data_7PT6 # _model_server_result.job_id yYC1d3NpppY-54G_EEXSxw _model_server_result.datetime_utc '2025-04-11 18:38:00' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7pt6 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"DB","auth_seq_id":902}' # _entry.id 7PT6 # _exptl.entry_id 7PT6 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 427.201 _entity.id 13 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7PT6 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7PT6 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 18 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 13 W N N ? 13 HA N N ? 13 SA N N ? 13 DB N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 B SG CYS 341 2 CYS 341 1_555 U ZN ZN . 2 ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc2 B SG CYS 344 2 CYS 344 1_555 U ZN ZN . 2 ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc3 B SG CYS 364 2 CYS 364 1_555 U ZN ZN . 2 ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc4 B SG CYS 367 2 CYS 367 1_555 U ZN ZN . 2 ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc5 B OG SER 550 2 SER 550 1_555 T MG MG . 2 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.878 ? metalc ? metalc6 B OE1 GLU 625 2 GLU 625 1_555 V MG MG . 2 MG 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.906 ? metalc ? metalc7 B OE2 GLU 625 2 GLU 625 1_555 V MG MG . 2 MG 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc ? metalc8 S O2G AGS . 2 AGS 1001 1_555 T MG MG . 2 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? metalc ? metalc9 S O2B AGS . 2 AGS 1001 1_555 T MG MG . 2 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? metalc ? metalc10 V MG MG . 2 MG 1004 1_555 E OG SER 423 5 SER 423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.916 ? metalc ? metalc11 V MG MG . 2 MG 1004 1_555 AA O2G AGS . 5 AGS 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.882 ? metalc ? metalc12 C OG SER 416 3 SER 416 1_555 X MG MG . 3 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.085 ? metalc ? metalc13 W O2B ADP . 3 ADP 1001 1_555 X MG MG . 3 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? metalc ? metalc14 D SG CYS 349 4 CYS 349 1_555 Z ZN ZN . 4 ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? metalc ? metalc15 D SG CYS 352 4 CYS 352 1_555 Z ZN ZN . 4 ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc16 D SG CYS 371 4 CYS 371 1_555 Z ZN ZN . 4 ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc17 D SG CYS 376 4 CYS 376 1_555 Z ZN ZN . 4 ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc18 D OG SER 575 4 SER 575 1_555 GA MG MG . 7 MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? metalc ? metalc19 Y O2G AGS . 4 AGS 1001 1_555 GA MG MG . 7 MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? metalc ? metalc20 Y O2B AGS . 4 AGS 1001 1_555 GA MG MG . 7 MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? metalc ? metalc21 E SG CYS 183 5 CYS 183 1_555 BA ZN ZN . 5 ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? metalc ? metalc22 E SG CYS 186 5 CYS 186 1_555 BA ZN ZN . 5 ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc23 E SG CYS 211 5 CYS 211 1_555 BA ZN ZN . 5 ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc24 E SG CYS 236 5 CYS 236 1_555 BA ZN ZN . 5 ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? metalc ? metalc25 F SG CYS 311 6 CYS 311 1_555 FA ZN ZN . 