data_7N1Y # _model_server_result.job_id sa3hfD01bcgY5Ci83exJtQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 08:38:35' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7n1y # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"GA","auth_seq_id":1405}' # _entry.id 7N1Y # _exptl.entry_id 7N1Y _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 32 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7N1Y _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7N1Y _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 CA N N ? 5 DA N N ? 5 EA N N ? 5 FA N N ? 5 GA N N ? 5 HA N N ? 5 IA N N ? 5 JA N N ? 5 KA N N ? 5 LA N N ? 5 MA N N ? 5 NA N N ? 5 OA N N ? 5 PA N N ? 5 QA N N ? 5 RA N N ? 5 SA N N ? 5 TA N N ? 5 UA N N ? 5 VA N N ? 5 WA N N ? 5 XA N N ? 5 YA N N ? 5 ZA N N ? 5 AB N N ? 5 BB N N ? 5 CB N N ? 5 DB N N ? 5 EB N N ? 5 FB N N ? 5 GB N N ? 5 HB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 2 oligosaccharide 3 oligosaccharide 4 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 2 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 3 3 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing 4 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 4 3 2 MAN NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 2 n D NAG 1 D 1 NAG A 2000 NAG 2 n D NAG 2 D 2 NAG A 2001 NAG 2 n E NAG 1 E 1 NAG A 2015 NAG 2 n E NAG 2 E 2 NAG A 2016 NAG 2 n F NAG 1 F 1 NAG A 2019 NAG 2 n F NAG 2 F 2 NAG A 2020 NAG 2 n G NAG 1 G 1 NAG A 2024 NAG 2 n G NAG 2 G 2 NAG A 2025 NAG 2 n H NAG 1 H 1 NAG A 2027 NAG 2 n H NAG 2 H 2 NAG A 2028 NAG 3 n I NAG 1 I 1 NAG A 2030 NAG 3 n I NAG 2 I 2 NAG A 2031 NAG 3 n I FUC 3 I 3 FUC A 2032 FUC 4 n J NAG 1 J 1 NAG A 2033 NAG 4 n J NAG 2 J 2 NAG A 2034 NAG 4 n J MAN 3 J 3 MAN A 2035 MAN 4 n K NAG 1 K 1 NAG A 2036 NAG 4 n K NAG 2 K 2 NAG A 2037 NAG 4 n K MAN 3 K 3 MAN A 2038 MAN 2 n L NAG 1 L 1 NAG B 2000 NAG 2 n L NAG 2 L 2 NAG B 2001 NAG 2 n M NAG 1 M 1 NAG B 2003 NAG 2 n M NAG 2 M 2 NAG B 2004 NAG 2 n N NAG 1 N 1 NAG B 2012 NAG 2 n N NAG 2 N 2 NAG B 2013 NAG 2 n O NAG 1 O 1 NAG B 2019 NAG 2 n O NAG 2 O 2 NAG B 2020 NAG 2 n P NAG 1 P 1 NAG B 2024 NAG 2 n P NAG 2 P 2 NAG B 2025 NAG 2 n Q NAG 1 Q 1 NAG B 2027 NAG 2 n Q NAG 2 Q 2 NAG B 2028 NAG 3 n R NAG 1 R 1 NAG B 2030 NAG 3 n R NAG 2 R 2 NAG B 2031 NAG 3 n R FUC 3 R 3 FUC B 2032 FUC 4 n S NAG 1 S 1 NAG B 2033 NAG 4 n S NAG 2 S 2 NAG B 2034 NAG 4 n S MAN 3 S 3 MAN B 2035 MAN 4 n T NAG 1 T 1 NAG B 2036 NAG 4 n T NAG 2 T 2 NAG B 2037 NAG 4 n T MAN 3 T 3 MAN B 2038 MAN 2 n U NAG 1 U 1 NAG C 2000 NAG 2 n U NAG 2 U 2 NAG C 2001 NAG 2 n V NAG 1 V 1 NAG C 2015 NAG 2 n V NAG 2 V 2 NAG C 2016 NAG 2 n W NAG 1 W 1 NAG C 2019 NAG 2 n W NAG 2 W 2 NAG C 2020 NAG 2 n X NAG 1 X 1 NAG C 2024 NAG 2 n X NAG 2 X 2 NAG C 2025 NAG 2 n Y NAG 1 Y 1 NAG C 2027 NAG 2 n Y NAG 2 Y 2 NAG C 2028 NAG 3 n Z NAG 1 Z 1 NAG C 2030 NAG 3 n Z NAG 2 Z 2 NAG C 2031 NAG 3 n Z FUC 3 Z 3 FUC C 2032 FUC 4 n AA NAG 1 a 1 NAG C 2033 NAG 4 n AA NAG 2 a 2 NAG C 2034 NAG 4 n AA MAN 3 a 3 MAN C 2035 MAN 4 n BA NAG 1 b 1 NAG C 2036 NAG 4 n BA NAG 2 b 2 NAG C 2037 NAG 4 n BA MAN 3 b 3 MAN C 2038 MAN # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 15 A CYS 15 1_555 A SG CYS 134 A CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 129 A CYS 131 1_555 A SG CYS 163 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 288 A CYS 291 1_555 A SG CYS 298 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 333 A CYS 336 1_555 A SG CYS 358 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 376 A CYS 379 1_555 A SG CYS 429 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 388 A CYS 391 1_555 A SG CYS 522 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 477 A CYS 480 1_555 A SG CYS 485 A CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 535 A CYS 538 1_555 A SG CYS 587 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 614 A CYS 617 1_555 A SG CYS 646 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.006 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 659 A CYS 662 1_555 A SG CYS 668 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.994 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 735 A CYS 738 1_555 A SG CYS 757 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 740 A CYS 743 1_555 A SG CYS 746 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 1029 