data_7N61
#
_model_server_result.job_id            4xC55mza4A9vvm0ji1C27Q 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-07-31 02:18:09' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          7n61 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"UF","auth_seq_id":501}' 
#
_entry.id    7N61 
#
_exptl.entry_id    7N61 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              523.18 
_entity.id                          21 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    52 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            7N61 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7N61 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    139-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      139 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF,BF,CF,DF,EF,FF,GF,HF,IF,JF,KF,LF,MF,NF,OF,PF,QF,RF,SF,TF,UF,VF,WF,XF,YF,ZF,AG,BG,CG,DG,EG,FG,GG,HG,IG,JG,KG,LG,MG,NG,OG,PG,QG,RG,SG,TG,UG,VG,WG,XG,YG,ZG,AH,BH,CH,DH,EH,FH,GH,HH,IH,JH,KH,LH,MH,NH,OH,PH,QH,RH,SH,TH,UH,VH,WH,XH,YH,ZH,AI,BI,CI,DI,EI,FI,GI,HI,II,JI,KI,LI,MI 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 21 OE N N 
? 21 QE N N 
? 21 SE N N 
? 21 UE N N 
? 21 WE N N 
? 21 YE N N 
? 21 AF N N 
? 21 CF N N 
? 21 EF N N 
? 21 GF N N 
? 21 IF N N 
? 21 KF N N 
? 21 MF N N 
? 21 OF N N 
? 21 QF N N 
? 21 SF N N 
? 21 UF N N 
? 21 WF N N 
? 21 YF N N 
? 21 AG N N 
? 21 CG N N 
? 21 EG N N 
? 21 GG N N 
? 21 IG N N 
? 21 KG N N 
? 21 MG N N 
? 21 OG N N 
? 21 QG N N 
? 21 SG N N 
? 21 UG N N 
? 21 WG N N 
? 21 YG N N 
? 21 AH N N 
? 21 CH N N 
? 21 EH N N 
? 21 GH N N 
? 21 IH N N 
? 21 KH N N 
? 21 MH N N 
? 21 OH N N 
? 21 QH N N 
? 21 SH N N 
? 21 UH N N 
? 21 WH N N 
? 21 YH N N 
? 21 AI N N 
? 21 CI N N 
? 21 EI N N 
? 21 GI N N 
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? 21 MI N N 
#
_chem_comp.formula           'C10 H16 N5 O14 P3' 
_chem_comp.formula_weight    523.18 
_chem_comp.id                GTP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PG O1G GTP doub 218 n n 
PG O2G GTP sing 219 n n 
PG O3G GTP sing 220 n n 
PG O3B GTP sing 221 n n 
O2G HOG2 GTP sing 222 n n 
O3G HOG3 GTP sing 223 n n 
O3B PB GTP sing 224 n n 
PB O1B GTP doub 225 n n 
PB O2B GTP sing 226 n n 
PB O3A GTP sing 227 n n 
O2B HOB2 GTP sing 228 n n 
O3A PA GTP sing 229 n n 
PA O1A GTP doub 230 n n 
PA O2A GTP sing 231 n n 
PA O5' GTP sing 232 n n 
O2A HOA2 GTP sing 233 n n 
O5' C5' GTP sing 234 n n 
C5' C4' GTP sing 235 n n 
C5' H5' GTP sing 236 n n 
C5' "H5''" GTP sing 237 n n 
C4' O4' GTP sing 238 n n 
C4' C3' GTP sing 239 n n 
C4' H4' GTP sing 240 n n 
O4' C1' GTP sing 241 n n 
C3' O3' GTP sing 242 n n 
C3' C2' GTP sing 243 n n 
C3' H3' GTP sing 244 n n 
O3' HO3' GTP sing 245 n n 
C2' O2' GTP sing 246 n n 
C2' C1' GTP sing 247 n n 
C2' H2' GTP sing 248 n n 
O2' HO2' GTP sing 249 n n 
C1' N9 GTP sing 250 n n 
C1' H1' GTP sing 251 n n 
N9 C8 GTP sing 252 n y 
N9 C4 GTP sing 253 n y 
C8 N7 GTP doub 254 n y 
C8 H8 GTP sing 255 n n 
N7 C5 GTP sing 256 n y 
C5 C6 GTP sing 257 n n 
C5 C4 GTP doub 258 n y 
C6 O6 GTP doub 259 n n 
C6 N1 GTP sing 260 n n 
N1 C2 GTP sing 261 n n 
N1 HN1 GTP sing 262 n n 
C2 N2 GTP sing 263 n n 
C2 N3 GTP doub 264 n n 
N2 HN21 GTP sing 265 n n 
N2 HN22 GTP sing 266 n n 
N3 C4 GTP sing 267 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7N61 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
JE 19 ADP 0X 1 801 501 ADP ADP . 
