data_7PNK
#
_model_server_result.job_id            8hhzAamUoVFVu_W7uQYRDA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-21 17:38:41' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7pnk 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"ID","auth_seq_id":404}' 
#
_entry.id    7PNK 
#
_exptl.entry_id    7PNK 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              536.873 
_entity.id                          30 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            BETA-CAROTENE 
_entity.pdbx_number_of_molecules    16 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7PNK 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7PNK 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    44-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      44 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF,BF,CF,DF,EF,FF,GF,HF,IF,JF,KF,LF,MF,NF,OF,PF,QF,RF,SF,TF,UF,VF,WF,XF,YF,ZF,AG,BG,CG,DG,EG,FG,GG,HG,IG,JG,KG,LG,MG,NG,OG,PG,QG,RG,SG,TG,UG,VG,WG,XG,YG,ZG,AH,BH,CH,DH,EH,FH,GH,HH,IH,JH,KH,LH,MH,NH,OH,PH,QH,RH,SH,TH,UH,VH,WH,XH,YH,ZH,AI,BI,CI,DI,EI,FI,GI,HI,II,JI,KI,LI,MI,NI,OI,PI,QI,RI,SI,TI,UI,VI,WI,XI,YI,ZI,AJ,BJ,CJ,DJ,EJ,FJ,GJ,HJ,IJ,JJ,KJ,LJ,MJ,NJ,OJ,PJ,QJ,RJ,SJ,TJ,UJ,VJ,WJ,XJ,YJ,ZJ,AK,BK,CK,DK,EK,FK,GK,HK 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 30 CB N N 
? 30 WB N N 
? 30 XB N N 
? 30 SC N N 
? 30 TC N N 
? 30 UC N N 
? 30 VC N N 
? 30 ID N N 
? 30 MH N N 
? 30 GI N N 
? 30 HI N N 
? 30 CJ N N 
? 30 DJ N N 
? 30 EJ N N 
? 30 FJ N N 
? 30 SJ N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 B C LEU 216 B LEU 217 1_555 B N CSD 217 B CSD 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale2 B C CSD 217 B CSD 218 1_555 B N VAL 218 B VAL 219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale3 Z C LEU 216 b LEU 217 1_555 Z N CSD 217 b CSD 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale4 Z C CSD 217 b CSD 218 1_555 Z N VAL 218 b VAL 219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
metalc ? metalc1 A OD2 ASP 162 A ASP 170 1_555 SA CA1 OEX . A OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.105 ? 
metalc ? metalc2 A OE2 GLU 181 A GLU 189 1_555 SA CA1 OEX . A OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.126 ? 
metalc ? metalc3 A OE1 GLU 325 A GLU 333 1_555 SA MN3 OEX . A OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.686 ? 
metalc ? metalc4 A OE2 GLU 325 A GLU 333 1_555 SA MN4 OEX . A OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.767 ? 
metalc ? metalc5 A OD1 ASP 334 A ASP 342 1_555 SA MN2 OEX . A OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.656 ? 
metalc ? metalc6 A OD2 ASP 334 A ASP 342 1_555 SA MN1 OEX . A OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? 
metalc ? metalc7 SA MN2 OEX . A OEX 401 1_555 D OE1 GLU 330 C GLU 342 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? 
metalc ? metalc8 SA MN3 OEX . A OEX 401 1_555 D OE2 GLU 330 C GLU 342 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.721 ? 
metalc ? metalc9 F NE2 HIS 17 E HIS 23 1_555 OD FE HEM . F HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.76 ? 
metalc ? metalc10 G NE2 HIS 10 F HIS 23 1_555 OD FE HEM . F HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? 
metalc ? metalc11 T O ILE 110 N ILE 145 1_555 DE MG CHL . N CHL 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.908 ? 
metalc ? metalc12 U O PHE 10 G PHE 40 1_555 SE MG CHL . G CHL 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.946 ? 
metalc ? metalc13 V O PHE 14 S PHE 60 1_555 LF MG CHL . S CHL 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.935 ? 
metalc ? metalc14 VF MG CLA . S CLA 611 1_555 DG O4 LHG . S LHG 624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.999 ? 
metalc ? metalc15 W O PHE 11 Y PHE 49 1_555 GG MG CHL . Y CHL 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.993 ? 
metalc ? metalc16 W O ILE 108 Y ILE 146 1_555 KG MG CHL . Y CHL 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.982 ? 
metalc ? metalc17 Y OE1 GLU 181 a GLU 189 1_555 CH MN1 OEX . a OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.736 ? 
metalc ? metalc18 Y OE2 GLU 181 a GLU 189 1_555 CH MN1 OEX . a OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.735 ? 
metalc ? metalc19 Y OE2 GLU 325 a GLU 333 1_555 CH MN4 OEX . a OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.786 ? 
metalc ? metalc20 Y OD2 ASP 334 a ASP 342 1_555 CH MN1 OEX . a OEX 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.699 ? 
metalc ? metalc21 CH MN2 OEX . a OEX 401 1_555 BA OE2 GLU 330 c GLU 342 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.783 ? 
metalc ? metalc22 DH FE FE2 . a FE2 402 1_555 PJ O1 BCT . d BCT 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.78 ? 
metalc ? metalc23 DA NE2 HIS 17 e HIS 23 1_555 YJ FE HEM . f HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.734 ? 
metalc ? metalc24 EA NE2 HIS 10 f HIS 23 1_555 YJ FE HEM . f HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.721 ? 