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1040 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.006 ? disulf ? disulf14 A SG CYS 1079 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1123 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.002 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 15 B CYS 15 1_555 B SG CYS 134 B CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 129 B CYS 131 1_555 B SG CYS 163 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 288 B CYS 291 1_555 B SG CYS 298 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.998 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 333 B CYS 336 1_555 B SG CYS 358 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 376 B CYS 379 1_555 B SG CYS 429 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 388 B CYS 391 1_555 B SG CYS 522 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 477 B CYS 480 1_555 B SG CYS 485 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 535 B CYS 538 1_555 B SG CYS 587 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 614 B CYS 617 1_555 B SG CYS 646 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 659 B CYS 662 1_555 B SG CYS 668 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.992 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 735 B CYS 738 1_555 B SG CYS 757 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 740 B CYS 743 1_555 B SG CYS 746 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf27 B SG CYS 1029 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1040 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? disulf ? disulf28 B SG CYS 1079 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1123 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf29 C SG CYS 15 C CYS 15 1_555 C SG CYS 134 C CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf30 C SG CYS 129 C CYS 131 1_555 C SG CYS 163 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 288 C CYS 291 1_555 C SG CYS 298 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 333 C CYS 336 1_555 C SG CYS 358 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 376 C CYS 379 1_555 C SG CYS 429 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 388 C CYS 391 1_555 C SG CYS 522 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 477 C CYS 480 1_555 C SG CYS 485 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 535 C CYS 538 1_555 C SG CYS 587 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf37 C SG CYS 614 C CYS 617 1_555 C SG CYS 646 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf38 C SG CYS 659 C CYS 662 1_555 C SG CYS 668 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf39 C SG CYS 735 C CYS 738 1_555 C SG CYS 757 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? disulf ? disulf40 C SG CYS 740 C CYS 743 1_555 C SG CYS 746 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf41 C SG CYS 1029 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1040 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? disulf ? disulf42 C SG CYS 1079 C CYS 1082 1_555 C SG CYS 1123 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 17 A ASN 17 1_555 D C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 146 A ASN 149 1_555 EA C1 NAG . A NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 279 A ASN 282 1_555 HA C1 NAG . A NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 328 A ASN 331 1_555 E C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 654 A ASN 657 1_555 KA C1 NAG . A NAG 1409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 706 A ASN 709 1_555 LA C1 NAG . A NAG 1410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 714 A ASN 717 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 798 A ASN 801 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 1071 A ASN 1074 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 1131 A ASN 1134 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 1155 A ASN 1158 1_555 MA C1 NAG . A NAG 1411 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale12 B ND2 ASN 17 B ASN 17 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.565 ? covale ? covale13 B ND2 ASN 61 B ASN 61 1_555 NA C1 NAG . B NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 120 B ASN 122 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 162 B ASN 165 1_555 PA C1 NAG . B NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.389 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 231 B ASN 234 1_555 QA C1 NAG . B NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 279 B ASN 282 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 328 B ASN 331 1_555 RA C1 NAG . B NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 600 B ASN 603 1_555 TA C1 NAG . B NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 613 B ASN 616 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 654 B ASN 657 1_555 UA C1 NAG . B NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 714 B ASN 717 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 798 B ASN 801 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 1071 B ASN 1074 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 1095 B ASN 1098 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 1131 B ASN 1134 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale27 B ND2 ASN 1155 B ASN 1158 1_555 WA C1 NAG . B NAG 1410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? covale ? covale28 C ND2 ASN 17 C ASN 17 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.554 ? covale ? covale29 C ND2 ASN 146 C ASN 149 1_555 ZA C1 NAG . C NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.591 ? covale ? covale30 C ND2 ASN 279 C ASN 282 1_555 CB C1 NAG . C NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale31 C ND2 ASN 328 C ASN 331 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.479 ? covale ? covale32 C ND2 ASN 340 C ASN 343 1_555 DB C1 NAG . C NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 600 C ASN 603 1_555 EB C1 NAG . C NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 654 C ASN 657 1_555 FB C1 NAG . C NAG 1409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 714 C ASN 717 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 798 C ASN 801 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 1071 C ASN 1074 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 1095 C ASN 1098 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 1131 C ASN 1134 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 1155 C ASN 1158 1_555 HB C1 NAG . C NAG 1411 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale41 D O4 NAG . D NAG 1 1_555 D C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale42 E O4 NAG . E NAG 1 1_555 E C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? covale ? covale43 F O4 NAG . F NAG 1 1_555 F C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale44 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? covale ? covale45 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale46 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale47 I O6 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 FUC . I FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? covale ? covale48 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale49 J O4 NAG . J NAG 2 1_555 J C1 MAN . J MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? covale ? covale50 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale51 K O4 NAG . K NAG 2 1_555 K C1 MAN . K MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? covale ? covale52 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale53 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? covale ? covale54 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale55 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.479 ? covale ? covale56 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? covale ? covale57 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.483 ? covale ? covale58 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? covale ? covale59 R O6 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 FUC . R FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? covale ? covale60 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? covale ? covale61 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 MAN . S MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? covale ? covale62 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? covale ? covale63 T O4 NAG . T NAG 2 1_555 T C1 MAN . T MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? covale ? covale64 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale65 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? covale ? covale66 