data_7SB5 # _model_server_result.job_id w9meWDUaZcQiaGWztRFh9A _model_server_result.datetime_utc '2024-11-16 10:43:47' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7sb5 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"HA","auth_seq_id":1407}' # _entry.id 7SB5 # _exptl.entry_id 7SB5 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 31 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 Q N N ? 5 R N N ? 5 S N N ? 5 T N N ? 5 U N N ? 5 V N N ? 5 W N N ? 5 X N N ? 5 Y N N ? 5 Z N N ? 5 AA N N ? 5 BA N N ? 5 CA N N ? 5 DA N N ? 5 EA N N ? 5 FA N N ? 5 GA N N ? 5 HA N N ? 5 IA N N ? 5 JA N N ? 5 KA N N ? 5 NA N N ? 5 OA N N ? 5 PA N N ? 5 QA N N ? 5 RA N N ? 5 SA N N ? 5 TA N N ? 5 UA N N ? 5 VA N N ? 5 WA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 3 oligosaccharide 4 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 4 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n F NAG 1 D 1 NAG C 1570 NAG 3 n F NAG 2 D 2 NAG C 1571 NAG 4 n G NAG 1 E 1 NAG C 1576 NAG 4 n G NAG 2 E 2 NAG C 1577 NAG 4 n G BMA 3 E 3 BMA C 1578 BMA 3 n H NAG 1 F 1 NAG C 1602 NAG 3 n H NAG 2 F 2 NAG C 1603 NAG 3 n I NAG 1 G 1 NAG B 1562 NAG 3 n I NAG 2 G 2 NAG B 1563 NAG 3 n J NAG 1 I 1 NAG B 1570 NAG 3 n J NAG 2 I 2 NAG B 1571 NAG 3 n K NAG 1 J 1 NAG B 1574 NAG 3 n K NAG 2 J 2 NAG B 1575 NAG 4 n L NAG 1 K 1 NAG B 1576 NAG 4 n L NAG 2 K 2 NAG B 1577 NAG 4 n L BMA 3 K 3 BMA B 1578 BMA 3 n M NAG 1 M 1 NAG A 1562 NAG 3 n M NAG 2 M 2 NAG A 1563 NAG 3 n N NAG 1 N 1 NAG A 1565 NAG 3 n N NAG 2 N 2 NAG A 1602 NAG 3 n O NAG 1 O 1 NAG A 1570 NAG 3 n O NAG 2 O 2 NAG A 1571 NAG 3 n P NAG 1 P 1 NAG A 1576 NAG 3 n P NAG 2 P 2 NAG A 1577 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 21 C CYS 21 1_555 A SG CYS 173 C CYS 173 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 168 C CYS 168 1_555 A SG CYS 201 C CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 180 C CYS 180 1_555 A SG CYS 260 C CYS 260 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.09 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 298 C CYS 298 1_555 A SG CYS 308 C CYS 308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 343 C CYS 343 1_555 A SG CYS 368 C CYS 368 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 386 C CYS 386 1_555 A SG CYS 439 C CYS 439 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 398 C CYS 398 1_555 A SG CYS 614 C CYS 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 491 C CYS 491 1_555 A SG CYS 561 C CYS 561 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 499 C CYS 499 1_555 A SG CYS 522 C CYS 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 501 C CYS 501 1_555 A SG CYS 576 C CYS 576 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 535 C CYS 535 1_555 A SG CYS 548 C CYS 548 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 571 C CYS 571 1_555 A SG CYS 578 C CYS 578 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 591 C CYS 591 1_555 A SG CYS 597 C CYS 597 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf14 A SG CYS 630 C CYS 630 1_555 A SG CYS 683 C CYS 683 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf15 A SG CYS 708 C CYS 708 1_555 A SG CYS 732 C CYS 732 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf16 A SG CYS 747 C CYS 747 1_555 A SG CYS 756 C CYS 756 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf17 A SG CYS 825 C CYS 825 1_555 A SG CYS 847 C CYS 847 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? disulf ? disulf18 A SG CYS 830 C CYS 830 1_555 A SG CYS 836 C CYS 836 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf19 A SG CYS 937 C CYS 937 1_555 A SG CYS 948 C CYS 948 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? disulf ? disulf20 A SG CYS 1125 C CYS 1125 1_555 A SG CYS 1136 C CYS 1136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf21 A SG CYS 1175 C CYS 1175 1_555 A SG CYS 1220 C CYS 1220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 21 B CYS 21 1_555 B SG CYS 173 B CYS 173 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 168 B CYS 168 1_555 B SG CYS 201 B CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 180 B CYS 180 1_555 B SG CYS 260 B CYS 260 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 298 B CYS 298 1_555 B SG CYS 308 B CYS 308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 343 B CYS 343 1_555 B SG CYS 368 B CYS 368 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.104 ? disulf ? disulf27 B SG CYS 386 B CYS 386 1_555 B SG CYS 439 B CYS 439 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf28 B SG CYS 398 B CYS 398 1_555 B SG CYS 614 B CYS 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf29 B SG CYS 491 B CYS 491 1_555 B SG CYS 561 B CYS 561 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? disulf ? disulf30 B SG CYS 499 B CYS 499 1_555 B SG CYS 522 B CYS 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf31 B SG CYS 501 B CYS 501 1_555 B SG CYS 576 B CYS 576 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf32 B SG CYS 535 B CYS 535 1_555 B SG CYS 548 B CYS 548 