data_7PNM # _model_server_result.job_id znP57qfBN9VCTGE5zu24XQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 09:10:37' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7pnm # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"W","auth_seq_id":1402}' # _entry.id 7PNM # _exptl.entry_id 7PNM _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 24 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7PNM _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7PNM _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 V N N ? 5 W N N ? 5 X N N ? 5 Y N N ? 5 Z N N ? 5 AA N N ? 5 BA N N ? 5 CA N N ? 5 DA N N ? 5 EA N N ? 5 FA N N ? 5 GA N N ? 5 HA N N ? 5 IA N N ? 5 JA N N ? 5 KA N N ? 5 LA N N ? 5 MA N N ? 5 NA N N ? 5 OA N N ? 5 PA N N ? 5 QA N N ? 5 RA N N ? 5 SA N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 4 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 4 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n J NAG 1 F 1 NAG A 2125 NAG 4 n J NAG 2 F 2 NAG A 2126 NAG 4 n K NAG 1 J 1 NAG A 2194 NAG 4 n K NAG 2 J 2 NAG A 2195 NAG 4 n L NAG 1 K 1 NAG A 2363 NAG 4 n L NAG 2 K 2 NAG A 2364 NAG 4 n M NAG 1 M 1 NAG A 2929 NAG 4 n M NAG 2 M 2 NAG A 2930 NAG 4 n N NAG 1 N 1 NAG B 2125 NAG 4 n N NAG 2 N 2 NAG B 2126 NAG 4 n O NAG 1 O 1 NAG B 2194 NAG 4 n O NAG 2 O 2 NAG B 2195 NAG 4 n P NAG 1 P 1 NAG B 2363 NAG 4 n P NAG 2 P 2 NAG B 2364 NAG 4 n Q NAG 1 Q 1 NAG B 2929 NAG 4 n Q NAG 2 Q 2 NAG B 2930 NAG 4 n R NAG 1 R 1 NAG C 2125 NAG 4 n R NAG 2 R 2 NAG C 2126 NAG 4 n S NAG 1 S 1 NAG C 2194 NAG 4 n S NAG 2 S 2 NAG C 2195 NAG 4 n T NAG 1 T 1 NAG C 2363 NAG 4 n T NAG 2 T 2 NAG C 2364 NAG 4 n U NAG 1 U 1 NAG C 2929 NAG 4 n U NAG 2 U 2 NAG C 2930 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 31 A CYS 21 1_555 A SG CYS 179 A CYS 169 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 174 A CYS 164 1_555 A SG CYS 207 A CYS 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 186 A CYS 176 1_555 A SG CYS 266 A CYS 256 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 300 A CYS 290 1_555 A SG CYS 310 A CYS 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 345 A CYS 335 1_555 A SG CYS 370 A CYS 360 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 388 A CYS 378 1_555 A SG CYS 441 A CYS 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 400 A CYS 390 1_555 A SG CYS 615 A CYS 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 493 A CYS 483 1_555 A SG CYS 562 A CYS 553 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 501 A CYS 491 1_555 A SG CYS 523 A CYS 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 503 A CYS 493 1_555 A SG CYS 577 A CYS 568 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 536 A CYS 527 1_555 A SG CYS 549 A CYS 540 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 572 A CYS 563 1_555 A SG CYS 579 A CYS 570 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 592 A CYS 583 1_555 A SG CYS 598 A CYS 589 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf14 A SG CYS 631 A CYS 622 1_555 A SG CYS 684 A CYS 675 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf15 A SG CYS 709 A CYS 700 1_555 A SG CYS 733 A CYS 725 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf16 A SG CYS 748 A CYS 740 1_555 A SG CYS 757 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf17 A SG CYS 826 A CYS 818 1_555 A SG CYS 848 A CYS 840 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf18 A SG CYS 831 A CYS 823 1_555 A SG CYS 837 A CYS 829 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf19 A SG CYS 938 A CYS 930 1_555 A SG CYS 949 A CYS 941 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf20 A SG CYS 1126 A CYS 1118 1_555 A SG CYS 1137 A CYS 1129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf21 A SG CYS 1176 A CYS 1168 1_555 A SG CYS 1221 A CYS 1213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 23 L CYS 23 1_555 B SG CYS 93 L CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf23 C SG CYS 22 H CYS 22 1_555 C SG CYS 96 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf24 D SG CYS 31 B CYS 21 1_555 D SG CYS 179 B CYS 169 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf25 D SG CYS 174 B CYS 164 1_555 D SG CYS 207 B CYS 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf26 D SG CYS 186 B CYS 176 1_555 D SG CYS 266 B CYS 256 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf27 D SG CYS 300 B CYS 290 1_555 D SG CYS 310 B CYS 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf28 D SG CYS 345 B CYS 335 1_555 D SG CYS 370 B CYS 360 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf29 D SG CYS 388 B CYS 378 1_555 D SG CYS 441 B CYS 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf30 D SG CYS 400 B CYS 390 1_555 D SG CYS 615 B CYS 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? disulf ? disulf31 D SG CYS 493 B CYS 483 1_555 D SG CYS 562 B CYS 553 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf32 D SG CYS 501 B CYS 491 1_555 D SG CYS 523 B CYS 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf33 D SG CYS 503 B CYS 493 1_555 D SG CYS 577 B CYS 568 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf34 D SG CYS 536 B CYS 527 1_555 D SG CYS 549 B CYS 540 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf35 D SG CYS 572 B CYS 563 1_555 D SG CYS 579 B CYS 570 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf36 D SG CYS 592 B CYS 583 1_555 D SG CYS 598 B CYS 589 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf37 D SG CYS 631 B CYS 622 1_555 D SG CYS 684 B CYS 675 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf38 D SG CYS 709 B CYS 700 1_555 D SG CYS 733 B CYS 725 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf39 D SG CYS 748 B CYS 740 1_555 D SG CYS 757 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf40 D SG CYS 826 B CYS 818 1_555 D SG CYS 848 B CYS 840 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf41 D SG CYS 831 B CYS 823 1_555 D SG CYS 837 B CYS 829 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf42 D SG CYS 938 B CYS 930 1_555 D SG CYS 949 B CYS 941 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf43 D SG CYS 1126 B CYS 1118 1_555 D SG CYS 1137 B CYS 1129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf44 D SG CYS 1176 B CYS 1168 1_555 D SG CYS 1221 B CYS 1213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf45 E SG CYS 23 D CYS 23 1_555 E SG CYS 93 D CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf46 F SG CYS 22 G CYS 22 1_555 F SG CYS 96 G CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf47 G SG CYS 31 C CYS 21 1_555 G SG CYS 179 C CYS 169 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf48 G SG CYS 174 C CYS 164 1_555 G SG CYS 207 C CYS 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf49 G SG CYS 186 C CYS 176 1_555 G SG CYS 266 C CYS 256 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf50 G SG CYS 300 C CYS 290 1_555 G SG CYS 310 C CYS 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf51 G SG CYS 345 C CYS 335 1_555 G SG CYS 370 C CYS 360 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf52 G SG CYS 388 C CYS 378 1_555 G SG CYS 441 C CYS 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf53 G SG CYS 400 C CYS 390 1_555 G SG CYS 615 C CYS 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf54 G SG CYS 493 C CYS 483 1_555 G SG CYS 562 C CYS 553 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf55 G SG CYS 501 C CYS 491 1_555 G SG CYS 523 C CYS 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf56 G SG CYS 503 C CYS 493 1_555 G SG CYS 577 C CYS 568 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf57 G SG CYS 536 C CYS 527 1_555 G SG CYS 549 C CYS 540 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf58 G SG CYS 572 C CYS 563 1_555 G SG CYS 579 C CYS 570 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf59 G SG CYS 592 C CYS 583 1_555 G SG CYS 598 C CYS 589 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf60 G SG CYS 631 C CYS 622 1_555 G SG CYS 684 C CYS 675 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf61 G SG CYS 709 C CYS 700 1_555 G SG CYS 733 C CYS 725 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf62 G SG CYS 748 C CYS 