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale67 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale68 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? covale ? covale69 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.476 ? covale ? covale70 Z O6 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 FUC . Z FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? covale ? covale71 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? covale ? covale72 AA O4 NAG . a NAG 2 1_555 AA C1 MAN . a MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? covale ? covale73 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? covale ? covale74 BA O4 NAG . b NAG 2 1_555 BA C1 MAN . b MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 282 n n C1 O1 NAG sing 283 n n C1 O5 NAG sing 284 n n C1 H1 NAG sing 285 n n C2 C3 NAG sing 286 n n C2 N2 NAG sing 287 n n C2 H2 NAG sing 288 n n C3 C4 NAG sing 289 n n C3 O3 NAG sing 290 n n C3 H3 NAG sing 291 n n C4 C5 NAG sing 292 n n C4 O4 NAG sing 293 n n C4 H4 NAG sing 294 n n C5 C6 NAG sing 295 n n C5 O5 NAG sing 296 n n C5 H5 NAG sing 297 n n C6 O6 NAG sing 298 n n C6 H61 NAG sing 299 n n C6 H62 NAG sing 300 n n C7 C8 NAG sing 301 n n C7 N2 NAG sing 302 n n C7 O7 NAG doub 303 n n C8 H81 NAG sing 304 n n C8 H82 NAG sing 305 n n C8 H83 NAG sing 306 n n N2 HN2 NAG sing 307 n n O1 HO1 NAG sing 308 n n O3 HO3 NAG sing 309 n n O4 HO4 NAG sing 310 n n O6 HO6 NAG sing 311 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7N1Y _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code CA 5 NAG A 1 1401 2002 NAG NAG . DA 5 NAG A 1 1402 2003 NAG NAG . EA 5 NAG A 1 1403 2006 NAG NAG . FA 5 NAG A 1 1404 2007 NAG NAG . GA 5 NAG A 1 1405 2009 NAG NAG . HA 5 NAG A 1 1406 2012 NAG NAG . IA 5 NAG A 1 1407 2017 NAG NAG . JA 5 NAG A 1 1408 2018 NAG NAG . KA 5 NAG A 1 1409 2022 NAG NAG . LA 5 NAG A 1 1410 2023 NAG NAG . MA 5 NAG A 1 1411 2040 NAG NAG . NA 5 NAG B 1 1401 2002 NAG NAG . OA 5 NAG B 1 1402 2006 NAG NAG . PA 5 NAG B 1 1403 2007 NAG NAG . QA 5 NAG B 1 1404 2009 NAG NAG . RA 5 NAG B 1 1405 2015 NAG NAG . SA 5 NAG B 1 1406 2017 NAG NAG . TA 5 NAG B 1 1407 2018 NAG NAG . UA 5 NAG B 1 1408 2022 NAG NAG . VA 5 NAG B 1 1409 2023 NAG NAG . WA 5 NAG B 1 1410 2040 NAG NAG . XA 5 NAG C 1 1401 2002 NAG NAG . YA 5 NAG C 1 1402 2003 NAG NAG . ZA 5 NAG C 1 1403 2006 NAG NAG . AB 5 NAG C 1 1404 2007 NAG NAG . BB 5 NAG C 1 1405 2009 NAG NAG . CB 5 NAG C 1 1406 2012 NAG NAG . DB 5 NAG C 1 1407 2017 NAG NAG . EB 5 NAG C 1 1408 2018 NAG NAG . FB 5 NAG C 1 1409 2022 NAG NAG . GB 5 NAG C 1 1410 2023 NAG NAG . HB 5 NAG C 1 1411 2040 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . GA 5 193.529 227.181 165.491 1 129.65 ? C1 NAG 1405 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . GA 5 193.179 226.424 164.222 1 129.65 ? C2 NAG 1405 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . GA 5 193.339 224.93 164.451 1 129.65 ? C3 NAG 1405 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . GA 5 194.76 224.638 164.914 1 129.65 ? C4 NAG 1405 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . GA 5 195.114 225.5 166.129 1 129.65 ? C5 NAG 1405 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . GA 5 196.57 225.394 166.524 1 129.65 ? C6 NAG 1405 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . GA 5 191.439 226.548 162.504 1 129.65 ? C7 NAG 1405 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . GA 5 190.024 226.94 162.193 1 129.65 ? C8 NAG 1405 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . GA 5 191.837 226.74 163.765 1 129.65 ? N2 NAG 1405 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . GA 5 193.055 224.229 163.245 1 129.65 ? O3 NAG 1405 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . GA 5 194.896 223.263 165.253 1 129.65 ? O4 NAG 1405 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . GA 5 194.862 226.888 165.862 1 129.65 ? O5 NAG 1405 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . GA 5 197.285 226.585 166.223 1 129.65 ? O6 NAG 1405 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . GA 5 192.185 226.068 161.653 1 129.65 ? O7 NAG 1405 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 17 _model_server_stats.parse_time_ms 25 _model_server_stats.create_model_time_ms 29 _model_server_stats.query_time_ms 292 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 14 #