data_7OGU # _model_server_result.job_id zREvOMwmDZj-O7Q-84VVag _model_server_result.datetime_utc '2024-11-15 23:53:47' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7ogu # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"SA","auth_seq_id":704}' # _entry.id 7OGU # _exptl.entry_id 7OGU _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 22.99 _entity.id 12 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'SODIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 96.744 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7OGU _cell.length_a 93.962 _cell.length_b 169.894 _cell.length_c 143.547 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7OGU _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? trimeric 3 author_defined_assembly 1 ? trimeric 3 author_defined_assembly 2 ? trimeric 3 author_defined_assembly 3 ? trimeric 3 author_defined_assembly 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,M,N,O,P,Q,R,S,T,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,KB,LB 1 1 D,E,F,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,WA,XA,YA,ZA,AB,MB,NB 2 1 G,H,I,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,BB,CB,DB,EB,OB 3 1 J,K,L,JA,KA,LA,MA,NA,OA,FB,GB,HB,IB,JB,PB 4 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 12 RA N N ? 12 SA N N ? 12 VA N N ? 12 YA N N ? 12 AB N N ? 12 CB N N ? 12 EB N N ? 12 JB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide 9 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 5 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 5 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 6 3 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing 7 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 8 ? 7 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 9 ? 8 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 10 ? 8 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 11 ? 8 4 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing 12 ? 9 2 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n M NAG 1 AaA 1 NAG AaA 607 NAG 4 n M NAG 2 AaA 2 NAG AbA 608 NAG 5 n N NAG 1 AcA 1 NAG AcA 609 NAG 5 n N NAG 2 AcA 2 NAG AdA 610 NAG 5 n N BMA 3 AcA 3 BMA AeA 611 BMA 5 n N MAN 4 AcA 4 MAN AgA 613 MAN 5 n O NAG 1 AhA 1 NAG AhA 614 NAG 5 n O NAG 2 AhA 2 NAG AiA 615 NAG 5 n O BMA 3 AhA 3 BMA AjA 616 BMA 5 n O MAN 4 AhA 4 MAN AkA 617 MAN 4 n P NAG 1 AlA 1 NAG AlA 618 NAG 4 n P NAG 2 AlA 2 NAG AmA 619 NAG 6 n Q NAG 1 AnA 1 NAG AnA 620 NAG 6 n Q NAG 2 AnA 2 NAG AoA 621 NAG 6 n Q FUC 3 AnA 3 FUC ApA 622 FUC 4 n R NAG 1 AqA 1 NAG AqA 623 NAG 4 n R NAG 2 AqA 2 NAG ArA 624 NAG 4 n S NAG 1 AsA 1 NAG AsA 625 NAG 4 n S NAG 2 AsA 2 NAG AtA 626 NAG 7 n T NAG 1 BaB 1 NAG BaB 212 NAG 7 n T NAG 2 BaB 2 NAG BbB 213 NAG 7 n T BMA 3 BaB 3 BMA BcB 214 BMA 7 n U NAG 1 DaD 1 NAG DaD 607 NAG 7 n U NAG 2 DaD 2 NAG DbD 608 NAG 7 n U BMA 3 DaD 3 BMA DcD 609 BMA 4 n V NAG 1 DeD 1 NAG DeD 614 NAG 4 n V NAG 2 DeD 2 NAG DfD 615 NAG 4 n W NAG 1 DgD 1 NAG DgD 616 NAG 4 n W NAG 2 DgD 2 NAG DhD 617 NAG 5 n X NAG 1 DiD 1 NAG DiD 618 NAG 5 n X NAG 2 DiD 2 NAG DjD 619 NAG 5 n X BMA 3 DiD 3 BMA DkD 620 BMA 5 n X MAN 4 DiD 4 MAN DlD 621 MAN 4 n Y NAG 1 DmD 1 NAG DmD 622 NAG 4 n Y NAG 2 DmD 2 NAG DnD 623 NAG 8 n Z NAG 1 DpD 1 NAG DpD 625 NAG 8 n Z NAG 2 DpD 2 NAG DqD 626 NAG 8 n Z BMA 3 DpD 3 BMA DsD 628 BMA 8 n Z FUC 4 DpD 4 FUC DrD 627 FUC 7 n AA NAG 1 EaE 1 NAG EaE 212 NAG 7 n AA NAG 2 EaE 2 NAG EbE 213 NAG 7 n AA BMA 3 EaE 3 BMA EcE 214 BMA 4 n BA NAG 1 EdE 1 NAG EdE 215 NAG 4 n BA NAG 2 EdE 2 NAG EeE 216 NAG 7 n CA NAG 