data_7PLM
#
_model_server_result.job_id            skFSA7AsIE5jKijAeibDXw 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-03-04 14:01:41' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7plm 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":1303}' 
#
_entry.id    7PLM 
#
_exptl.entry_id    7PLM 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              351.64 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7PLM 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7PLM 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 C N N 
? 2 D N N 
? 2 E N N 
? 2 I N N 
? 2 J N N 
? 2 K N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 1195 A CYS 1195 1_555 A SG CYS 1212 A CYS 1212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf2 B SG CYS 1195 B CYS 1195 1_555 B SG CYS 1212 B CYS 1212 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? 
metalc ? metalc1 A SG CYS 689 A CYS 689 1_555 C FE4 SF4 . A SF4 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 692 A CYS 692 1_555 C FE3 SF4 . A SF4 1301 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.245 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 695 A CYS 695 1_555 C FE2 SF4 . A SF4 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? 
metalc ? metalc4 A SG CYS 699 A CYS 699 1_555 D FE2 SF4 . A SF4 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? 
metalc ? metalc5 A SG CYS 745 A CYS 745 1_555 D FE3 SF4 . A SF4 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? 
metalc ? metalc6 A SG CYS 748 A CYS 748 1_555 D FE4 SF4 . A SF4 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? 
metalc ? metalc7 A SG CYS 751 A CYS 751 1_555 D FE1 SF4 . A SF4 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? 
metalc ? metalc8 A SG CYS 755 A CYS 755 1_555 C FE1 SF4 . A SF4 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? 
metalc ? metalc9 A SG CYS 812 A CYS 812 1_555 E FE2 SF4 . A SF4 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? 
metalc ? metalc10 A SG CYS 815 A CYS 815 1_555 E FE3 SF4 . A SF4 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? 
metalc ? metalc11 A SG CYS 840 A CYS 840 1_555 E FE1 SF4 . A SF4 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? 
metalc ? metalc12 A OD1 ASP 963 A ASP 963 1_555 H MG MG . A MG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.005 ? 
metalc ? metalc13 A OD2 ASP 963 A ASP 963 1_555 H MG MG . A MG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.108 ? 
metalc ? metalc14 A OD1 ASP 983 A ASP 983 1_555 G CA CA . A CA 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? 
metalc ? metalc15 A OD1 ASN 985 A ASN 985 1_555 G CA CA . A CA 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? 
metalc ? metalc16 A OG1 THR 991 A THR 991 1_555 H MG MG . A MG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? 
metalc ? metalc17 A O VAL 993 A VAL 993 1_555 H MG MG . A MG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.935 ? 
metalc ? metalc18 A O ALA 1056 A ALA 1056 1_555 G CA CA . A CA 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.123 ? 
metalc ? metalc19 A O PHE 1059 A PHE 1059 1_555 G CA CA . A CA 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.543 ? 
metalc ? metalc20 A O GLY 1061 A GLY 1061 1_555 G CA CA . A CA 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.836 ? 
metalc ? metalc21 A SG CYS 1071 A CYS 1071 1_555 E FE4 SF4 . A SF4 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? 
metalc ? metalc22 F O2A TPP . A TPP 1304 1_555 H MG MG . A MG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? 
metalc ? metalc23 F O2B TPP . A TPP 1304 1_555 H MG MG . A MG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.807 ? 
metalc ? metalc24 B SG CYS 689 B CYS 689 1_555 I FE4 SF4 . B SF4 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? 
metalc ? metalc25 B SG CYS 692 B CYS 692 1_555 I FE3 SF4 . B SF4 1301 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? 
metalc ? metalc26 B SG CYS 695 B CYS 695 1_555 I FE2 SF4 . B SF4 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? 
metalc ? metalc27 B SG CYS 699 B CYS 699 1_555 J FE2 SF4 . B SF4 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? 
metalc ? metalc28 B SG CYS 745 B CYS 745 1_555 J FE3 SF4 . B SF4 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? 
metalc ? metalc29 B SG CYS 748 B CYS 748 1_555 J FE4 SF4 . B SF4 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? 
metalc ? metalc30 B SG CYS 751 B CYS 751 1_555 J FE1 SF4 . B SF4 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? 
metalc ? metalc31 B SG CYS 755 B CYS 755 1_555 I FE1 SF4 . B SF4 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? 
metalc ? metalc32 B SG CYS 812 B CYS 812 1_555 K FE2 SF4 . B SF4 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? 
metalc ? metalc33 B SG CYS 815 B CYS 815 1_555 K FE3 SF4 . B SF4 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? 
metalc ? metalc34 B SG CYS 840 B CYS 840 1_555 K FE1 SF4 . B SF4 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? 
metalc ? metalc35 B OD1 ASP 963 B ASP 963 1_555 N MG MG . B MG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.006 ? 
metalc ? metalc36 B OD2 ASP 963 B ASP 963 1_555 N MG MG . B MG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? 
metalc ? metalc37 B OD1 ASP 983 B ASP 983 1_555 M CA CA . B CA 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.405 ? 
metalc ? metalc38 B OD1 ASN 985 B ASN 985 1_555 M CA CA . B CA 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? 
metalc ? metalc39 B OG1 THR 991 B THR 991 1_555 N MG MG . B MG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? 
metalc ? metalc40 B O VAL 993 B VAL 993 1_555 N MG MG . B MG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.931 ? 
metalc ? metalc41 B O ALA 1056 B ALA 1056 1_555 M CA CA . B CA 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.12 ? 
metalc ? metalc42 B O PHE 1059 B PHE 1059 1_555 M CA CA . B CA 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.543 ? 
metalc ? metalc43 B O GLY 1061 B GLY 1061 1_555 M CA CA . B CA 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.836 ? 
metalc ? metalc44 B SG CYS 1071 B CYS 1071 1_555 K FE4 SF4 . B SF4 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? 
metalc ? metalc45 L O2A TPP . B TPP 1304 1_555 N MG MG . B MG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? 
metalc ? metalc46 L O2B TPP . B TPP 1304 1_555 N MG MG . B MG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.802 ? 
