data_7NVM # _model_server_result.job_id gXF3tXliwORHFmRGlrxWBg _model_server_result.datetime_utc '2025-03-04 14:47:53' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7nvm # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"RA","auth_seq_id":603}' # _entry.id 7NVM # _exptl.entry_id 7NVM _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 83.977 _entity.id 14 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ALUMINUM FLUORIDE' _entity.pdbx_number_of_molecules 16 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7NVM _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7NVM _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details eicosameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 20 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 14 W N N ? 14 Z N N ? 14 CA N N ? 14 FA N N ? 14 IA N N ? 14 LA N N ? 14 OA N N ? 14 RA N N ? 14 UA N N ? 14 XA N N ? 14 AB N N ? 14 DB N N ? 14 GB N N ? 14 JB N N ? 14 MB N N ? 14 PB N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 G SG CYS 22 N CYS 22 1_555 G SG CYS 95 N CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf2 P SG CYS 22 n CYS 22 1_555 P SG CYS 95 n CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASP 88 A ASP 88 1_555 V MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.967 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 88 A ASP 88 1_555 V MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.848 ? metalc ? metalc3 U O3A ADP . A ADP 601 1_555 V MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? metalc ? metalc4 B OD1 ASP 97 B ASP 97 1_555 Y MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.952 ? metalc ? metalc5 X O1A ADP . B ADP 601 1_555 Y MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.995 ? metalc ? metalc6 AA O1A ADP . D ADP 601 1_555 BA MG MG . D MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? metalc ? metalc7 D OD1 ASP 104 E ASP 104 1_555 EA MG MG . E MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc ? metalc8 D OD2 ASP 104 E ASP 104 1_555 EA MG MG . E MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.801 ? metalc ? metalc9 DA O1A ADP . E ADP 601 1_555 EA MG MG . E MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.747 ? metalc ? metalc10 DA O3A ADP . E ADP 601 1_555 EA MG MG . E MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? metalc ? metalc11 E OD1 ASP 93 G ASP 93 1_555 HA MG MG . G MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.977 ? metalc ? metalc12 E OD2 ASP 93 G ASP 93 1_555 HA MG MG . G MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.164 ? metalc ? metalc13 GA O3B ADP . G ADP 601 1_555 HA MG MG . G MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.76 ? metalc ? metalc14 GA O2A ADP . G ADP 601 1_555 HA MG MG . G MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.731 ? metalc ? metalc15 F OD1 ASP 92 H ASP 92 1_555 KA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? metalc ? metalc16 F OD2 ASP 92 H ASP 92 1_555 KA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? metalc ? metalc17 JA O1B ADP . H ADP 601 1_555 KA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.889 ? metalc ? metalc18 JA O3A ADP . H ADP 601 1_555 KA MG MG . H MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc19 H OD1 ASP 99 Q ASP 99 1_555 NA MG MG . Q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.92 ? metalc ? metalc20 H OD2 ASP 99 Q ASP 99 1_555 NA MG MG . Q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? metalc ? metalc21 MA O3B ADP . Q ADP 601 1_555 NA MG MG . Q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? metalc ? metalc22 MA O2A ADP . Q ADP 601 1_555 NA MG MG . Q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.37 ? metalc ? metalc23 I OD1 ASP 90 Z ASP 90 1_555 QA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.396 ? metalc ? metalc24 I OD2 ASP 90 Z ASP 90 1_555 QA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.009 ? metalc ? metalc25 PA O2A ADP . Z ADP 601 1_555 QA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? metalc ? metalc26 J OD1 ASP 88 a ASP 88 1_555 TA MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? metalc ? metalc27 J OD2 ASP 88 a ASP 88 1_555 TA MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.842 ? metalc ? metalc28 SA O3A ADP . a ADP 601 1_555 TA MG MG . a MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.762 ? metalc ? metalc29 K OD1 ASP 97 b ASP 97 1_555 WA MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.944 ? metalc ? metalc30 K OD2 ASP 97 b ASP 97 1_555 WA MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.928 ? metalc ? metalc31 VA O1A ADP . b ADP 601 1_555 WA MG MG . b MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.997 ? metalc ? metalc32 YA O2B ADP . d ADP 601 1_555 ZA MG MG . d MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.83 ? metalc ? metalc33 YA O1A ADP . d ADP 601 1_555 ZA MG MG . d MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.962 ? metalc ? metalc34 M OD1 ASP 104 e ASP 104 1_555 CB MG MG . e MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? metalc ? metalc35 