data_7MGZ
#
_model_server_result.job_id            9tPJOpGDV7cB2wO2RbUFBw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-18 16:25:33' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7mgz 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"M","auth_seq_id":604}' 
#
_entry.id    7MGZ 
#
_exptl.entry_id    7MGZ 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              506.196 
_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 5 H N N 
? 5 M N N 
? 5 S N N 
? 5 X N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD2 ASP 70 F ASP 70 1_555 G MG MG . F MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? 
metalc ? metalc2 A OE2 GLU 146 F GLU 146 1_555 G MG MG . F MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? 
metalc ? metalc3 E O2A UTP . F UTP 601 1_555 O MG MG . P MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.464 ? 
metalc ? metalc4 E O2B UTP . F UTP 601 1_555 O MG MG . P MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.981 ? 
metalc ? metalc5 G MG MG . F MG 603 1_555 H O1G ANP . F ANP 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? 
metalc ? metalc6 G MG MG . F MG 603 1_555 H O2B ANP . F ANP 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? 
metalc ? metalc7 I MG MG . F MG 605 1_555 P O1B UTP . P UTP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.981 ? 
metalc ? metalc8 I MG MG . F MG 605 1_555 P O1A UTP . P UTP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? 
metalc ? metalc9 B OD2 ASP 70 O ASP 70 1_555 L MG MG . O MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? 
metalc ? metalc10 B OE2 GLU 146 O GLU 146 1_555 L MG MG . O MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? 
metalc ? metalc11 J O2A UTP . O UTP 601 1_555 T MG MG . Q MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.464 ? 
metalc ? metalc12 J O2B UTP . O UTP 601 1_555 T MG MG . Q MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.981 ? 
metalc ? metalc13 L MG MG . O MG 603 1_555 M O1G ANP . O ANP 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? 
metalc ? metalc14 L MG MG . O MG 603 1_555 M O2B ANP . O ANP 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? 
metalc ? metalc15 N MG MG . O MG 605 1_555 U O1B UTP . Q UTP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.981 ? 
metalc ? metalc16 N MG MG . O MG 605 1_555 U O1A UTP . Q UTP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.464 ? 
metalc ? metalc17 C OD2 ASP 70 P ASP 70 1_555 R MG MG . P MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? 
metalc ? metalc18 C OE2 GLU 146 P GLU 146 1_555 R MG MG . P MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? 
metalc ? metalc19 R MG MG . P MG 604 1_555 S O1G ANP . P ANP 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? 
metalc ? metalc20 R MG MG . P MG 604 1_555 S O2B ANP . P ANP 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? 
metalc ? metalc21 D OD2 ASP 70 Q ASP 70 1_555 W MG MG . Q MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? 
metalc ? metalc22 D OE2 GLU 146 Q GLU 146 1_555 W MG MG . Q MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? 
metalc ? metalc23 W MG MG . Q MG 604 1_555 X O1G ANP . Q ANP 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? 
metalc ? metalc24 W MG MG . Q MG 604 1_555 X O2B ANP . Q ANP 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H17 N6 O12 P3' 
_chem_comp.formula_weight    506.196 
_chem_comp.id                ANP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PG O1G ANP doub 13 n n 
PG O2G ANP sing 14 n n 
PG O3G ANP sing 15 n n 
PG N3B ANP sing 16 n n 
O2G HOG2 ANP sing 17 n n 
O3G HOG3 ANP sing 18 n n 
PB O1B ANP doub 19 n n 
PB O2B ANP sing 20 n n 
PB N3B ANP sing 21 n n 
PB O3A ANP sing 22 n n 
O2B HOB2 ANP sing 23 n n 
N3B HNB1 ANP sing 24 n n 
PA O1A ANP doub 25 n n 
PA O2A ANP sing 26 n n 
PA O3A ANP sing 27 n n 
PA O5' ANP sing 28 n n 
O2A HOA2 ANP sing 29 n n 
O5' C5' ANP sing 30 n n 
C5' C4' ANP sing 31 n n 
C5' "H5'1" ANP sing 32 n n 
C5' "H5'2" ANP sing 33 n n 
C4' O4' ANP sing 34 n n 
C4' C3' ANP sing 35 n n 
C4' H4' ANP sing 36 n n 
O4' C1' ANP sing 37 n n 
C3' O3' ANP sing 38 n n 
C3' C2' ANP sing 39 n n 
C3' H3' ANP sing 40 n n 
O3' HO3' ANP sing 41 n n 
C2' O2' ANP sing 42 n n 
C2' C1' ANP sing 43 n n 
C2' H2' ANP sing 44 n n 
O2' HO2' ANP sing 45 n n 
C1' N9 ANP sing 46 n n 
C1' H1' ANP sing 47 n n 
N9 C8 ANP sing 48 n y 
N9 C4 ANP sing 49 n y 
C8 N7 ANP doub 50 n y 
C8 H8 ANP sing 51 n n 
N7 C5 ANP sing 52 n y 
C5 C6 ANP sing 53 n y 
C5 C4 ANP doub 54 n y 
C6 N6 ANP sing 55 n n 
C6 N1 ANP doub 56 n y 
N6 HN61 ANP sing 57 n n 
N6 HN62 ANP sing 58 n n 
N1 C2 ANP sing 59 n y 
C2 N3 ANP doub 60 n y 
C2 H2 ANP sing 61 n n 
N3 C4 ANP sing 62 n y 
#
_atom_sites.entry_id                     7MGZ 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 UTP F 1 601 602 UTP UTP . 
F 3 GLN F 1 602 611 GLN GLN . 
G 4 MG F 1 603 2 MG MG . 
H 5 ANP F 1 604 1 ANP ANP . 
I 4 MG F 1 605 3 MG MG . 
J 2 UTP O 1 601 602 UTP UTP . 
K 3 GLN O 1 602 611 GLN GLN . 
L 4 MG O 1 603 2 MG MG . 
M 5 ANP O 1 604 1 ANP ANP . 
N 4 MG O 1 605 3 MG MG . 
O 4 MG P 1 601 3 MG MG . 
P 2 UTP P 1 602 602 UTP UTP . 
Q 3 GLN P 1 603 611 GLN GLN . 
R 4 MG P 1 604 2 MG MG . 
S 5 ANP P 1 605 1 ANP ANP . 
T 4 MG Q 1 601 3 MG MG . 
U 2 UTP Q 1 602 602 UTP UTP . 
V 3 GLN Q 1 603 611 GLN GLN . 
W 4 MG Q 1 604 2 MG MG . 
X 5 ANP Q 1 605 1 ANP ANP . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 P PG ANP . . . M 5 176.433 172.522 152.528 1 10 ? PG ANP 604 O 1 
HETATM 2 O O1G ANP . . . M 5 176.698 173.784 151.781 1 10 ? O1G ANP 604 O 1 
HETATM 3 O O2G ANP . . . M 5 176.639 172.739 153.979 1 10 ? O2G ANP 604 O 1 
HETATM 4 O O3G ANP . . . M 5 175.159 171.806 152.158 1 10 ? O3G ANP 604 O 1 
HETATM 5 P PB ANP . . . M 5 178.439 170.682 150.761 1 10 ? PB ANP 604 O 1 
HETATM 6 O O1B ANP . . . M 5 177.801 169.363 151.025 1 10 ? O1B ANP 604 O 1 
HETATM 7 O O2B ANP . . . M 5 178.316 171.097 149.347 1 10 ? O2B ANP 604 O 1 
HETATM 8 N N3B ANP . . . M 5 177.872 171.648 152.142 1 10 ? N3B ANP 604 O 1 
HETATM 9 P PA ANP . . . M 5 180.946 171.341 149.835 1 10 ? PA ANP 604 O 1 
HETATM 10 O O1A ANP . . . M 5 180.667 171.256 148.383 1 10 ? O1A ANP 604 O 1 
HETATM 11 O O2A ANP . . . M 5 181.162 172.687 150.457 1 10 ? O2A ANP 604 O 1 
HETATM 12 O O3A ANP . . . M 5 180.013 170.463 150.799 1 10 ? O3A ANP 604 O 1 
HETATM 13 O O5' ANP . . . M 5 182.272 170.477 149.949 1 10 ? O5' ANP 604 O 1 
HETATM 14 C C5' ANP . . . M 5 182.776 169.965 151.18 1 10 ? C5' ANP 604 O 1 
HETATM 15 C C4' ANP . . . M 5 184.287 170.118 151.175 1 10 ? C4' ANP 604 O 1 
HETATM 16 O O4' ANP . . . M 5 184.9 169.041 150.476 1 10 ? O4' ANP 604 O 1 
HETATM 17 C C3' ANP . . . M 5 184.699 171.366 150.44 1 10 ? C3' ANP 604 O 1 
HETATM 18 O O3' ANP . . . M 5 185.746 172.029 151.145 1 10 ? O3' ANP 604 O 1 
HETATM 19 C C2' ANP . . . M 5 185.16 170.853 149.104 1 10 ? C2' ANP 604 O 1 
HETATM 20 O O2' ANP . . . M 5 186.106 171.748 148.522 1 10 ? O2' ANP 604 O 1 
HETATM 21 C C1' ANP . . . M 5 185.75 169.496 149.425 1 10 ? C1' ANP 604 O 1 
HETATM 22 N N9 ANP . . . M 5 185.642 168.443 148.399 1 10 ? N9 ANP 604 O 1 
HETATM 23 C C8 ANP . . . M 5 184.637 168.341 147.555 1 10 ? C8 ANP 604 O 1 
HETATM 24 N N7 ANP . . . M 5 184.73 167.271 146.757 1 10 ? N7 ANP 604 O 1 
HETATM 25 C C5 ANP . . . M 5 185.844 166.654 147.108 1 10 ? C5 ANP 604 O 1 
HETATM 26 C C6 ANP . . . M 5 186.528 165.464 146.653 1 10 ? C6 ANP 604 O 1 
HETATM 27 N N6 ANP . . . M 5 185.982 164.765 145.66 1 10 ? N6 ANP 604 O 1 
HETATM 28 N N1 ANP . . . M 5 187.669 165.125 147.258 1 10 ? N1 ANP 604 O 1 
HETATM 29 C C2 ANP . . . M 5 188.174 165.844 148.26 1 10 ? C2 ANP 604 O 1 
HETATM 30 N N3 ANP . . . M 5 187.599 166.957 148.723 1 10 ? N3 ANP 604 O 1 
HETATM 31 C C4 ANP . . . M 5 186.443 167.412 148.199 1 10 ? C4 ANP 604 O 1 
HETATM 32 H HNB1 ANP . . . M 5 178.548 171.824 152.856 1 10 ? HNB1 ANP 604 O 1 
HETATM 33 H "H5'1" ANP . . . M 5 182.348 170.514 152.02 1 10 ? "H5'1" ANP 604 O 1 
HETATM 34 H "H5'2" ANP . . . M 5 182.508 168.911 151.282 1 10 ? "H5'2" ANP 604 O 1 
HETATM 35 H H4' ANP . . . M 5 184.654 170.166 152.21 1 10 ? H4' ANP 604 O 1 
HETATM 36 H H3' ANP . . . M 5 183.829 172.026 150.306 1 10 ? H3' ANP 604 O 1 
HETATM 37 H HO3' ANP . . . M 5 186.02 171.489 151.899 1 10 ? HO3' ANP 604 O 1 
HETATM 38 H H2' ANP . . . M 5 184.269 170.723 148.48 1 10 ? H2' ANP 604 O 1 
HETATM 39 H HO2' ANP . . . M 5 186.841 171.886 149.135 1 10 ? HO2' ANP 604 O 1 
HETATM 40 H H1' ANP . . . M 5 186.786 169.605 149.776 1 10 ? H1' ANP 604 O 1 
HETATM 41 H H8 ANP . . . M 5 183.854 169.057 147.502 1 10 ? H8 ANP 604 O 1 
HETATM 42 H HN61 ANP . . . M 5 185.121 165.078 145.235 1 10 ? HN61 ANP 604 O 1 
HETATM 43 H HN62 ANP . . . M 5 186.439 163.931 145.318 1 10 ? HN62 ANP 604 O 1 
HETATM 44 H H2 ANP . . . M 5 189.101 165.515 148.716 1 10 ? H2 ANP 604 O 1 
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