 G CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf4 C SG CYS 22 H CYS 22 1_555 C SG CYS 96 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf5 C SG CYS 101 H CYS 97 1_555 C SG CYS 106 H CYS 100 1_555 ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf6 D SG CYS 23 L CYS 23 1_555 D SG CYS 89 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf7 E SG CYS 22 D CYS 22 1_555 E SG CYS 96 D CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf8 E SG CYS 101 D CYS 97 1_555 E SG CYS 106 D CYS 100 1_555 ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf9 E SG CYS 150 D CYS 140 1_555 E SG CYS 206 D CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf10 F SG CYS 23 E CYS 23 1_555 F SG CYS 89 E CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf11 F SG CYS 135 E CYS 134 1_555 F SG CYS 195 E CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf12 G SG CYS 2 A CYS 15 1_555 G SG CYS 123 A CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf13 G SG CYS 118 A CYS 131 1_555 G SG CYS 153 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf14 G SG CYS 278 A CYS 291 1_555 G SG CYS 288 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf15 G SG CYS 323 A CYS 336 1_555 G SG CYS 348 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf16 G SG CYS 366 A CYS 379 1_555 G SG CYS 419 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf17 G SG CYS 378 A CYS 391 1_555 G SG CYS 512 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf18 G SG CYS 467 A CYS 480 1_555 G SG CYS 475 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf19 G SG CYS 525 A CYS 538 1_555 G SG CYS 577 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf20 G SG CYS 604 A CYS 617 1_555 G SG CYS 636 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf21 G SG CYS 649 A CYS 662 1_555 G SG CYS 658 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf22 G SG CYS 725 A CYS 738 1_555 G SG CYS 747 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf23 G SG CYS 730 A CYS 743 1_555 G SG CYS 736 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf24 G SG CYS 1019 A CYS 1032 1_555 G SG CYS 1030 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf25 G SG CYS 1069 A CYS 1082 1_555 G SG CYS 1113 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf26 H SG CYS 2 B CYS 15 1_555 H SG CYS 123 B CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf27 H SG CYS 118 B CYS 131 1_555 H SG CYS 153 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf28 H SG CYS 278 B CYS 291 1_555 H SG CYS 288 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf29 H SG CYS 323 B CYS 336 1_555 H SG CYS 348 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf30 H SG CYS 366 B CYS 379 1_555 H SG CYS 419 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf31 H SG CYS 378 B CYS 391 1_555 H SG CYS 512 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf32 H SG CYS 467 B CYS 480 1_555 H SG CYS 475 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf33 H SG CYS 525 B CYS 538 1_555 H SG CYS 577 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf34 H SG CYS 604 B CYS 617 1_555 H SG CYS 636 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf35 H SG CYS 649 B CYS 662 1_555 H SG CYS 658 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf36 H SG CYS 725 B CYS 738 1_555 H SG CYS 747 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf37 H SG CYS 730 B CYS 743 1_555 H SG CYS 736 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf38 H SG CYS 1019 B CYS 1032 1_555 H SG CYS 1030 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf39 H SG CYS 1069 B CYS 1082 1_555 H SG CYS 1113 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf40 I SG CYS 2 C CYS 15 1_555 I SG CYS 123 C CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf41 I SG CYS 118 C CYS 131 1_555 I SG CYS 153 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf42 I SG CYS 278 C CYS 291 1_555 I SG CYS 288 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf43 I SG CYS 323 C CYS 336 1_555 I SG CYS 348 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf44 I SG CYS 366 C CYS 379 1_555 I SG CYS 419 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf45 I SG CYS 378 C CYS 391 1_555 I SG CYS 512 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf46 I SG CYS 467 C CYS 480 1_555 I SG CYS 475 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf47 I SG CYS 525 C CYS 538 1_555 I SG CYS 577 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf48 I SG CYS 604 C CYS 617 1_555 I SG CYS 636 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf49 I SG CYS 649 C CYS 662 1_555 I SG CYS 658 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf50 I SG CYS 725 C CYS 738 1_555 I SG CYS 747 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf51 I SG CYS 730 C CYS 743 1_555 I SG CYS 736 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf52 I SG CYS 1019 C CYS 1032 1_555 I SG