1 GaG 1 NAG GaG 607 NAG 7 n CA NAG 2 GaG 2 NAG GbG 608 NAG 7 n CA BMA 3 GaG 3 BMA GcG 609 BMA 7 n DA NAG 1 GdG 1 NAG GdG 610 NAG 7 n DA NAG 2 GdG 2 NAG GeG 611 NAG 7 n DA BMA 3 GdG 3 BMA GfG 612 BMA 4 n EA NAG 1 GgG 1 NAG GgG 613 NAG 4 n EA NAG 2 GgG 2 NAG GhG 614 NAG 9 n FA NAG 1 GjG 1 NAG GjG 616 NAG 9 n FA FUC 2 GjG 2 FUC GkG 617 FUC 4 n GA NAG 1 GlG 1 NAG GlG 618 NAG 4 n GA NAG 2 GlG 2 NAG GmG 619 NAG 4 n HA NAG 1 GnG 1 NAG GnG 620 NAG 4 n HA NAG 2 GnG 2 NAG GoG 621 NAG 4 n IA NAG 1 HaH 1 NAG HaH 212 NAG 4 n IA NAG 2 HaH 2 NAG HbH 213 NAG 4 n JA NAG 1 JaJ 1 NAG JaJ 607 NAG 4 n JA NAG 2 JaJ 2 NAG JbJ 608 NAG 4 n KA NAG 1 JcJ 1 NAG JcJ 612 NAG 4 n KA NAG 2 JcJ 2 NAG JdJ 613 NAG 4 n LA NAG 1 JeJ 1 NAG JeJ 614 NAG 4 n LA NAG 2 JeJ 2 NAG JfJ 615 NAG 4 n MA NAG 1 JgJ 1 NAG JgJ 616 NAG 4 n MA NAG 2 JgJ 2 NAG JhJ 617 NAG 4 n NA NAG 1 JkJ 1 NAG JkJ 620 NAG 4 n NA NAG 2 JkJ 2 NAG JlJ 621 NAG 4 n OA NAG 1 KaK 1 NAG KaK 212 NAG 4 n OA NAG 2 KaK 2 NAG KbK 213 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 37 AAA CYS 48 1_555 A SG CYS 44 AAA CYS 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 70 AAA CYS 81 1_555 A SG CYS 96 AAA CYS 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 358 AAA CYS 369 1_555 A SG CYS 384 AAA CYS 395 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 588 AAA CYS 599 1_555 A SG CYS 595 AAA CYS 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf5 B SG CYS 39 BBB CYS 58 1_555 B SG CYS 46 BBB CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf6 B SG CYS 183 BBB CYS 202 1_555 B SG CYS 191 BBB CYS 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? disulf ? disulf7 D SG CYS 37 DDD CYS 48 1_555 D SG CYS 44 DDD CYS 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf8 D SG CYS 70 DDD CYS 81 1_555 D SG CYS 96 DDD CYS 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? disulf ? disulf9 D SG CYS 358 DDD CYS 369 1_555 D SG CYS 384 DDD CYS 395 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf10 D SG CYS 588 DDD CYS 599 1_555 D SG CYS 595 DDD CYS 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf11 E SG CYS 39 EEE CYS 58 1_555 E SG CYS 46 EEE CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf12 E SG CYS 183 EEE CYS 202 1_555 E SG CYS 191 EEE CYS 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf13 G SG CYS 37 GGG CYS 48 1_555 G SG CYS 44 GGG CYS 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf14 G SG CYS 70 GGG CYS 81 1_555 G SG CYS 96 GGG CYS 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf15 G SG CYS 358 GGG CYS 369 1_555 G SG CYS 384 GGG CYS 395 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf16 G SG CYS 588 GGG CYS 599 1_555 G SG CYS 595 GGG CYS 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf17 H SG CYS 39 HHH CYS 58 1_555 H SG CYS 46 HHH CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf18 H SG CYS 183 HHH CYS 202 1_555 H SG CYS 191 HHH CYS 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf19 J SG CYS 37 JJJ CYS 48 1_555 J SG CYS 44 JJJ CYS 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf20 J SG CYS 70 JJJ CYS 81 1_555 J SG CYS 96 JJJ CYS 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? disulf ? disulf21 J SG CYS 358 JJJ CYS 369 1_555 J SG CYS 384 JJJ CYS 395 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf22 K SG CYS 39 KKK CYS 58 1_555 K SG CYS 46 KKK CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf23 K SG CYS 183 KKK CYS 202 1_555 K SG CYS 191 KKK CYS 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 86 AAA ASN 97 1_555 R C1 NAG . AqA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 167 AAA ASN 178 1_555 P C1 NAG . AlA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 175 AAA ASN 186 1_555 N C1 NAG . AcA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 192 AAA ASN 203 1_555 Q C1 NAG . AnA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 251 AAA ASN 262 1_555 M C1 NAG . AaA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 418 AAA ASN 429 1_555 S C1 NAG . AsA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 434 AAA ASN 445 1_555 O C1 NAG . AhA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.402 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 558 AAA ASN 569 1_555 QA C1 NAG . AAA NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale9 B ND2 ASN 85 BBB ASN 104 1_555 UA C1 NAG . BBB NAG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale10 B ND2 ASN 131 BBB ASN 150 1_555 TA C1 NAG . BBB NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale11 B ND2 ASN 165 BBB ASN 184 1_555 T C1 NAG . BaB NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale12 C C VAL 3 CCC VAL 111 1_555 C N HYP 4 CCC HYP 112 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.351 ? covale ? covale13 C C HYP 4 CCC HYP 112 1_555 C N SER 5 CCC SER 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale ? covale14 C C GLY 6 CCC GLY 114 1_555 C N HYP 7 CCC HYP 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.356 ? covale ? covale15 C C HYP 7 CCC HYP 115 1_555 C N ASN 8 CCC ASN 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? covale ? covale16 D ND2 ASN 82 DDD ASN 93 1_555 WA C1 NAG . DDD NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale17 D ND2 ASN 86 DDD ASN 97 1_555 Z C1 NAG . DpD NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale18 D ND2 ASN 167 DDD ASN 178 1_555 X C1 NAG . DiD NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? covale ? covale19 D ND2 ASN 175 DDD ASN 186 1_555 U C1 NAG . DaD NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale20 D ND2 ASN 251 DDD ASN 262 1_555 V C1 NAG . DeD NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale21 D ND2 ASN 418 DDD ASN 429 1_555 W C1 NAG . DgD NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale22 D ND2 ASN 434 DDD ASN 445 1_555 Y C1 NAG . DmD NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale23 D ND2 ASN 558 DDD ASN 569 1_555 XA C1 NAG . DDD NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale24 E ND2 ASN 85 EEE ASN 104 1_555 ZA C1 NAG . EEE NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale25 E ND2 ASN 131 EEE ASN 150 1_555 BA C1 NAG . EdE NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale26 E ND2 ASN 165 EEE ASN 184 1_555 AA C1 NAG . EaE NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale27 F C VAL 3 FFF VAL 111 1_555 F N HYP 4 FFF HYP 112 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.353 ? covale ? covale28 F C HYP 4 FFF HYP 112 1_555 F N SER 5 FFF SER 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale29 F C GLY 6 FFF GLY 114 1_555 F N HYP 7 FFF HYP 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.354 ? covale ? covale30 F C HYP 7 FFF HYP 115 1_555 F N ASN 8 FFF ASN 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? covale ? covale31 G ND2 ASN 82 GGG ASN 93 1_555 HA C1 NAG . GnG NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale32 G ND2 ASN 86 GGG ASN 97 1_555 FA C1 NAG . GjG NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? covale ? covale33 G ND2 ASN 167 GGG ASN 178 1_555 EA C1 NAG . GgG NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale34 