#
_chem_comp.formula           'C40 H56' 
_chem_comp.formula_weight    536.873 
_chem_comp.id                BCR 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              BETA-CAROTENE 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 BCR sing 348 n n 
C1 C6 BCR sing 349 n n 
C1 C31 BCR sing 350 n n 
C1 C32 BCR sing 351 n n 
C2 C3 BCR sing 352 n n 
C2 HC21 BCR sing 353 n n 
C2 HC22 BCR sing 354 n n 
C3 C4 BCR sing 355 n n 
C3 HC31 BCR sing 356 n n 
C3 HC32 BCR sing 357 n n 
C4 C5 BCR sing 358 n n 
C4 HC41 BCR sing 359 n n 
C4 HC42 BCR sing 360 n n 
C5 C6 BCR doub 361 n n 
C5 C33 BCR sing 362 n n 
C6 C7 BCR sing 363 n n 
C7 C8 BCR doub 364 e n 
C7 HC7 BCR sing 365 n n 
C8 C9 BCR sing 366 n n 
C8 HC8 BCR sing 367 n n 
C9 C10 BCR doub 368 e n 
C9 C34 BCR sing 369 n n 
C10 C11 BCR sing 370 n n 
C10 H10C BCR sing 371 n n 
C11 C12 BCR doub 372 e n 
C11 H11C BCR sing 373 n n 
C33 H331 BCR sing 374 n n 
C33 H332 BCR sing 375 n n 
C33 H333 BCR sing 376 n n 
C31 H311 BCR sing 377 n n 
C31 H312 BCR sing 378 n n 
C31 H313 BCR sing 379 n n 
C32 H321 BCR sing 380 n n 
C32 H322 BCR sing 381 n n 
C32 H323 BCR sing 382 n n 
C34 H341 BCR sing 383 n n 
C34 H342 BCR sing 384 n n 
C34 H343 BCR sing 385 n n 
C12 C13 BCR sing 386 n n 
C12 H12C BCR sing 387 n n 
C13 C14 BCR doub 388 e n 
C13 C35 BCR sing 389 n n 
C14 C15 BCR sing 390 n n 
C14 H14C BCR sing 391 n n 
C15 C16 BCR doub 392 e n 
C15 H15C BCR sing 393 n n 
C16 C17 BCR sing 394 n n 
C16 H16C BCR sing 395 n n 
C17 C18 BCR doub 396 e n 
C17 H17C BCR sing 397 n n 
C18 C19 BCR sing 398 n n 
C18 C36 BCR sing 399 n n 
C19 C20 BCR doub 400 e n 
C19 H19C BCR sing 401 n n 
C20 C21 BCR sing 402 n n 
C20 H20C BCR sing 403 n n 
C21 C22 BCR doub 404 e n 
C21 H21C BCR sing 405 n n 
C22 C23 BCR sing 406 n n 
C22 C37 BCR sing 407 n n 
C23 C24 BCR doub 408 e n 
C23 H23C BCR sing 409 n n 
C24 C25 BCR sing 410 n n 
C24 H24C BCR sing 411 n n 
C25 C26 BCR doub 412 n n 
C25 C30 BCR sing 413 n n 
C26 C27 BCR sing 414 n n 
C26 C38 BCR sing 415 n n 
C27 C28 BCR sing 416 n n 
C27 H271 BCR sing 417 n n 
C27 H272 BCR sing 418 n n 
C28 C29 BCR sing 419 n n 
C28 H281 BCR sing 420 n n 
C28 H282 BCR sing 421 n n 
C29 C30 BCR sing 422 n n 
C29 H291 BCR sing 423 n n 
C29 H292 BCR sing 424 n n 
C30 C39 BCR sing 425 n n 
C30 C40 BCR sing 426 n n 
C35 H351 BCR sing 427 n n 
C35 H352 BCR sing 428 n n 
C35 H353 BCR sing 429 n n 
C36 H361 BCR sing 430 n n 
C36 H362 BCR sing 431 n n 
C36 H363 BCR sing 432 n n 
C37 H371 BCR sing 433 n n 
C37 H372 BCR sing 434 n n 
C37 H373 BCR sing 435 n n 
C38 H381 BCR sing 436 n n 
C38 H382 BCR sing 437 n n 
C38 H383 BCR sing 438 n n 
C39 H391 BCR sing 439 n n 
C39 H392 BCR sing 440 n n 
C39 H393 BCR sing 441 n n 
C40 H401 BCR sing 442 n n 
C40 H402 BCR sing 443 n n 
C40 H403 BCR sing 444 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7PNK 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
SA 25 OEX A 1 401 401 OEX OEX . 