740 1_555 G SG CYS 757 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf63 G SG CYS 826 C CYS 818 1_555 G SG CYS 848 C CYS 840 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf64 G SG CYS 831 C CYS 823 1_555 G SG CYS 837 C CYS 829 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf65 G SG CYS 938 C CYS 930 1_555 G SG CYS 949 C CYS 941 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf66 G SG CYS 1126 C CYS 1118 1_555 G SG CYS 1137 C CYS 1129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf67 G SG CYS 1176 C CYS 1168 1_555 G SG CYS 1221 C CYS 1213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf68 H SG CYS 23 E CYS 23 1_555 H SG CYS 93 E CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf69 I SG CYS 22 I CYS 22 1_555 I SG CYS 96 I CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 69 A ASN 59 1_555 Y C1 NAG . A NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 143 A ASN 133 1_555 J C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 156 A ASN 146 1_555 Z C1 NAG . A NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 212 A ASN 202 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 373 A ASN 363 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 451 A ASN 441 1_555 V C1 NAG . A NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 649 A ASN 640 1_555 W C1 NAG . A NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 676 A ASN 667 1_555 AA C1 NAG . A NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 696 A ASN 687 1_555 BA C1 NAG . A NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 714 A ASN 706 1_555 CA C1 NAG . A NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 739 A ASN 731 1_555 X C1 NAG . A NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 937 A ASN 929 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale13 D ND2 ASN 69 B ASN 59 1_555 GA C1 NAG . B NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale14 D ND2 ASN 143 B ASN 133 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale15 D ND2 ASN 156 B ASN 146 1_555 HA C1 NAG . B NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale16 D ND2 ASN 212 B ASN 202 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale17 D ND2 ASN 373 B ASN 363 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale18 D ND2 ASN 451 B ASN 441 1_555 DA C1 NAG . B NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale19 D ND2 ASN 649 B ASN 640 1_555 EA C1 NAG . B NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale20 D ND2 ASN 676 B ASN 667 1_555 IA C1 NAG . B NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale21 D ND2 ASN 696 B ASN 687 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale22 D ND2 ASN 714 B ASN 706 1_555 KA C1 NAG . B NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale23 D ND2 ASN 739 B ASN 731 1_555 FA C1 NAG . B NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale24 D ND2 ASN 937 B ASN 929 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale25 G ND2 ASN 69 C ASN 59 1_555 OA C1 NAG . C NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale26 G ND2 ASN 143 C ASN 133 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale27 G ND2 ASN 156 C ASN 146 1_555 PA C1 NAG . C NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale28 G ND2 ASN 212 C ASN 202 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale29 G ND2 ASN 373 C ASN 363 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale30 G ND2 ASN 451 C ASN 441 1_555 LA C1 NAG . C NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale31 G ND2 ASN 649 C ASN 640 1_555 MA C1 NAG . C NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale32 G ND2 ASN 676 C ASN 667 1_555 QA C1 NAG . C NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale33 G ND2 ASN 696 C ASN 687 1_555 RA C1 NAG . C NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale34 G ND2 ASN 714 C ASN 706 1_555 SA C1 NAG . C NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale35 G ND2 ASN 739 C ASN 731 1_555 NA C1 NAG . C NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale36 G ND2 ASN 937 C ASN 929 