CYS 1030 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf53 I SG CYS 1069 C CYS 1082 1_555 I SG CYS 1113 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 100 F ASN 96 1_555 J C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale2 C ND2 ASN 100 H ASN 96 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale3 E ND2 ASN 100 D ASN 96 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale4 G ND2 ASN 4 A ASN 17 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale5 G ND2 ASN 48 A ASN 61 1_555 KA C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale6 G ND2 ASN 136 A ASN 149 1_555 OA C1 NAG . A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale7 G ND2 ASN 152 A ASN 165 1_555 MA C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale8 G ND2 ASN 221 A ASN 234 1_555 LA C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale9 G ND2 ASN 269 A ASN 282 1_555 FA C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale10 G ND2 ASN 318 A ASN 331 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale11 G ND2 ASN 330 A ASN 343 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale12 G ND2 ASN 590 A ASN 603 1_555 NA C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale13 G ND2 ASN 603 A ASN 616 1_555 HA C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale14 G ND2 ASN 644 A ASN 657 1_555 GA C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale15 G ND2 ASN 696 A ASN 709 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale16 G ND2 ASN 704 A ASN 717 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale17 G ND2 ASN 788 A ASN 801 1_555 IA C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale18 G ND2 ASN 1061 A ASN 1074 1_555 JA C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale19 G ND2 ASN 1085 A ASN 1098 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale20 G ND2 ASN 1121 A ASN 1134 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale21 H ND2 ASN 4 B ASN 17 1_555 VA C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale22 H ND2 ASN 269 B ASN 282 1_555 PA C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale23 H ND2 ASN 318 B ASN 331 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale24 H ND2 ASN 330 B ASN 343 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale25 H ND2 ASN 590 B ASN 603 1_555 UA C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale26 H ND2 ASN 603 B ASN 616 1_555 RA C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale27 H ND2 ASN 644 B ASN 657 1_555 QA C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale28 H ND2 ASN 696 B ASN 709 1_555 SA C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale29 H ND2 ASN 704 B ASN 717 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale30 H ND2 ASN 788 B ASN 801 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale31 H ND2 ASN 1061 B ASN 1074 1_555 TA C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale32 H ND2 ASN 1085 B ASN 1098 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale33 H ND2 ASN 1121 B ASN 1134 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale34 I ND2 ASN 4 C ASN 17 1_555 FB C1 NAG . C NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale35 I ND2 ASN 48 C ASN 61 1_555 BB C1 NAG . C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale36 I ND2 ASN 152 C ASN 165 1_555 EB C1 NAG . C NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale37 I ND2 ASN 221 C ASN 234 1_555 CB C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale38 I ND2 ASN 269 C ASN 282 1_555 WA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale39 I ND2 ASN 318 C ASN 331 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale40 I ND2 ASN 330 C ASN 343 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale41 I ND2 ASN 590 C ASN 603 1_555 DB C1 NAG . C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale42 I ND2 ASN 603 C ASN 616 1_555 YA C1 NAG . C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale43 I ND2 ASN 644 C ASN 657 1_555 XA C1 NAG . C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale44 I ND2 ASN 696 C ASN 709 1_555 ZA C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale45 I ND2 ASN 704 C ASN 717 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale46 I ND2 ASN 788 C ASN 801 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale47 I ND2 ASN 1061 C ASN 1074 1_555 AB C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale48 I ND2 ASN 1085 C ASN 1098 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale49 I ND2 ASN 1121 C ASN 1134 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale50 J O4 NAG . I NAG 1 1_555 J C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale51 J O4 NAG . I NAG 2 1_555 J C1 BMA . I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale52 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale53 K O4 NAG . J NAG 2 1_555 K C1 BMA . J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale54 