data_7MC9 # _model_server_result.job_id j7fzt3rUvyttyOshpHXE7g _model_server_result.datetime_utc '2024-12-21 16:12:40' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7mc9 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"KA","auth_seq_id":2001}' # _entry.id 7MC9 # _exptl.entry_id 7MC9 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 14 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7MC9 _cell.length_a 98.138 _cell.length_b 136.873 _cell.length_c 193.348 _cell.Z_PDB 32 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7MC9 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? dimeric 2 author_defined_assembly 1 ? dimeric 2 author_defined_assembly 2 ? dimeric 2 author_defined_assembly 3 ? dimeric 2 author_defined_assembly 4 ? dimeric 2 author_defined_assembly 5 ? dimeric 2 author_defined_assembly 6 ? dimeric 2 author_defined_assembly 7 ? dimeric 2 author_defined_assembly 8 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,Q,R,S,T 1 1 C,D,U,V,MA,NA 2 1 E,F,W,X,Y,Z,OA 3 1 G,H,AA,BA,CA,PA,QA 4 1 I,J,DA,EA,RA 5 1 K,L,FA,GA,SA 6 1 M,N,HA,IA,JA 7 1 O,P,KA,LA 8 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 Q N N ? 3 R N N ? 3 S N N ? 3 U N N ? 3 W N N ? 3 X N N ? 3 Y N N ? 3 AA N N ? 3 BA N N ? 3 DA N N ? 3 FA N N ? 3 HA N N ? 3 IA N N ? 3 KA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 E SG CYS 126 E CYS 1811 1_555 E SG CYS 151 E CYS 1836 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? disulf ? disulf2 G SG CYS 126 G CYS 1811 1_555 G SG CYS 151 G CYS 1836 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.917 ? covale ? covale1 A SG CYS 44 A CYS 3414 1_555 T C2 AYE . B AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.651 ? covale ? covale2 B C GLY 75 B GLY 75 1_555 T N1 AYE . B AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.299 ? covale ? covale3 C SG CYS 44 C CYS 1729 1_555 V C2 AYE . D AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.645 ? covale ? covale4 D C GLY 75 D GLY 75 1_555 V N1 AYE . D AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.302 ? covale ? covale5 E C ASN 42 E ASN 1727 1_555 Z C3 AYE . F AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale6 E SG CYS 44 E CYS 1729 1_555 Z C2 AYE . F AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.655 ? covale ? covale7 E SG CYS 44 E CYS 1729 1_555 Z C1 AYE . F AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.874 ? covale ? covale8 F C GLY 75 F GLY 75 1_555 Z N1 AYE . F AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.298 ? covale ? covale9 G SG CYS 44 G CYS 1729 1_555 CA C3 AYE . H AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.673 ? covale ? covale10 G SG CYS 44 G CYS 1729 1_555 CA C2 AYE . H AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.652 ? covale ? covale11 H C GLY 75 H GLY 75 1_555 CA N1 AYE . H AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.3 ? covale ? covale12 I SG CYS 44 I CYS 1729 1_555 EA C3 AYE . J AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.8 ? covale ? covale13 I SG CYS 44 I CYS 1729 1_555 EA C2 AYE . J AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.649 ? covale ? covale14 J C GLY 75 J GLY 75 1_555 EA N1 AYE . J AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.3 ? covale ? covale15 K SG CYS 44 K CYS 44 1_555 GA C1 AYE . L AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.984 ? covale ? covale16 K SG CYS 44 K CYS 44 1_555 GA C2 AYE . L AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.649 ? covale ? covale17 L C GLY 75 L GLY 75 1_555 GA N1 AYE . L AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.301 ? covale ? covale18 M SG CYS 44 M CYS 1729 1_555 JA C2 AYE . N AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.651 ? covale ? covale19 N C GLY 75 N GLY 75 1_555 JA N1 AYE . N AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.299 ? covale ? covale20 N O GLY 75 N GLY 75 1_555 