KE 19 ADP 0Y 1 801 501 ADP ADP . 
LE 19 ADP 0Z 1 801 501 ADP ADP . 
ME 19 ADP 1A 1 801 501 ADP ADP . 
NE 20 GDP 1a 1 501 501 GDP GDP . 
OE 21 GTP 1b 1 501 501 GTP GTP . 
PE 20 GDP 1c 1 501 501 GDP GDP . 
QE 21 GTP 1d 1 501 501 GTP GTP . 
RE 20 GDP 1e 1 501 501 GDP GDP . 
SE 21 GTP 1f 1 501 501 GTP GTP . 
TE 20 GDP 1g 1 501 501 GDP GDP . 
UE 21 GTP 1h 1 501 501 GTP GTP . 
VE 20 GDP 2a 1 501 501 GDP GDP . 
WE 21 GTP 2b 1 501 501 GTP GTP . 
XE 20 GDP 2c 1 501 501 GDP GDP . 
YE 21 GTP 2d 1 501 501 GTP GTP . 
ZE 20 GDP 2e 1 501 501 GDP GDP . 
AF 21 GTP 2f 1 501 501 GTP GTP . 
BF 20 GDP 2g 1 501 501 GDP GDP . 
CF 21 GTP 2h 1 501 501 GTP GTP . 
DF 20 GDP 3a 1 501 501 GDP GDP . 
EF 21 GTP 3b 1 501 501 GTP GTP . 
FF 20 GDP 3c 1 501 501 GDP GDP . 
GF 21 GTP 3d 1 501 501 GTP GTP . 
HF 20 GDP 3e 1 501 501 GDP GDP . 
IF 21 GTP 3f 1 501 501 GTP GTP . 
JF 20 GDP 3g 1 501 501 GDP GDP . 
KF 21 GTP 3h 1 501 501 GTP GTP . 
LF 20 GDP 4a 1 501 501 GDP GDP . 
MF 21 GTP 4b 1 501 501 GTP GTP . 
NF 20 GDP 4c 1 501 501 GDP GDP . 
OF 21 GTP 4d 1 501 501 GTP GTP . 
PF 20 GDP 4e 1 501 501 GDP GDP . 
QF 21 GTP 4f 1 501 501 GTP GTP . 
RF 20 GDP 4g 1 501 501 GDP GDP . 
SF 21 GTP 4h 1 501 501 GTP GTP . 
TF 20 GDP 5a 1 501 501 GDP GDP . 
UF 21 GTP 5b 1 501 501 GTP GTP . 
VF 20 GDP 5c 1 501 501 GDP GDP . 
WF 21 GTP 5d 1 501 501 GTP GTP . 
XF 20 GDP 5e 1 501 501 GDP GDP . 
YF 21 GTP 5f 1 501 501 GTP GTP . 
ZF 20 GDP 5g 1 501 501 GDP GDP . 
AG 21 GTP 5h 1 501 501 GTP GTP . 
BG 20 GDP 6a 1 501 501 GDP GDP . 
CG 21 GTP 6b 1 501 501 GTP GTP . 
DG 20 GDP 6c 1 501 501 GDP GDP . 
EG 21 GTP 6d 1 501 501 GTP GTP . 
FG 20 GDP 6e 1 501 501 GDP GDP . 
GG 21 GTP 6f 1 501 501 GTP GTP . 
