data_7RS5 # _model_server_result.job_id 3SiRtu86Eqqc_CI4ijaRog _model_server_result.datetime_utc '2024-11-12 21:19:01' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7rs5 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"TB","auth_seq_id":501}' # _entry.id 7RS5 # _exptl.entry_id 7RS5 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 443.201 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 9 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 27-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 27 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 DA N N ? 6 JA N N ? 6 PA N N ? 6 VA N N ? 6 BB N N ? 6 HB N N ? 6 NB N N ? 6 TB N N ? 6 ZB N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD2 ASP 98 A ASP 98 1_555 CA MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? metalc ? metalc2 BA O3G GTP . A GTP 501 1_555 CA MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.806 ? metalc ? metalc3 BA O3B GTP . A GTP 501 1_555 CA MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? metalc ? metalc4 BA O1B GTP . A GTP 501 1_555 CA MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc5 C OG1 THR 116 K THR 199 1_555 GA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc6 C OG SER 225 K SER 308 1_555 GA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc7 FA O3G ANP . K ANP 501 1_555 GA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc8 FA O2B ANP . K ANP 501 1_555 GA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? metalc ? metalc9 D OD2 ASP 98 C ASP 98 1_555 IA MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc10 HA O3G GTP . C GTP 501 1_555 IA MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.807 ? metalc ? metalc11 HA O3B GTP . C GTP 501 1_555 IA MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? metalc ? metalc12 HA O1B GTP . C GTP 501 1_555 IA MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc13 F OG1 THR 116 a THR 116 1_555 MA MG MG . a MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc14 F OG SER 225 a SER 225 1_555 MA MG MG . a MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc15 LA O3G ANP . a ANP 401 1_555 MA MG MG . a MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc16 LA O2B ANP . a ANP 401 1_555 MA MG MG . a MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.108 ? metalc ? metalc17 G OD2 ASP 98 E ASP 98 1_555 OA MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? metalc ? metalc18 NA O3G GTP . E GTP 501 1_555 OA MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.808 ? metalc ? metalc19 NA O3B GTP . E GTP 501 1_555 OA MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? metalc ? metalc20 NA O1B GTP . E GTP 501 1_555 OA MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc21 I OG1 THR 116 b THR 116 1_555 SA MG MG . b MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc22 I OG SER 225 b SER 225 1_555 SA MG MG . b MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc23 RA O3G ANP . b ANP 401 1_555 SA MG MG . b MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc24 RA O2B ANP . b ANP 401 1_555 SA MG MG . b MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? metalc ? metalc25 J OD2 ASP 98 G ASP 98 1_555 UA MG MG . G MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc26 TA O3G GTP . G GTP 501 1_555 UA MG MG . G MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.807 ? metalc ? metalc27 TA O3B GTP . G GTP 501 1_555 UA MG MG . G MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? metalc ? metalc28 TA O1B GTP . G GTP 501 1_555 UA MG MG . G MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.24 ? metalc ? metalc29 L OG1 THR 116 c THR 116 1_555 YA MG MG . c MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? metalc ? metalc30 L OG SER 225 c SER 225 1_555 YA MG MG . c MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc31 XA O3G ANP . c ANP 401 1_555 YA MG MG . c MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc32 XA O2B ANP . c ANP 401 1_555 YA MG MG . c MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? metalc ? metalc33 M OD2 ASP 98 I ASP 98 1_555 AB MG MG . I MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc34 ZA O3G GTP . I GTP 501 1_555 AB MG MG . I MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.807 ? metalc ? metalc35 ZA O3B GTP . I GTP 501 1_555 AB MG MG . I MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? metalc ? metalc36 ZA O1B GTP . I GTP 501 1_555 AB MG MG . I MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc37 O OG1 THR 116 d THR 116 1_555 EB MG MG . d MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? metalc ? metalc38 O OG SER 225 d SER 225 1_555 EB MG MG . d MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc39 DB O3G ANP . d ANP 401 1_555 EB MG MG . d MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc40 DB O2B ANP . d ANP 401 1_555 EB MG MG . d MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? metalc ? metalc41 P OD2 ASP 98 L ASP 98 1_555 GB MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc42 FB O3G GTP . L GTP 501 1_555 GB MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.807 ? metalc ? metalc43 FB O3B GTP . L GTP 501 1_555 GB MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? metalc ? metalc44 FB O1B GTP . L GTP 501 1_555 GB MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? metalc ? metalc45 R OG1 THR 116 e THR 116 1_555 KB MG MG . e MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc46 R OG SER 225 e SER 225 1_555 KB MG MG . e MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc47 JB O3G ANP . e ANP 401 1_555 KB MG MG . e MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc48 JB O2B ANP . e ANP 401 1_555 KB MG MG . e MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? metalc ? metalc49 S OD2 ASP 98 N ASP 98 1_555 MB MG MG . N MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc50 LB O3G GTP . N GTP 501 1_555 MB MG MG . N MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.807 ? metalc ? metalc51 LB O3B GTP . N GTP 501 1_555 MB MG MG . N MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? metalc ? metalc52 LB O1B GTP . N GTP 501 1_555 MB MG MG . N MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc53 U OG1 THR 116 f THR 116 1_555 QB MG MG . f MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc54 U OG SER 225 f SER 225 1_555 QB MG MG . f MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc55 PB O3G ANP . f ANP 401 1_555 QB MG MG . f MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc56 PB O2B ANP . f ANP 401 1_555 QB MG MG . f MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? metalc ? metalc57 V OD2 ASP 98 P ASP 98 1_555 SB MG MG . P MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc58 RB O3G GTP . P GTP 501 1_555 SB MG MG . P MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.808 ? metalc ? metalc59 RB O3B GTP . P GTP 501 1_555 SB MG MG . P MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? metalc ? metalc60 RB O1B GTP . P GTP 501 1_555 SB MG MG . P MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc61 X OG1 THR 116 g THR 116 1_555 WB MG MG . g MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc62 X OG SER 225 g SER 225 1_555 WB MG MG . g MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc63 VB O3G ANP . g ANP 401 1_555 WB MG MG . g MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc64 VB O2B ANP . g ANP 401 1_555 WB MG MG . g MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? metalc ? metalc65 Y OD2 ASP 98 R ASP 98 1_555 YB MG MG . R MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc66 XB O3G GTP . R GTP 501 1_555 YB MG MG . R MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.807 ? metalc ? metalc67 XB O3B GTP . R GTP 501 1_555 YB MG MG . R MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.19 ? metalc ? metalc68 XB O1B GTP . R GTP 501 1_555 YB MG MG . R MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? metalc ? metalc69 AA OG1 THR 116 h THR 116 1_555 CC MG MG . h MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? metalc ? metalc70 AA OG SER 225 h SER 225 1_555 CC MG MG . h MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc71 BC O3G ANP . h ANP 401 1_555 CC MG MG . h MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc72 BC O2B ANP . h ANP 401 1_555 CC MG MG . h MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? # _chem_comp.formula 'C10 H15 N5 O11 P2' _chem_comp.formula_weight 443.201 _chem_comp.id GDP _chem_comp.mon_nstd_flag n _chem_comp.name "GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _chem_comp.type 'rna linking' _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PB O1B GDP doub 133 n n PB O2B GDP sing 134 n n PB O3B GDP sing 135 n n PB O3A GDP sing 136 n n O2B HOB2 GDP sing 137 n n O3B HOB3 GDP sing 138 n n O3A PA GDP sing 139 n n PA O1A GDP doub 140 n n PA O2A GDP sing 141 n n PA O5' GDP sing 142 n n O2A HOA2 GDP sing 143 n n O5' C5' GDP sing 144 n n C5' C4' GDP sing 145 n n C5' H5' GDP sing 146 n n C5' "H5''" GDP sing 147 n n C4' O4' GDP sing 148 n n C4' C3' GDP sing 149 n n C4' H4' GDP sing 150 n n O4' C1' GDP sing 151 n n C3' O3' GDP sing 152 n n C3' C2' GDP sing 153 n n C3' H3' GDP sing 154 n n O3' HO3' GDP sing 155 n n C2' O2' GDP sing 156 n n C2' C1' GDP sing 157 n n C2' H2' GDP sing 158 n n O2' HO2' GDP sing 159 n n C1' N9 GDP sing 160 n n C1' H1' GDP sing 161 n n N9 C8 GDP sing 162 n y N9 C4 GDP sing 163 n y C8 N7 GDP doub 164 n y C8 H8 GDP sing 165 n n N7 C5 GDP sing 166 n y C5 C6 GDP sing 167 n n C5 C4 GDP doub 168 n y C6 O6 GDP doub 169 n n C6 N1 GDP sing 170 n n N1 C2 GDP sing 171 n n N1 HN1 GDP sing 172 n n C2 N2 GDP sing 173 n n C2 N3 GDP doub 174 n n N2 HN21 GDP sing 175 n n N2 HN22 GDP sing 176 n n N3 C4 GDP sing 177 n n # _atom_sites.entry_id 7RS5 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code BA 4 GTP A 1 501 501 GTP GTP . CA 5 MG A 1 502 502 MG MG . DA 6 GDP B 1 501 501 GDP GDP . EA 7 TA1 B 1 502 502 TA1 TA1 . FA 8 ANP K 1 501 1204 ANP ANP . GA 5 MG K 1 502 1205 MG MG . HA 4 GTP C 1 501 501 GTP GTP . IA 5 MG C 1 502 502 MG MG . JA 6 GDP D 1 501 501 GDP GDP . KA 7 TA1 D 1 502 502 TA1 TA1 . LA 8 ANP a 1 401 1204 ANP ANP . MA 5 MG a 1 402 1205 MG MG . NA 4 GTP E 1 501 501 GTP GTP . OA 5 MG E 1 502 502 MG MG . PA 6 GDP F 1 501 501 GDP GDP . QA 7 TA1 F 1 502 502 TA1 TA1 . RA 8 ANP b 1 401 1204 ANP ANP . SA 5 MG b 1 402 1205 MG MG . TA 4 GTP G 1 501 501 GTP GTP . UA 5 MG G 1 502 502 MG MG . VA 6 GDP H 1 501 501 GDP GDP . WA 7 TA1 H 1 502 502 TA1 TA1 . XA 8 ANP c 1 401 1204 ANP ANP . YA 5 MG c 1 402 1205 MG MG . ZA 4 GTP I 1 501 501 GTP GTP . AB 5 MG I 1 502 502 MG MG . BB 6 GDP J 1 501 501 GDP GDP . CB 7 TA1 J 1 502 502 TA1 TA1 . DB 8 ANP d 1 401 1204 ANP ANP . EB 5 MG d 1 402 1205 MG MG . FB 4 GTP L 1 501 501 GTP GTP . GB 5 MG L 1 502 502 MG MG . HB 6 GDP M 1 501 501 GDP GDP . IB 7 TA1 M 1 502 502 TA1 TA1 . JB 8 ANP e 1 401 1204 ANP ANP . KB 5 MG e 1 402 1205 MG MG . LB 4 GTP N 1 501 501 GTP GTP . MB 5 MG N 1 502 502 MG MG . NB 6 GDP O 1 501 501 GDP GDP . OB 7 TA1 O 1 502 502 TA1 TA1 . PB 8 ANP f 1 401 1204 ANP ANP . QB 5 MG f 1 402 1205 MG MG . RB 4 GTP P 1 501 501 GTP GTP . SB 5 MG P 1 502 502 MG MG . TB 6 GDP Q 1 501 501 GDP GDP . UB 7 TA1 Q 1 502 502 TA1 TA1 . VB 8 ANP g 1 401 1204 ANP ANP . WB 5 MG g 1 402 1205 MG MG . XB 4 GTP R 1 501 501 GTP GTP . YB 5 MG R 1 502 502 MG MG . ZB 6 GDP S 1 501 501 GDP GDP . AC 7 TA1 S 1 502 502 TA1 TA1 . BC 8 ANP h 1 401 1204 ANP ANP . CC 5 MG h 1 402 1205 MG MG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PB GDP . . . TB 6 105.474 155.326 48.619 1 79.74 ? PB GDP 501 Q 1 HETATM 2 O O1B GDP . . . TB 6 104.661 155.607 47.384 1 73.16 ? O1B GDP 501 Q 1 HETATM 3 O O2B GDP . . . TB 6 106.172 153.998 48.488 1 69.34 ? O2B GDP 501 Q 1 HETATM 4 O O3B GDP . . . TB 6 106.478 156.433 48.809 1 70.07 ? O3B GDP 501 Q 1 HETATM 5 O O3A GDP . . . TB 6 104.496 155.276 49.884 1 64.16 ? O3A GDP 501 Q 1 HETATM 6 P PA GDP . . . TB 6 103.481 156.494 50.096 1 67 ? PA GDP 501 Q 1 HETATM 7 O O1A GDP . . . TB 6 103.269 157.229 48.8 1 65.36 ? O1A GDP 501 Q 1 HETATM 8 O O2A GDP . . . TB 6 104.001 157.427 51.164 1 60.14 ? O2A GDP 501 Q 1 HETATM 9 O O5' GDP . . . TB 6 102.144 155.733 50.556 1 68.26 ? O5' GDP 501 Q 1 HETATM 10 C C5' GDP . . . TB 6 101.015 155.702 49.685 1 70.36 ? C5' GDP 501 Q 1 HETATM 11 C C4' GDP . . . TB 6 99.772 155.349 50.487 1 66.21 ? C4' GDP 501 Q 1 HETATM 12 O O4' GDP . . . TB 6 99.723 156.173 51.646 1 62.84 ? O4' GDP 501 Q 1 HETATM 13 C C3' GDP . . . TB 6 98.495 155.61 49.715 1 67.14 ? C3' GDP 501 Q 1 HETATM 14 O O3' GDP . . . TB 6 97.894 154.377 49.321 1 68.6 ? O3' GDP 501 Q 1 HETATM 15 C C2' GDP . . . TB 6 97.574 156.365 50.641 1 63.57 ? C2' GDP 501 Q 1 HETATM 16 O O2' GDP . . . TB 6 96.496 155.548 51.091 1 65.79 ? O2' GDP 501 Q 1 HETATM 17 C C1' GDP . . . TB 6 98.433 156.757 51.811 1 60.1 ? C1' GDP 501 Q 1 HETATM 18 N N9 GDP . . . TB 6 98.563 158.214 51.83 1 58.74 ? N9 GDP 501 Q 1 HETATM 19 C C8 GDP . . . TB 6 99.063 158.971 50.853 1 57.44 ? C8 GDP 501 Q 1 HETATM 20 N N7 GDP . . . TB 6 99.038 160.276 51.215 1 59.39 ? N7 GDP 501 Q 1 HETATM 21 C C5 GDP . . . TB 6 98.526 160.34 52.45 1 58.37 ? C5 GDP 501 Q 1 HETATM 22 C C6 GDP . . . TB 6 98.244 161.388 53.437 1 58.78 ? C6 GDP 501 Q 1 HETATM 23 O O6 GDP . . . TB 6 98.496 162.588 53.213 1 58.96 ? O6 GDP 501 Q 1 HETATM 24 N N1 GDP . . . TB 6 97.723 161.021 54.601 1 58.6 ? N1 GDP 501 Q 1 HETATM 25 C C2 GDP . . . TB 6 97.451 159.745 54.886 1 58.97 ? C2 GDP 501 Q 1 HETATM 26 N N2 GDP . . . TB 6 96.918 159.434 56.076 1 60.86 ? N2 GDP 501 Q 1 HETATM 27 N N3 GDP . . . TB 6 97.684 158.729 54.04 1 61.51 ? N3 GDP 501 Q 1 HETATM 28 C C4 GDP . . . TB 6 98.211 158.974 52.838 1 59.36 ? C4 GDP 501 Q 1 HETATM 29 H H5' GDP . . . TB 6 101.155 155.05 48.982 1 84.43 ? H5' GDP 501 Q 1 HETATM 30 H "H5''" GDP . . . TB 6 100.902 156.563 49.255 1 84.43 ? "H5''" GDP 501 Q 1 HETATM 31 H H4' GDP . . . TB 6 99.828 154.404 50.701 1 79.45 ? H4' GDP 501 Q 1 HETATM 32 H H3' GDP . . . TB 6 98.673 156.118 48.909 1 80.56 ? H3' GDP 501 Q 1 HETATM 33 H HO3' GDP . . . TB 6 97.101 154.513 49.087 1 82.33 ? HO3' GDP 501 Q 1 HETATM 34 H H2' GDP . . . TB 6 97.174 157.125 50.19 1 76.29 ? H2' GDP 501 Q 1 HETATM 35 H HO2' GDP . . . TB 6 96.151 155.149 50.436 1 78.94 ? HO2' GDP 501 Q 1 HETATM 36 H H1' GDP . . . TB 6 98.034 156.451 52.64 1 72.12 ? H1' GDP 501 Q 1 HETATM 37 H H8 GDP . . . TB 6 99.396 158.634 50.005 1 68.92 ? H8 GDP 501 Q 1 HETATM 38 H HN1 GDP . . . TB 6 97.555 161.62 55.195 1 70.32 ? HN1 GDP 501 Q 1 HETATM 39 H HN21 GDP . . . TB 6 97.312 159.675 56.8 1 73.04 ? HN21 GDP 501 Q 1 HETATM 40 H HN22 GDP . . . TB 6 96.134 159.073 56.111 1 73.04 ? HN22 GDP 501 Q 1 # _model_server_stats.io_time_ms 50 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 443 _model_server_stats.query_time_ms 219 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 40 #