data_7PRG
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_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-23 17:07:33' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          7prg 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":202}' 
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_entry.id    7PRG 
#
loop_
_exptl.entry_id
_exptl.method
7PRG 'X-RAY DIFFRACTION' 
7PRG 'NEUTRON DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
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_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CALCIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            7PRG 
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_cell.length_b            73.87 
_cell.length_c            55.003 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7PRG 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    'P 2yb' 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
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#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 E N N 
? 2 F N N 
? 2 H N N 
? 2 I N N 
? 2 L N N 
? 2 M N N 
? 2 P N N 
? 2 Q N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A O ASN 22 A ASN 21 1_555 F CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLU 96 A GLU 95 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.514 ? 
metalc ? metalc3 A OE2 GLU 96 A GLU 95 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.478 ? 
metalc ? metalc4 A OD1 ASP 100 A ASP 99 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? 
metalc ? metalc5 A OD1 ASP 102 A ASP 101 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? 
metalc ? metalc6 A OD1 ASP 102 A ASP 101 1_555 F CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.104 ? 
metalc ? metalc7 A OD2 ASP 102 A ASP 101 1_555 F CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? 
metalc ? metalc8 A OD1 ASN 104 A ASN 103 1_555 F CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? 
metalc ? metalc9 A OD1 ASP 105 A ASP 104 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.671 ? 
metalc ? metalc10 A OD2 ASP 105 A ASP 104 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? 
metalc ? metalc11 A OD1 ASP 105 A ASP 104 1_555 F CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? 
metalc ? metalc12 A O GLY 115 A GLY 114 1_555 I CA CA . B CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? 
metalc ? metalc13 E CA CA . A CA 201 1_555 G O2 FUC . A FUC 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.541 ? 
metalc ? metalc14 E CA CA . A CA 201 1_555 G O3 FUC . A FUC 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.407 ? 
metalc ? metalc15 F CA CA . A CA 202 1_555 G O3 FUC . A FUC 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? 
metalc ? metalc16 F CA CA . A CA 202 1_555 G O4 FUC . A FUC 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.5 ? 
metalc ? metalc17 F CA CA . A CA 202 1_555 B O GLY 115 B GLY 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? 
metalc ? metalc18 B O ASN 22 B ASN 21 1_555 I CA CA . B CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? 
metalc ? metalc19 B OE1 GLU 96 B GLU 95 1_555 H CA CA . B CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? 
metalc ? metalc20 B OE2 GLU 96 B GLU 95 1_555 H CA CA . B CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.428 ? 
metalc ? metalc21 B OD1 ASP 100 B ASP 99 1_555 H CA CA . B CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? 
metalc ? metalc22 B OD1 ASP 102 B ASP 101 1_555 H CA CA . B CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? 
metalc ? metalc23 B OD1 ASP 102 B ASP 101 1_555 I CA CA . B CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.102 ? 
metalc ? metalc24 B OD2 ASP 102 B ASP 101 1_555 I CA CA . B CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? 
metalc ? metalc25 B OD1 ASN 104 B ASN 103 1_555 I CA CA . B CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? 
metalc ? metalc26 B OD1 ASP 105 B ASP 104 1_555 H CA CA . B CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.706 ? 
metalc ? metalc27 B OD2 ASP 105 B ASP 104 1_555 H CA CA . B CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? 
metalc ? metalc28 B OD1 ASP 105 B ASP 104 1_555 I CA CA . B CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? 
metalc ? metalc29 H CA CA . B CA 201 1_555 J O2 FUC . B FUC 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.456 ? 
metalc ? metalc30 H CA CA . B CA 201 1_555 J O3 FUC . B FUC 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.419 ? 
metalc ? metalc31 I CA CA . B CA 202 1_555 J O4 FUC . B FUC 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? 
metalc ? metalc32 I CA CA . B CA 202 1_555 J O3 FUC . B FUC 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? 
metalc ? metalc33 C O ASN 22 C ASN 21 1_555 L CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? 
metalc ? metalc34 C OE1 GLU 96 C GLU 95 1_555 M CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? 
metalc ? metalc35 C OE2 GLU 96 C GLU 95 1_555 M CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? 
metalc ? metalc36 C OD1 ASP 100 C ASP 99 1_555 M CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? 
metalc ? metalc37 C OD1 ASP 102 C ASP 101 1_555 L CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.044 ? 
metalc ? metalc38 C OD2 ASP 102 C ASP 101 1_555 L CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? 
metalc ? metalc39 C OD1 ASP 102 C ASP 101 1_555 M CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? 
metalc ? metalc40 C OD1 ASN 104 C ASN 103 1_555 L CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? 
metalc ? metalc41 C OD1 ASP 105 C ASP 104 1_555 L CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? 
metalc ? metalc42 C OD1 ASP 105 C ASP 104 1_555 M CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.72 ? 
metalc ? metalc43 C OD2 ASP 105 C ASP 104 1_555 M CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? 
metalc ? metalc44 C O GLY 115 C GLY 114 1_555 Q CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? 
metalc ? metalc45 L CA CA . C CA 201 1_555 N O3 FUC . C FUC 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? 
metalc ? metalc46 L CA CA . C CA 201 1_555 N O4 FUC . C FUC 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.517 ? 
metalc ? metalc47 L CA CA . C CA 201 1_555 D O GLY 115 D GLY 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? 
metalc ? metalc48 M CA CA . C CA 202 1_555 N O2 FUC . C FUC 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? 
metalc ? metalc49 M CA CA . C CA 202 1_555 N O3 FUC . C FUC 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.46 ? 
metalc ? metalc50 D O ASN 22 D ASN 21 1_555 Q CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? 
metalc ? metalc51 D OE1 GLU 96 D GLU 95 1_555 P CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.556 ? 
metalc ? metalc52 D OE2 GLU 96 D GLU 95 1_555 P CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? 
metalc ? metalc53 D OD1 ASP 100 D ASP 99 1_555 P CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? 
metalc ? metalc54 D OD1 ASP 102 D ASP 101 1_555 P CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? 
metalc ? metalc55 D OD2 ASP 102 D ASP 101 1_555 Q CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.445 ? 
metalc ? metalc56 D OD1 ASN 104 D ASN 103 1_555 Q CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? 
metalc ? metalc57 D OD1 ASP 105 D ASP 104 1_555 P CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? 
metalc ? metalc58 D OD2 ASP 105 D ASP 104 1_555 P CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? 
metalc ? metalc59 D OD1 ASP 105 D ASP 104 1_555 Q CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? 
metalc ? metalc60 O O2 FUC . D FUC 201 1_555 P CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.486 ? 
metalc ? metalc61 O O3 FUC . D FUC 201 1_555 P CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.471 ? 
metalc ? metalc62 O O3 FUC . D FUC 201 1_555 Q CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.474 ? 
metalc ? metalc63 O O4 FUC . D FUC 201 1_555 Q CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ca 2' 
_chem_comp.formula_weight    40.078 
_chem_comp.id                CA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CALCIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     7PRG 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.018904 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.001514 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.013537 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.018239 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 CA A 1 201 201 CA CA . 
F 2 CA A 1 202 301 CA CA . 
G 3 FUC A 1 203 401 FUC FUC . 
H 2 CA B 1 201 201 CA CA . 
I 2 CA B 1 202 301 CA CA . 
J 3 FUC B 1 203 401 FUC FUC . 
K 4 SO4 B 1 204 501 SO4 SO4 . 
L 2 CA C 1 201 201 CA CA . 
M 2 CA C 1 202 301 CA CA . 
N 3 FUC C 1 203 401 FUC FUC . 
O 3 FUC D 1 201 201 FUC FUC . 
P 2 CA D 1 202 301 CA CA . 
Q 2 CA D 1 203 401 CA CA . 
R 5 HOH A 1 301 361 HOH HOH . 
R 5 HOH A 2 302 131 HOH HOH . 
R 5 HOH A 3 303 72 HOH HOH . 
R 5 HOH A 4 304 56 HOH HOH . 
R 5 HOH A 5 305 243 HOH HOH . 
R 5 HOH A 6 306 26 HOH HOH . 
R 5 HOH A 7 307 155 HOH HOH . 
R 5 HOH A 8 308 259 HOH HOH . 
R 5 HOH A 9 309 153 HOH HOH . 
R 5 HOH A 10 310 281 HOH HOH . 
R 5 HOH A 11 311 315 HOH HOH . 
R 5 HOH A 12 312 24 HOH HOH . 
R 5 HOH A 13 313 33 HOH HOH . 
R 5 HOH A 14 314 215 HOH HOH . 
R 5 HOH A 15 315 177 HOH HOH . 
R 5 HOH A 16 316 201 HOH HOH . 
R 5 HOH A 17 317 48 HOH HOH . 
R 5 HOH A 18 318 10 HOH HOH . 
R 5 HOH A 19 319 79 HOH HOH . 
R 5 HOH A 20 320 53 HOH HOH . 
R 5 HOH A 21 321 2 HOH HOH . 
R 5 HOH A 22 322 288 HOH HOH . 
R 5 HOH A 23 323 255 HOH HOH . 
R 5 HOH A 24 324 117 HOH HOH . 
R 5 HOH A 25 325 49 HOH HOH . 
R 5 HOH A 26 326 275 HOH HOH . 
R 5 HOH A 27 327 61 HOH HOH . 
R 5 HOH A 28 328 299 HOH HOH . 
R 5 HOH A 29 329 336 HOH HOH . 
R 5 HOH A 30 330 110 HOH HOH . 
R 5 HOH A 31 331 355 HOH HOH . 
R 5 HOH A 32 332 60 HOH HOH . 
R 5 HOH A 33 333 80 HOH HOH . 
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R 5 HOH A 36 336 25 HOH HOH . 
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U 5 HOH D 1 301 123 HOH HOH . 
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