G ND2 ASN 175 GGG ASN 186 1_555 CA C1 NAG . GaG NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale35 G ND2 ASN 251 GGG ASN 262 1_555 DA C1 NAG . GdG NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale36 G ND2 ASN 418 GGG ASN 429 1_555 GA C1 NAG . GlG NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale37 G ND2 ASN 558 GGG ASN 569 1_555 BB C1 NAG . GGG NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? covale ? covale38 H ND2 ASN 131 HHH ASN 150 1_555 DB C1 NAG . HHH NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale39 H ND2 ASN 165 HHH ASN 184 1_555 IA C1 NAG . HaH NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale40 I C VAL 3 III VAL 111 1_555 I N HYP 4 III HYP 112 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.353 ? covale ? covale41 I C HYP 4 III HYP 112 1_555 I N SER 5 III SER 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale ? covale42 I C GLY 6 III GLY 114 1_555 I N HYP 7 III HYP 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.353 ? covale ? covale43 I C HYP 7 III HYP 115 1_555 I N ASN 8 III ASN 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? covale ? covale44 J ND2 ASN 82 JJJ ASN 93 1_555 FB C1 NAG . JJJ NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale45 J ND2 ASN 86 JJJ ASN 97 1_555 HB C1 NAG . JJJ NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale46 J ND2 ASN 167 JJJ ASN 178 1_555 LA C1 NAG . JeJ NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale47 J ND2 ASN 175 JJJ ASN 186 1_555 JA C1 NAG . JaJ NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale48 J ND2 ASN 192 JJJ ASN 203 1_555 NA C1 NAG . JkJ NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale49 J ND2 ASN 251 JJJ ASN 262 1_555 KA C1 NAG . JcJ NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale50 J ND2 ASN 418 JJJ ASN 429 1_555 GB C1 NAG . JJJ NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale51 J ND2 ASN 434 JJJ ASN 445 1_555 MA C1 NAG . JgJ NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? covale ? covale52 J ND2 ASN 558 JJJ ASN 569 1_555 IB C1 NAG . JJJ NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale53 K ND2 ASN 165 KKK ASN 184 1_555 OA C1 NAG . KaK NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale54 L C VAL 3 LLL VAL 111 1_555 L N HYP 4 LLL HYP 112 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.353 ? covale ? covale55 L C HYP 4 LLL HYP 112 1_555 L N SER 5 LLL SER 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale ? covale56 L C GLY 6 LLL GLY 114 1_555 L N HYP 7 LLL HYP 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.354 ? covale ? covale57 L C HYP 7 LLL HYP 115 1_555 L N ASN 8 LLL ASN 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? covale ? covale58 M O4 NAG . AaA NAG 1 1_555 M C1 NAG . AaA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale59 N O4 NAG . AcA NAG 1 1_555 N C1 NAG . AcA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale60 N O4 NAG . AcA NAG 2 1_555 N C1 BMA . AcA BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? covale ? covale61 N O3 BMA . AcA BMA 3 1_555 N C1 MAN . AcA MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.346 ? covale ? covale62 O O4 NAG . AhA NAG 1 1_555 O C1 NAG . AhA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale ? covale63 O O4 NAG . AhA NAG 2 1_555 O C1 BMA . AhA BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.348 ? covale ? covale64 O O3 BMA . AhA BMA 3 1_555 O C1 MAN . AhA MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? covale ? covale65 P O4 NAG . AlA NAG 1 1_555 P C1 NAG . AlA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.346 ? covale ? covale66 Q O4 NAG . AnA NAG 1 1_555 Q C1 NAG . AnA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.346 ? covale ? covale67 Q O6 NAG . AnA NAG 1 1_555 Q C1 FUC . AnA FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.349 ? covale ? covale68 R O4 NAG . AqA NAG 1 1_555 R C1 NAG . AqA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale69 S O4 NAG . AsA NAG 1 1_555 S C1 NAG . AsA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale70 T O4 NAG . BaB NAG 1 1_555 T C1 NAG . BaB NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? covale ? covale71 T O4 NAG . BaB NAG 2 1_555 T C1 BMA . BaB BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.365 ? covale ? covale72 U O4 NAG . DaD NAG 1 1_555 U C1 NAG . DaD NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.346 ? covale ? covale73 U O4 NAG . DaD NAG 2 1_555 U C1 BMA . DaD BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.351 ? covale ? covale74 V O4 NAG . DeD NAG 1 1_555 V C1 NAG . DeD NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.346 ? covale ? covale75 W O4 NAG . DgD NAG 1 1_555 W C1 NAG . DgD NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale76 X O4 NAG . DiD NAG 1 1_555 X C1 NAG . DiD NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale77 X O4 NAG . DiD NAG 2 1_555 X C1 BMA . DiD BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale78 X O3 BMA . DiD BMA 3 1_555 X C1 MAN . DiD MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.348 ? covale ? covale79 Y O4 NAG . DmD NAG 1 1_555 Y C1 NAG . DmD NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.361 ? covale ? covale80 Z O4 NAG . DpD NAG 1 1_555 Z C1 NAG . DpD NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? covale ? covale81 Z O6 NAG . DpD NAG 1 1_555 Z C1 FUC . DpD FUC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale82 Z O4 NAG . DpD NAG 2 1_555 Z C1 BMA . DpD BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.348 ? covale ? covale83 AA O4 NAG . EaE NAG 1 1_555 AA C1 NAG . EaE NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale84 AA O4 NAG . EaE NAG 2 1_555 AA C1 BMA . EaE BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? covale ? covale85 BA O4 NAG . EdE NAG 1 1_555 BA C1 NAG . EdE NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? covale ? covale86 CA O4 NAG . GaG NAG 1 1_555 CA C1 NAG . GaG NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? covale ? covale87 CA O4 NAG . GaG NAG 2 1_555 CA C1 BMA . GaG BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? covale ? covale88 DA O4 NAG . GdG NAG 1 1_555 DA C1 NAG . GdG NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? covale ? covale89 DA O4 NAG . GdG NAG 2 1_555 DA C1 BMA . GdG BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.359 ? covale ? covale90 EA O4 NAG . GgG NAG 1 1_555 EA C1 NAG . GgG NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? covale ? covale91 FA O6 NAG . GjG NAG 1 1_555 FA C1 FUC . GjG FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale ? covale92 GA O4 NAG . GlG NAG 1 1_555 GA C1 NAG . GlG NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale93 HA O4 NAG . GnG NAG 1 1_555 HA C1 NAG . GnG NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.354 ? covale ? covale94 IA O4 NAG . HaH NAG 1 1_555 IA C1 NAG . HaH NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale95 JA O4 NAG . JaJ NAG 1 1_555 JA C1 NAG . JaJ NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale96 