#
_chem_comp.formula           'Fe4 S4' 
_chem_comp.formula_weight    351.64 
_chem_comp.id                SF4 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
FE1 S2 SF4 sing 290 n n 
FE1 S3 SF4 sing 291 n n 
FE1 S4 SF4 sing 292 n n 
FE2 S1 SF4 sing 293 n n 
FE2 S3 SF4 sing 294 n n 
FE2 S4 SF4 sing 295 n n 
FE3 S1 SF4 sing 296 n n 
FE3 S2 SF4 sing 297 n n 
FE3 S4 SF4 sing 298 n n 
FE4 S1 SF4 sing 299 n n 
FE4 S2 SF4 sing 300 n n 
FE4 S3 SF4 sing 301 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7PLM 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 SF4 A 1 1301 1233 SF4 SF4 . 
D 2 SF4 A 1 1302 1234 SF4 SF4 . 
E 2 SF4 A 1 1303 1235 SF4 SF4 . 
F 3 TPP A 1 1304 1236 TPP TPP . 
G 4 CA A 1 1305 1238 CA CA . 
H 5 MG A 1 1306 1237 MG MG . 
I 2 SF4 B 1 1301 1233 SF4 SF4 . 
J 2 SF4 B 1 1302 1234 SF4 SF4 . 
K 2 SF4 B 1 1303 1235 SF4 SF4 . 
L 3 TPP B 1 1304 1236 TPP TPP . 
M 4 CA B 1 1305 1238 CA CA . 
N 5 MG B 1 1306 1237 MG MG . 
O 6 HOH A 1 1401 1352 HOH HOH . 
O 6 HOH A 2 1402 2008 HOH HOH . 
O 6 HOH A 3 1403 2020 HOH HOH . 
O 6 HOH A 4 1404 2022 HOH HOH . 
O 6 HOH A 5 1405 1264 HOH HOH . 
O 6 HOH A 6 1406 1469 HOH HOH . 
O 6 HOH A 7 1407 1382 HOH HOH . 
O 6 HOH A 8 1408 1471 HOH HOH . 
O 6 HOH A 9 1409 2019 HOH HOH . 
O 6 HOH A 10 1410 2007 HOH HOH . 
O 6 HOH A 11 1411 1735 HOH HOH . 
O 6 HOH A 12 1412 1249 HOH HOH . 
O 6 HOH A 13 1413 1245 HOH HOH . 
O 6 HOH A 14 1414 2011 HOH HOH . 
O 6 HOH A 15 1415 1409 HOH HOH . 
O 6 HOH A 16 1416 2003 HOH HOH . 
O 6 HOH A 17 1417 1241 HOH HOH . 
O 6 HOH A 18 1418 1337 HOH HOH . 
O 6 HOH A 19 1419 2027 HOH HOH . 
O 6 HOH A 20 1420 1691 HOH HOH . 
O 6 HOH A 21 1421 2021 HOH HOH . 
O 6 HOH A 22 1422 2031 HOH HOH . 
O 6 HOH A 23 1423 1370 HOH HOH . 
O 6 HOH A 24 1424 1312 HOH HOH . 
O 6 HOH A 25 1425 1332 HOH HOH . 
O 6 HOH A 26 1426 1278 HOH HOH . 
O 6 HOH A 27 1427 2001 HOH HOH . 
O 6 HOH A 28 1428 1388 HOH HOH . 
O 6 HOH A 29 1429 2005 HOH HOH . 
O 6 HOH A 30 1430 1477 HOH HOH . 
O 6 HOH A 31 1431 1248 HOH HOH . 
O 6 HOH A 32 1432 1256 HOH HOH . 
O 6 HOH A 33 1433 1349 HOH HOH . 
O 6 HOH A 34 1434 1481 HOH HOH . 
O 6 HOH A 35 1435 1763 HOH HOH . 
O 6 HOH A 36 1436 1530 HOH HOH . 
O 6 HOH A 37 1437 1566 HOH HOH . 
O 6 HOH A 38 1438 2002 HOH HOH . 
O 6 HOH A 39 1439 1360 HOH HOH . 
O 6 HOH A 40 1440 1632 HOH HOH . 
O 6 HOH A 41 1441 2023 HOH HOH . 
O 6 HOH A 42 1442 2029 HOH HOH . 
O 6 HOH A 43 1443 2030 HOH HOH . 
O 6 HOH A 44 1444 2010 HOH HOH . 
O 6 HOH A 45 1445 1260 HOH HOH . 
O 6 HOH A 46 1446 1334 HOH HOH . 
O 6 HOH A 47 1447 2026 HOH HOH . 
O 6 HOH A 48 1448 2018 HOH HOH . 
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