data_7PH3
#
_model_server_result.job_id            iZWrtfd4VHHjcmjxafOnww 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-26 13:14:17' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7ph3 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"L","auth_seq_id":604}' 
#
_entry.id    7PH3 
#
_exptl.entry_id    7PH3 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              510.615 
_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7PH3 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7PH3 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 5 G N N 
? 5 L N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 C SG CYS 25 C CYS 22 1_555 C SG CYS 98 C CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
disulf ? disulf2 D SG CYS 25 D CYS 22 1_555 D SG CYS 98 D CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
covale ? covale1 C SG CYS 63 C CYS 60 1_555 M C4 88T . C 88T 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.835 ? 
covale ? covale2 D SG CYS 63 D CYS 60 1_555 O C4 88T . D 88T 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.824 ? 
metalc ? metalc1 A OG SER 394 A SER 383 1_555 F MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLN 435 A GLN 424 1_555 F MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
metalc ? metalc3 E O3G ANP . A ANP 601 1_555 F MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? 
metalc ? metalc4 E O2B ANP . A ANP 601 1_555 F MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? 
metalc ? metalc5 F MG MG . A MG 602 1_555 Q O HOH . A HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.06 ? 
metalc ? metalc6 F MG MG . A MG 602 1_555 Q O HOH . A HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? 
metalc ? metalc7 B OG SER 394 B SER 383 1_555 J MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? 
metalc ? metalc8 B OE1 GLN 435 B GLN 424 1_555 J MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? 
metalc ? metalc9 I O1G ANP . B ANP 601 1_555 J MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? 
metalc ? metalc10 I O2B ANP . B ANP 601 1_555 J MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.99 ? 
metalc ? metalc11 J MG MG . B MG 602 1_555 R O HOH . B HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? 
metalc ? metalc12 J MG MG . B MG 602 1_555 R O HOH . B HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? 
metalc ? metalc13 M N4 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.645 ? 
metalc ? metalc14 M O4 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? 
metalc ? metalc15 M N5 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.613 ? 
metalc ? metalc16 M O5 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.648 ? 
metalc ? metalc17 M N6 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.655 ? 
metalc ? metalc18 M O6 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? 
metalc ? metalc19 M N7 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.629 ? 
metalc ? metalc20 M O7 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.358 ? 
metalc ? metalc21 M O8 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? 
metalc ? metalc22 M O9 88T . C 88T 200 1_555 N GD GD . C GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? 
metalc ? metalc23 O N4 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.685 ? 
metalc ? metalc24 O O4 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? 
metalc ? metalc25 O N5 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.653 ? 
metalc ? metalc26 O O5 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.663 ? 
metalc ? metalc27 O N6 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.657 ? 
metalc ? metalc28 O O6 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? 
metalc ? metalc29 O N7 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.637 ? 
metalc ? metalc30 O O7 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.318 ? 
metalc ? metalc31 O O8 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? 
metalc ? metalc32 O O9 88T . D 88T 200 1_555 P GD GD . D GD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? 
#
_chem_comp.formula           'C24 H46 O11' 
_chem_comp.formula_weight    510.615 
_chem_comp.id                LMT 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE 
_chem_comp.type              d-saccharide 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1B C2B LMT sing 448 n n 
C1B O1B LMT sing 449 n n 
C1B O5B LMT sing 450 n n 
C1B H1B LMT sing 451 n n 
C2B C3B LMT sing 452 n n 
C2B O2B LMT sing 453 n n 
C2B H2B LMT sing 454 n n 
C3B C4B LMT sing 455 n n 
C3B O3B LMT sing 456 n n 
C3B H3B LMT sing 457 n n 
C4B C5B LMT sing 458 n n 
C4B O4' LMT sing 459 n n 
C4B H4B LMT sing 460 n n 
C5B C6B LMT sing 461 n n 
C5B O5B LMT sing 462 n n 
C5B H5B LMT sing 463 n n 
C6B O6B LMT sing 464 n n 
C6B "H6'2" LMT sing 465 n n 
C6B "H6'1" LMT sing 466 n n 
O1B C4' LMT sing 467 n n 
O2B H2O1 LMT sing 468 n n 
O3B H3O1 LMT sing 469 n n 
O4' H4O1 LMT sing 470 n n 
O6B H6B LMT sing 471 n n 
C1' C2' LMT sing 472 n n 
C1' O1' LMT sing 473 n n 
C1' O5' LMT sing 474 n n 
C1' H1' LMT sing 475 n n 
C2' C3' LMT sing 476 n n 
C2' O2' LMT sing 477 n n 
C2' H2' LMT sing 478 n n 
C3' C4' LMT sing 479 n n 
C3' O3' LMT sing 480 n n 
C3' H3' LMT sing 481 n n 
C4' C5' LMT sing 482 n n 
C4' H4' LMT sing 483 n n 
C5' C6' LMT sing 484 n n 
C5' O5' LMT sing 485 n n 
C5' H5' LMT sing 486 n n 
C6' O6' LMT sing 487 n n 
C6' H6D LMT sing 488 n n 
C6' H6E LMT sing 489 n n 
O1' C1 LMT sing 490 n n 
O2' H2O2 LMT sing 491 n n 
O3' H3O2 LMT sing 492 n n 
O6' H6' LMT sing 493 n n 
C1 C2 LMT sing 494 n n 
C1 H12 LMT sing 495 n n 
C1 H11 LMT sing 496 n n 
C2 C3 LMT sing 497 n n 
C2 H22 LMT sing 498 n n 
C2 H21 LMT sing 499 n n 
C3 C4 LMT sing 500 n n 
C3 H32 LMT sing 501 n n 
C3 H31 LMT sing 502 n n 
C4 C5 LMT sing 503 n n 
C4 H42 LMT sing 504 n n 
C4 H41 LMT sing 505 n n 
C5 C6 LMT sing 506 n n 
C5 H52 LMT sing 507 n n 
C5 H51 LMT sing 508 n n 
C6 C7 LMT sing 509 n n 
C6 H62 LMT sing 510 n n 
C6 H61 LMT sing 511 n n 
C7 C8 LMT sing 512 n n 
C7 H72 LMT sing 513 n n 
C7 H71 LMT sing 514 n n 
C8 C9 LMT sing 515 n n 
C8 H82 LMT sing 516 n n 
C8 H81 LMT sing 517 n n 
C9 C10 LMT sing 518 n n 
C9 H92 LMT sing 519 n n 
C9 H91 LMT sing 520 n n 
C10 C11 LMT sing 521 n n 
C10 H102 LMT sing 522 n n 
C10 H101 LMT sing 523 n n 
C11 C12 LMT sing 524 n n 
C11 H112 LMT sing 525 n n 
C11 H111 LMT sing 526 n n 
C12 H123 LMT sing 527 n n 
C12 H122 LMT sing 528 n n 
C12 H121 LMT sing 529 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7PH3 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 3 ANP A 1 601 601 ANP ANP . 