KA O4 NAG . JcJ NAG 1 1_555 KA C1 NAG . JcJ NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale97 LA O4 NAG . JeJ NAG 1 1_555 LA C1 NAG . JeJ NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.358 ? covale ? covale98 MA O4 NAG . JgJ NAG 1 1_555 MA C1 NAG . JgJ NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale99 NA O4 NAG . JkJ NAG 1 1_555 NA C1 NAG . JkJ NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? covale ? covale100 OA O4 NAG . KaK NAG 1 1_555 OA C1 NAG . KaK NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? metalc ? metalc1 A O ASN 167 AAA ASN 178 1_555 SA NA NA . AAA NA 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.48 ? metalc ? metalc2 A O ASN 228 AAA ASN 239 1_555 RA NA NA . AAA NA 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.676 ? metalc ? metalc3 A O ASN 251 AAA ASN 262 1_555 RA NA NA . AAA NA 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.757 ? metalc ? metalc4 RA NA NA . AAA NA 703 1_555 M O6 NAG . AaA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.511 ? metalc ? metalc5 SA NA NA . AAA NA 704 1_555 P O5 NAG . AlA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.033 ? metalc ? metalc6 SA NA NA . AAA NA 704 1_555 P O6 NAG . AlA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.473 ? metalc ? metalc7 B O CYS 39 BBB CYS 58 1_555 VA NA NA . BBB NA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.581 ? metalc ? metalc8 B O TRP 41 BBB TRP 60 1_555 VA NA NA . BBB NA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.798 ? metalc ? metalc9 B O VAL 44 BBB VAL 63 1_555 VA NA NA . BBB NA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.673 ? metalc ? metalc10 D O ASN 228 DDD ASN 239 1_555 YA NA NA . DDD NA 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.998 ? metalc ? metalc11 D O ASN 251 DDD ASN 262 1_555 YA NA NA . DDD NA 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.487 ? metalc ? metalc12 YA NA NA . DDD NA 703 1_555 V O5 NAG . DeD NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.035 ? metalc ? metalc13 YA NA NA . DDD NA 703 1_555 V O6 NAG . DeD NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? metalc ? metalc14 E O CYS 39 EEE CYS 58 1_555 AB NA NA . EEE NA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.779 ? metalc ? metalc15 E O TRP 41 EEE TRP 60 1_555 AB NA NA . EEE NA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.541 ? metalc ? metalc16 E O VAL 44 EEE VAL 63 1_555 AB NA NA . EEE NA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? metalc ? metalc17 G O ASN 228 GGG ASN 239 1_555 CB NA NA . GGG NA 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? metalc ? metalc18 G O ASN 251 GGG ASN 262 1_555 CB NA NA . GGG NA 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.642 ? metalc ? metalc19 CB NA NA . GGG NA 702 1_555 DA O6 NAG . GdG NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? metalc ? metalc20 H O CYS 39 HHH CYS 58 1_555 EB NA NA . HHH NA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.524 ? metalc ? metalc21 H O TRP 41 HHH TRP 60 1_555 EB NA NA . HHH NA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? metalc ? metalc22 H O VAL 44 HHH VAL 63 1_555 EB NA NA . HHH NA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.618 ? metalc ? metalc23 K O CYS 39 KKK CYS 58 1_555 JB NA NA . KKK NA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.674 ? metalc ? metalc24 K O TRP 41 KKK TRP 60 1_555 JB NA NA . KKK NA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.912 ? metalc ? metalc25 K O VAL 44 KKK VAL 