data_7RS5 # _model_server_result.job_id -z7Xhvv9Pc6cz5yGaYvRag _model_server_result.datetime_utc '2024-11-12 21:23:05' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7rs5 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"QB","auth_seq_id":402}' # _entry.id 7RS5 # _exptl.entry_id 7RS5 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 18 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 27-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 27 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 CA N N ? 5 GA N N ? 5 IA N N ? 5 MA N N ? 5 OA N N ? 5 SA N N ? 5 UA N N ? 5 YA N N ? 5 AB N N ? 5 EB N N ? 5 GB N N ? 5 KB N N ? 5 MB N N ? 5 QB N N ? 5 SB N N ? 5 WB N N ? 5 YB N N ? 5 CC N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD2 ASP 98 A ASP 98 1_555 CA MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? metalc ? metalc2 BA O3G GTP . A GTP 501 1_555 CA MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.806 ? metalc ? metalc3 BA O3B GTP . A GTP 501 1_555 CA MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? metalc ? metalc4 BA O1B GTP . A GTP 501 1_555 CA MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc5 C OG1 THR 116 K THR 199 1_555 GA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc6 C OG SER 225 K SER 308 1_555 GA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc7 FA O3G ANP . K ANP 501 1_555 GA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc8 FA O2B ANP . K ANP 501 1_555 GA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? metalc ? metalc9 D OD2 ASP 98 C ASP 98 1_555 IA MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc10 HA O3G GTP . C GTP 501 1_555 IA MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.807 ? metalc ? metalc11 HA O3B GTP . C GTP 501 1_555 IA MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? metalc ? metalc12 HA O1B GTP . C GTP 501 1_555 IA MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc13 F OG1 THR 116 a THR 116 1_555 MA MG MG . a MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc14 F OG SER 225 a SER 225 1_555 MA MG MG . a MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc15 LA O3G ANP . a ANP 401 1_555 MA MG MG . a MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc16 LA O2B ANP . a ANP 401 1_555 MA MG MG . a MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.108 ? metalc ? metalc17 G OD2 ASP 98 E ASP 98 1_555 OA MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? metalc ? metalc18 NA O3G GTP . E GTP 501 1_555 OA MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.808 ? metalc ? metalc19 NA O3B GTP . E GTP 501 1_555 OA MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? metalc ? metalc20 NA O1B GTP . E GTP 501 1_555 OA MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc21 I OG1 THR 116 b THR 116 1_555 SA MG MG . b MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc22 I OG SER 225 b SER 225 1_555 SA MG MG . b MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc23 RA O3G ANP . b ANP 401 1_555 SA MG MG . b MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc24 RA O2B ANP . b ANP 401 1_555 SA MG MG . b MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? metalc ? metalc25 J OD2 ASP 98 G ASP 98 1_555 UA MG MG . G MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc26 TA O3G GTP . G GTP 501 1_555 UA MG MG . G MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.807 ? metalc ? metalc27 TA O3B GTP . G GTP 501 1_555 UA MG MG . G MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? metalc ? metalc28 TA O1B GTP . G GTP 501 1_555 UA MG MG . G MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.24 ? metalc ? metalc29 L OG1 THR 116 c THR 116 1_555 YA MG MG . c MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? metalc ? metalc30 L OG SER 225 c SER 225 1_555 YA MG MG . c MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc31 XA O3G ANP . c ANP 401 1_555 YA MG MG . c MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc32 XA O2B ANP . c ANP 401 1_555 YA MG MG . c MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? metalc ? metalc33 M OD2 ASP 98 I ASP 98 1_555 AB MG MG . I MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc34 ZA O3G GTP . I GTP 501 1_555 AB MG MG . I MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.807 ? metalc ? metalc35 ZA O3B GTP . I GTP 501 1_555 AB MG MG . I MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? metalc ? metalc36 ZA O1B GTP . I GTP 501 1_555 AB MG MG . I MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc37 O OG1 THR 116 d THR 116 1_555 EB MG MG . d MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? metalc ? metalc38 O OG SER 225 d SER 225 1_555 EB MG MG . d MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc39 DB O3G ANP . d ANP 401 1_555 EB MG MG . d MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc40 DB O2B ANP . d ANP 401 1_555 EB MG MG . d MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? metalc ? metalc41 P OD2 ASP 98 L ASP 98 1_555 GB MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc42 FB O3G GTP . L GTP 501 1_555 GB MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.807 ? metalc ? metalc43 FB O3B GTP . L GTP 501 1_555 GB MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? metalc ? metalc44 FB O1B GTP . L GTP 501 1_555 GB MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? metalc ? metalc45 R OG1 THR 116 e THR 116 1_555 KB MG MG . e MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc46 R OG SER 225 e SER 225 1_555 KB MG MG . e MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc47 JB O3G ANP . e ANP 401 1_555 KB MG MG . e MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc48 JB O2B ANP . e ANP 401 1_555 KB MG MG . e MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? metalc ? metalc49 S OD2 ASP 98 N ASP 98 1_555 MB MG MG . N MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc50 LB O3G GTP . N GTP 501 1_555 MB MG MG . N MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.807 ? metalc ? metalc51 LB O3B GTP . N GTP 501 1_555 MB MG MG . N MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? metalc ? metalc52 LB O1B GTP . N GTP 501 1_555 MB MG MG . N MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc53 U OG1 THR 116 f THR 116 1_555 QB MG MG . f MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc54 U OG SER 225 f SER 225 1_555 QB MG MG . f MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc55 PB O3G ANP . f ANP 401 1_555 QB MG MG . f MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc56 PB O2B ANP . f ANP 401 1_555 QB MG MG . f MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? metalc ? metalc57 V OD2 ASP 98 P ASP 98 1_555 SB MG MG . P MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc58 RB O3G GTP . P GTP 501 1_555 SB MG MG . P MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.808 ? metalc ? metalc59 RB O3B GTP . P GTP 501 1_555 SB MG MG . P MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? metalc ? metalc60 RB O1B GTP . P GTP 501 1_555 SB MG MG . P MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc61 X OG1 THR 116 g THR 116 1_555 WB MG MG . g MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc62 X OG SER 225 g SER 225 1_555 WB MG MG . g MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc63 VB O3G ANP . g ANP 401 1_555 WB MG MG . g MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc64 VB O2B ANP . g ANP 401 1_555 WB MG MG . g MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? metalc ? metalc65 Y OD2 ASP 98 R ASP 98 1_555 YB MG MG . R MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc66 XB O3G GTP . R GTP 501 1_555 YB MG MG . R MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.807 ? metalc ? metalc67 XB O3B GTP . R GTP 501 1_555 YB MG MG . R MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.19 ? metalc ? metalc68 XB O1B GTP . R GTP 501 1_555 YB MG MG . R MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? metalc ? metalc69 AA OG1 THR 116 h THR 116 1_555 CC MG MG . h MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? metalc ? metalc70 AA OG SER 225 h SER 225 1_555 CC MG MG . h MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc71 BC O3G ANP . h ANP 401 1_555 CC MG MG . h MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc72 BC O2B ANP . h ANP 401 1_555 CC MG MG . h MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7RS5 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code BA 4 GTP A 1 501 501 GTP GTP . CA 5 MG A 1 502 502 MG MG . DA 6 GDP B 1 501 501 GDP GDP . EA 7 TA1 B 1 502 502 TA1 TA1 . FA 8 ANP K 1 501 1204 ANP ANP . GA 5 MG K 1 502 1205 MG MG . HA 4 GTP C 1 501 501 GTP GTP . IA 5 MG C 1 502 502 MG MG . JA 6 GDP D 1 501 501 GDP GDP . KA 7 TA1 D 1 502 502 TA1 TA1 . LA 8 ANP a 1 401 1204 ANP ANP . MA 5 MG a 1 402 1205 MG MG . NA 4 GTP E 1 501 501 GTP GTP . OA 5 MG E 1 502 502 MG MG . PA 6 GDP F 1 501 501 GDP GDP . QA 7 TA1 F 1 502 502 TA1 TA1 . RA 8 ANP b 1 401 1204 ANP ANP . SA 5 MG b 1 402 1205 MG MG . TA 4 GTP G 1 501 501 GTP GTP . UA 5 MG G 1 502 502 MG MG . VA 6 GDP H 1 501 501 GDP GDP . WA 7 TA1 H 1 502 502 TA1 TA1 . XA 8 ANP c 1 401 1204 ANP ANP . YA 5 MG c 1 402 1205 MG MG . ZA 4 GTP I 1 501 501 GTP GTP . AB 5 MG I 1 502 502 MG MG . BB 6 GDP J 1 501 501 GDP GDP . CB 7 TA1 J 1 502 502 TA1 TA1 . DB 8 ANP d 1 401 1204 ANP ANP . EB 5 MG d 1 402 1205 MG MG . FB 4 GTP L 1 501 501 GTP GTP . GB 5 MG L 1 502 502 MG MG . HB 6 GDP M 1 501 501 GDP GDP . IB 7 TA1 M 1 502 502 TA1 TA1 . JB 8 ANP e 1 401 1204 ANP ANP . KB 5 MG e 1 402 1205 MG MG . LB 4 GTP N 1 501 501 GTP GTP . MB 5 MG N 1 502 502 MG MG . NB 6 GDP O 1 501 501 GDP GDP . OB 7 TA1 O 1 502 502 TA1 TA1 . PB 8 ANP f 1 401 1204 ANP ANP . QB 5 MG f 1 402 1205 MG MG . RB 4 GTP P 1 501 501 GTP GTP . SB 5 MG P 1 502 502 MG MG . TB 6 GDP Q 1 501 501 GDP GDP . UB 7 TA1 Q 1 502 502 TA1 TA1 . VB 8 ANP g 1 401 1204 ANP ANP . WB 5 MG g 1 402 1205 MG MG . XB 4 GTP R 1 501 501 GTP GTP . YB 5 MG R 1 502 502 MG MG . ZB 6 GDP S 1 501 501 GDP GDP . AC 7 TA1 S 1 502 502 TA1 TA1 . BC 8 ANP h 1 401 1204 ANP ANP . CC 5 MG h 1 402 1205 MG MG . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id QB _atom_site.label_entity_id 5 _atom_site.Cartn_x 231.516 _atom_site.Cartn_y 197.65 _atom_site.Cartn_z 228.896 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 241.32 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 402 _atom_site.auth_asym_id f _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 66 _model_server_stats.parse_time_ms 17 _model_server_stats.create_model_time_ms 534 _model_server_stats.query_time_ms 379 _model_server_stats.encode_time_ms 7 _model_server_stats.element_count 1 #