data_7LY2 # _model_server_result.job_id aQTGdQI46isT3P5T6fj2Mw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 08:35:38' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7ly2 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"CB","auth_seq_id":1301}' # _entry.id 7LY2 # _exptl.entry_id 7LY2 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 8 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 45 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 15 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 Y N N ? 8 Z N N ? 8 AA N N ? 8 BA N N ? 8 CA N N ? 8 DA N N ? 8 EA N N ? 8 FA N N ? 8 GA N N ? 8 HA N N ? 8 IA N N ? 8 JA N N ? 8 KA N N ? 8 LA N N ? 8 MA N N ? 8 NA N N ? 8 OA N N ? 8 PA N N ? 8 QA N N ? 8 RA N N ? 8 SA N N ? 8 TA N N ? 8 UA N N ? 8 VA N N ? 8 WA N N ? 8 XA N N ? 8 YA N N ? 8 ZA N N ? 8 AB N N ? 8 BB N N ? 8 CB N N ? 8 DB N N ? 8 EB N N ? 8 FB N N ? 8 GB N N ? 8 HB N N ? 8 IB N N ? 8 JB N N ? 8 KB N N ? 8 LB N N ? 8 MB N N ? 8 NB N N ? 8 OB N N ? 8 PB N N ? 8 QB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 6 4 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing 4 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 6 n P NAG 1 P 1 NAG A 5343 NAG 6 n P NAG 2 P 2 NAG A 5344 NAG 6 n P BMA 3 P 3 BMA A 5345 BMA 6 n P FUC 4 P 4 FUC A 5342 FUC 7 n Q NAG 1 Q 1 NAG A 5717 NAG 7 n Q NAG 2 Q 2 NAG A 5718 NAG 7 n R NAG 1 R 1 NAG A 5801 NAG 7 n R NAG 2 R 2 NAG A 5802 NAG 6 n S NAG 1 S 1 NAG B 5343 NAG 6 n S NAG 2 S 2 NAG B 5344 NAG 6 n S BMA 3 S 3 BMA B 5345 BMA 6 n S FUC 4 S 4 FUC B 5342 FUC 7 n T NAG 1 T 1 NAG B 5717 NAG 7 n T NAG 2 T 2 NAG B 5718 NAG 7 n U NAG 1 U 1 NAG B 5801 NAG 7 n U NAG 2 U 2 NAG B 5802 NAG 6 n V NAG 1 V 1 NAG J 5343 NAG 6 n V NAG 2 V 2 NAG J 5344 NAG 6 n V BMA 3 V 3 BMA J 5345 BMA 6 n V FUC 4 V 4 FUC J 5342 FUC 7 n W NAG 1 W 1 NAG J 5717 NAG 7 n W NAG 2 W 2 NAG J 5718 NAG 7 n X NAG 1 X 1 NAG J 5801 NAG 7 n X NAG 2 X 2 NAG J 5802 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 15 A CYS 15 1_555 A SG CYS 136 A CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 131 A CYS 131 1_555 A SG CYS 166 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 291 A CYS 291 1_555 A SG CYS 301 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 336 A CYS 336 1_555 A SG CYS 361 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 379 A CYS 379 1_555 A SG CYS 432 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 391 A CYS 391 1_555 A SG CYS 525 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 480 A CYS 480 1_555 A SG CYS 488 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 538 A CYS 538 1_555 A SG CYS 590 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 617 A CYS 617 1_555 A SG CYS 649 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 662 A CYS 662 1_555 A SG CYS 671 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 738 A CYS 738 1_555 A SG CYS 760 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 743 A CYS 743 1_555 A SG CYS 749 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.106 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 1032 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1043 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.013 ? disulf ? disulf14 A SG CYS 1082 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1126 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 22 D CYS 23 1_555 B SG CYS 88 D CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? disulf ? disulf16 C SG CYS 21 E CYS 22 1_555 C SG CYS 95 E CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf17 D SG CYS 21 H CYS 22 1_555 D SG CYS 95 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf18 E SG CYS 21 L CYS 22 1_555 E SG CYS 86 L CYS 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf19 F SG CYS 15 B CYS 15 1_555 F SG CYS 136 B CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf20 F SG CYS 131 B CYS 131 1_555 F SG CYS 166 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf21 F SG CYS 291 B CYS 291 1_555 F SG CYS 301 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf22 F SG CYS 336 B CYS 336 1_555 F SG CYS 361 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf23 F SG CYS 379 B CYS 379 1_555 F SG CYS 432 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? disulf ? disulf24 F SG CYS 391 B CYS 391 1_555 F SG CYS 525 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf25 F SG CYS 480 B CYS 480 1_555 F SG CYS 488 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf26 F SG CYS 538 B CYS 538 1_555 F SG CYS 590 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? disulf ? disulf27 F SG CYS 617 B CYS 617 1_555 F SG CYS 649 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf28 F SG CYS 662 B CYS 662 1_555 F SG CYS 671 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf29 F SG CYS 738 B CYS 738 1_555 F SG CYS 760 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? disulf ? disulf30 F SG CYS 743 B CYS 743 1_555 F SG CYS 749 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? disulf ? disulf31 F SG CYS 1032 B CYS 1032 1_555 F SG CYS 1043 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.013 ? disulf ? disulf32 F SG CYS 1082 B CYS 1082 1_555 F SG CYS 1126 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf33 G SG CYS 22 C CYS 23 1_555 G SG CYS 88 C CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? disulf ? disulf34 H SG CYS 21 F CYS 22 1_555 H SG CYS 95 F CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf35 I SG CYS 21 G CYS 22 1_555 I SG CYS 95 G CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf36 J SG CYS 21 I CYS 22 1_555 J SG CYS 86 I CYS 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf37 K SG CYS 15 J CYS 15 1_555 K SG CYS 136 J CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf38 K SG CYS 131 J CYS 131 1_555 K SG CYS 166 J CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf39 K SG CYS 291 J CYS 291 1_555 K SG CYS 301 J CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf40 K SG CYS 336 J CYS 336 1_555 K SG CYS 361 J CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf41 K SG CYS 379 J CYS 379 1_555 K SG CYS 432 J CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? disulf ? disulf42 K SG CYS 391 J CYS 391 1_555 K SG CYS 525 J CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? disulf ? disulf43 K SG CYS 480 J CYS 480 1_555 K SG CYS 488 J CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf44 K SG CYS 538 J CYS 538 1_555 K SG CYS 590 J CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? disulf ? disulf45 K SG CYS 617 J CYS 617 1_555 K SG CYS 649 J CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf46 K SG CYS 662 J CYS 662 1_555 K SG CYS 671 J CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf47 K SG CYS 738 J CYS 738 1_555 K SG CYS 760 J CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? disulf ? disulf48 K SG CYS 743 J CYS 743 1_555 K SG CYS 749 J CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? disulf ? disulf49 K SG CYS 1032 J CYS 1032 1_555 K SG CYS 1043 J CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.013 ? disulf ? disulf50 K SG CYS 1082 J CYS 1082 1_555 K SG CYS 1126 J CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf51 L SG CYS 22 K CYS 23 1_555 L SG CYS 88 K CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? disulf ? disulf52 M SG CYS 21 M CYS 22 1_555 M SG CYS 95 M CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf53 N SG CYS 21 N CYS 22 1_555 N SG CYS 95 N CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf54 O SG CYS 21 O CYS 22 1_555 O SG CYS 86 O CYS 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 17 A ASN 17 1_555 Y C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 61 A ASN 61 1_555 LA C1 NAG . A NAG 1314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 122 A ASN 122 1_555 Z C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.489 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 149 A ASN 149 1_555 CA C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 165 A ASN 165 1_555 AA C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.5 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 234 A ASN 234 1_555 MA C1 NAG . A NAG 1315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 282 A ASN 282 1_555 BA C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 331 A ASN 331 1_555 DA C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 343 A ASN 343 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 603 A ASN 603 1_555 EA C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 616 A ASN 616 1_555 FA C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 657 A ASN 657 1_555 GA C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 709 A ASN 709 1_555 HA C1 NAG . A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 717 A ASN 717 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.489 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 801 A ASN 801 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.489 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 1074 A ASN 1074 1_555 IA C1 NAG . A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? covale ? covale17 A ND2 ASN 1098 A ASN 1098 1_555 JA C1 NAG . A NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale18 A ND2 ASN 1134 A ASN 1134 1_555 KA C1 NAG . A NAG 1313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale19 F ND2 ASN 17 B ASN 17 1_555 NA C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale20 F ND2 ASN 61 B ASN 61 1_555 AB C1 NAG . B NAG 1314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale21 F ND2 ASN 122 B ASN 122 1_555 OA C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.49 ? covale ? covale22 F ND2 ASN 149 B ASN 149 1_555 RA C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale ? covale23 F ND2 ASN 165 B ASN 165 1_555 PA C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.5 ? covale ? covale24 F ND2 ASN 234 B ASN 234 1_555 BB C1 NAG . B NAG 1315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale25 F ND2 ASN 282 B ASN 282 1_555 QA C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale26 F ND2 ASN 331 B ASN 331 1_555 SA C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? covale ? covale27 F ND2 ASN 343 B ASN 343 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale28 F ND2 ASN 603 B ASN 603 1_555 TA C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale29 F ND2 ASN 616 B ASN 616 1_555 UA C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale30 F ND2 ASN 657 B ASN 657 1_555 VA C1 NAG . B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale31 F ND2 ASN 709 B ASN 709 1_555 WA C1 NAG . B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale32 F ND2 ASN 717 B ASN 717 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.488 ? covale ? covale33 F ND2 ASN 801 B ASN 801 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.489 ? covale ? covale34 F ND2 ASN 1074 B ASN 1074 1_555 XA C1 NAG . B NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? covale ? covale35 F ND2 ASN 1098 B ASN 1098 1_555 YA C1 NAG . B NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale36 F ND2 ASN 1134 B ASN 1134 1_555 ZA C1 NAG . B NAG 1313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale37 K ND2 ASN 17 J ASN 17 1_555 CB C1 NAG . J NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale38 K ND2 ASN 61 J ASN 61 1_555 PB C1 NAG . J NAG 1314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale39 K ND2 ASN 122 J ASN 122 1_555 DB C1 NAG . J NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.49 ? covale ? covale40 K ND2 ASN 149 J ASN 149 1_555 GB C1 NAG . J NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale ? covale41 K ND2 ASN 165 J ASN 165 1_555 EB C1 NAG . J NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.5 ? covale ? covale42 K ND2 ASN 234 J ASN 234 1_555 QB C1 NAG . J NAG 1315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale43 K ND2 ASN 282 J ASN 282 1_555 FB C1 NAG . J NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale44 K ND2 ASN 331 J ASN 331 1_555 HB C1 NAG . J NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? covale ? covale45 K ND2 ASN 343 J ASN 343 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale46 K ND2 ASN 603 J ASN 603 1_555 IB C1 NAG . J NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale47 K ND2 ASN 616 J ASN 616 1_555 JB C1 NAG . J NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale48 K ND2 ASN 657 J ASN 657 1_555 KB C1 NAG . J NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale49 K ND2 ASN 709 J ASN 709 1_555 LB C1 NAG . J NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale50 K ND2 ASN 717 J ASN 717 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.488 ? covale ? covale51 K ND2 ASN 801 J ASN 801 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.489 ? covale ? covale52 K ND2 ASN 1074 J ASN 1074 1_555 MB C1 NAG . J NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? covale ? covale53 K ND2 ASN 1098 J ASN 1098 1_555 NB C1 NAG . J NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale54 K ND2 ASN 1134 J ASN 1134 1_555 OB C1 NAG . J NAG 1313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale ? covale55 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale56 P O6 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 FUC . P FUC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.485 ? covale ? covale57 P O4 NAG . P NAG 2 1_555 P C1 BMA . P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale58 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale59 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale60 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale61 S O6 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 FUC . S FUC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.485 ? covale ? covale62 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale63 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale64 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale65 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? covale ? covale66 V O6 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 FUC . V FUC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.485 ? covale ? covale67 V O4 NAG . V NAG 2 1_555 V C1 BMA . V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale68 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale69 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 282 n n C1 O1 NAG sing 283 n n C1 O5 NAG sing 284 n n C1 H1 NAG sing 285 n n C2 C3 NAG sing 286 n n C2 N2 NAG sing 287 n n C2 H2 NAG sing 288 n n C3 C4 NAG sing 289 n n C3 O3 NAG sing 290 n n C3 H3 NAG sing 291 n n C4 C5 NAG sing 292 n n C4 O4 NAG sing 293 n n C4 H4 NAG sing 294 n n C5 C6 NAG sing 295 n n C5 O5 NAG sing 296 n n C5 H5 NAG sing 297 n n C6 O6 NAG sing 298 n n C6 H61 NAG sing 299 n n C6 H62 NAG sing 300 n n C7 C8 NAG sing 301 n n C7 N2 NAG sing 302 n n C7 O7 NAG doub 303 n n C8 H81 NAG sing 304 n n C8 H82 NAG sing 305 n n C8 H83 NAG sing 306 n n N2 HN2 NAG sing 307 n n O1 HO1 NAG sing 308 n n O3 HO3 NAG sing 309 n n O4 HO4 NAG sing 310 n n O6 HO6 NAG sing 311 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7LY2 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Y 8 NAG A 1 1301 1314 NAG NAG . Z 8 NAG A 1 1302 1414 NAG NAG . AA 8 NAG A 1 1303 1614 NAG NAG . BA 8 NAG A 1 1304 1725 NAG NAG . CA 8 NAG A 1 1305 1902 NAG NAG . DA 8 NAG A 1 1306 5331 NAG NAG . EA 8 NAG A 1 1307 5603 NAG NAG . FA 8 NAG A 1 1308 5616 NAG NAG . GA 8 NAG A 1 1309 5657 NAG NAG . HA 8 NAG A 1 1310 5709 NAG NAG . IA 8 NAG A 1 1311 6074 NAG NAG . JA 8 NAG A 1 1312 6098 NAG NAG . KA 8 NAG A 1 1313 6134 NAG NAG . LA 8 NAG A 1 1314 6201 NAG NAG . MA 8 NAG A 1 1315 6301 NAG NAG . NA 8 NAG B 1 1301 1314 NAG NAG . OA 8 NAG B 1 1302 1414 NAG NAG . PA 8 NAG B 1 1303 1614 NAG NAG . QA 8 NAG B 1 1304 1725 NAG NAG . RA 8 NAG B 1 1305 1902 NAG NAG . SA 8 NAG B 1 1306 5331 NAG NAG . TA 8 NAG B 1 1307 5603 NAG NAG . UA 8 NAG B 1 1308 5616 NAG NAG . VA 8 NAG B 1 1309 5657 NAG NAG . WA 8 NAG B 1 1310 5709 NAG NAG . XA 8 NAG B 1 1311 6074 NAG NAG . YA 8 NAG B 1 1312 6098 NAG NAG . ZA 8 NAG B 1 1313 6134 NAG NAG . AB 8 NAG B 1 1314 6201 NAG NAG . BB 8 NAG B 1 1315 6301 NAG NAG . CB 8 NAG J 1 1301 1314 NAG NAG . DB 8 NAG J 1 1302 1414 NAG NAG . EB 8 NAG J 1 1303 1614 NAG NAG . FB 8 NAG J 1 1304 1725 NAG NAG . GB 8 NAG J 1 1305 1902 NAG NAG . HB 8 NAG J 1 1306 5331 NAG NAG . IB 8 NAG J 1 1307 5603 NAG NAG . JB 8 NAG J 1 1308 5616 NAG NAG . KB 8 NAG J 1 1309 5657 NAG NAG . LB 8 NAG J 1 1310 5709 NAG NAG . MB 8 NAG J 1 1311 6074 NAG NAG . NB 8 NAG J 1 1312 6098 NAG NAG . OB 8 NAG J 1 1313 6134 NAG NAG . PB 8 NAG J 1 1314 6201 NAG NAG . QB 8 NAG J 1 1315 6301 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . CB 8 199.948 148.053 196.189 1 36.12 ? C1 NAG 1301 J 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . CB 8 200.359 147.053 195.057 1 36.04 ? C2 NAG 1301 J 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . CB 8 200.271 147.789 193.704 1 36.15 ? C3 NAG 1301 J 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . CB 8 198.829 148.295 193.505 1 35.51 ? C4 NAG 1301 J 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . CB 8 198.474 149.242 194.668 1 35.99 ? C5 NAG 1301 J 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . CB 8 197.051 149.756 194.561 1 35.77 ? C6 NAG 1301 J 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . CB 8 202.095 145.365 195.052 1 36.15 ? C7 NAG 1301 J 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . CB 8 203.499 144.908 195.308 1 36.26 ? C8 NAG 1301 J 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . CB 8 201.737 146.617 195.304 1 35.97 ? N2 NAG 1301 J 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . CB 8 200.624 146.894 192.641 1 36.92 ? O3 NAG 1301 J 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . CB 8 198.733 148.983 192.263 1 36.46 ? O4 NAG 1301 J 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . CB 8 198.61 148.534 195.941 1 36.34 ? O5 NAG 1301 J 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . CB 8 196.104 148.696 194.562 1 36.22 ? O6 NAG 1301 J 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . CB 8 201.27 144.561 194.603 1 35.84 ? O7 NAG 1301 J 1 # _model_server_stats.io_time_ms 76 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 54 _model_server_stats.query_time_ms 327 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 14 #