6 ZN 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc26 F SG CYS 314 6 CYS 314 1_555 FA ZN ZN . 6 ZN 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc27 F SG CYS 333 6 CYS 333 1_555 FA ZN ZN . 6 ZN 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc28 F SG CYS 338 6 CYS 338 1_555 FA ZN ZN . 6 ZN 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc29 F OG SER 582 6 SER 582 1_555 EA MG MG . 6 MG 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? metalc ? metalc30 DA O2G AGS . 6 AGS 1102 1_555 EA MG MG . 6 MG 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.132 ? metalc ? metalc31 DA O2B AGS . 6 AGS 1102 1_555 EA MG MG . 6 MG 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? metalc ? metalc32 G SG CYS 262 7 CYS 262 1_555 JA ZN ZN . 7 ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc33 G SG CYS 265 7 CYS 265 1_555 JA ZN ZN . 7 ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc34 G SG CYS 284 7 CYS 284 1_555 JA ZN ZN . 7 ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc35 G SG CYS 289 7 CYS 289 1_555 JA ZN ZN . 7 ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc36 G OG SER 467 7 SER 467 1_555 IA MG MG . 7 MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? metalc ? metalc37 G OE2 GLU 542 7 GLU 542 1_555 GA MG MG . 7 MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? metalc ? metalc38 HA O2B ADP . 7 ADP 902 1_555 IA MG MG . 7 MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? metalc ? metalc39 H OD1 ASP 182 8 ASP 182 1_555 LA MG MG . 8 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.007 ? metalc ? metalc40 H OD2 ASP 182 8 ASP 182 1_555 LA MG MG . 8 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? metalc ? metalc41 H SG CYS 223 8 CYS 223 1_555 MA ZN ZN . 8 ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? metalc ? metalc42 H SG CYS 225 8 CYS 225 1_555 MA ZN ZN . 8 ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? metalc ? metalc43 H ND1 HIS 348 8 HIS 348 1_555 MA ZN ZN . 8 ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? metalc ? metalc44 KA O2G AGS . 8 AGS 1001 1_555 LA MG MG . 8 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? metalc ? metalc45 KA O2B AGS . 8 AGS 1001 1_555 LA MG MG . 8 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.986 ? metalc ? metalc46 KA O3B AGS . 8 AGS 1001 1_555 LA MG MG . 8 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.979 ? metalc ? metalc47 I SG CYS 661 9 CYS 661 1_555 NA ZN ZN . 9 ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc48 I SG CYS 664 9 CYS 664 1_555 NA ZN ZN . 9 ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc49 I NE2 HIS 674 9 HIS 674 1_555 NA ZN ZN . 9 ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? metalc ? metalc50 I ND1 HIS 680 9 HIS 680 1_555 NA ZN ZN . 9 ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? metalc ? metalc51 K SG CYS 341 B CYS 341 1_555 QA ZN ZN . B ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc52 K SG CYS 344 B CYS 344 1_555 QA ZN ZN . B ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc53 K SG CYS 364 B CYS 364 1_555 QA ZN ZN . B ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc54 K SG CYS 367 B CYS 367 1_555 QA ZN ZN . B ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc55 K OG SER 550 B SER 550 1_555 PA MG MG . B MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.877 ? metalc ? metalc56 K OE1 GLU 625 B GLU 625 1_555 RA MG MG . B