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale37 J O4 NAG . F NAG 1 1_555 J C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale38 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale39 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale40 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale41 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale42 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale43 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale44 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale45 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale46 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale47 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale48 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 235 n n C1 O1 NAG sing 236 n n C1 O5 NAG sing 237 n n C1 H1 NAG sing 238 n n C2 C3 NAG sing 239 n n C2 N2 NAG sing 240 n n C2 H2 NAG sing 241 n n C3 C4 NAG sing 242 n n C3 O3 NAG sing 243 n n C3 H3 NAG sing 244 n n C4 C5 NAG sing 245 n n C4 O4 NAG sing 246 n n C4 H4 NAG sing 247 n n C5 C6 NAG sing 248 n n C5 O5 NAG sing 249 n n C5 H5 NAG sing 250 n n C6 O6 NAG sing 251 n n C6 H61 NAG sing 252 n n C6 H62 NAG sing 253 n n C7 C8 NAG sing 254 n n C7 N2 NAG sing 255 n n C7 O7 NAG doub 256 n n C8 H81 NAG sing 257 n n C8 H82 NAG sing 258 n n C8 H83 NAG sing 259 n n N2 HN2 NAG sing 260 n n O1 HO1 NAG sing 261 n n O3 HO3 NAG sing 262 n n O4 HO4 NAG sing 263 n n O6 HO6 NAG sing 264 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7PNM _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code V 5 NAG A 1 1401 2441 NAG NAG . W 5 NAG A 1 1402 2640 NAG NAG . X 5 NAG A 1 1403 2731 NAG NAG . Y 5 NAG A 1 1404 3189 NAG NAG . Z 5 NAG A 1 1405 3190 NAG NAG . AA 5 NAG A 1 1406 3191 NAG NAG . BA 5 NAG A 1 1407 3192 NAG NAG . CA 5 NAG A 1 1408 3193 NAG NAG . DA 5 NAG B 1 1401 2441 NAG NAG . EA 5 NAG B 1 1402 2640 NAG NAG . FA 5 NAG B 1 1403 2731 NAG NAG . GA 5 NAG B 1 1404 3189 NAG NAG . HA 5 NAG B 1 1405 3190 NAG NAG . IA 5 NAG B 1 1406 3191 NAG NAG . JA 5 NAG B 1 1407 3192 NAG NAG . KA 5 NAG B 1 1408 3193 NAG NAG . LA 5 NAG C 1 1401 2441 NAG NAG . MA 5 NAG C 1 1402 2640 NAG NAG . NA 5 NAG C 1 1403 2731 NAG NAG . OA 5 NAG C 1 1404 3189 NAG NAG . PA 5 NAG C 1 1405 3190 NAG NAG . QA 5 NAG C 1 1406 3191 NAG NAG . RA 5 NAG C 1 1407 3192 NAG NAG . SA 5 NAG C 1 1408 3193 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . W 5 148.016 124.82 176.052 1 107.39 ? C1 NAG 1402 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . W 5 147.688 124.042 177.332 1 107.39 ? C2 NAG 1402 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . W 5 146.241 123.552 177.295 1 107.39 ? C3 NAG 1402 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . W 5 145.285 124.708 177.028 1 107.39 ? C4 NAG 1402 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . W 5 145.699 125.462 175.765 1 107.39 ? C5 NAG 1402 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . W 5 144.869 126.699 175.515 1 107.39 ? C6 NAG 1402 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . W 5 149.234 122.682 178.667 1 107.39 ? C7 NAG 1402 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . W 5 150.14 121.488 178.68 1 107.39 ? C8 NAG 1402 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . W 5 148.602 122.926 177.515 1 107.39 ? N2 NAG 1402 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . W 5 145.921 122.933 178.536 1 107.39 ? O3 NAG 1402 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . W 5 143.96 124.214 176.864 1 107.39 ? O4 NAG 1402 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . W 5 147.064 125.896 175.879 1 107.39 ? O5 NAG 1402 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . W 5 145.293 127.379 174.341 1 107.39 ? O6 NAG 1402 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . W 5 149.083 123.394 179.655 1 107.39 ? O7 NAG 1402 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 24 _model_server_stats.parse_time_ms 13 _model_server_stats.create_model_time_ms 53 _model_server_stats.query_time_ms 303 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 14 #