TA 26 FE2 A 1 402 402 FE2 FE2 . 
UA 27 CL A 1 403 403 CL CL . 
VA 27 CL A 1 404 404 CL CL . 
WA 28 CLA A 1 405 405 CLA CLA . 
XA 28 CLA A 1 406 406 CLA CLA . 
YA 28 CLA A 1 407 407 CLA CLA . 
ZA 29 PHO A 1 408 408 PHO PHO . 
AB 29 PHO A 1 409 409 PHO PHO . 
BB 28 CLA A 1 410 410 CLA CLA . 
CB 30 BCR A 1 411 411 BCR BCR . 
DB 31 SQD A 1 412 412 SQD SQD . 
EB 32 LMG A 1 413 413 LMG LMG . 
FB 33 SPH A 1 414 414 SPH SPH . 
GB 28 CLA B 1 602 602 CLA CLA . 
HB 28 CLA B 1 603 603 CLA CLA . 
IB 28 CLA B 1 604 604 CLA CLA . 
JB 28 CLA B 1 605 605 CLA CLA . 
KB 28 CLA B 1 606 606 CLA CLA . 
LB 28 CLA B 1 607 607 CLA CLA . 
MB 28 CLA B 1 608 608 CLA CLA . 
NB 28 CLA B 1 609 609 CLA CLA . 
OB 28 CLA B 1 610 610 CLA CLA . 
PB 28 CLA B 1 611 611 CLA CLA . 
QB 28 CLA B 1 612 612 CLA CLA . 
RB 28 CLA B 1 613 613 CLA CLA . 
SB 28 CLA B 1 614 614 CLA CLA . 
TB 28 CLA B 1 615 615 CLA CLA . 
UB 28 CLA B 1 616 616 CLA CLA . 
VB 28 CLA B 1 617 617 CLA CLA . 
WB 30 BCR B 1 618 618 BCR BCR . 
XB 30 BCR B 1 619 619 BCR BCR . 
YB 34 C7Z B 1 620 620 C7Z C7Z . 
ZB 31 SQD B 1 621 621 SQD SQD . 
AC 32 LMG B 1 622 622 LMG LMG . 
BC 35 DGD B 1 623 623 DGD DGD . 
CC 36 3PH B 1 624 624 3PH 3PH . 
DC 37 DGA B 1 625 625 DGA DGA . 
EC 31 SQD B 1 626 626 SQD SQD . 
FC 28 CLA C 1 501 501 CLA CLA . 
GC 28 CLA C 1 502 502 CLA CLA . 
HC 28 CLA C 1 503 503 CLA CLA . 
IC 28 CLA C 1 504 504 CLA CLA . 
JC 28 CLA C 1 505 505 CLA CLA . 
KC 28 CLA C 1 506 506 CLA CLA . 
LC 28 CLA C 1 507 507 CLA CLA . 
MC 28 CLA C 1 508 508 CLA CLA . 
NC 28 CLA C 1 509 509 CLA CLA . 
OC 28 CLA C 1 510 510 CLA CLA . 
PC 28 CLA C 1 511 511 CLA CLA . 
QC 28 CLA C 1 512 512 CLA CLA . 
RC 28 CLA C 1 513 513 CLA CLA . 
SC 30 BCR C 1 514 514 BCR BCR . 
TC 30 BCR C 1 515 515 BCR BCR . 
UC 30 BCR C 1 516 516 BCR BCR . 
VC 30 BCR C 1 517 517 BCR BCR . 
WC 35 DGD C 1 518 518 DGD DGD . 
XC 35 DGD C 1 519 519 DGD DGD . 
YC 35 DGD C 1 520 520 DGD DGD . 
ZC 32 LMG C 1 521 521 LMG LMG . 
AD 32 LMG C 1 523 523 LMG LMG . 
BD 37 DGA C 1 524 524 DGA DGA . 
CD 38 LHG C 1 525 525 LHG LHG . 
DD 31 SQD C 1 526 526 SQD SQD . 
ED 39 LMK C 1 527 527 LMK LMK . 
FD 40 BCT D 1 401 401 BCT BCT . 
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HD 28 CLA D 1 403 403 CLA CLA . 
ID 30 BCR D 1 404 404 BCR BCR . 
JD 41 PL9 D 1 405 405 PL9 PL9 . 
KD 38 LHG D 1 408 408 LHG LHG . 
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TD 37 DGA J 1 101 101 DGA DGA . 
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VD 38 LHG L 1 101 101 LHG LHG . 
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AE 28 CLA N 1 602 602 CLA CLA . 
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CE 28 CLA N 1 604 604 CLA CLA . 
DE 46 CHL N 1 605 605 CHL CHL . 
EE 46 CHL N 1 606 606 CHL CHL . 
FE 46 CHL N 1 607 607 CHL CHL . 
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