data_7PH3
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_model_server_result.job_id            G8GvxpZok2zjxFQD1pL7dQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-26 12:43:41' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          7ph3 
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_model_server_params.name     atom_site 
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_entry.id    7PH3 
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_exptl.entry_id    7PH3 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              157.25 
_entity.id                          8 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'GADOLINIUM ATOM' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            7PH3 
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_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7PH3 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 8 N N N 
? 8 P N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 C SG CYS 25 C CYS 22 1_555 C SG CYS 98 C CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
disulf ? disulf2 D SG CYS 25 D CYS 22 1_555 D SG CYS 98 D CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
covale ? covale1 C SG CYS 63 C CYS 60 1_555 M C4 88T . C 88T 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.835 ? 
covale ? covale2 D SG CYS 63 D CYS 60 1_555 O C4 88T . D 88T 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.824 ? 
metalc ? metalc1 A OG SER 394 A SER 383 1_555 F MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLN 435 A GLN 424 1_555 F MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
metalc ? metalc3 E O3G ANP . A ANP 601 1_555 F MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? 
metalc ? metalc4 E O2B ANP . A ANP 601 1_555 F MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? 
metalc ? metalc5 F MG MG . A MG 602 1_555 Q O HOH . A HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.06 ? 
metalc ? metalc6 F MG MG . A MG 602 1_555 Q O HOH . A HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? 
metalc ? metalc7 B OG SER 394 B SER 383 1_555 J MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? 
metalc ? metalc8 B OE1 GLN 435 B GLN 424 1_555 J MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? 
metalc ? metalc9 I O1G ANP . B ANP 601 1_555 J MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? 
metalc ? metalc10 I O2B ANP . B ANP 601 1_555 J MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.99 ? 
metalc ? metalc11 J MG MG . B MG 602 1_555 R O HOH . B HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? 
metalc ? metalc12 J MG MG . B MG 602 1_555 R O HOH . B HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? 
metalc ? metalc13 M N4 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.645 ? 
metalc ? metalc14 M O4 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? 
metalc ? metalc15 M N5 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.613 ? 
metalc ? metalc16 M O5 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.648 ? 
metalc ? metalc17 M N6 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.655 ? 
metalc ? metalc18 M O6 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? 
metalc ? metalc19 M N7 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.629 ? 
metalc ? metalc20 M O7 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.358 ? 
metalc ? metalc21 M O8 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? 
metalc ? metalc22 M O9 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? 
metalc ? metalc23 O N4 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.685 ? 
metalc ? metalc24 O O4 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? 
metalc ? metalc25 O N5 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.653 ? 
metalc ? metalc26 O O5 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.663 ? 
metalc ? metalc27 O N6 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.657 ? 
metalc ? metalc28 O O6 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? 
metalc ? metalc29 O N7 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.637 ? 
metalc ? metalc30 O O7 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.318 ? 
metalc ? metalc31 O O8 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? 
metalc ? metalc32 O O9 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? 
#
_chem_comp.formula           Gd 
_chem_comp.formula_weight    157.25 
_chem_comp.id                GD 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'GADOLINIUM ATOM' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     7PH3 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
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_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
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loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 3 ANP A 1 601 601 ANP ANP . 
F 4 MG A 1 602 602 MG MG . 
G 5 LMT A 1 603 603 LMT LMT . 
H 6 3PE A 1 604 604 3PE 3PE . 
I 3 ANP B 1 601 601 ANP ANP . 
J 4 MG B 1 602 602 MG MG . 
K 6 3PE B 1 603 603 3PE 3PE . 
L 5 LMT B 1 604 604 LMT LMT . 
M 7 88T C 1 200 200 88T 8WI . 
N 8 GD C 1 201 201 GD GD . 
O 7 88T D 1 200 200 88T 8WI . 
P 8 GD D 1 201 201 GD GD . 
Q 9 HOH A 1 701 701 HOH HOH . 
Q 9 HOH A 2 702 702 HOH HOH . 
R 9 HOH B 1 701 701 HOH HOH . 
R 9 HOH B 2 702 702 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           GD 
_atom_site.label_atom_id         GD 
_atom_site.label_comp_id         GD 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         P 
_atom_site.label_entity_id       8 
_atom_site.Cartn_x               130.168 
_atom_site.Cartn_y               115.862 
_atom_site.Cartn_z               216.377 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        174.75 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          GD 
_atom_site.auth_comp_id          GD 
_atom_site.auth_seq_id           201 
_atom_site.auth_asym_id          D 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              61 
_model_server_stats.parse_time_ms           10 
_model_server_stats.create_model_time_ms    13 
_model_server_stats.query_time_ms           314 
_model_server_stats.encode_time_ms          12 
_model_server_stats.element_count           1 
#