MG 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.907 ? metalc ? metalc57 K OE2 GLU 625 B GLU 625 1_555 RA MG MG . B MG 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc58 OA O2G AGS . B AGS 1001 1_555 PA MG MG . B MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? metalc ? metalc59 OA O2B AGS . B AGS 1001 1_555 PA MG MG . B MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.25 ? metalc ? metalc60 RA MG MG . B MG 1004 1_555 N OG SER 423 E SER 423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.916 ? metalc ? metalc61 RA MG MG . B MG 1004 1_555 WA O2G AGS . E AGS 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.882 ? metalc ? metalc62 L OG SER 416 C SER 416 1_555 TA MG MG . C MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.085 ? metalc ? metalc63 SA O2B ADP . C ADP 1001 1_555 TA MG MG . C MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? metalc ? metalc64 M SG CYS 349 D CYS 349 1_555 VA ZN ZN . D ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? metalc ? metalc65 M SG CYS 352 D CYS 352 1_555 VA ZN ZN . D ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc66 M SG CYS 371 D CYS 371 1_555 VA ZN ZN . D ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc67 M SG CYS 376 D CYS 376 1_555 VA ZN ZN . D ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc68 M OG SER 575 D SER 575 1_555 CB MG MG . G MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? metalc ? metalc69 UA O2G AGS . D AGS 1001 1_555 CB MG MG . G MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? metalc ? metalc70 UA O2B AGS . D AGS 1001 1_555 CB MG MG . G MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? metalc ? metalc71 N SG CYS 183 E CYS 183 1_555 XA ZN ZN . E ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? metalc ? metalc72 N SG CYS 186 E CYS 186 1_555 XA ZN ZN . E ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc ? metalc73 N SG CYS 211 E CYS 211 1_555 XA ZN ZN . E ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc74 N SG CYS 236 E CYS 236 1_555 XA ZN ZN . E ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? metalc ? metalc75 O SG CYS 311 F CYS 311 1_555 BB ZN ZN . F ZN 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc76 O SG CYS 314 F CYS 314 1_555 BB ZN ZN . F ZN 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc77 O SG CYS 333 F CYS 333 1_555 BB ZN ZN . F ZN 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? metalc ? metalc78 O SG CYS 338 F CYS 338 1_555 BB ZN ZN . F ZN 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc79 O OG SER 582 F SER 582 1_555 AB MG MG . F MG 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? metalc ? metalc80 ZA O2G AGS . F AGS 1102 1_555 AB MG MG . F MG 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.132 ? metalc ? metalc81 ZA O2B AGS . F AGS 1102 1_555 AB MG MG . F MG 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? metalc ? metalc82 P SG CYS 262 G CYS 262 1_555 FB ZN ZN . G ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc83 P SG CYS 265 G CYS 265 1_555 FB ZN ZN . G ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc84 P SG CYS 284 G CYS 284 1_555 FB ZN ZN . G ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc85 P SG CYS 289 G CYS 289 1_555 FB ZN ZN . G ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc86 P OG SER 467 G SER 467 1_555 EB MG MG . G MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? metalc ? metalc87 P OE2 GLU 542 G GLU 542 1_555 CB MG MG . G MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? metalc ? metalc88 DB O2B ADP . G ADP 902 1_555 EB MG MG . G MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? metalc ? metalc89 Q OD1 ASP 182 H ASP 182 1_555 HB MG MG . H MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.008 ? metalc ? metalc90 Q OD2 ASP 182 H ASP 182 1_555 HB MG MG . H MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? metalc ? metalc91 Q SG CYS 223 H CYS 223 1_555 IB ZN ZN . H ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? metalc ? metalc92 Q SG CYS 225 H CYS 225 1_555 IB ZN ZN . H ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? metalc ? metalc93 Q ND1 HIS 348 H HIS 348 1_555 IB ZN ZN . H ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.173 ? metalc ? metalc94 GB O2G AGS . H AGS 1001 1_555 HB MG MG . H MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? metalc ? metalc95 GB O2B AGS . H AGS 1001 1_555 HB MG MG . H MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.986 ? metalc ? metalc96 GB O3B AGS . H AGS 1001 1_555 HB MG MG . H MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.98 ? metalc ? metalc97 R SG CYS 661 I CYS 661 1_555 JB ZN ZN . I ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc98 R SG CYS 664 I CYS 664 1_555 JB ZN ZN . I ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc99 R NE2 HIS 674 I HIS 674 1_555 JB ZN ZN . I ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? metalc ? metalc100 R ND1 HIS 680 I HIS 680 1_555 JB ZN ZN . I ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? # _chem_comp.formula 'C10 H15 N5 O10 P2' _chem_comp.formula_weight 427.201 _chem_comp.id ADP _chem_comp.mon_nstd_flag n _chem_comp.name "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PB O1B ADP doub 1 n n PB O2B ADP sing 2 n n PB O3B ADP sing 3 n n PB O3A ADP sing 4 n n O2B HOB2 ADP sing 5 n n O3B HOB3 ADP sing 6 n n PA O1A ADP doub 7 n n PA O2A ADP sing 8 n n PA O3A ADP sing 9 n n PA O5' ADP sing 10 n n O2A HOA2 ADP sing 11 n n O5' C5' ADP sing 12 n n C5' C4' ADP sing 13 n n C5' "H5'1" ADP sing 14 n n C5' "H5'2" ADP sing 15 n n C4' O4' ADP sing 16 n n C4' C3' ADP sing 17 n n C4' H4' ADP sing 18 n n O4' C1' ADP sing 19 n n C3' O3' ADP sing 20 n n C3' C2' ADP sing 21 n n C3' H3' ADP sing 22 n n O3' HO3' ADP sing 23 n n C2' O2' ADP sing 24 n n C2' C1' ADP sing 25 n n C2' H2' ADP sing 26 n n O2' HO2' ADP sing 27 n n C1' N9 ADP sing 28 n n C1' H1' ADP sing 29 n n N9 C8 ADP sing 30 n y N9 C4 ADP sing 31 n y C8 N7 ADP doub 32 n y C8 H8 ADP sing 33 n n N7 C5 ADP sing 34 n y C5 C6 ADP sing 35 n y C5 C4 ADP doub 36 n y C6 N6 ADP sing 37 n n C6 N1 ADP doub 38 n y N6 HN61 ADP sing 39 n n N6 HN62 ADP sing 40 n n N1 C2 ADP sing 41 n y C2 N3 ADP doub 42 n y C2 H2 ADP sing 43 n n N3 C4 ADP sing 44 n y # _atom_sites.entry_id 7PT6 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code S 10 AGS 2 1 1001 1001 AGS AGS . T 11 MG 2 1 1002 1002 MG MG . U 12 ZN 2 1 1003 1101 ZN ZN . V 11 MG 2 1 1004 1002 MG MG . W 13 ADP 3 1 1001 1001 ADP ADP . X 11 MG 3 1 1002 1002 MG MG . Y 10 AGS 4 1 1001 1001 AGS AGS . Z 12 ZN 4 1 1002 1101 ZN ZN . AA 10 AGS 5 1 1001 1001 AGS AGS . BA 12 ZN 5 1 1002 1101 ZN ZN . CA 10 AGS 6 1 1101 1003 AGS AGS . DA 10 AGS 6 1 1102 1001 AGS AGS . EA 11 MG 6 1 1103 1002 MG MG . FA 12 ZN 6 1 1104 1101 ZN ZN . GA 11 MG 7 1 901 1002 MG