data_7MH0
#
_model_server_result.job_id            A0Uueorf_PkZ7KqDQtmjug 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-18 16:25:14' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7mh0 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"T","auth_seq_id":604}' 
#
_entry.id    7MH0 
#
_exptl.entry_id    7MH0 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              483.156 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 E N N 
? 2 G N N 
? 2 J N N 
? 2 L N N 
? 2 M N N 
? 2 O N N 
? 2 R N N 
? 2 T N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD2 ASP 70 A ASP 70 1_555 F MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? 
metalc ? metalc2 E O1A CTP . A CTP 601 1_555 F MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.603 ? 
metalc ? metalc3 E O2G CTP . A CTP 601 1_555 F MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? 
metalc ? metalc4 G O1A CTP . A CTP 603 1_555 I MG MG . B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? 
metalc ? metalc5 G O2B CTP . A CTP 603 1_555 I MG MG . B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? 
metalc ? metalc6 G O3G CTP . A CTP 603 1_555 I MG MG . B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? 
metalc ? metalc7 H MG MG . A MG 604 1_555 L O2A CTP . B CTP 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? 
metalc ? metalc8 H MG MG . A MG 604 1_555 L O1B CTP . B CTP 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? 
metalc ? metalc9 H MG MG . A MG 604 1_555 L O1G CTP . B CTP 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? 
metalc ? metalc10 B OD2 ASP 70 B ASP 70 1_555 K MG MG . B MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? 
metalc ? metalc11 J O2A CTP . B CTP 602 1_555 K MG MG . B MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.602 ? 
metalc ? metalc12 J O1G CTP . B CTP 602 1_555 K MG MG . B MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? 
metalc ? metalc13 C OD2 ASP 70 C ASP 70 1_555 N MG MG . C MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? 
metalc ? metalc14 M O2A CTP . C CTP 601 1_555 N MG MG . C MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.603 ? 
metalc ? metalc15 M O1G CTP . C CTP 601 1_555 N MG MG . C MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? 
metalc ? metalc16 O O2A CTP . C CTP 603 1_555 Q MG MG . D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? 
metalc ? metalc17 O O1B CTP . C CTP 603 1_555 Q MG MG . D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? 
metalc ? metalc18 O O1G CTP . C CTP 603 1_555 Q MG MG . D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.164 ? 
metalc ? metalc19 P MG MG . C MG 604 1_555 T O2B CTP . D CTP 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? 
metalc ? metalc20 P MG MG . C MG 604 1_555 T O3G CTP . D CTP 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? 
metalc ? metalc21 P MG MG . C MG 604 1_555 T O1A CTP . D CTP 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? 
metalc ? metalc22 D OD2 ASP 70 D ASP 70 1_555 S MG MG . D MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? 
metalc ? metalc23 R O1A CTP . D CTP 602 1_555 S MG MG . D MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.602 ? 
metalc ? metalc24 R O2G CTP . D CTP 602 1_555 S MG MG . D MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? 
#
_chem_comp.formula           'C9 H16 N3 O14 P3' 
_chem_comp.formula_weight    483.156 
_chem_comp.id                CTP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              "CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
N1 C2 CTP sing 70 n n 
N1 C6 CTP sing 71 n n 
N1 C1' CTP sing 72 n n 
C2 N3 CTP sing 73 n n 
C2 O2 CTP doub 74 n n 
N3 C4 CTP doub 75 n n 
C4 C5 CTP sing 76 n n 
C4 N4 CTP sing 77 n n 
C5 C6 CTP doub 78 n n 
C5 H5 CTP sing 79 n n 
C6 H6 CTP sing 80 n n 
N4 HN41 CTP sing 81 n n 
N4 HN42 CTP sing 82 n n 
C1' C2' CTP sing 83 n n 
C1' O4' CTP sing 84 n n 
C1' H1' CTP sing 85 n n 
C2' O2' CTP sing 86 n n 
C2' C3' CTP sing 87 n n 
C2' H2' CTP sing 88 n n 
O2' HO2' CTP sing 89 n n 
C3' C4' CTP sing 90 n n 
C3' O3' CTP sing 91 n n 
C3' H3' CTP sing 92 n n 
C4' O4' CTP sing 93 n n 
C4' C5' CTP sing 94 n n 
C4' H4' CTP sing 95 n n 
O3' HO3' CTP sing 96 n n 
C5' O5' CTP sing 97 n n 
C5' "H5'1" CTP sing 98 n n 
C5' "H5'2" CTP sing 99 n n 
O5' PA CTP sing 100 n n 
PA O1A CTP doub 101 n n 
PA O2A CTP sing 102 n n 
PA O3A CTP sing 103 n n 
O2A HOA2 CTP sing 104 n n 
O3A PB CTP sing 105 n n 
PB O1B CTP doub 106 n n 
PB O2B CTP sing 107 n n 
PB O3B CTP sing 108 n n 
O2B HOB2 CTP sing 109 n n 
O3B PG CTP sing 110 n n 
PG O1G CTP doub 111 n n 
PG O2G CTP sing 112 n n 
PG O3G CTP sing 113 n n 
O2G HOG2 CTP sing 114 n n 
O3G HOG3 CTP sing 115 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7MH0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 CTP A 1 601 602 CTP CTP . 
F 3 MG A 1 602 2 MG MG . 
G 2 CTP A 1 603 601 CTP CTP . 
H 3 MG A 1 604 3 MG MG . 
I 3 MG B 1 601 3 MG MG . 
J 2 CTP B 1 602 602 CTP CTP . 
K 3 MG B 1 603 2 MG MG . 
L 2 CTP B 1 604 601 CTP CTP . 
M 2 CTP C 1 601 602 CTP CTP . 
N 3 MG C 1 602 2 MG MG . 
O 2 CTP C 1 603 601 CTP CTP . 
P 3 MG C 1 604 3 MG MG . 
Q 3 MG D 1 601 3 MG MG . 
R 2 CTP D 1 602 602 CTP CTP . 
S 3 MG D 1 603 2 MG MG . 
T 2 CTP D 1 604 601 CTP CTP . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 N N1 CTP . . . T 2 183.4 160.43 170.926 1 0 ? N1 CTP 604 D 1 
HETATM 2 C C2 CTP . . . T 2 182.153 160.679 171.552 1 0 ? C2 CTP 604 D 1 
HETATM 3 N N3 CTP . . . T 2 181.319 161.616 171.036 1 0 ? N3 CTP 604 D 1 
HETATM 4 C C4 CTP . . . T 2 181.683 162.318 169.957 1 0 ? C4 CTP 604 D 1 
HETATM 5 C C5 CTP . . . T 2 182.915 162.098 169.318 1 0 ? C5 CTP 604 D 1 
HETATM 6 C C6 CTP . . . T 2 183.774 161.129 169.824 1 0 ? C6 CTP 604 D 1 
HETATM 7 O O2 CTP . . . T 2 181.778 160.044 172.572 1 0 ? O2 CTP 604 D 1 
HETATM 8 N N4 CTP . . . T 2 180.77 163.238 169.537 1 0 ? N4 CTP 604 D 1 
HETATM 9 C C1' CTP . . . T 2 184.256 159.43 171.509 1 0 ? C1' CTP 604 D 1 
HETATM 10 C C2' CTP . . . T 2 184.442 158.129 170.753 1 0 ? C2' CTP 604 D 1 
HETATM 11 O O2' CTP . . . T 2 183.424 157.214 171.182 1 0 ? O2' CTP 604 D 1 
HETATM 12 C C3' CTP . . . T 2 185.843 157.721 171.18 1 0 ? C3' CTP 604 D 1 
HETATM 13 C C4' CTP . . . T 2 186.423 158.922 171.914 1 0 ? C4' CTP 604 D 1 
HETATM 14 O O4' CTP . . . T 2 185.552 159.971 171.516 1 0 ? O4' CTP 604 D 1 
HETATM 15 O O3' CTP . . . T 2 185.782 156.634 172.091 1 0 ? O3' CTP 604 D 1 
HETATM 16 C C5' CTP . . . T 2 187.852 159.301 171.523 1 0 ? C5' CTP 604 D 1 
HETATM 17 O O5' CTP . . . T 2 188.332 160.263 172.449 1 0 ? O5' CTP 604 D 1 
HETATM 18 P PA CTP . . . T 2 189.387 161.388 172.072 1 0 ? PA CTP 604 D 1 
HETATM 19 O O1A CTP . . . T 2 190.644 160.808 171.534 1 0 ? O1A CTP 604 D 1 
HETATM 20 O O2A CTP . . . T 2 189.401 162.286 173.303 1 0 ? O2A CTP 604 D 1 
HETATM 21 O O3A CTP . . . T 2 188.586 162.058 170.82 1 0 ? O3A CTP 604 D 1 
HETATM 22 P PB CTP . . . T 2 189.175 162.244 169.335 1 0 ? PB CTP 604 D 1 
HETATM 23 O O1B CTP . . . T 2 187.953 162.321 168.514 1 0 ? O1B CTP 604 D 1 
HETATM 24 O O2B CTP . . . T 2 190.267 161.293 169.041 1 0 ? O2B CTP 604 D 1 
HETATM 25 O O3B CTP . . . T 2 189.748 163.738 169.301 1 0 ? O3B CTP 604 D 1 
HETATM 26 P PG CTP . . . T 2 191.259 164.196 169.622 1 0 ? PG CTP 604 D 1 
HETATM 27 O O1G CTP . . . T 2 191.87 164.422 168.236 1 0 ? O1G CTP 604 D 1 
HETATM 28 O O2G CTP . . . T 2 191.071 165.48 170.389 1 0 ? O2G CTP 604 D 1 
HETATM 29 O O3G CTP . . . T 2 191.704 163.017 170.408 1 0 ? O3G CTP 604 D 1 
HETATM 30 H H5 CTP . . . T 2 183.192 162.677 168.447 1 0 ? H5 CTP 604 D 1 
HETATM 31 H H6 CTP . . . T 2 184.725 160.933 169.349 1 0 ? H6 CTP 604 D 1 
HETATM 32 H HN41 CTP . . . T 2 179.899 163.348 170.037 1 0 ? HN41 CTP 604 D 1 
HETATM 33 H HN42 CTP . . . T 2 180.964 163.809 168.727 1 0 ? HN42 CTP 604 D 1 
HETATM 34 H H1' CTP . . . T 2 183.938 159.22 172.529 1 0 ? H1' CTP 604 D 1 
HETATM 35 H H2' CTP . . . T 2 184.394 158.292 169.675 1 0 ? H2' CTP 604 D 1 
HETATM 36 H HO2' CTP . . . T 2 183.768 156.662 171.888 1 0 ? HO2' CTP 604 D 1 
HETATM 37 H H3' CTP . . . T 2 186.452 157.466 170.313 1 0 ? H3' CTP 604 D 1 
HETATM 38 H H4' CTP . . . T 2 186.358 158.768 172.993 1 0 ? H4' CTP 604 D 1 
HETATM 39 H HO3' CTP . . . T 2 185.845 156.967 172.989 1 0 ? HO3' CTP 604 D 1 
HETATM 40 H "H5'1" CTP . . . T 2 188.489 158.415 171.549 1 0 ? "H5'1" CTP 604 D 1 
HETATM 41 H "H5'2" CTP . . . T 2 187.858 159.725 170.519 1 0 ? "H5'2" CTP 604 D 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              15 
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_model_server_stats.encode_time_ms          4 
_model_server_stats.element_count           41 
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