F 4 MG A 1 602 602 MG MG . 
G 5 LMT A 1 603 603 LMT LMT . 
H 6 3PE A 1 604 604 3PE 3PE . 
I 3 ANP B 1 601 601 ANP ANP . 
J 4 MG B 1 602 602 MG MG . 
K 6 3PE B 1 603 603 3PE 3PE . 
L 5 LMT B 1 604 604 LMT LMT . 
M 7 88T C 1 200 200 88T 8WI . 
N 8 GD C 1 201 201 GD GD . 
O 7 88T D 1 200 200 88T 8WI . 
P 8 GD D 1 201 201 GD GD . 
Q 9 HOH A 1 701 701 HOH HOH . 
Q 9 HOH A 2 702 702 HOH HOH . 
R 9 HOH B 1 701 701 HOH HOH . 
R 9 HOH B 2 702 702 HOH HOH . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1B LMT . . . L 5 142.128 161.366 134.704 1 37.91 ? C1B LMT 604 B 1 
HETATM 2 C C2B LMT . . . L 5 141.073 162.411 135.102 1 37.91 ? C2B LMT 604 B 1 
HETATM 3 C C3B LMT . . . L 5 141.756 163.698 135.601 1 37.91 ? C3B LMT 604 B 1 
HETATM 4 C C4B LMT . . . L 5 142.742 164.244 134.539 1 37.91 ? C4B LMT 604 B 1 
HETATM 5 C C5B LMT . . . L 5 143.612 163.078 134.036 1 37.91 ? C5B LMT 604 B 1 
HETATM 6 C C6B LMT . . . L 5 145.079 163.486 134.067 1 37.91 ? C6B LMT 604 B 1 
HETATM 7 O O1B LMT . . . L 5 141.851 160.872 133.432 1 37.91 ? O1B LMT 604 B 1 
HETATM 8 O O2B LMT . . . L 5 140.313 162.662 133.991 1 37.91 ? O2B LMT 604 B 1 
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HETATM 10 O O4' LMT . . . L 5 142.059 164.792 133.476 1 37.91 ? O4' LMT 604 B 1 
HETATM 11 O O5B LMT . . . L 5 143.42 161.894 134.772 1 37.91 ? O5B LMT 604 B 1 
HETATM 12 O O6B LMT . . . L 5 145.464 163.761 135.355 1 37.91 ? O6B LMT 604 B 1 
HETATM 13 C C1' LMT . . . L 5 140.943 157.128 131.773 1 37.91 ? C1' LMT 604 B 1 
HETATM 14 C C2' LMT . . . L 5 139.972 157.679 132.835 1 37.91 ? C2' LMT 604 B 1 
HETATM 15 C C3' LMT . . . L 5 140.179 159.194 133.073 1 37.91 ? C3' LMT 604 B 1 
HETATM 16 C C4' LMT . . . L 5 141.656 159.48 133.325 1 37.91 ? C4' LMT 604 B 1 
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HETATM 18 C C6' LMT . . . L 5 143.77 159.401 131.896 1 37.91 ? C6' LMT 604 B 1 
HETATM 19 O O1' LMT . . . L 5 140.984 155.773 131.867 1 37.91 ? O1' LMT 604 B 1 
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HETATM 22 O O5' LMT . . . L 5 142.271 157.568 132.022 1 37.91 ? O5' LMT 604 B 1 
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HETATM 24 C C1 LMT . . . L 5 140.074 155.086 131.048 1 37.91 ? C1 LMT 604 B 1 
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HETATM 26 C C3 LMT . . . L 5 141.234 152.966 131.818 1 37.91 ? C3 LMT 604 B 1 
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HETATM 29 C C6 LMT . . . L 5 141.15 149.242 131.516 1 37.91 ? C6 LMT 604 B 1 
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