BB O1A ADP . e ADP 601 1_555 CB MG MG . e MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? metalc ? metalc36 BB O3A ADP . e ADP 601 1_555 CB MG MG . e MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.121 ? metalc ? metalc37 N OD1 ASP 93 g ASP 93 1_555 FB MG MG . g MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.15 ? metalc ? metalc38 N OD2 ASP 93 g ASP 93 1_555 FB MG MG . g MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? metalc ? metalc39 EB O3B ADP . g ADP 601 1_555 FB MG MG . g MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.633 ? metalc ? metalc40 EB O2A ADP . g ADP 601 1_555 FB MG MG . g MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.828 ? metalc ? metalc41 O OD1 ASP 92 h ASP 92 1_555 IB MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? metalc ? metalc42 O OD2 ASP 92 h ASP 92 1_555 IB MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? metalc ? metalc43 HB O1B ADP . h ADP 601 1_555 IB MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.893 ? metalc ? metalc44 HB O1A ADP . h ADP 601 1_555 IB MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.973 ? metalc ? metalc45 HB O3A ADP . h ADP 601 1_555 IB MG MG . h MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.427 ? metalc ? metalc46 Q OD1 ASP 99 q ASP 99 1_555 LB MG MG . q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.927 ? metalc ? metalc47 Q OD2 ASP 99 q ASP 99 1_555 LB MG MG . q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.159 ? metalc ? metalc48 KB O3B ADP . q ADP 601 1_555 LB MG MG . q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? metalc ? metalc49 KB O2A ADP . q ADP 601 1_555 LB MG MG . q MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? metalc ? metalc50 R OD1 ASP 90 z ASP 90 1_555 OB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.576 ? metalc ? metalc51 R OD2 ASP 90 z ASP 90 1_555 OB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.132 ? metalc ? metalc52 NB O2A ADP . z ADP 601 1_555 OB MG MG . z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.147 ? # _chem_comp.formula 'Al F3' _chem_comp.formula_weight 83.977 _chem_comp.id AF3 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ALUMINUM FLUORIDE' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag AL F1 AF3 sing 45 n n AL F2 AF3 sing 46 n n AL F3 AF3 sing 47 n n # _atom_sites.entry_id 7NVM _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code U 12 ADP A 1 601 601 ADP ADP . V 13 MG A 1 602 602 MG MG . W 14 AF3 A 1 603 603 AF3 AF3 . X 12 ADP B 1 601 601 ADP ADP . Y 13 MG B 1 602 602 MG MG . Z 14 AF3 B 1 603 603 AF3 AF3 . AA 12 ADP D 1 601 601 ADP ADP . BA 13 MG D 1 602 602 MG MG . CA 14 AF3 D 1 603 603 AF3 AF3 . DA 12 ADP E 1 601 601 ADP ADP . EA 13 MG E 1 602 602 MG MG . FA 14 AF3 E 1 603 603 AF3 AF3 . GA 12 ADP G 1 601 601 ADP ADP . HA 13 MG G 1 602 602 MG MG . IA 14 AF3 G 1 603 603 AF3 AF3 . JA 12 ADP H 1 601 601 ADP ADP . KA 13 MG H 1 602 602 MG MG . LA 14 AF3 H 1 603 603 AF3 AF3 . MA 12 ADP Q 1 601 601 ADP ADP . NA 13 MG Q 1 602 602 MG MG . OA 14 AF3 Q 1 603 603 AF3 AF3 . PA 12 ADP Z 1 601 601 ADP ADP . QA 13 MG Z 1 602 602 MG MG . RA 14 AF3 Z 1 603 603 AF3 AF3 . SA 12 ADP a 1 601 601 ADP ADP . TA 13 MG a 1 602 602 MG MG . UA 14 AF3 a 1 603 603 AF3 AF3 . VA 12 ADP b 1 601 601 ADP ADP . WA 13 MG b 1 602 602 MG MG . XA 14 AF3 b 1 603 603 AF3 AF3 . YA 12 ADP d 1 601 601 ADP ADP . ZA 13 MG d 1 602 602 MG MG . AB 14 AF3 d 1 603 603 AF3 AF3 . BB 12 ADP e 1 601 601 ADP ADP . CB 13 MG e 1 602 602 MG MG . DB 14 AF3 e 1 603 603 AF3 AF3 . EB 12 ADP g 1 601 601 ADP ADP . FB 13 MG g 1 602 602 MG MG . GB 14 AF3 g 1 603 603 AF3 AF3 . HB 12 ADP h 1 601 601 ADP ADP . IB 13 MG h 1 602 602 MG MG . JB 14 AF3 h 1 603 603 AF3 AF3 . KB 12 ADP q 1 601 601 ADP ADP . LB 13 MG q 1 602 602 MG MG . MB 14 AF3 q 1 603 603 AF3 AF3 . NB 12 ADP z 1 601 601 ADP ADP . OB 13 MG z 1 602 602 MG MG . PB 14 AF3 z 1 603 603 AF3 AF3 . QB 15 HOH A 1 701 21 HOH HOH . QB 15 HOH A 2 702 5 HOH HOH . RB 15 HOH B 1 701 7 HOH HOH . RB 15 HOH B 2 702 6 HOH HOH . SB 15 HOH D 1 701 8 HOH HOH . TB 15 HOH E 1 701 9 HOH HOH . UB 15 HOH G 1 701 10 HOH HOH . VB 15 HOH H 1 701 11 HOH HOH . WB 15 HOH Q 1 701 4 HOH HOH . XB 15 HOH Z 1 701 12 HOH HOH . YB 15 HOH a 1 701 22 HOH HOH . YB 15 HOH a 2 702 20 HOH HOH . ZB 15 HOH b 1 701 13 HOH HOH . AC 15 HOH d 1 701 14 HOH HOH . BC 15 HOH e 1 701 15 HOH HOH . CC 15 HOH g 1 701 16 HOH HOH . DC 15 HOH h 1 701 17 HOH HOH . EC 15 HOH q 1 701 18 HOH HOH . FC 15 HOH z 1 701 19 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 AL AL AF3 . . . RA 14 200.4 188.258 263.14 1 55.66 ? AL AF3 603 Z 1 HETATM 2 F F1 AF3 . . . RA 14 199.168 189.299 262.873 1 58.18 ? F1 AF3 603 Z 1 HETATM 3 F F2 AF3 . . . RA 14 200.344 186.734 262.55 1 47.61 ? F2 AF3 603 Z 1 HETATM 4 F F3 AF3 . . . RA 14 201.756 188.772 263.89 1 62.59 ? F3 AF3 603 Z 1 # _model_server_stats.io_time_ms 30 _model_server_stats.parse_time_ms 13 _model_server_stats.create_model_time_ms 351 _model_server_stats.query_time_ms 277 _model_server_stats.encode_time_ms 7 _model_server_stats.element_count 4 #