JA N1 AYE . N AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.246 ? covale ? covale21 O SG CYS 44 O CYS 1729 1_555 LA C2 AYE . P AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.649 ? covale ? covale22 P C GLY 75 P GLY 75 1_555 LA N1 AYE . P AYE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.3 ? metalc ? metalc1 A NE2 HIS 3 A HIS 3373 1_555 R ZN ZN . A ZN 3702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? metalc ? metalc2 A ND1 HIS 7 A HIS 3377 1_555 R ZN ZN . A ZN 3702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? metalc ? metalc3 A OE2 GLU 118 A GLU 3488 1_555 S ZN ZN . A ZN 3703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 125 A CYS 3495 1_555 Q ZN ZN . A ZN 3701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? metalc ? metalc5 A SG CYS 126 A CYS 3496 1_555 Q ZN ZN . A ZN 3701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.438 ? metalc ? metalc6 A SG CYS 127 A CYS 3497 1_555 S ZN ZN . A ZN 3703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc7 A SG CYS 151 A CYS 3521 1_555 Q ZN ZN . A ZN 3701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.542 ? metalc ? metalc8 A ND1 HIS 153 A HIS 3523 1_555 Q ZN ZN . A ZN 3701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc9 R ZN ZN . A ZN 3702 1_555 O O CYS 127 O CYS 1812 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.008 ? metalc ? metalc10 R ZN ZN . A ZN 3702 1_555 O SG CYS 127 O CYS 1812 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.195 ? metalc ? metalc11 S ZN ZN . A ZN 3703 1_555 C OE2 GLU 118 C GLU 1803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? metalc ? metalc12 S ZN ZN . A ZN 3703 1_555 C SG CYS 127 C CYS 1812 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? metalc ? metalc13 C NE2 HIS 3 C HIS 1688 1_555 IA ZN ZN . M ZN 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.541 ? metalc ? metalc14 C ND1 HIS 7 C HIS 1692 1_555 IA ZN ZN . M ZN 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.09 ? metalc ? metalc15 C SG CYS 125 C CYS 1810 1_555 U ZN ZN . C ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? metalc ? metalc16 C SG CYS 126 C CYS 1811 1_555 U ZN ZN . C ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.581 ? metalc ? metalc17 E NE2 HIS 3 E HIS 1688 1_555 X ZN ZN . E ZN 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc ? metalc18 E ND1 HIS 7 E HIS 1692 1_555 X ZN ZN . E ZN 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? metalc ? metalc19 E OE2 GLU 118 E GLU 1803 1_555 Y ZN ZN . E ZN 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? metalc ? metalc20 E SG CYS 125 E CYS 1810 1_555 W ZN ZN . E ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? metalc ? metalc21 E SG CYS 126 E CYS 1811 1_555 W ZN ZN . E ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.63 ? metalc ? metalc22 E SG CYS 127 E CYS 1812 1_555 Y ZN ZN . E ZN 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.94 ? metalc ? metalc23 E ND1 HIS 153 E HIS 1838 1_555 W ZN ZN . E ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? metalc ? metalc24 X ZN ZN . E ZN 2002 1_555 K O CYS 127 K CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? metalc ? metalc25 X ZN ZN . E ZN 2002 1_555 K SG CYS 127 K CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? metalc ? metalc26 Y ZN ZN . E ZN 2003 1_555 G SG CYS 127 G CYS 1812 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? metalc ? metalc27 G NE2 HIS 3 G HIS 1688 1_555 BA ZN ZN . G ZN 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc28 G SG CYS 126 G CYS 1811 1_555 AA ZN ZN . G ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.797 ? metalc ? metalc29 G SG CYS 151 G CYS 1836 1_555 AA ZN ZN . G ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.118 ? metalc ? metalc30 G ND1 HIS 153 G HIS 1838 1_555 AA ZN ZN . G ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? metalc ? metalc31 BA ZN ZN . G ZN 