HG 20 GDP 6g 1 501 501 GDP GDP . 
IG 21 GTP 6h 1 501 501 GTP GTP . 
JG 20 GDP 7a 1 501 501 GDP GDP . 
KG 21 GTP 7b 1 501 501 GTP GTP . 
LG 20 GDP 7c 1 501 501 GDP GDP . 
MG 21 GTP 7d 1 501 501 GTP GTP . 
NG 20 GDP 7e 1 501 501 GDP GDP . 
OG 21 GTP 7f 1 501 501 GTP GTP . 
PG 20 GDP 7g 1 501 501 GDP GDP . 
QG 21 GTP 7h 1 501 501 GTP GTP . 
RG 20 GDP 8a 1 501 501 GDP GDP . 
SG 21 GTP 8b 1 501 501 GTP GTP . 
TG 20 GDP 8c 1 501 501 GDP GDP . 
UG 21 GTP 8d 1 501 501 GTP GTP . 
VG 20 GDP 8e 1 501 501 GDP GDP . 
WG 21 GTP 8f 1 501 501 GTP GTP . 
XG 20 GDP 8g 1 501 501 GDP GDP . 
YG 21 GTP 8h 1 501 501 GTP GTP . 
ZG 20 GDP 9a 1 501 501 GDP GDP . 
AH 21 GTP 9b 1 501 501 GTP GTP . 
BH 20 GDP 9c 1 501 501 GDP GDP . 
CH 21 GTP 9d 1 501 501 GTP GTP . 
DH 20 GDP 9e 1 501 501 GDP GDP . 
EH 21 GTP 9f 1 501 501 GTP GTP . 
FH 20 GDP 9g 1 501 501 GDP GDP . 
GH 21 GTP 9h 1 501 501 GTP GTP . 
HH 20 GDP Aa 1 501 501 GDP GDP . 
IH 21 GTP Ab 1 501 501 GTP GTP . 
JH 20 GDP Ac 1 501 501 GDP GDP . 
KH 21 GTP Ad 1 501 501 GTP GTP . 
LH 20 GDP Ae 1 501 501 GDP GDP . 
MH 21 GTP Af 1 501 501 GTP GTP . 
NH 20 GDP Ag 1 501 501 GDP GDP . 
OH 21 GTP Ah 1 501 501 GTP GTP . 
PH 20 GDP Ba 1 501 501 GDP GDP . 
QH 21 GTP Bb 1 501 501 GTP GTP . 
RH 20 GDP Bc 1 501 501 GDP GDP . 
SH 21 GTP Bd 1 501 501 GTP GTP . 
TH 20 GDP Be 1 501 501 GDP GDP . 
UH 21 GTP Bf 1 501 501 GTP GTP . 
VH 20 GDP Bg 1 501 501 GDP GDP . 
WH 21 GTP Bh 1 501 501 GTP GTP . 
XH 20 GDP Ca 1 501 501 GDP GDP . 
YH 21 GTP Cb 1 501 501 GTP GTP . 
ZH 20 GDP Cc 1 501 501 GDP GDP . 
AI 21 GTP Cd 1 501 501 GTP GTP . 
BI 20 GDP Ce 1 501 501 GDP GDP . 
CI 21 GTP Cf 1 501 501 GTP GTP . 
DI 20 GDP Cg 1 501 501 GDP GDP . 
EI 21 GTP Ch 1 501 501 GTP GTP . 
FI 20 GDP Da 1 501 501 GDP GDP . 
GI 21 GTP Db 1 501 501 GTP GTP . 
HI 20 GDP Dc 1 501 501 GDP GDP . 
II 21 GTP Dd 1 501 501 GTP GTP . 
JI 20 GDP De 1 501 501 GDP GDP . 
KI 21 GTP Df 1 501 501 GTP GTP . 
LI 20 GDP Dg 1 501 501 GDP GDP . 