MG . HA 13 ADP 7 1 902 1001 ADP ADP . IA 11 MG 7 1 903 1002 MG MG . JA 12 ZN 7 1 904 1101 ZN ZN . KA 10 AGS 8 1 1001 1001 AGS AGS . LA 11 MG 8 1 1002 1002 MG MG . MA 12 ZN 8 1 1003 1101 ZN ZN . NA 12 ZN 9 1 1101 1101 ZN ZN . OA 10 AGS B 1 1001 1001 AGS AGS . PA 11 MG B 1 1002 1002 MG MG . QA 12 ZN B 1 1003 1101 ZN ZN . RA 11 MG B 1 1004 1002 MG MG . SA 13 ADP C 1 1001 1001 ADP ADP . TA 11 MG C 1 1002 1002 MG MG . UA 10 AGS D 1 1001 1001 AGS AGS . VA 12 ZN D 1 1002 1101 ZN ZN . WA 10 AGS E 1 1001 1001 AGS AGS . XA 12 ZN E 1 1002 1101 ZN ZN . YA 10 AGS F 1 1101 1003 AGS AGS . ZA 10 AGS F 1 1102 1001 AGS AGS . AB 11 MG F 1 1103 1002 MG MG . BB 12 ZN F 1 1104 1101 ZN ZN . CB 11 MG G 1 901 1002 MG MG . DB 13 ADP G 1 902 1001 ADP ADP . EB 11 MG G 1 903 1002 MG MG . FB 12 ZN G 1 904 1101 ZN ZN . GB 10 AGS H 1 1001 1001 AGS AGS . HB 11 MG H 1 1002 1002 MG MG . IB 12 ZN H 1 1003 1101 ZN ZN . JB 12 ZN I 1 1101 1101 ZN ZN . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PB ADP . . . DB 13 228.946 251.232 152.434 1 101.95 ? PB ADP 902 G 1 HETATM 2 O O1B ADP . . . DB 13 229.367 252.648 152.273 1 101.95 ? O1B ADP 902 G 1 HETATM 3 O O2B ADP . . . DB 13 227.969 251.034 153.554 1 101.95 ? O2B ADP 902 G 1 HETATM 4 O O3B ADP . . . DB 13 230.093 250.316 152.519 1 101.95 ? O3B ADP 902 G 1 HETATM 5 P PA ADP . . . DB 13 227.931 249.424 150.358 1 101.95 ? PA ADP 902 G 1 HETATM 6 O O1A ADP . . . DB 13 229.099 248.527 150.526 1 101.95 ? O1A ADP 902 G 1 HETATM 7 O O2A ADP . . . DB 13 226.602 248.912 150.772 1 101.95 ? O2A ADP 902 G 1 HETATM 8 O O3A ADP . . . DB 13 228.205 250.816 151.085 1 101.95 ? O3A ADP 902 G 1 HETATM 9 O O5' ADP . . . DB 13 227.863 249.9 148.842 1 101.95 ? O5' ADP 902 G 1 HETATM 10 C C5' ADP . . . DB 13 226.583 250.16 148.231 1 101.95 ? C5' ADP 902 G 1 HETATM 11 C C4' ADP . . . DB 13 226.687 249.845 146.763 1 101.95 ? C4' ADP 902 G 1 HETATM 12 O O4' ADP . . . DB 13 227.753 250.647 146.207 1 101.95 ? O4' ADP 902 G 1 HETATM 13 C C3' ADP . . . DB 13 227.041 248.39 146.432 1 101.95 ? C3' ADP 902 G 1 HETATM 14 O O3' ADP . . . DB 13 226.002 247.701 145.748 1 101.95 ? O3' ADP 902 G 1 HETATM 15 C C2' ADP . . . DB 13 228.322 248.464 145.595 1 101.95 ? C2' ADP 902 G 1 HETATM 16 O O2' ADP . . . DB 13 228.249 247.626 144.464 1 101.95 ? O2' ADP 902 G 1 HETATM 17 C C1' ADP . . . DB 13 228.399 249.93 145.187 1 101.95 ? C1' ADP 902 G 1 HETATM 18 N N9 ADP . . . DB 13 229.761 250.434 145.082 1 101.95 ? N9 ADP 902 G 1 HETATM 19 C C8 ADP . . . DB 13 230.293 251.452 145.821 1 101.95 ? C8 ADP 902 G 1 HETATM 20 N N7 ADP . . . DB 13 231.543 251.709 145.539 1 101.95 ? N7 ADP 902 G 1 HETATM 21 C C5 ADP . . . DB 13 231.864 250.786 144.562 1 101.95 ? C5 ADP 902 G 1 HETATM 22 C C6 ADP . . . DB 13 233.055 250.543 143.863 1 101.95 ? C6 ADP 902 G 1 HETATM 23 N N6 ADP . . . DB 13 234.176 251.225 144.058 1 101.95 ? N6 ADP 902 G 1 HETATM 24 N N1 ADP . . . DB 13 233.047 249.544 142.953 1 101.95 ? N1 ADP 902 G 1 HETATM 25 C C2 ADP . . . DB 13 231.915 248.858 142.773 1 101.95 ? C2 ADP 902 G 1 HETATM 26 N N3 ADP . . . DB 13 230.738 249.002 143.369 1 101.95 ? N3 ADP 902 G 1 HETATM 27 C C4 ADP . . . DB 13 230.775 249.994 144.267 1 101.95 ? C4 ADP 902 G 1 # _model_server_stats.io_time_ms 32 _model_server_stats.parse_time_ms 31 _model_server_stats.create_model_time_ms 106 _model_server_stats.query_time_ms 360 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 27 #