data_7MEP # _model_server_result.job_id o3e0by3PYROceFrAssJzPg _model_server_result.datetime_utc '2025-09-12 08:43:17' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7mep # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"MB","auth_seq_id":702}' # _entry.id 7MEP # _exptl.entry_id 7MEP _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 8 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 51 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetradecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 14 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 DA N N ? 8 EA N N ? 8 FA N N ? 8 GA N N ? 8 HA N N ? 8 IA N N ? 8 JA N N ? 8 KA N N ? 8 LA N N ? 8 MA N N ? 8 NA N N ? 8 OA N N ? 8 PA N N ? 8 QA N N ? 8 RA N N ? 8 SA N N ? 8 TA N N ? 8 UA N N ? 8 VA N N ? 8 WA N N ? 8 XA N N ? 8 YA N N ? 8 ZA N N ? 8 AB N N ? 8 BB N N ? 8 CB N N ? 8 DB N N ? 8 EB N N ? 8 FB N N ? 8 GB N N ? 8 HB N N ? 8 IB N N ? 8 JB N N ? 8 KB N N ? 8 LB N N ? 8 MB N N ? 8 NB N N ? 8 OB N N ? 8 PB N N ? 8 QB N N ? 8 RB N N ? 8 SB N N ? 8 TB N N ? 8 UB N N ? 8 VB N N ? 8 WB N N ? 8 XB N N ? 8 YB N N ? 8 ZB N N ? 8 AC N N ? 8 BC N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 6 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 4 ? 6 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 5 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 6 n O NAG 1 O 1 NAG A 601 NAG 6 n O NAG 2 O 2 NAG A 602 NAG 6 n O BMA 3 O 3 BMA A 603 BMA 6 n O MAN 4 O 4 MAN A 637 MAN 6 n O MAN 5 O 5 MAN A 604 MAN 7 n P NAG 1 P 1 NAG A 608 NAG 7 n P NAG 2 P 2 NAG A 609 NAG 7 n Q NAG 1 Q 1 NAG A 612 NAG 7 n Q NAG 2 Q 2 NAG A 613 NAG 7 n R NAG 1 R 1 NAG A 623 NAG 7 n R NAG 2 R 2 NAG A 624 NAG 7 n S NAG 1 S 1 NAG A 628 NAG 7 n S NAG 2 S 2 NAG A 629 NAG 7 n T NAG 1 T 1 NAG A 639 NAG 7 n T NAG 2 T 2 NAG A 640 NAG 6 n U NAG 1 U 1 NAG C 601 NAG 6 n U NAG 2 U 2 NAG C 602 NAG 6 n U BMA 3 U 3 BMA C 603 BMA 6 n U MAN 4 U 4 MAN C 637 MAN 6 n U MAN 5 U 5 MAN C 604 MAN 7 n V NAG 1 V 1 NAG C 612 NAG 7 n V NAG 2 V 2 NAG C 613 NAG 7 n W NAG 1 W 1 NAG C 623 NAG 7 n W NAG 2 W 2 NAG C 624 NAG 7 n X NAG 1 X 1 NAG C 639 NAG 7 n X NAG 2 X 2 NAG C 640 NAG 6 n Y NAG 1 Y 1 NAG D 601 NAG 6 n Y NAG 2 Y 2 NAG D 602 NAG 6 n Y BMA 3 Y 3 BMA D 603 BMA 6 n Y MAN 4 Y 4 MAN D 637 MAN 6 n Y MAN 5 Y 5 MAN D 604 MAN 7 n Z NAG 1 Z 1 NAG D 608 NAG 7 n Z NAG 2 Z 2 NAG D 609 NAG 7 n AA NAG 1 a 1 NAG D 623 NAG 7 n AA NAG 2 a 2 NAG D 624 NAG 7 n BA NAG 1 b 1 NAG D 628 NAG 7 n BA NAG 2 b 2 NAG D 629 NAG 7 n CA NAG 1 c 1 NAG D 639 NAG 7 n CA NAG 2 c 2 NAG D 640 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 23 G CYS 23 1_555 A SG CYS 88 G CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 22 I CYS 22 1_555 B SG CYS 97 I CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf3 C SG CYS 56 A CYS 54 1_555 C SG CYS 75 A CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf4 C SG CYS 121 A CYS 119 1_555 C SG CYS 207 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf5 C SG CYS 128 A CYS 126 1_555 C SG CYS 198 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf6 C SG CYS 133 A CYS 131 1_555 C SG CYS 151 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf7 C SG CYS 220 A CYS 218 1_555 C SG CYS 249 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf8 C SG CYS 230 A CYS 228 1_555 C SG CYS 241 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf9 C SG CYS 298 A CYS 296 1_555 C SG CYS 332 A CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf10 C SG CYS 379 A CYS 378 1_555 C SG CYS 445 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf11 C SG CYS 386 A CYS 385 1_555 C SG CYS 418 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf12 C SG CYS 501 A CYS 501 1_555 D SG CYS 607 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf13 D SG CYS 600 B CYS 598 1_555 D SG CYS 606 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf14 E SG CYS 22 H CYS 22 1_555 E SG CYS 96 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf15 F SG CYS 23 L CYS 23 1_555 F SG CYS 88 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf16 G SG CYS 23 J CYS 23 1_555 G SG CYS 88 J CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? disulf ? disulf17 H SG CYS 22 M CYS 22 1_555 H SG CYS 97 M CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf18 I SG CYS 56 C CYS 54 1_555 I SG CYS 75 C CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf19 I SG CYS 121 C CYS 119 1_555 I SG CYS 207 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf20 I SG CYS 128 C CYS 126 1_555 I SG CYS 198 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf21 I SG CYS 133 C CYS 131 1_555 I SG CYS 151 C CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf22 I SG CYS 220 C CYS 218 1_555 I SG CYS 249 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf23 I SG CYS 230 C CYS 228 1_555 I SG CYS 241 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf24 I SG CYS 298 C CYS 296 1_555 I SG CYS 332 C CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf25 I SG CYS 379 C CYS 378 1_555 I SG CYS 445 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf26 I SG CYS 386 C CYS 385 1_555 I SG CYS 418 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf27 I SG CYS 501 C CYS 501 1_555 J SG CYS 607 E CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf28 J SG CYS 600 E CYS 598 1_555 J SG CYS 606 E CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf29 K SG CYS 23 K CYS 23 1_555 K SG CYS 88 K CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? disulf ? disulf30 L SG CYS 22 N CYS 22 1_555 L SG CYS 97 N CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? disulf ? disulf31 M SG CYS 56 D CYS 54 1_555 M SG CYS 75 D CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf32 M SG CYS 121 D CYS 119 1_555 M SG CYS 207 D CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? disulf ? disulf33 M SG CYS 128 D CYS 126 1_555 M SG CYS 198 D CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf34 M SG CYS 133 D CYS 131 1_555 M SG CYS 151 D CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf35 M SG CYS 220 D CYS 218 1_555 M SG CYS 249 D CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf36 M SG CYS 230 D CYS 228 1_555 M SG CYS 241 D CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf37 M SG CYS 298 D CYS 296 1_555 M SG CYS 332 D CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf38 M SG CYS 379 D CYS 378 1_555 M SG CYS 445 D CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf39 M SG CYS 386 D CYS 385 1_555 M SG CYS 418 D CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf40 M SG CYS 501 D CYS 501 1_555 N SG CYS 607 F CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf41 N SG CYS 600 F CYS 598 1_555 N SG CYS 606 F CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? covale ? covale1 C ND2 ASN 90 A ASN 88 1_555 KA C1 NAG . A NAG 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale2 C ND2 ASN 135 A ASN 133 1_555 JA C1 NAG . A NAG 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? covale ? covale3 C ND2 ASN 150 A ASN 156 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale4 C ND2 ASN 154 A ASN 160 1_555 DA C1 NAG . A NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale5 C ND2 ASN 199 A ASN 197 1_555 IA C1 NAG . A NAG 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale6 C ND2 ASN 236 A ASN 234 1_555 HA C1 NAG . A NAG 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? covale ? covale7 C ND2 ASN 243 A ASN 241 1_555 LA C1 NAG . A NAG 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale8 C ND2 ASN 264 A ASN 262 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale9 C ND2 ASN 278 A ASN 276 1_555 EA C1 NAG . A NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.535 ? covale ? covale10 C ND2 ASN 291 A ASN 289 1_555 MA C1 NAG . A NAG 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale11 C ND2 ASN 297 A ASN 295 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale12 C ND2 ASN 303 A ASN 301 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale13 C ND2 ASN 333 A ASN 332 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale14 C ND2 ASN 340 A ASN 339 1_555 NA C1 NAG . A NAG 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? covale ? covale15 C ND2 ASN 356 A ASN 355 1_555 OA C1 NAG . A NAG 712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale16 C ND2 ASN 364 A ASN 363 1_555 GA C1 NAG . A NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale17 C ND2 ASN 387 A ASN 386 1_555 FA C1 NAG . A NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale18 C ND2 ASN 393 A ASN 392 1_555 PA C1 NAG . A NAG 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale19 C ND2 ASN 448 A ASN 448 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale20 D ND2 ASN 613 B ASN 611 1_555 SA C1 NAG . B NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? covale ? covale21 D ND2 ASN 620 B ASN 618 1_555 RA C1 NAG . B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? covale ? covale22 D ND2 ASN 639 B ASN 637 1_555 QA C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale23 I ND2 ASN 90 C ASN 88 1_555 CB C1 NAG . C NAG 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale24 I ND2 ASN 135 C ASN 133 1_555 AB C1 NAG . C NAG 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale25 I ND2 ASN 150 C ASN 156 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale26 I ND2 ASN 154 C ASN 160 1_555 UA C1 NAG . C NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale27 I ND2 ASN 199 C ASN 197 1_555 ZA C1 NAG . C NAG 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.535 ? covale ? covale28 I ND2 ASN 236 C ASN 234 1_555 YA C1 NAG . C NAG 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale29 I ND2 ASN 243 C ASN 241 1_555 DB C1 NAG . C NAG 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale30 I ND2 ASN 264 C ASN 262 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale31 I ND2 ASN 278 C ASN 276 1_555 VA C1 NAG . C NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale32 I ND2 ASN 291 C ASN 289 1_555 EB C1 NAG . C NAG 712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale33 I ND2 ASN 297 C ASN 295 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale34 I ND2 ASN 303 C ASN 301 1_555 BB C1 NAG . C NAG 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? covale ? covale35 I ND2 ASN 333 C ASN 332 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale36 I ND2 ASN 340 C ASN 339 1_555 FB C1 NAG . C NAG 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? covale ? covale37 I ND2 ASN 356 C ASN 355 1_555 GB C1 NAG . C NAG 714 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale38 I ND2 ASN 364 C ASN 363 1_555 XA C1 NAG . C NAG 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale39 I ND2 ASN 387 C ASN 386 1_555 WA C1 NAG . C NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale40 I ND2 ASN 393 C ASN 392 1_555 HB C1 NAG . C NAG 715 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale41 I ND2 ASN 448 C ASN 448 1_555 TA C1 NAG . C NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale42 J ND2 ASN 613 E ASN 611 1_555 KB C1 NAG . E NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale43 J ND2 ASN 620 E ASN 618 1_555 JB C1 NAG . E NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale44 J ND2 ASN 639 E ASN 637 1_555 IB C1 NAG . E NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale45 M ND2 ASN 90 D ASN 88 1_555 TB C1 NAG . D NAG 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale46 M ND2 ASN 135 D ASN 133 1_555 SB C1 NAG . D NAG 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? covale ? covale47 M ND2 ASN 150 D ASN 156 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale48 M ND2 ASN 154 D ASN 160 1_555 LB C1 NAG . D NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale49 M ND2 ASN 199 D ASN 197 1_555 RB C1 NAG . D NAG 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale50 M ND2 ASN 236 D ASN 234 1_555 QB C1 NAG . D NAG 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale51 M ND2 ASN 243 D ASN 241 1_555 UB C1 NAG . D NAG 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale52 M ND2 ASN 264 D ASN 262 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale53 M ND2 ASN 278 D ASN 276 1_555 MB C1 NAG . D NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.529 ? covale ? covale54 M ND2 ASN 291 D ASN 289 1_555 VB C1 NAG . D NAG 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale55 M ND2 ASN 297 D ASN 295 1_555 NB C1 NAG . D NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale56 M ND2 ASN 303 D ASN 301 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale57 M ND2 ASN 333 D ASN 332 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale58 M ND2 ASN 340 D ASN 339 1_555 WB C1 NAG . D NAG 712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.53 ? covale ? covale59 M ND2 ASN 356 D ASN 355 1_555 XB C1 NAG . D NAG 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale60 M ND2 ASN 364 D ASN 363 1_555 PB C1 NAG . D NAG 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale61 M ND2 ASN 387 D ASN 386 1_555 OB C1 NAG . D NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale62 M ND2 ASN 393 D ASN 392 1_555 YB C1 NAG . D NAG 714 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale63 M ND2 ASN 448 D ASN 448 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale64 N ND2 ASN 613 F ASN 611 1_555 BC C1 NAG . F NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale65 N ND2 ASN 620 F ASN 618 1_555 AC C1 NAG . F NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? covale ? covale66 N ND2 ASN 639 F ASN 637 1_555 ZB C1 NAG . F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale67 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale68 O O4 NAG . O NAG 2 1_555 O C1 BMA . O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale69 O O3 BMA . O BMA 3 1_555 O C1 MAN . O MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.531 ? covale ? covale70 O O6 BMA . O BMA 3 1_555 O C1 MAN . O MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale71 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale72 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale73 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale74 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale75 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale76 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale77 U O4 NAG . U NAG 2 1_555 U C1 BMA . U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale78 U O3 BMA . U BMA 3 1_555 U C1 MAN . U MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale79 U O6 BMA . U BMA 3 1_555 U C1 MAN . U MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale80 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale81 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale82 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale83 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale84 Y O4 NAG . Y NAG 2 1_555 Y C1 BMA . Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale85 Y O3 BMA . Y BMA 3 1_555 Y C1 MAN . Y MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale86 Y O6 BMA . Y BMA 3 1_555 Y C1 MAN . Y MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale ? covale87 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale88 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale89 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale90 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7MEP _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code DA 8 NAG A 1 701 610 NAG NAG . EA 8 NAG A 1 702 611 NAG NAG . FA 8 NAG A 1 703 614 NAG NAG . GA 8 NAG A 1 704 616 NAG NAG . HA 8 NAG A 1 705 617 NAG NAG . IA 8 NAG A 1 706 619 NAG NAG . JA 8 NAG A 1 707 621 NAG NAG . KA 8 NAG A 1 708 632 NAG NAG . LA 8 NAG A 1 709 634 NAG NAG . MA 8 NAG A 1 710 638 NAG NAG . NA 8 NAG A 1 711 641 NAG NAG . OA 8 NAG A 1 712 642 NAG NAG . PA 8 NAG A 1 713 643 NAG NAG . QA 8 NAG B 1 701 701 NAG NAG . RA 8 NAG B 1 702 702 NAG NAG . SA 8 NAG B 1 703 703 NAG NAG . TA 8 NAG C 1 701 608 NAG NAG . UA 8 NAG C 1 702 610 NAG NAG . VA 8 NAG C 1 703 611 NAG NAG . WA 8 NAG C 1 704 614 NAG NAG . XA 8 NAG C 1 705 616 NAG NAG . YA 8 NAG C 1 706 617 NAG NAG . ZA 8 NAG C 1 707 619 NAG NAG . AB 8 NAG C 1 708 621 NAG NAG . BB 8 NAG C 1 709 628 NAG NAG . CB 8 NAG C 1 710 632 NAG NAG . DB 8 NAG C 1 711 634 NAG NAG . EB 8 NAG C 1 712 638 NAG NAG . FB 8 NAG C 1 713 641 NAG NAG . GB 8 NAG C 1 714 642 NAG NAG . HB 8 NAG C 1 715 643 NAG NAG . IB 8 NAG E 1 701 701 NAG NAG . JB 8 NAG E 1 702 702 NAG NAG . KB 8 NAG E 1 703 703 NAG NAG . LB 8 NAG D 1 701 610 NAG NAG . MB 8 NAG D 1 702 611 NAG NAG . NB 8 NAG D 1 703 612 NAG NAG . OB 8 NAG D 1 704 614 NAG NAG . PB 8 NAG D 1 705 616 NAG NAG . QB 8 NAG D 1 706 617 NAG NAG . RB 8 NAG D 1 707 619 NAG NAG . SB 8 NAG D 1 708 621 NAG NAG . TB 8 NAG D 1 709 632 NAG NAG . UB 8 NAG D 1 710 634 NAG NAG . VB 8 NAG D 1 711 638 NAG NAG . WB 8 NAG D 1 712 641 NAG NAG . XB 8 NAG D 1 713 642 NAG NAG . YB 8 NAG D 1 714 643 NAG NAG . ZB 8 NAG F 1 701 701 NAG NAG . AC 8 NAG F 1 702 702 NAG NAG . BC 8 NAG F 1 703 703 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . MB 8 162.09 146.7 186.762 1 65.87 ? C1 NAG 702 D 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . MB 8 163.365 146.546 185.812 1 70.3 ? C2 NAG 702 D 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . MB 8 163.726 145.025 185.703 1 71.99 ? C3 NAG 702 D 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . MB 8 164.012 144.445 187.134 1 70.86 ? C4 NAG 702 D 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . MB 8 162.73 144.642 188.02 1 66.29 ? C5 NAG 702 D 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . MB 8 162.912 144.23 189.479 1 65.7 ? C6 NAG 702 D 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . MB 8 163.681 148.04 183.843 1 74.11 ? C7 NAG 702 D 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . MB 8 163.216 148.512 182.495 1 75.66 ? C8 NAG 702 D 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . MB 8 162.993 147.08 184.475 1 73.52 ? N2 NAG 702 D 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . MB 8 164.895 144.874 184.878 1 74.71 ? O3 NAG 702 D 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . MB 8 164.336 143.057 187.019 1 74.44 ? O4 NAG 702 D 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . MB 8 162.379 146.081 188.068 1 61.6 ? O5 NAG 702 D 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . MB 8 163.093 142.824 189.631 1 75.56 ? O6 NAG 702 D 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . MB 8 164.696 148.553 184.341 1 72.29 ? O7 NAG 702 D 1 # _model_server_stats.io_time_ms 32 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 27 _model_server_stats.query_time_ms 308 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 14 #