data_7M75 # _model_server_result.job_id VQQXwxuqMm5t3wrC8D8H6w _model_server_result.datetime_utc '2024-11-05 08:05:18' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7m75 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"TB","auth_seq_id":3004}' # _entry.id 7M75 # _exptl.entry_id 7M75 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 893.489 _entity.id 14 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CHLOROPHYLL A' _entity.pdbx_number_of_molecules 95 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 7M75 _cell.length_a 285.429 _cell.length_b 285.429 _cell.length_c 166.543 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7M75 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 173 _symmetry.space_group_name_Hall 'P 6c' _symmetry.space_group_name_H-M 'P 63' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? dodecameric 12 author_defined_assembly 1 PISA 30-meric 30 software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF 1 1 A,B,C,D,F,G,H,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,WE,XE,YE,ZE,AF 2 1,2,3 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_565 -y,x-y+1,z -0.5 -0.866025 0 0.866025 -0.5 0 0 0 1 -142.7145 247.188765 0 3 'crystal symmetry operation' 3_455 -x+y-1,-x,z -0.5 0.866025 0 -0.866025 -0.5 0 0 0 1 -285.429 0 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 14 N N N ? 14 O N N ? 14 P N N ? 14 Q N N ? 14 R N N ? 14 S N N ? 14 T N N ? 14 U N N ? 14 V N N ? 14 W N N ? 14 X N N ? 14 Y N N ? 14 Z N N ? 14 AA N N ? 14 BA N N ? 14 CA N N ? 14 DA N N ? 14 EA N N ? 14 FA N N ? 14 GA N N ? 14 HA N N ? 14 IA N N ? 14 JA N N ? 14 KA N N ? 14 LA N N ? 14 MA N N ? 14 NA N N ? 14 OA N N ? 14 PA N N ? 14 QA N N ? 14 RA N N ? 14 SA N N ? 14 TA N N ? 14 UA N N ? 14 VA N N ? 14 WA N N ? 14 XA N N ? 14 YA N N ? 14 ZA N N ? 14 AB N N ? 14 BB N N ? 14 CB N N ? 14 DB N N ? 14 EB N N ? 14 PB N N ? 14 SB N N ? 14 TB N N ? 14 UB N N ? 14 VB N N ? 14 WB N N ? 14 XB N N ? 14 YB N N ? 14 ZB N N ? 14 AC N N ? 14 BC N N ? 14 CC N N ? 14 DC N N ? 14 EC N N ? 14 FC N N ? 14 GC N N ? 14 HC N N ? 14 IC N N ? 14 JC N N ? 14 KC N N ? 14 LC N N ? 14 MC N N ? 14 NC N N ? 14 OC N N ? 14 PC N N ? 14 QC N N ? 14 RC N N ? 14 SC N N ? 14 TC N N ? 14 UC N N ? 14 VC N N ? 14 WC N N ? 14 XC N N ? 14 YC N N ? 14 ZC N N ? 14 AD N N ? 14 BD N N ? 14 CD N N ? 14 DD N N ? 14 ED N N ? 14 RD N N ? 14 TD N N ? 14 YD N N ? 14 ZD N N ? 14 DE N N ? 14 FE N N ? 14 IE N N ? 14 JE N N ? 14 KE N N ? 14 OE N N ? 14 QE N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 F SG CYS 31 F CYS 8 1_555 F SG CYS 66 F CYS 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? metalc ? metalc1 A OE1 GLN 115 A GLN 115 1_555 U MG CLA . A CLA 809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? metalc ? metalc2 A OE1 GLN 123 A GLN 123 1_555 V MG CLA . A CLA 810 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.937 ? metalc ? metalc3 A O THR 501 A THR 501 1_555 WA MG CLA . A CLA 837 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 578 A CYS 578 1_555 QB FE3 SF4 . B SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? metalc ? metalc5 A SG CYS 587 A CYS 587 1_555 QB FE2 SF4 . B SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.25 ? metalc ? metalc6 N MG CLA . A CLA 802 1_555 RE O HOH . A HOH 920 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? metalc ? metalc7 Q O1A CLA . A CLA 805 1_555 X MG CLA . A CLA 812 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.586 ? metalc ? metalc8 CA MG CLA . A CLA 817 1_555 RE O HOH . A HOH 917 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? metalc ? metalc9 HA MG CLA . A CLA 822 1_555 RE O HOH . A HOH 923 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? metalc ? metalc10 LA MG CLA . A CLA 826 1_555 RE O HOH . A HOH 913 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.876 ? metalc ? metalc11 MA MG CLA . A CLA 827 1_555 RE O HOH . A HOH 927 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.562 ? metalc ? metalc12 BB MG CLA . A CLA 842 1_555 RE O HOH . A HOH 925 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? metalc ? metalc13 DB MG CLA . A CLA 844 1_555 RE O HOH . A HOH 918 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.171 ? metalc ? metalc14 EB MG CLA . A CLA 845 1_555 NB O5 LHG . A LHG 854 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.438 ? metalc ? metalc15 PB MG CLA . A CLA 856 1_555 SE O HOH . B HOH 3111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? metalc ? metalc16 RE O HOH . A HOH 915 1_555 HE CA CA . L CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.559 ? metalc ? metalc17 B OD2 ASP 92 B ASP 92 1_555 ZB MG CLA . B CLA 3010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? metalc ? metalc18 B OE1 GLN 94 B GLN 94 1_555 AC MG CLA . B CLA 3011 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc19 B OD2 ASP 133 B ASP 133 1_555 RB CA CA . B CA 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.624 ? metalc ? metalc20 B OE2 GLU 200 B GLU 200 1_555 RB CA CA . B CA 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? metalc ? metalc21 B OH TYR 329 B TYR 329 1_555 OC MG CLA . B CLA 3025 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? metalc ? metalc22 B SG CYS 565 B CYS 565 1_555 QB FE4 SF4 . B SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? metalc ? metalc23 B SG CYS 574 B CYS 574 1_555 QB FE1 SF4 . B SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? metalc ? metalc24 RB CA CA . B CA 3002 1_555 SE O HOH . B HOH 3137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.608 ? metalc ? metalc25 JC MG CLA . B CLA 3020 1_555 SE O HOH . B HOH 3130 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.445 ? metalc ? metalc26 MC MG CLA . B CLA 3023 1_555 SE O HOH . B HOH 3128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.235 ? metalc ? metalc27 PC MG CLA . B CLA 3026 1_555 SE O HOH . B HOH 3121 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.01 ? metalc ? metalc28 ZC MG CLA . B CLA 3036 1_555 SE O HOH . B HOH 3119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? metalc ? metalc29 AD MG CLA . B CLA 3037 1_555 SE O HOH . B HOH 3112 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? metalc ? metalc30 C SG CYS 10 C CYS 10 1_555 PD FE4 SF4 . C SF4 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.281 ? metalc ? metalc31 C SG CYS 13 C CYS 13 1_555 PD FE3 SF4 . C SF4 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? metalc ? metalc32 C SG CYS 16 C CYS 16 1_555 PD FE2 SF4 . C SF4 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? metalc ? metalc33 C SG CYS 20 C CYS 20 1_555 OD FE2 SF4 . C SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? metalc ? metalc34 C SG CYS 47 C CYS 47 1_555 OD FE4 SF4 . C SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? metalc ? metalc35 C SG CYS 50 C CYS 50 1_555 OD FE1 SF4 . C SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? metalc ? metalc36 C SG CYS 53 C CYS 53 1_555 OD FE3 SF4 . C SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc37 C SG CYS 57 C CYS 57 1_555 PD FE1 SF4 . 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TE 23 HOH C 6 206 114 HOH HOH . TE 23 HOH C 7 207 109 HOH HOH . TE 23 HOH C 8 208 52 HOH HOH . TE 23 HOH C 9 209 107 HOH HOH . TE 23 HOH C 10 210 101 HOH HOH . TE 23 HOH C 11 211 106 HOH HOH . UE 23 HOH D 1 201 110 HOH HOH . UE 23 HOH D 2 202 104 HOH HOH . UE 23 HOH D 3 203 117 HOH HOH . UE 23 HOH D 4 204 123 HOH HOH . UE 23 HOH D 5 205 113 HOH HOH . UE 23 HOH D 6 206 100 HOH HOH . UE 23 HOH D 7 207 119 HOH HOH . UE 23 HOH D 8 208 105 HOH HOH . UE 23 HOH D 9 209 116 HOH HOH . UE 23 HOH D 10 210 122 HOH HOH . UE 23 HOH D 11 211 121 HOH HOH . UE 23 HOH D 12 212 124 HOH HOH . UE 23 HOH D 13 213 118 HOH HOH . UE 23 HOH D 14 214 103 HOH HOH . VE 23 HOH E 1 101 115 HOH HOH . WE 23 HOH F 1 301 58 HOH HOH . WE 23 HOH F 2 302 161 HOH HOH . XE 23 HOH I 1 201 18 HOH HOH . XE 23 HOH I 2 202 134 HOH HOH . XE 23 HOH I 3 203 132 HOH HOH . YE 23 HOH J 1 201 19 HOH HOH . ZE 23 HOH L 1 301 139 HOH HOH . ZE 23 HOH L 2 302 4 HOH HOH . ZE 23 HOH L 3 303 94 HOH HOH . ZE 23 HOH L 4 304 144 HOH HOH . 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TB 14 -127.839 36.501 10.625 1 42.56 ? C1C CLA 3004 B 1 HETATM 27 C C2C CLA . . . TB 14 -127.645 35.106 11.025 1 44.15 ? C2C CLA 3004 B 1 HETATM 28 C C3C CLA . . . TB 14 -126.852 35.138 12.177 1 37.93 ? C3C CLA 3004 B 1 HETATM 29 C C4C CLA . . . TB 14 -126.568 36.552 12.479 1 35.66 ? C4C CLA 3004 B 1 HETATM 30 C CMC CLA . . . TB 14 -128.21 33.922 10.359 1 43.86 ? CMC CLA 3004 B 1 HETATM 31 C CAC CLA . . . TB 14 -126.429 33.941 12.929 1 40.55 ? CAC CLA 3004 B 1 HETATM 32 C CBC CLA . . . TB 14 -125.039 33.469 12.59 1 58.42 ? CBC CLA 3004 B 1 HETATM 33 N ND CLA . . . TB 14 -125.985 39.437 12.964 1 27.34 ? ND CLA 3004 B 1 HETATM 34 C C1D CLA . . . TB 14 -125.502 38.391 13.787 1 37.96 ? C1D CLA 3004 B 1 HETATM 35 C C2D CLA . . . TB 14 -124.616 38.996 14.81 1 38.94 ? C2D CLA 3004 B 1 HETATM 36 C C3D CLA . . . TB 14 -124.487 40.341 14.501 1 32.53 ? C3D CLA 3004 B 1 HETATM 37 C C4D CLA . . . TB 14 -125.398 40.567 13.367 1 27.81 ? C4D CLA 3004 B 1 HETATM 38 C CMD CLA . . . TB 14 -123.946 38.258 15.871 1 46.69 ? CMD CLA 3004 B 1 HETATM 39 C CAD CLA . . . TB 14 -123.905 41.63 14.878 1 26.21 ? CAD CLA 3004 B 1 HETATM 40 O OBD CLA . . . TB 14 -123.065 41.901 15.734 1 37.58 ? OBD CLA 3004 B 1 HETATM 41 C CBD CLA . . . TB 14 -124.556 42.716 13.962 1 30.59 ? CBD CLA 3004 B 1 HETATM 42 C CGD CLA . . . TB 14 -125.172 43.769 14.839 1 33.22 ? CGD CLA 3004 B 1 HETATM 43 O O1D CLA . . . TB 14 -126.302 43.774 15.347 1 36.51 ? O1D CLA 3004 B 1 HETATM 44 O O2D CLA . . . TB 14 -124.312 44.8 15.09 1 32.84 ? O2D CLA 3004 B 1 HETATM 45 C CED CLA . . . TB 14 -124.276 45.871 14.162 1 31.35 ? CED CLA 3004 B 1 HETATM 46 C C1 CLA . . . TB 14 -128.069 47.615 8.637 1 30.78 ? C1 CLA 3004 B 1 HETATM 47 C C2 CLA . . . TB 14 -129.158 46.676 8.224 1 36.22 ? C2 CLA 3004 B 1 HETATM 48 C C3 CLA . . . TB 14 -129.221 45.948 7.079 1 51.27 ? C3 CLA 3004 B 1 HETATM 49 C C4 CLA . . . TB 14 -128.18 45.952 6.017 1 48.66 ? C4 CLA 3004 B 1 HETATM 50 C C5 CLA . . . TB 14 -130.389 45.047 6.822 1 32.52 ? C5 CLA 3004 B 1 HETATM 51 C C6 CLA . . . TB 14 -131.212 45.378 5.581 1 33.04 ? C6 CLA 3004 B 1 HETATM 52 C C7 CLA . . . TB 14 -131.747 46.788 5.69 1 35.8 ? C7 CLA 3004 B 1 HETATM 53 C C8 CLA . . . TB 14 -132.684 47.23 4.572 1 27.56 ? C8 CLA 3004 B 1 HETATM 54 C C9 CLA . . . TB 14 -131.936 47.262 3.258 1 39.43 ? C9 CLA 3004 B 1 HETATM 55 C C10 CLA . . . TB 14 -133.253 48.605 4.912 1 36.33 ? C10 CLA 3004 B 1 HETATM 56 C C11 CLA . . . TB 14 -134.761 48.663 4.818 1 43 ? C11 CLA 3004 B 1 HETATM 57 C C12 CLA . . . TB 14 -135.275 50.09 4.742 1 43.94 ? C12 CLA 3004 B 1 HETATM 58 C C13 CLA . . . TB 14 -136.318 50.377 5.818 1 29.7 ? C13 CLA 3004 B 1 HETATM 59 C C14 CLA . . . TB 14 -135.617 50.314 7.164 1 34.75 ? C14 CLA 3004 B 1 HETATM 60 C C15 CLA . . . TB 14 -137.53 49.452 5.694 1 26.87 ? C15 CLA 3004 B 1 HETATM 61 C C16 CLA . . . TB 14 -138.519 49.641 6.828 1 31 ? C16 CLA 3004 B 1 HETATM 62 C C17 CLA . . . TB 14 -139.831 50.282 6.416 1 21.47 ? 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