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale55 L O4 NAG . K NAG 2 1_555 L C1 BMA . K BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale56 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale57 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale58 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale59 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale60 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale61 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale62 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale63 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale64 S O3 BMA . S BMA 3 1_555 S C1 MAN . S MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale65 S O6 BMA . S BMA 3 1_555 S C1 MAN . S MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale66 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale67 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale68 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale69 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale70 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale71 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale72 Y O4 NAG . Y NAG 2 1_555 Y C1 BMA . Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale73 Y O3 BMA . Y BMA 3 1_555 Y C1 MAN . Y MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale74 Y O6 BMA . Y BMA 3 1_555 Y C1 MAN . Y MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale75 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale76 Z O4 NAG . Z NAG 2 1_555 Z C1 BMA . Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale77 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale78 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale79 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale80 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale81 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale82 EA O4 NAG . e NAG 2 1_555 EA C1 BMA . e BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale83 EA O3 BMA . e BMA 3 1_555 EA C1 MAN . e MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale84 EA O6 BMA . e BMA 3 1_555 EA C1 MAN . e MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7LRT _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code FA 7 NAG A 1 1301 2534 NAG NAG . GA 7 NAG A 1 1302 2535 NAG NAG . HA 7 NAG A 1 1303 2536 NAG NAG . IA 7 NAG A 1 1304 2537 NAG NAG . JA 7 NAG A 1 1305 2539 NAG NAG . KA 7 NAG A 1 1306 2540 NAG NAG . LA 7 NAG A 1 1307 2541 NAG NAG . MA 7 NAG A 1 1308 2543 NAG NAG . NA 7 NAG A 1 1309 2551 NAG NAG . OA 7 NAG A 1 1310 2552 NAG NAG . PA 7 NAG B 1 1301 2534 NAG NAG . QA 7 NAG B 1 1302 2535 NAG NAG . RA 7 NAG B 1 1303 2536 NAG NAG . SA 7 NAG B 1 1304 2538 NAG NAG . TA 7 NAG B 1 1305 2539 NAG NAG . UA 7 NAG B 1 1306 2542 NAG NAG . VA 7 NAG B 1 1307 2551 NAG NAG . WA 7 NAG C 1 1301 2534 NAG NAG . XA 7 NAG C 1 1302 2535 NAG NAG . YA 7 NAG C 1 1303 2536 NAG NAG . ZA 7 NAG C 1 1304 2538 NAG NAG . AB 7 NAG C 1 1305 2539 NAG NAG . BB 7 NAG C 1 1306 2540 NAG NAG . CB 7 NAG C 1 1307 2541 NAG NAG . DB 7 NAG C 1 1308 2542 NAG NAG . EB 7 NAG C 1 1309 2543 NAG NAG . FB 7 NAG C 1 1310 2549 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . JA 7 229.892 249.43 293.263 1 104.29 ? C1 NAG 1305 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . JA 7 230.551 249.514 294.642 1 104.29 ? C2 NAG 1305 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . JA 7 231.025 250.939 294.913 1 104.29 ? C3 NAG 1305 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . JA 7 231.929 251.42 293.787 1 104.29 ? C4 NAG 1305 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . JA 7 231.219 251.275 292.446 1 104.29 ? C5 NAG 1305 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . JA 7 232.102 251.623 291.27 1 104.29 ? C6 NAG 1305 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . JA 7 230.051 248.693 296.902 1 104.29 ? C7 NAG 1305 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . JA 7 228.976 248.27 297.857 1 104.29 ? C8 NAG 1305 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . JA 7 229.641 249.072 295.686 1 104.29 ? N2 NAG 1305 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . JA 7 231.728 250.985 296.149 1 104.29 ? O3 NAG 1305 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . JA 7 232.276 252.785 293.99 1 104.29 ? O4 NAG 1305 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . JA 7 230.803 249.914 292.261 1 104.29 ? O5 NAG 1305 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . JA 7 231.628 251.03 290.069 1 104.29 ? O6 NAG 1305 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . JA 7 231.236 248.694 297.217 1 104.29 ? O7 NAG 1305 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 27 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 49 _model_server_stats.query_time_ms 302 _model_server_stats.encode_time_ms 8 _model_server_stats.element_count 14 #