MI 21 GTP Dh 1 501 501 GTP GTP . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 P PG GTP . . . UF 21 294.802 513.435 410.1 1 132.53 ? PG GTP 501 5b 1 
HETATM 2 O O1G GTP . . . UF 21 294.292 513.105 408.721 1 132.53 ? O1G GTP 501 5b 1 
HETATM 3 O O2G GTP . . . UF 21 293.763 514.216 410.859 1 132.53 ? O2G GTP 501 5b 1 
HETATM 4 O O3G GTP . . . UF 21 295.121 512.169 410.854 1 132.53 ? O3G GTP 501 5b 1 
HETATM 5 O O3B GTP . . . UF 21 296.119 514.343 409.969 1 132.53 ? O3B GTP 501 5b 1 
HETATM 6 P PB GTP . . . UF 21 296.96 514.403 408.605 1 132.53 ? PB GTP 501 5b 1 
HETATM 7 O O1B GTP . . . UF 21 297.374 513.01 408.198 1 132.53 ? O1B GTP 501 5b 1 
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HETATM 10 P PA GTP . . . UF 21 295.12 516.366 407.882 1 132.53 ? PA GTP 501 5b 1 
HETATM 11 O O1A GTP . . . UF 21 296.083 517.329 408.523 1 132.53 ? O1A GTP 501 5b 1 
HETATM 12 O O2A GTP . . . UF 21 293.944 516.118 408.79 1 132.53 ? O2A GTP 501 5b 1 
HETATM 13 O O5' GTP . . . UF 21 294.635 516.974 406.472 1 132.53 ? O5' GTP 501 5b 1 
HETATM 14 C C5' GTP . . . UF 21 293.675 516.306 405.683 1 132.53 ? C5' GTP 501 5b 1 
HETATM 15 C C4' GTP . . . UF 21 293.158 517.243 404.593 1 132.53 ? C4' GTP 501 5b 1 
HETATM 16 O O4' GTP . . . UF 21 294.101 518.256 404.318 1 132.53 ? O4' GTP 501 5b 1 
HETATM 17 C C3' GTP . . . UF 21 292.912 516.532 403.275 1 132.53 ? C3' GTP 501 5b 1 
HETATM 18 O O3' GTP . . . UF 21 291.537 516.277 403.112 1 132.53 ? O3' GTP 501 5b 1 
HETATM 19 C C2' GTP . . . UF 21 293.388 517.497 402.207 1 132.53 ? C2' GTP 501 5b 1 
HETATM 20 O O2' GTP . . . UF 21 292.288 517.978 401.473 1 132.53 ? O2' GTP 501 5b 1 
HETATM 21 C C1' GTP . . . UF 21 294.055 518.637 402.957 1 132.53 ? C1' GTP 501 5b 1 
HETATM 22 N N9 GTP . . . UF 21 295.434 518.851 402.492 1 132.53 ? N9 GTP 501 5b 1 
HETATM 23 C C8 GTP . . . UF 21 296.529 518.112 402.847 1 132.53 ? C8 GTP 501 5b 1 
HETATM 24 N N7 GTP . . . UF 21 297.615 518.631 402.232 1 132.53 ? N7 GTP 501 5b 1 
HETATM 25 C C5 GTP . . . UF 21 297.23 519.698 401.502 1 132.53 ? C5 GTP 501 5b 1 
HETATM 26 C C6 GTP . . . UF 21 297.932 520.577 400.694 1 132.53 ? C6 GTP 501 5b 1 
HETATM 27 O O6 GTP . . . UF 21 299.142 520.451 400.549 1 132.53 ? O6 GTP 501 5b 1 
HETATM 28 N N1 GTP . . . UF 21 297.269 521.599 400.056 1 132.53 ? N1 GTP 501 5b 1 
HETATM 29 C C2 GTP . . . UF 21 295.909 521.738 400.224 1 132.53 ? C2 GTP 501 5b 1 
HETATM 30 N N2 GTP . . . UF 21 295.265 522.724 399.607 1 132.53 ? N2 GTP 501 5b 1 
HETATM 31 N N3 GTP . . . UF 21 295.214 520.859 401.03 1 132.53 ? N3 GTP 501 5b 1 
HETATM 32 C C4 GTP . . . UF 21 295.863 519.852 401.66 1 132.53 ? C4 GTP 501 5b 1 
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