data_7M76 # _model_server_result.job_id 0g6uuVhZtD17_XrX_qhNKg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-13 06:06:33' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7m76 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"QB","auth_seq_id":3001}' # _entry.id 7M76 # _exptl.entry_id 7M76 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 351.64 _entity.id 19 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'IRON/SULFUR CLUSTER' _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 7M76 _cell.length_a 284.269 _cell.length_b 284.269 _cell.length_c 165.746 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7M76 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 173 _symmetry.space_group_name_Hall 'P 6c' _symmetry.space_group_name_H-M 'P 63' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? dodecameric 12 author_defined_assembly 1 PISA 33-meric 33 software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE 1 1 A,B,C,D,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE 2 1,2,3 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_565 -y,x-y+1,z -0.5 -0.866025 0 0.866025 -0.5 0 0 0 1 -142.1345 246.184176 0 3 'crystal symmetry operation' 3_455 -x+y-1,-x,z -0.5 0.866025 0 -0.866025 -0.5 0 0 0 1 -284.269 0 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 19 QB N N ? 19 PD N N ? 19 QD N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 F SG CYS 31 F CYS 8 1_555 F SG CYS 66 F CYS 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? metalc ? metalc1 A OE1 GLN 115 A GLN 115 1_555 U MG CLA . A CLA 809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.091 ? metalc ? metalc2 A OE1 GLN 123 A GLN 123 1_555 V MG CLA . A CLA 810 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.968 ? metalc ? metalc3 A O THR 501 A THR 501 1_555 WA MG CLA . A CLA 837 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 578 A CYS 578 1_555 QB FE3 SF4 . B SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? metalc ? metalc5 A SG CYS 587 A CYS 587 1_555 QB FE2 SF4 . B SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? metalc ? metalc6 N MG CLA . A CLA 802 1_555 RE O HOH . A HOH 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? metalc ? metalc7 Q O1A CLA . A CLA 805 1_555 X MG CLA . A CLA 812 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.765 ? metalc ? metalc8 CA MG CLA . A CLA 817 1_555 RE O HOH . A HOH 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? metalc ? metalc9 HA MG CLA . A CLA 822 1_555 RE O HOH . A HOH 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? metalc ? metalc10 MA MG CLA . A CLA 827 1_555 RE O HOH . A HOH 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? metalc ? metalc11 BB MG CLA . A CLA 842 1_555 RE O HOH . A HOH 907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.191 ? metalc ? metalc12 DB MG CLA . A CLA 844 1_555 RE O HOH . A HOH 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc13 EB MG CLA . A CLA 845 1_555 NB O5 LHG . A LHG 854 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.474 ? metalc ? metalc14 PB MG CLA . A CLA 856 1_555 SE O HOH . B HOH 3101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? metalc ? metalc15 RE O HOH . A HOH 901 1_555 GE CA CA . L CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? metalc ? metalc16 B OD2 ASP 92 B ASP 92 1_555 ZB MG CLA . B CLA 3010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? metalc ? metalc17 B OE1 GLN 94 B GLN 94 1_555 AC MG CLA . B CLA 3011 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? metalc ? metalc18 B OD2 ASP 133 B ASP 133 1_555 RB CA CA . B CA 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.582 ? metalc ? metalc19 B OE2 GLU 200 B GLU 200 1_555 RB CA CA . B CA 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.634 ? metalc ? metalc20 B OH TYR 329 B TYR 329 1_555 OC MG CLA . B CLA 3025 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? metalc ? metalc21 B SG CYS 565 B CYS 565 1_555 QB FE4 SF4 . B SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? metalc ? metalc22 B SG CYS 574 B CYS 574 1_555 QB FE1 SF4 . B SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc ? metalc23 RB CA CA . B CA 3002 1_555 SE O HOH . B HOH 3107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.77 ? metalc ? metalc24 JC MG CLA . B CLA 3020 1_555 SE O HOH . B HOH 3108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? metalc ? metalc25 MC MG CLA . B CLA 3023 1_555 SE O HOH . B HOH 3104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? metalc ? metalc26 PC MG CLA . B CLA 3026 1_555 SE O HOH . B HOH 3106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.163 ? metalc ? metalc27 ZC MG CLA . B CLA 3036 1_555 SE O HOH . B HOH 3102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.412 ? metalc ? metalc28 AD MG CLA . B CLA 3037 1_555 SE O HOH . B HOH 3105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.237 ? metalc ? metalc29 ED MG CLA . B CLA 3041 1_555 SE O HOH . B HOH 3103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.79 ? metalc ? metalc30 C SG CYS 10 C CYS 10 1_555 QD FE4 SF4 . C SF4 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? metalc ? metalc31 C SG CYS 13 C CYS 13 1_555 QD FE3 SF4 . C SF4 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc ? metalc32 C SG CYS 16 C CYS 16 1_555 QD FE2 SF4 . C SF4 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? metalc ? metalc33 C SG CYS 20 C CYS 20 1_555 PD FE2 SF4 . C SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? metalc ? metalc34 C SG CYS 47 C CYS 47 1_555 PD FE4 SF4 . C SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? metalc ? metalc35 C SG CYS 50 C CYS 50 1_555 PD FE1 SF4 . C SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc36 C SG CYS 53 C CYS 53 1_555 PD FE3 SF4 . C SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? metalc ? metalc37 C SG CYS 57 C CYS 57 1_555 QD FE1 SF4 . C SF4 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? metalc ? metalc38 SD MG CLA . F CLA 202 1_555 TE O HOH . J HOH 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? metalc ? metalc39 H OE2 GLU 28 J GLU 28 1_555 WD MG CLA . J CLA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.38 ? metalc ? metalc40 J OE2 GLU 49 L GLU 49 1_555 HE MG CLA . L CLA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? metalc ? metalc41 J O PRO 67 L PRO 67 1_555 GE CA CA . L CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.749 ? metalc ? metalc42 J OD1 ASP 70 L ASP 70 1_555 GE CA CA . L CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.37 ? metalc ? metalc43 J OD2 ASP 70 L ASP 70 1_555 GE CA CA . L CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.808 ? metalc ? metalc44 J O PHE 153 L PHE 153 1_555 GE CA CA . L CA 203 2_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? metalc ? metalc45 GE CA CA . L CA 203 1_555 UE O HOH . L HOH 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.585 ? metalc ? metalc46 JE MG CLA . L CLA 206 1_555 UE O HOH . L HOH 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? metalc ? metalc47 OE MG CLA . M CLA 102 1_555 VE O HOH . M HOH 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.967 ? metalc ? metalc48 L OD1 ASN 23 X ASN 23 1_555 QE MG CLA . 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