data_7QBV # _model_server_result.job_id qBf3Jqa_bpsaVyNMWYUclw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-01 11:27:06' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7qbv # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":502}' # _entry.id 7QBV # _exptl.entry_id 7QBV _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 55.845 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'FE (III) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7QBV _cell.length_a 155.498 _cell.length_b 163 _cell.length_c 77.328 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7QBV _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 18 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 ? monomeric 1 author_defined_assembly 3 ? monomeric 1 author_defined_assembly 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,E,F,G,H,I,Y 1 1 B,J,K,L,M,N,Z 2 1 C,O,P,Q,R,S,AA 3 1 D,T,U,V,W,X,BA 4 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 F N N ? 3 K N N ? 3 P N N ? 3 U N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SG CYS 40 A CYS 15 1_555 E FE4 SF4 . A SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 44 A CYS 19 1_555 E FE2 SF4 . A SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 47 A CYS 22 1_555 E FE1 SF4 . A SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 60 A CYS 35 1_555 F FE FE . A FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc5 A SG CYS 63 A CYS 38 1_555 F FE FE . A FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc6 A SG CYS 70 A CYS 45 1_555 F FE FE . A FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc7 A SG CYS 73 A CYS 48 1_555 F FE FE . A FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? metalc ? metalc8 A O GLY 143 A GLY 118 1_555 I NA NA . A NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.073 ? metalc ? metalc9 A O PHE 146 A PHE 121 1_555 I NA NA . A NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.681 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASP 181 A ASP 156 1_555 I NA NA . A NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc11 A O GLU 183 A GLU 158 1_555 I NA NA . A NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.881 ? metalc ? metalc12 A OG SER 187 A SER 162 1_555 I NA NA . A NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.149 ? metalc ? metalc13 B SG CYS 40 B CYS 15 1_555 J FE4 SF4 . B SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc14 B SG CYS 44 B CYS 19 1_555 J FE2 SF4 . B SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? metalc ? metalc15 B SG CYS 47 B CYS 22 1_555 J FE1 SF4 . B SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? metalc ? metalc16 B SG CYS 60 B CYS 35 1_555 K FE FE . B FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc17 B SG CYS 63 B CYS 38 1_555 K FE FE . B FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? metalc ? metalc18 B SG CYS 70 B CYS 45 1_555 K FE FE . B FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc ? metalc19 B SG CYS 73 B CYS 48 1_555 K FE FE . B FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.48 ? metalc ? metalc20 B O GLY 143 B GLY 118 1_555 N NA NA . B NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.913 ? metalc ? metalc21 B O PHE 146 B PHE 121 1_555 N NA NA . B NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.628 ? metalc ? metalc22 B OD1 ASP 181 B ASP 156 1_555 N NA NA . B NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? metalc ? metalc23 B O GLU 183 B GLU 158 1_555 N NA NA . B NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.981 ? metalc ? metalc24 B OG SER 187 B SER 162 1_555 N NA NA . B NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.09 ? metalc ? metalc25 C SG CYS 40 C CYS 15 1_555 O FE4 SF4 . C SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc26 C SG CYS 44 C CYS 19 1_555 O FE2 SF4 . C SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc27 C SG CYS 47 C CYS 22 1_555 O FE1 SF4 . C SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? metalc ? metalc28 C SG CYS 60 C CYS 35 1_555 P FE FE . C FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.585 ? metalc ? metalc29 C SG CYS 63 C CYS 38 1_555 P FE FE . C FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? metalc ? metalc30 C SG CYS 70 C CYS 45 1_555 P FE FE . C FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.417 ? metalc ? metalc31 C SG CYS 73 C CYS 48 1_555 P FE FE . C FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.219 ? metalc ? metalc32 C O GLY 143 C GLY 118 1_555 S NA NA . C NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.64 ? metalc ? metalc33 C O PHE 146 C PHE 121 1_555 S NA NA . C NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc34 C OD1 ASP 181 C ASP 156 1_555 S NA NA . C NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.511 ? metalc ? metalc35 C O GLU 183 C GLU 158 1_555 S NA NA . C NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.877 ? metalc ? metalc36 C OG SER 187 C SER 162 1_555 S NA NA . C NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.705 ? metalc ? metalc37 D SG CYS 40 D CYS 15 1_555 T FE4 SF4 . D SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? metalc ? metalc38 D SG CYS 44 D CYS 19 1_555 T FE2 SF4 . D SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? metalc ? metalc39 D SG CYS 47 D CYS 22 1_555 T FE1 SF4 . D SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc ? metalc40 D SG CYS 60 D CYS 35 1_555 U FE FE . D FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.614 ? metalc ? metalc41 D SG CYS 63 D CYS 38 1_555 U FE FE . D FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? metalc ? metalc42 D SG CYS 70 D CYS 45 1_555 U FE FE . D FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.52 ? metalc ? metalc43 D SG CYS 73 D CYS 48 1_555 U FE FE . D FE 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc44 D O GLY 143 D GLY 118 1_555 X NA NA . D NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.703 ? metalc ? metalc45 D O PHE 146 D PHE 121 1_555 X NA NA . D NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.396 ? metalc ? metalc46 D OD1 ASP 181 D ASP 156 1_555 X NA NA . D NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? metalc ? metalc47 D O GLU 183 D GLU 158 1_555 X NA NA . D NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.743 ? metalc ? metalc48 D OG SER 187 D SER 162 1_555 X NA NA . D NA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? # _chem_comp.formula 'Fe 3' _chem_comp.formula_weight 55.845 _chem_comp.id FE _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'FE (III) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7QBV _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.006431 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006135 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.012932 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 2 SF4 A 1 501 501 SF4 SF4 . F 3 FE A 1 502 502 FE FE . G 4 SAH A 1 503 503 SAH SAH . H 5 COB A 1 504 504 COB COB . I 6 NA A 1 505 505 NA NA . J 2 SF4 B 1 501 501 SF4 SF4 . K 3 FE B 1 502 502 FE FE . L 4 SAH B 1 503 503 SAH SAH . M 5 COB B 1 504 504 COB COB . N 6 NA B 1 505 505 NA NA . O 2 SF4 C 1 501 501 SF4 SF4 . P 3 FE C 1 502 502 FE FE . Q 4 SAH C 1 503 503 SAH SAH . R 5 COB C 1 504 504 COB COB . S 6 NA C 1 505 505 NA NA . T 2 SF4 D 1 501 501 SF4 SF4 . U 3 FE D 1 502 502 FE FE . V 4 SAH D 1 503 503 SAH SAH . W 5 COB D 1 504 504 COB COB . X 6 NA D 1 505 505 NA NA . Y 7 HOH A 1 601 604 HOH HOH . Y 7 HOH A 2 602 606 HOH HOH . Y 7 HOH A 3 603 611 HOH HOH . Y 7 HOH A 4 604 607 HOH HOH . Y 7 HOH A 5 605 609 HOH HOH . Y 7 HOH A 6 606 601 HOH HOH . Y 7 HOH A 7 607 613 HOH HOH . Y 7 HOH A 8 608 612 HOH HOH . Y 7 HOH A 9 609 603 HOH HOH . Y 7 HOH A 10 610 610 HOH HOH . Y 7 HOH A 11 611 602 HOH HOH . Y 7 HOH A 12 612 605 HOH HOH . Y 7 HOH A 13 613 608 HOH HOH . Y 7 HOH A 14 614 614 HOH HOH . Z 7 HOH B 1 601 604 HOH HOH . Z 7 HOH B 2 602 610 HOH HOH . Z 7 HOH B 3 603 605 HOH HOH . Z 7 HOH B 4 604 608 HOH HOH . Z 7 HOH B 5 605 601 HOH HOH . Z 7 HOH B 6 606 606 HOH HOH . Z 7 HOH B 7 607 603 HOH HOH . Z 7 HOH B 8 608 612 HOH HOH . Z 7 HOH B 9 609 607 HOH HOH . Z 7 HOH B 10 610 614 HOH HOH . Z 7 HOH B 11 611 611 HOH HOH . Z 7 HOH B 12 612 602 HOH HOH . Z 7 HOH B 13 613 615 HOH HOH . Z 7 HOH B 14 614 617 HOH HOH . Z 7 HOH B 15 615 609 HOH HOH . Z 7 HOH B 16 616 613 HOH HOH . Z 7 HOH B 17 617 618 HOH HOH . Z 7 HOH B 18 618 616 HOH HOH . AA 7 HOH C 1 601 609 HOH HOH . AA 7 HOH C 2 602 611 HOH HOH . AA 7 HOH C 3 603 615 HOH HOH . AA 7 HOH C 4 604 606 HOH HOH . AA 7 HOH C 5 605 605 HOH HOH . AA 7 HOH C 6 606 604 HOH HOH . AA 7 HOH C 7 607 607 HOH HOH . AA 7 HOH C 8 608 603 HOH HOH . AA 7 HOH C 9 609 616 HOH HOH . AA 7 HOH C 10 610 612 HOH HOH . AA 7 HOH C 11 611 613 HOH HOH . AA 7 HOH C 12 612 610 HOH HOH . AA 7 HOH C 13 613 601 HOH HOH . AA 7 HOH C 14 614 608 HOH HOH . AA 7 HOH C 15 615 602 HOH HOH . AA 7 HOH C 16 616 614 HOH HOH . BA 7 HOH D 1 601 605 HOH HOH . BA 7 HOH D 2 602 604 HOH HOH . BA 7 HOH D 3 603 610 HOH HOH . BA 7 HOH D 4 604 608 HOH HOH . BA 7 HOH D 5 605 606 HOH HOH . BA 7 HOH D 6 606 601 HOH HOH . BA 7 HOH D 7 607 603 HOH HOH . BA 7 HOH D 8 608 609 HOH HOH . BA 7 HOH D 9 609 612 HOH HOH . BA 7 HOH D 10 610 602 HOH HOH . BA 7 HOH D 11 611 611 HOH HOH . BA 7 HOH D 12 612 615 HOH HOH . BA 7 HOH D 13 613 614 HOH HOH . BA 7 HOH D 14 614 607 HOH HOH . BA 7 HOH D 15 615 613 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol FE _atom_site.label_atom_id FE _atom_site.label_comp_id FE _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id K _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 68.254 _atom_site.Cartn_y 25.599 _atom_site.Cartn_z 31.179 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 47.32 _atom_site.pdbx_formal_charge 3 _atom_site.auth_atom_id FE _atom_site.auth_comp_id FE _atom_site.auth_seq_id 502 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 27 _model_server_stats.parse_time_ms 15 _model_server_stats.create_model_time_ms 25 _model_server_stats.query_time_ms 254 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #