data_7PRW
#
_model_server_result.job_id            2G7As5ePkbOmVShOaiD8BA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-22 00:58:20' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7prw 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"M","auth_seq_id":803}' 
#
_entry.id    7PRW 
#
_exptl.entry_id    7PRW 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              62.068 
_entity.id                          6 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            1,2-ETHANEDIOL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7PRW 
_cell.length_a            80.21 
_cell.length_b            122.724 
_cell.length_c            130.449 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7PRW 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    pentameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      5 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 6 H N N 
? 6 J N N 
? 6 M N N 
? 6 N N N 
? 6 O N N 
? 6 Q N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A SG CYS 37 A CYS 421 1_555 F ZN ZN . A ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.471 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 40 A CYS 424 1_555 F ZN ZN . A ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.163 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 54 A CYS 438 1_555 F ZN ZN . A ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.848 ? 
metalc ? metalc4 A SG CYS 57 A CYS 441 1_555 F ZN ZN . A ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.219 ? 
metalc ? metalc5 A SG CYS 73 A CYS 457 1_555 G ZN ZN . A ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? 
metalc ? metalc6 A SG CYS 79 A CYS 463 1_555 G ZN ZN . A ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.223 ? 
metalc ? metalc7 A SG CYS 89 A CYS 473 1_555 G ZN ZN . A ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? 
metalc ? metalc8 A SG CYS 92 A CYS 476 1_555 G ZN ZN . A ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? 
metalc ? metalc9 B SG CYS 37 B CYS 421 1_555 K ZN ZN . B ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.451 ? 
metalc ? metalc10 B SG CYS 40 B CYS 424 1_555 K ZN ZN . B ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.168 ? 
metalc ? metalc11 B SG CYS 54 B CYS 438 1_555 K ZN ZN . B ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.566 ? 
metalc ? metalc12 B SG CYS 57 B CYS 441 1_555 K ZN ZN . B ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? 
metalc ? metalc13 B SG CYS 73 B CYS 457 1_555 L ZN ZN . B ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? 
metalc ? metalc14 B SG CYS 79 B CYS 463 1_555 L ZN ZN . B ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? 
metalc ? metalc15 B SG CYS 89 B CYS 473 1_555 L ZN ZN . B ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.149 ? 
metalc ? metalc16 B SG CYS 92 B CYS 476 1_555 L ZN ZN . B ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog1 C N3 DT 1 C DT 1 1_555 D N1 DA 23 D DA 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog2 C O4 DT 1 C DT 1 1_555 D N6 DA 23 D DA 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog3 C N3 DC 2 C DC 2 1_555 D N1 DG 22 D DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog4 C N4 DC 2 C DC 2 1_555 D O6 DG 22 D DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog5 C O2 DC 2 C DC 2 1_555 D N2 DG 22 D DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog6 C N1 DG 3 C DG 3 1_555 D N3 DC 21 D DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog7 C N2 DG 3 C DG 3 1_555 D O2 DC 21 D DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog8 C O6 DG 3 C DG 3 1_555 D N4 DC 21 D DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog9 C N1 DA 4 C DA 4 1_555 D N3 DT 20 D DT 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog10 C N6 DA 4 C DA 4 1_555 D O4 DT 20 D DT 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog11 C N3 DC 5 C DC 5 1_555 D N1 DG 19 D DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog12 C N4 DC 5 C DC 5 1_555 D O6 DG 19 D DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog13 C O2 DC 5 C DC 5 1_555 D N2 DG 19 D DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog14 C N1 DG 6 C DG 6 1_555 D N3 DC 18 D DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog15 C N2 DG 6 C DG 6 1_555 D O2 DC 18 D DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog16 C O6 DG 6 C DG 6 1_555 D N4 DC 18 D DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog17 C N1 DG 7 C DG 7 1_555 D N3 DC 17 D DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog18 C N2 DG 7 C DG 7 1_555 D O2 DC 17 D DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog19 C O6 DG 7 C DG 7 1_555 D N4 DC 17 D DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog20 C N1 DA 8 C DA 8 1_555 D N3 DT 16 D DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog21 C N6 DA 8 C DA 8 1_555 D O4 DT 16 D DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog22 C N3 DC 9 C DC 9 1_555 D N1 DG 15 D DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog23 C N4 DC 9 C DC 9 1_555 D O6 DG 15 D DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog24 C O2 DC 9 C DC 9 1_555 D N2 DG 15 D DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog25 C N1 DA 10 C DA 10 1_555 D N3 DT 14 D DT 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog26 C N6 DA 10 C DA 10 1_555 D O4 DT 14 D DT 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog27 C N1 DA 11 C DA 11 1_555 D N3 DT 13 D DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog28 C N6 DA 11 C DA 11 1_555 D O4 DT 13 D DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog29 C N1 DA 12 C DA 12 1_555 D N3 DT 12 D DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog30 C N6 DA 12 C DA 12 1_555 D O4 DT 12 D DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog31 C N1 DA 13 C DA 13 1_555 D N3 DT 11 D DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog32 C N6 DA 13 C DA 13 1_555 D O4 DT 11 D DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog33 C N3 DT 14 C DT 14 1_555 D N1 DA 10 D DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog34 C O4 DT 14 C DT 14 1_555 D N6 DA 10 D DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog35 C N1 DG 15 C DG 15 1_555 D N3 DC 9 D DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog36 C N2 DG 15 C DG 15 1_555 D O2 DC 9 D DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog37 C O6 DG 15 C DG 15 1_555 D N4 DC 9 D DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog38 C N3 DT 16 C DT 16 1_555 D N1 DA 8 D DA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog39 C O4 DT 16 C DT 16 1_555 D N6 DA 8 D DA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog40 C N3 DT 17 C DT 17 1_555 D N1 DA 7 D DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog41 C O4 DT 17 C DT 17 1_555 D N6 DA 7 D DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog42 C N3 DC 18 C DC 18 1_555 D N1 DG 6 D DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog43 C N4 DC 18 C DC 18 1_555 D O6 DG 6 D DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog44 C O2 DC 18 C DC 18 1_555 D N2 DG 6 D DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog45 C N3 DT 19 C DT 19 1_555 D N1 DA 5 D DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog46 C O4 DT 19 C DT 19 1_555 D N6 DA 5 D DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog47 C N1 DG 20 C DG 20 1_555 D N3 DC 4 D DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog48 C N2 DG 20 C DG 20 1_555 D O2 DC 4 D DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog49 C O6 DG 20 C DG 20 1_555 D N4 DC 4 D DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog50 C N3 DT 21 C DT 21 1_555 D N1 DA 3 D DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog51 C O4 DT 21 C DT 21 1_555 D N6 DA 3 D DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog52 C N1 DA 22 C DA 22 1_555 D N3 DT 2 D DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog53 C N6 DA 22 C DA 22 1_555 D O4 DT 2 D DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog54 C N3 DC 23 C DC 23 1_555 D N1 DG 1 D DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog55 C N4 DC 23 C DC 23 1_555 D O6 DG 1 D DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog56 C O2 DC 23 C DC 23 1_555 D N2 DG 1 D DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
#
_chem_comp.formula           'C2 H6 O2' 
_chem_comp.formula_weight    62.068 
_chem_comp.id                EDO 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              1,2-ETHANEDIOL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     'ETHYLENE GLYCOL' 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 EDO sing 313 n n 
C1 C2 EDO sing 314 n n 
C1 H11 EDO sing 315 n n 
C1 H12 EDO sing 316 n n 
O1 HO1 EDO sing 317 n n 
C2 O2 EDO sing 318 n n 
C2 H21 EDO sing 319 n n 
C2 H22 EDO sing 320 n n 
O2 HO2 EDO sing 321 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7PRW 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.012467 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.008148 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.007666 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
F 5 ZN A 1 801 505 ZN ZN . 
G 5 ZN A 1 802 506 ZN ZN . 
H 6 EDO A 1 803 601 EDO EDO . 
I 7 82H A 1 804 801 82H INH . 
J 6 EDO A 1 805 901 EDO EDO . 
K 5 ZN B 1 801 505 ZN ZN . 
L 5 ZN B 1 802 506 ZN ZN . 
M 6 EDO B 1 803 601 EDO EDO . 
N 6 EDO B 1 804 602 EDO EDO . 
O 6 EDO B 1 805 201 EDO EDO . 
P 7 82H B 1 806 801 82H INH . 
Q 6 EDO D 1 101 101 EDO EDO . 
R 8 HOH A 1 901 145 HOH HOH . 
R 8 HOH A 2 902 116 HOH HOH . 
R 8 HOH A 3 903 4 HOH HOH . 
R 8 HOH A 4 904 244 HOH HOH . 
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