63 1_555 JB NA NA . KKK NA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? # _chem_comp.formula 'Na 1' _chem_comp.formula_weight 22.99 _chem_comp.id NA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'SODIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7OGU _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.010643 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.001259 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005886 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007015 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code PA 10 MAN AAA 1 701 612 MAN MAN . QA 11 NAG AAA 1 702 627 NAG NAG . RA 12 NA AAA 1 703 6 NA NA . SA 12 NA AAA 1 704 11 NA NA . TA 11 NAG BBB 1 301 215 NAG NAG . UA 11 NAG BBB 1 302 216 NAG NAG . VA 12 NA BBB 1 303 1 NA NA . WA 11 NAG DDD 1 701 613 NAG NAG . XA 11 NAG DDD 1 702 624 NAG NAG . YA 12 NA DDD 1 703 10 NA NA . ZA 11 NAG EEE 1 301 217 NAG NAG . AB 12 NA EEE 1 302 2 NA NA . BB 11 NAG GGG 1 701 615 NAG NAG . CB 12 NA GGG 1 702 9 NA NA . DB 11 NAG HHH 1 301 214 NAG NAG . EB 12 NA HHH 1 302 3 NA NA . FB 11 NAG JJJ 1 701 618 NAG NAG . GB 11 NAG JJJ 1 702 619 NAG NAG . HB 11 NAG JJJ 1 703 622 NAG NAG . IB 11 NAG JJJ 1 704 625 NAG NAG . JB 12 NA KKK 1 301 4 NA NA . KB 13 HOH AAA 1 801 1 HOH HOH . KB 13 HOH AAA 2 802 4 HOH HOH . KB 13 HOH AAA 3 803 39 HOH HOH . KB 13 HOH AAA 4 804 14 HOH HOH . KB 13 HOH AAA 5 805 33 HOH HOH . KB 13 HOH AAA 6 806 43 HOH HOH . KB 13 HOH AAA 7 807 18 HOH HOH . KB 13 HOH AAA 8 808 27 HOH HOH . KB 13 HOH AAA 9 809 47 HOH HOH . KB 13 HOH AAA 10 810 38 HOH HOH . KB 13 HOH AAA 11 811 10 HOH HOH . LB 13 HOH BBB 1 401 44 HOH HOH . LB 13 HOH BBB 2 402 11 HOH HOH . LB 13 HOH BBB 3 403 23 HOH HOH . MB 13 HOH DDD 1 801 46 HOH HOH . MB 13 HOH DDD 2 802 35 HOH HOH . MB 13 HOH DDD 3 803 2 HOH HOH . MB 13 HOH DDD 4 804 22 HOH HOH . MB 13 HOH DDD 5 805 29 HOH HOH . MB 13 HOH DDD 6 806 19 HOH HOH . MB 13 HOH DDD 7 807 30 HOH HOH . MB 13 HOH DDD 8 808 26 HOH HOH . MB 13 HOH DDD 9 809 3 HOH HOH . MB 13 HOH DDD 10 810 40 HOH HOH . MB 13 HOH DDD 11 811 37 HOH HOH . NB 13 HOH EEE 1 401 17 HOH HOH . OB 13 HOH GGG 1 801 13 HOH HOH . OB 13 HOH GGG 2 802 6 HOH HOH . OB 13 HOH GGG 3 803 9 HOH HOH . OB 13 HOH GGG 4 804 15 HOH HOH . OB 13 HOH GGG 5 805 21 HOH HOH . OB 13 HOH GGG 6 806 12 HOH HOH . OB 13 HOH GGG 7 807 32 HOH HOH . OB 13 HOH GGG 8 808 20 HOH HOH . OB 13 HOH GGG 9 809 25 HOH HOH . OB 13 HOH GGG 10 810 16 HOH HOH . OB 13 HOH GGG 11 811 24 HOH HOH . OB 13 HOH GGG 12 812 41 HOH HOH . OB 13 HOH GGG 13 813 45 HOH HOH . OB 13 HOH GGG 14 814 8 HOH HOH . OB 13 HOH GGG 15 815 42 HOH HOH . PB 13 HOH JJJ 1 801 5 HOH HOH . PB 13 HOH JJJ 2 802 34 HOH HOH . PB 13 HOH JJJ 3 803 31 HOH HOH . PB 13 HOH JJJ 4 804 28 HOH HOH . PB 13 HOH JJJ 5 805 36 HOH HOH . PB 13 HOH JJJ 6 806 7 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol NA _atom_site.label_atom_id NA _atom_site.label_comp_id NA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id SA _atom_site.label_entity_id 12 _atom_site.Cartn_x -68.595 _atom_site.Cartn_y -13.384 _atom_site.Cartn_z 27.947 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 44.44 _atom_site.pdbx_formal_charge 0 _atom_site.auth_atom_id NA _atom_site.auth_comp_id NA _atom_site.auth_seq_id 704 _atom_site.auth_asym_id AAA _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 22 _model_server_stats.parse_time_ms 24 _model_server_stats.create_model_time_ms 35 _model_server_stats.query_time_ms 299 _model_server_stats.encode_time_ms 14 _model_server_stats.element_count 1 #