data_7M78 # _model_server_result.job_id KrZodqre5eJvjLVJkCj7VQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 14:03:15' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7m78 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"XC","auth_seq_id":833}' # _entry.id 7M78 # _exptl.entry_id 7M78 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 893.489 _entity.id 14 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CHLOROPHYLL A' _entity.pdbx_number_of_molecules 95 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 7M78 _cell.length_a 284.864 _cell.length_b 284.864 _cell.length_c 166.177 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7M78 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 173 _symmetry.space_group_name_Hall 'P 6c' _symmetry.space_group_name_H-M 'P 63' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? dodecameric 12 author_defined_assembly 1 PISA 30-meric 30 software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE 1 1 A,B,C,D,F,G,H,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE 2 1,2,3 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_565 -y,x-y+1,z -0.5 -0.866025 0 0.866025 -0.5 0 0 0 1 -142.432 246.699461 0 3 'crystal symmetry operation' 3_455 -x+y-1,-x,z -0.5 0.866025 0 -0.866025 -0.5 0 0 0 1 -284.864 0 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 14 N N N ? 14 O N N ? 14 P N N ? 14 Q N N ? 14 R N N ? 14 S N N ? 14 T N N ? 14 U N N ? 14 V N N ? 14 W N N ? 14 X N N ? 14 Y N N ? 14 Z N N ? 14 AA N N ? 14 BA N N ? 14 CA N N ? 14 DA N N ? 14 EA N N ? 14 FA N N ? 14 GA N N ? 14 HA N N ? 14 IA N N ? 14 JA N N ? 14 KA N N ? 14 LA N N ? 14 MA N N ? 14 NA N N ? 14 OA N N ? 14 PA N N ? 14 QA N N ? 14 RA N N ? 14 SA N N ? 14 TA N N ? 14 UA N N ? 14 VA N N ? 14 WA N N ? 14 XA N N ? 14 YA N N ? 14 ZA N N ? 14 AB N N ? 14 BB N N ? 14 CB N N ? 14 DB N N ? 14 QB N N ? 14 SB N N ? 14 TB N N ? 14 UB N N ? 14 VB N N ? 14 WB N N ? 14 XB N N ? 14 YB N N ? 14 ZB N N ? 14 AC N N ? 14 BC N N ? 14 CC N N ? 14 DC N N ? 14 EC N N ? 14 FC N N ? 14 GC N N ? 14 HC N N ? 14 IC N N ? 14 JC N N ? 14 KC N N ? 14 LC N N ? 14 MC N N ? 14 NC N N ? 14 OC N N ? 14 PC N N ? 14 QC N N ? 14 RC N N ? 14 SC N N ? 14 TC N N ? 14 UC N N ? 14 VC N N ? 14 WC N N ? 14 XC N N ? 14 YC N N ? 14 ZC N N ? 14 AD N N ? 14 BD N N ? 14 CD N N ? 14 DD N N ? 14 ED N N ? 14 FD N N ? 14 SD N N ? 14 TD N N ? 14 YD N N ? 14 ZD N N ? 14 DE N N ? 14 EE N N ? 14 IE N N ? 14 JE N N ? 14 KE N N ? 14 OE N N ? 14 QE N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 F SG CYS 31 F CYS 8 1_555 F SG CYS 66 F CYS 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? covale ? covale1 C SG CYS 50 C CYS 50 1_555 QD S4 SF4 . C SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? metalc ? metalc1 A OE1 GLN 115 A GLN 115 1_555 U MG CLA . A CLA 809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.867 ? metalc ? metalc2 A OE1 GLN 123 A GLN 123 1_555 V MG CLA . A CLA 810 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.922 ? metalc ? metalc3 A O THR 501 A THR 501 1_555 WA MG CLA . A CLA 837 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 578 A CYS 578 1_555 FB FE3 SF4 . A SF4 846 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc5 A SG CYS 587 A CYS 587 1_555 FB FE2 SF4 . A SF4 846 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc6 N MG CLA . A CLA 802 1_555 RE O HOH . A HOH 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.128 ? metalc ? metalc7 Q O1A CLA . A CLA 805 1_555 X MG CLA . A CLA 812 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.663 ? metalc ? metalc8 CA MG CLA . A CLA 817 1_555 RE O HOH . A HOH 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? metalc ? metalc9 HA MG CLA . A CLA 822 1_555 RE O HOH . A HOH 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.155 ? metalc ? metalc10 LA MG CLA . A CLA 826 1_555 RE O HOH . A HOH 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.906 ? metalc ? metalc11 MA MG CLA . A CLA 827 1_555 RE O HOH . A HOH 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? metalc ? metalc12 CB MG CLA . A CLA 843 1_555 RE O HOH . A HOH 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? metalc ? metalc13 DB MG CLA . A CLA 844 1_555 OB O5 LHG . A LHG 855 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.994 ? metalc ? metalc14 FB FE4 SF4 . A SF4 846 1_555 B SG CYS 565 B CYS 565 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? metalc ? metalc15 FB FE1 SF4 . A SF4 846 1_555 B SG CYS 574 B CYS 574 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? metalc ? metalc16 QB MG CLA . A CLA 857 1_555 SE O HOH . B HOH 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? metalc ? metalc17 B OD2 ASP 92 B ASP 92 1_555 ZB MG CLA . B CLA 809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.085 ? metalc ? metalc18 B OE1 GLN 94 B GLN 94 1_555 AC MG CLA . B CLA 810 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? metalc ? metalc19 B OD2 ASP 133 B ASP 133 1_555 RB CA CA . B CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.605 ? metalc ? metalc20 B OE2 GLU 200 B GLU 200 1_555 RB CA CA . B CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.531 ? metalc ? metalc21 B OH TYR 329 B TYR 329 1_555 OC MG CLA . B CLA 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.197 ? metalc ? metalc22 RB CA CA . B CA 801 1_555 SE O HOH . B HOH 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? metalc ? metalc23 JC MG CLA . B CLA 819 1_555 SE O HOH . B HOH 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.159 ? metalc ? metalc24 MC MG CLA . B CLA 822 1_555 SE O HOH . B HOH 907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.13 ? metalc ? metalc25 PC MG CLA . B CLA 825 1_555 SE O HOH . B HOH 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.866 ? metalc ? metalc26 ZC MG CLA . B CLA 835 1_555 SE O HOH . B HOH 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.113 ? metalc ? metalc27 AD MG CLA . B CLA 836 1_555 SE O HOH . B HOH 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? metalc ? metalc28 ED MG CLA . B CLA 840 1_555 SE O HOH . B HOH 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? metalc ? metalc29 C SG CYS 10 C CYS 10 1_555 RD FE4 SF4 . C SF4 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? metalc ? metalc30 C SG CYS 13 C CYS 13 1_555 RD FE3 SF4 . C SF4 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc ? metalc31 C SG CYS 16 C CYS 16 1_555 RD FE2 SF4 . C SF4 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? metalc ? metalc32 C SG CYS 20 C CYS 20 1_555 QD FE2 SF4 . C SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? metalc ? metalc33 C SG CYS 47 C CYS 47 1_555 QD FE4 SF4 . C SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? metalc ? metalc34 C SG CYS 50 C CYS 50 1_555 QD FE1 SF4 . C SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? metalc ? metalc35 C SG CYS 53 C CYS 53 1_555 QD FE3 SF4 . C SF4 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? metalc ? metalc36 C SG CYS 57 C CYS 57 1_555 RD FE1 SF4 . 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