2002 1_555 I O CYS 127 I CYS 1812 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc32 BA ZN ZN . G ZN 2002 1_555 I SG CYS 127 I CYS 1812 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.631 ? metalc ? metalc33 I SG CYS 125 I CYS 1810 1_555 DA ZN ZN . I ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc34 I SG CYS 126 I CYS 1811 1_555 DA ZN ZN . I ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? metalc ? metalc35 I SG CYS 151 I CYS 1836 1_555 DA ZN ZN . I ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? metalc ? metalc36 I ND1 HIS 153 I HIS 1838 1_555 DA ZN ZN . I ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? metalc ? metalc37 K SG CYS 125 K CYS 125 1_555 FA ZN ZN . K ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.197 ? metalc ? metalc38 K SG CYS 126 K CYS 126 1_555 FA ZN ZN . K ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc39 K SG CYS 151 K CYS 151 1_555 FA ZN ZN . K ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc40 K ND1 HIS 153 K HIS 153 1_555 FA ZN ZN . K ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.636 ? metalc ? metalc41 M SG CYS 125 M CYS 1810 1_555 HA ZN ZN . M ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc42 M SG CYS 126 M CYS 1811 1_555 HA ZN ZN . M ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? metalc ? metalc43 M O CYS 127 M CYS 1812 1_555 IA ZN ZN . M ZN 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.009 ? metalc ? metalc44 M SG CYS 127 M CYS 1812 1_555 IA ZN ZN . M ZN 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? metalc ? metalc45 M SG CYS 151 M CYS 1836 1_555 HA ZN ZN . M ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc46 M ND1 HIS 153 M HIS 1838 1_555 HA ZN ZN . M ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? metalc ? metalc47 O SG CYS 125 O CYS 1810 1_555 KA ZN ZN . O ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc48 O SG CYS 126 O CYS 1811 1_555 KA ZN ZN . O ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? metalc ? metalc49 O SG CYS 151 O CYS 1836 1_555 KA ZN ZN . O ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.157 ? metalc ? metalc50 O ND1 HIS 153 O HIS 1838 1_555 KA ZN ZN . O ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7MC9 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.01019 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.007306 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.005172 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Q 3 ZN A 1 3701 1 ZN ZN . R 3 ZN A 1 3702 10 ZN ZN . S 3 ZN A 1 3703 15 ZN ZN . T 4 AYE B 1 101 76 AYE AYE . U 3 ZN C 1 2001 8 ZN ZN . V 4 AYE D 1 101 76 AYE AYE . W 3 ZN E 1 2001 2 ZN ZN . X 3 ZN E 1 2002 9 ZN ZN . Y 3 ZN E 1 2003 14 ZN ZN . Z 4 AYE F 1 101 76 AYE AYE . AA 3 ZN G 1 2001 3 ZN ZN . BA 3 ZN G 1 2002 12 ZN ZN . CA 4 AYE H 1 101 76 AYE AYE . DA 3 ZN I 1 2001 4 ZN ZN . EA 4 AYE J 1 101 76 AYE AYE . FA 3 ZN K 1 301 5 ZN ZN . GA 4 AYE L 1 101 76 AYE AYE . HA 3 ZN M 1 2001 6 ZN ZN . IA 3 ZN M 1 2002 11 ZN ZN . JA 4 AYE N 1 101 76 AYE AYE . KA 3 ZN O 1 2001 7 ZN ZN . LA 4 AYE P 1 101 76 AYE AYE . MA 5 HOH C 1 2101 9 HOH HOH . MA 5 HOH C 2 2102 6 HOH HOH . MA 5 HOH C 3 2103 5 HOH HOH . NA 5 HOH D 1 201 7 HOH HOH . OA 5 HOH E 1 2101 12 HOH HOH . PA 5 HOH G 1 2101 3 HOH HOH . QA 5 HOH H 1 201 4 HOH HOH . RA 5 HOH I 1 2101 2 HOH HOH . SA 5 HOH K 1 401 10 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id KA _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 3.885 _atom_site.Cartn_y 10.811 _atom_site.Cartn_z -13.337 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 53.69 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 2001 _atom_site.auth_asym_id O _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 15 _model_server_stats.parse_time_ms 19 _model_server_stats.create_model_time_ms 25 _model_server_stats.query_time_ms 295 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #