data_7MLJ # _model_server_result.job_id Ggu-v6Ic5_fa9pNlSa8PqA _model_server_result.datetime_utc '2025-01-06 22:05:19' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7mlj # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"O","auth_seq_id":2004}' # _entry.id 7MLJ # _exptl.entry_id 7MLJ _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 9 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 98.116 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7MLJ _cell.length_a 186.309 _cell.length_b 104.656 _cell.length_c 298.413 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7MLJ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall 'C 2y' _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 9 J N N ? 9 K N N ? 9 N N N ? 9 O N N ? 9 P N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 B OD1 ASP 183 B ASP 183 1_555 J MG MG . B MG 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? metalc ? metalc2 B OD1 ASP 193 B ASP 193 1_555 J MG MG . B MG 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.504 ? metalc ? metalc3 K MG MG . B MG 2002 1_555 D O LYS 840 D LYS 840 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? metalc ? metalc4 D SG CYS 58 D CYS 58 1_555 M ZN ZN . D ZN 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc5 D SG CYS 60 D CYS 60 1_555 M ZN ZN . D ZN 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc6 D SG CYS 73 D CYS 73 1_555 M ZN ZN . D ZN 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc7 D SG CYS 76 D CYS 76 1_555 M ZN ZN . D ZN 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc8 D OD1 ASP 739 D ASP 739 1_555 N MG MG . D MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.986 ? metalc ? metalc9 D OD1 ASP 741 D ASP 741 1_555 N MG MG . D MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.691 ? metalc ? metalc10 D OD1 ASP 743 D ASP 743 1_555 N MG MG . D MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? metalc ? metalc11 D OD2 ASP 743 D ASP 743 1_555 N MG MG . D MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.831 ? metalc ? metalc12 D O TRP 897 D TRP 897 1_555 O MG MG . D MG 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.808 ? metalc ? metalc13 D O ILE 900 D ILE 900 1_555 O MG MG . D MG 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.836 ? metalc ? metalc14 D SG CYS 1112 D CYS 1112 1_555 L ZN ZN . D ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc15 D SG CYS 1194 D CYS 1194 1_555 L ZN ZN . D ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc16 D SG CYS 1201 D CYS 1201 1_555 L ZN ZN . D ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc17 D SG CYS 1204 D CYS 1204 1_555 L ZN ZN . D ZN 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc18 N MG MG . D MG 2003 1_555 H O3' G 4 I G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.988 ? metalc ? metalc19 F O ALA 312 F ALA 292 1_555 P MG MG . F MG 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.592 ? metalc ? metalc20 F O GLY 316 F GLY 296 1_555 P MG MG . F MG 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? metalc ? metalc21 F O TRP 319 F TRP 299 1_555 P MG MG . F MG 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 G N3 DC 5 G DC 6 1_555 I N1 DG 23 H DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 G N4 DC 5 G DC 6 1_555 I O6 DG 23 H DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 G O2 DC 5 G DC 6 1_555 I N2 DG 23 H DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 G N1 DA 6 G DA 7 1_555 I N3 DT 22 H DT 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 G N6 DA 6 G DA 7 1_555 I O4 DT 22 H DT 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DT-DG MISPAIR' hydrog6 G N3 DT 7 G DT 8 1_555 I O6 DG 20 H DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DT-DA PAIR' hydrog7 G N3 DT 7 G DT 8 1_555 I N1 DA 21 H DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 G N3 DC 8 G DC 9 1_555 I N1 DG 20 H DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 G N4 DC 8 G DC 9 1_555 I O6 DG 20 H DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 G O2 DC 8 G DC 9 1_555 I N2 DG 20 H DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog11 G O2 DC 9 G DC 10 1_555 I N2 DG 19 H DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 G N1 DG 10 G DG 11 1_555 I N3 DC 18 H DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 G N2 DG 10 G DG 11 1_555 I O2 DC 18 H DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 G O6 DG 10 G DG 11 1_555 I N4 DC 18 H DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 G N3 DT 11 G DT 12 1_555 I N1 DA 17 H DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 G O4 DT 11 G DT 12 1_555 I N6 DA 17 H DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 G N1 DG 12 G DG 13 1_555 I N3 DC 16 H DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 G N2 DG 12 G DG 13 1_555 I O2 DC 16 H DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 G O6 DG 12 G DG 13 1_555 I N4 DC 16 H DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 G N3 DC 14 G DC 15 1_555 H N1 G 4 I G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 G N4 DC 14 G DC 15 1_555 H O6 G 4 I G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 G O2 DC 14 G DC 15 1_555 H N2 G 4 I G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 G N3 DC 15 G DC 16 1_555 H N1 G 3 I G 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 G N4 DC 15 G DC 16 1_555 H O6 G 3 I G 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 G O2 DC 15 G DC 16 1_555 H N2 G 3 I G 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog26 G N3 DT 16 G DT 17 1_555 H O6 G 2 I G 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog27 G O2 DT 16 G DT 17 1_555 H N1 G 2 I G 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-G MISPAIR' hydrog28 G N2 DG 17 G DG 18 1_555 H O6 G 1 I G 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7MLJ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.005367 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000765 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009555 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.003385 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code J 9 MG B 1 2001 2001 MG MG . K 9 MG B 1 2002 2004 MG MG . L 10 ZN D 1 2001 2001 ZN ZN . M 10 ZN D 1 2002 2002 ZN ZN . N 9 MG D 1 2003 2003 MG MG . O 9 MG D 1 2004 2005 MG MG . P 9 MG F 1 2001 2001 MG MG . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id O _atom_site.label_entity_id 9 _atom_site.Cartn_x -33.791 _atom_site.Cartn_y 11.409 _atom_site.Cartn_z 103.698 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 149.42 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 2004 _atom_site.auth_asym_id D _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 38 _model_server_stats.parse_time_ms 21 _model_server_stats.create_model_time_ms 81 _model_server_stats.query_time_ms 530 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #