data_7PBX
#
_model_server_result.job_id            dTxQKIlYYyvSWvJAWdlugA 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-03-04 17:08:14' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7pbx 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"SA","auth_seq_id":602}' 
#
_entry.id    7PBX 
#
_exptl.entry_id    7PBX 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    14 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7PBX 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7PBX 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    21-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      21 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 W N N 
? 4 Y N N 
? 4 AA N N 
? 4 CA N N 
? 4 EA N N 
? 4 GA N N 
? 4 IA N N 
? 4 KA N N 
? 4 MA N N 
? 4 OA N N 
? 4 QA N N 
? 4 SA N N 
? 4 UA N N 
? 4 WA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD1 ASP 86 Ac ASP 87 1_555 W MG MG . Ac MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? 
metalc ? metalc2 A OD2 ASP 86 Ac ASP 87 1_555 W MG MG . Ac MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? 
metalc ? metalc3 V O2B ADP . Ac ADP 601 1_555 W MG MG . Ac MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? 
metalc ? metalc4 V O3B ADP . Ac ADP 601 1_555 W MG MG . Ac MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.495 ? 
metalc ? metalc5 V O2A ADP . Ac ADP 601 1_555 W MG MG . Ac MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? 
metalc ? metalc6 B OD1 ASP 86 Ad ASP 87 1_555 Y MG MG . Ad MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.829 ? 
metalc ? metalc7 B OD2 ASP 86 Ad ASP 87 1_555 Y MG MG . Ad MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? 
metalc ? metalc8 X O1B ADP . Ad ADP 601 1_555 Y MG MG . Ad MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.663 ? 
metalc ? metalc9 X O3B ADP . Ad ADP 601 1_555 Y MG MG . Ad MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.793 ? 
metalc ? metalc10 X O3A ADP . Ad ADP 601 1_555 Y MG MG . Ad MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.789 ? 
metalc ? metalc11 D OD1 ASP 86 Ai ASP 87 1_555 AA MG MG . Ai MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.115 ? 
metalc ? metalc12 D OD2 ASP 86 Ai ASP 87 1_555 AA MG MG . Ai MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? 
metalc ? metalc13 Z O2B ADP . Ai ADP 601 1_555 AA MG MG . Ai MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? 
metalc ? metalc14 Z O3B ADP . Ai ADP 601 1_555 AA MG MG . Ai MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? 
metalc ? metalc15 Z O2A ADP . Ai ADP 601 1_555 AA MG MG . Ai MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc16 E OD1 ASP 86 Aj ASP 87 1_555 CA MG MG . Aj MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.828 ? 
metalc ? metalc17 E OD2 ASP 86 Aj ASP 87 1_555 CA MG MG . Aj MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? 
metalc ? metalc18 BA O1B ADP . Aj ADP 601 1_555 CA MG MG . Aj MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.663 ? 
metalc ? metalc19 BA O3B ADP . Aj ADP 601 1_555 CA MG MG . Aj MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.793 ? 
metalc ? metalc20 BA O3A ADP . Aj ADP 601 1_555 CA MG MG . Aj MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.789 ? 
metalc ? metalc21 G OD1 ASP 86 Ao ASP 87 1_555 EA MG MG . Ao MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? 
metalc ? metalc22 G OD2 ASP 86 Ao ASP 87 1_555 EA MG MG . Ao MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? 
metalc ? metalc23 DA O2B ADP . Ao ADP 601 1_555 EA MG MG . Ao MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? 
metalc ? metalc24 DA O3B ADP . Ao ADP 601 1_555 EA MG MG . Ao MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? 
metalc ? metalc25 DA O2A ADP . Ao ADP 601 1_555 EA MG MG . Ao MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? 
metalc ? metalc26 H OD1 ASP 86 Ap ASP 87 1_555 GA MG MG . Ap MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.829 ? 
metalc ? metalc27 H OD2 ASP 86 Ap ASP 87 1_555 GA MG MG . Ap MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? 
metalc ? metalc28 FA O1B ADP . Ap ADP 601 1_555 GA MG MG . Ap MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.663 ? 
metalc ? metalc29 FA O3B ADP . Ap ADP 601 1_555 GA MG MG . Ap MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.793 ? 
metalc ? metalc30 FA O3A ADP . Ap ADP 601 1_555 GA MG MG . Ap MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.789 ? 
metalc ? metalc31 J OD1 ASP 86 Au ASP 87 1_555 IA MG MG . Au MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.113 ? 
metalc ? metalc32 J OD2 ASP 86 Au ASP 87 1_555 IA MG MG . Au MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? 
metalc ? metalc33 HA O2B ADP . Au ADP 601 1_555 IA MG MG . Au MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? 
metalc ? metalc34 HA O3B ADP . Au ADP 601 1_555 IA MG MG . Au MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.495 ? 
metalc ? metalc35 HA O2A ADP . Au ADP 601 1_555 IA MG MG . Au MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc36 K OD1 ASP 86 Av ASP 87 1_555 KA MG MG . Av MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.829 ? 
metalc ? metalc37 K OD2 ASP 86 Av ASP 87 1_555 KA MG MG . Av MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? 
metalc ? metalc38 JA O1B ADP . Av ADP 601 1_555 KA MG MG . Av MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.662 ? 
metalc ? metalc39 JA O3B ADP . Av ADP 601 1_555 KA MG MG . Av MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.793 ? 
metalc ? metalc40 JA O3A ADP . Av ADP 601 1_555 KA MG MG . Av MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.789 ? 
metalc ? metalc41 M OD1 ASP 86 Ba ASP 87 1_555 MA MG MG . Ba MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? 
metalc ? metalc42 M OD2 ASP 86 Ba ASP 87 1_555 MA MG MG . Ba MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? 
metalc ? metalc43 LA O2B ADP . Ba ADP 601 1_555 MA MG MG . Ba MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? 
metalc ? metalc44 LA O3B ADP . Ba ADP 601 1_555 MA MG MG . Ba MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? 
metalc ? metalc45 LA O2A ADP . Ba ADP 601 1_555 MA MG MG . Ba MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? 
metalc ? metalc46 N OD1 ASP 86 Bb ASP 87 1_555 OA MG MG . Bb MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.829 ? 
metalc ? metalc47 N OD2 ASP 86 Bb ASP 87 1_555 OA MG MG . Bb MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? 
metalc ? metalc48 NA O1B ADP . Bb ADP 601 1_555 OA MG MG . Bb MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.663 ? 
metalc ? metalc49 NA O3B ADP . Bb ADP 601 1_555 OA MG MG . Bb MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.792 ? 
metalc ? metalc50 NA O3A ADP . Bb ADP 601 1_555 OA MG MG . Bb MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.789 ? 
metalc ? metalc51 P OD1 ASP 86 Bg ASP 87 1_555 QA MG MG . Bg MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? 
metalc ? metalc52 P OD2 ASP 86 Bg ASP 87 1_555 QA MG MG . Bg MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? 
metalc ? metalc53 PA O2B ADP . Bg ADP 601 1_555 QA MG MG . Bg MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? 
metalc ? metalc54 PA O3B ADP . Bg ADP 601 1_555 QA MG MG . Bg MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? 
metalc ? metalc55 PA O2A ADP . Bg ADP 601 1_555 QA MG MG . Bg MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? 
metalc ? metalc56 Q OD1 ASP 86 Bh ASP 87 1_555 SA MG MG . Bh MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.828 ? 
metalc ? metalc57 Q OD2 ASP 86 Bh ASP 87 1_555 SA MG MG . Bh MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.502 ? 
metalc ? metalc58 RA O1B ADP . Bh ADP 601 1_555 SA MG MG . Bh MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.662 ? 
metalc ? metalc59 RA O3B ADP . Bh ADP 601 1_555 SA MG MG . Bh MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.793 ? 
metalc ? metalc60 RA O3A ADP . Bh ADP 601 1_555 SA MG MG . Bh MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.789 ? 
metalc ? metalc61 S OD1 ASP 86 Bm ASP 87 1_555 UA MG MG . Bm MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? 
metalc ? metalc62 S OD2 ASP 86 Bm ASP 87 1_555 UA MG MG . Bm MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? 
metalc ? metalc63 TA O2B ADP . Bm ADP 601 1_555 UA MG MG . Bm MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? 
metalc ? metalc64 TA O3B ADP . Bm ADP 601 1_555 UA MG MG . Bm MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? 
metalc ? metalc65 TA O2A ADP . Bm ADP 601 1_555 UA MG MG . Bm MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc66 T OD1 ASP 86 Bn ASP 87 1_555 WA MG MG . Bn MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.829 ? 
metalc ? metalc67 T OD2 ASP 86 Bn ASP 87 1_555 WA MG MG . Bn MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.5 ? 
metalc ? metalc68 VA O1B ADP . Bn ADP 601 1_555 WA MG MG . Bn MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.663 ? 
metalc ? metalc69 VA O3B ADP . Bn ADP 601 1_555 WA MG MG . Bn MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.792 ? 
metalc ? metalc70 VA O3A ADP . Bn ADP 601 1_555 WA MG MG . Bn MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.789 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     7PBX 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
V 3 ADP Ac 1 601 601 ADP ADP . 
W 4 MG Ac 1 602 605 MG MG . 
X 3 ADP Ad 1 601 601 ADP ADP . 
Y 4 MG Ad 1 602 604 MG MG . 
Z 3 ADP Ai 1 601 601 ADP ADP . 
AA 4 MG Ai 1 602 605 MG MG . 
BA 3 ADP Aj 1 601 601 ADP ADP . 
CA 4 MG Aj 1 602 604 MG MG . 
DA 3 ADP Ao 1 601 601 ADP ADP . 
EA 4 MG Ao 1 602 605 MG MG . 
FA 3 ADP Ap 1 601 601 ADP ADP . 
GA 4 MG Ap 1 602 604 MG MG . 
HA 3 ADP Au 1 601 601 ADP ADP . 
IA 4 MG Au 1 602 605 MG MG . 
JA 3 ADP Av 1 601 601 ADP ADP . 
KA 4 MG Av 1 602 604 MG MG . 
LA 3 ADP Ba 1 601 601 ADP ADP . 
MA 4 MG Ba 1 602 605 MG MG . 
NA 3 ADP Bb 1 601 601 ADP ADP . 
OA 4 MG Bb 1 602 604 MG MG . 
PA 3 ADP Bg 1 601 601 ADP ADP . 
QA 4 MG Bg 1 602 605 MG MG . 
RA 3 ADP Bh 1 601 601 ADP ADP . 
SA 4 MG Bh 1 602 604 MG MG . 
TA 3 ADP Bm 1 601 601 ADP ADP . 
UA 4 MG Bm 1 602 605 MG MG . 
VA 3 ADP Bn 1 601 601 ADP ADP . 
WA 4 MG Bn 1 602 604 MG MG . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MG 
_atom_site.label_atom_id         MG 
_atom_site.label_comp_id         MG 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         SA 
_atom_site.label_entity_id       4 
_atom_site.Cartn_x               248.226 
_atom_site.Cartn_y               179.408 
_atom_site.Cartn_z               182.872 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        50 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MG 
_atom_site.auth_comp_id          MG 
_atom_site.auth_seq_id           602 
_atom_site.auth_asym_id          Bh 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              23 
_model_server_stats.parse_time_ms           10 
_model_server_stats.create_model_time_ms    58 
_model_server_stats.query_time_ms           264 
_model_server_stats.encode_time_ms          18 
_model_server_stats.element_count           1 
#