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf33 B SG CYS 571 B CYS 571 1_555 B SG CYS 578 B CYS 578 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf34 B SG CYS 591 B CYS 591 1_555 B SG CYS 597 B CYS 597 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? disulf ? disulf35 B SG CYS 630 B CYS 630 1_555 B SG CYS 683 B CYS 683 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf36 B SG CYS 708 B CYS 708 1_555 B SG CYS 732 B CYS 732 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf37 B SG CYS 747 B CYS 747 1_555 B SG CYS 756 B CYS 756 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? disulf ? disulf38 B SG CYS 825 B CYS 825 1_555 B SG CYS 847 B CYS 847 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? disulf ? disulf39 B SG CYS 830 B CYS 830 1_555 B SG CYS 836 B CYS 836 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf40 B SG CYS 937 B CYS 937 1_555 B SG CYS 948 B CYS 948 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf41 B SG CYS 1125 B CYS 1125 1_555 B SG CYS 1136 B CYS 1136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf42 B SG CYS 1175 B CYS 1175 1_555 B SG CYS 1220 B CYS 1220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf43 C SG CYS 21 A CYS 21 1_555 C SG CYS 173 A CYS 173 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf44 C SG CYS 168 A CYS 168 1_555 C SG CYS 201 A CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf45 C SG CYS 180 A CYS 180 1_555 C SG CYS 260 A CYS 260 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf46 C SG CYS 298 A CYS 298 1_555 C SG CYS 308 A CYS 308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf47 C SG CYS 343 A CYS 343 1_555 C SG CYS 368 A CYS 368 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf48 C SG CYS 386 A CYS 386 1_555 C SG CYS 439 A CYS 439 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf49 C SG CYS 398 A CYS 398 1_555 C SG CYS 614 A CYS 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf50 C SG CYS 491 A CYS 491 1_555 C SG CYS 561 A CYS 561 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf51 C SG CYS 499 A CYS 499 1_555 C SG CYS 522 A CYS 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf52 C SG CYS 501 A CYS 501 1_555 C SG CYS 576 A CYS 576 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf53 C SG CYS 535 A CYS 535 1_555 C SG CYS 548 A CYS 548 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf54 C SG CYS 571 A CYS 571 1_555 C SG CYS 578 A CYS 578 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf55 C SG CYS 591 A CYS 591 1_555 C SG CYS 597 A CYS 597 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? disulf ? disulf56 C SG CYS 630 A CYS 630 1_555 C SG CYS 683 A CYS 683 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf57 C SG CYS 708 A CYS 708 1_555 C SG CYS 732 A CYS 732 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf58 C SG CYS 747 A CYS 747 1_555 C SG CYS 756 A CYS 756 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf59 C SG CYS 825 A CYS 825 1_555 C SG CYS 847 A CYS 847 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? disulf ? disulf60 C SG CYS 830 A CYS 830 1_555 C SG CYS 836 A CYS 836 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf61 C SG CYS 937 A CYS 937 1_555 C SG CYS 948 A CYS 948 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf62 C SG CYS 1125 A CYS 1125 1_555 C SG CYS 1136 A CYS 1136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf63 C SG CYS 1175 A CYS 1175 1_555 C SG CYS 1220 A CYS 1220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 137 C ASN 137 1_555 Q C1 NAG . C NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 206 C ASN 206 1_555 G C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 212 C ASN 212 1_555 R C1 NAG . C NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.42 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 371 C ASN 371 1_555 H C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 449 C ASN 449 1_555 Y C1 NAG . C NAG 1409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 648 C ASN 648 1_555 X C1 NAG . C NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 675 C ASN 675 1_555 V C1 NAG . C NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 695 C ASN 695 1_555 W C1 NAG . C NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 713 C ASN 713 1_555 S C1 NAG . C NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 738 C ASN 738 1_555 F C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.483 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 787 C ASN 787 1_555 AA C1 NAG . C NAG 1411 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 936 C ASN 936 1_555 T C1 NAG . C NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.532 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 1193 C ASN 1193 1_555 U C1 NAG . C NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 1223 C ASN 1223 1_555 Z C1 NAG . C NAG 1410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.529 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 137 B ASN 137 1_555 I C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 206 B ASN 206 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 212 B ASN 212 1_555 BA C1 NAG . B NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 371 B ASN 371 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 449 B ASN 449 1_555 CA C1 NAG . B NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 648 B ASN 648 1_555 IA C1 NAG . B NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.53 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 675 B ASN 675 1_555 GA C1 NAG . B NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 695 B ASN 695 1_555 HA C1 NAG . B NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 713 B ASN 713 1_555 DA C1 NAG . B NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 738 B ASN 738 1_555 J C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 787 B ASN 787 1_555 EA C1 NAG . B NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 936 B ASN 936 1_555 FA C1 NAG . B NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale27 B ND2 ASN 1193 B ASN 1193 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale28 B ND2 ASN 1223 B ASN 1223 1_555 KA C1 NAG . B NAG 1410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale29 C ND2 ASN 137 A ASN 137 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale30 C ND2 ASN 206 A ASN 206 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale31 C ND2 ASN 212 A ASN 212 1_555 NA C1 NAG . A NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale32 C ND2 ASN 371 A ASN 371 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 449 A ASN 449 1_555 OA C1 NAG . A NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 648 A ASN 648 1_555 VA C1 NAG . A NAG 1409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 675 A ASN 675 1_555 TA C1 NAG . A NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 695 A ASN 695 1_555 UA C1 NAG . A NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? covale ? covale37 C ND2 ASN 713 A ASN 713 1_555 PA C1 NAG . A NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale38 C ND2 ASN 738 A ASN 738 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale39 C ND2 ASN 787 A ASN 787 1_555 QA C1 NAG . A NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale40 C ND2 ASN 936 A ASN 936 1_555 RA C1 NAG . A NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale41 C ND2 ASN 1193 A ASN 1193 1_555 SA C1 NAG . A NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? covale ? covale42 C ND2 ASN 1223 A ASN 1223 1_555 WA C1 NAG . A NAG 1410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale43 F O4 NAG . D NAG 1 1_555 F C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale44 G O4 NAG . E NAG 1 1_555 G C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale45 G O4 NAG . E NAG 2 1_555 G C1 BMA . E BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale46 H O4 NAG . F NAG 1 1_555 H C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale47 I O4 NAG . G NAG 1 1_555 I C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale48 J O4 NAG . I NAG 1 1_555 J C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? covale ? covale49 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale50 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale51 L O4 NAG . K NAG 2 1_555 L C1 BMA . K BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? covale ? covale52 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale53 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? covale ? covale54 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale ? covale55 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 259 n n C1 O1 NAG sing 260 n n C1 O5 NAG sing 261 n n C1 H1 NAG sing 262 n n C2 C3 NAG sing 263 n n C2 N2 NAG sing 264 n n C2 H2 NAG sing 265 n n C3 C4 NAG sing 266 n n C3 O3 NAG sing 267 n n C3 H3 NAG sing 268 n n C4 C5 NAG sing 269 n n C4 O4 NAG sing 270 n n C4 H4 NAG sing 271 n n C5 C6 NAG sing 272 n n C5 O5 NAG sing 273 n n C5 H5 NAG sing 274 n n C6 O6 NAG sing 275 n n C6 H61 NAG sing 276 n n C6 H62 NAG sing 277 n n C7 C8 NAG sing 278 n n C7 N2 NAG sing 279 n n C7 O7 NAG doub 280 n n C8 H81 NAG sing 281 n n C8 H82 NAG sing 282 n n C8 H83 NAG sing 283 n n N2 HN2 NAG sing 284 n n O1 HO1 NAG sing 285 n n O3 HO3 NAG sing 286 n n O4 HO4 NAG sing 287 n n O6 HO6 NAG sing 288 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7SB5 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Q 5 NAG C 1 1401 1562 NAG NAG . R 5 NAG C 1 1402 1564 NAG NAG . S 5 NAG C 1 1403 1569 NAG NAG . T 5 NAG C 1 1404 1573 NAG NAG . U 5 NAG C 1 1405 1574 NAG NAG . V 5 NAG C 1 1406 1579 NAG NAG . W 5 NAG C 1 1407 1580 NAG NAG . X 5 NAG C 1 1408 1582 NAG NAG . Y 5 NAG C 1 1409 1604 NAG NAG . Z 5 NAG C 1 1410 1605 NAG NAG . AA 5 NAG C 1 1411 1606 NAG NAG . BA 5 NAG B 1 1401 1564 NAG NAG . CA 5 NAG B 1 1402 1567 NAG NAG . DA 5 NAG B 1 1403 1569 NAG NAG . EA 5 NAG B 1 1404 1572 NAG NAG . FA 5 NAG B 1 1405 1573 NAG NAG . GA 5 NAG B 1 1406 1579 NAG NAG . HA 5 NAG B 1 1407 1580 NAG NAG . IA 5 NAG B 1 1408 1582 NAG NAG . JA 5 NAG B 1 1409 1602 NAG NAG . KA 5 NAG B 1 1410 1603 NAG NAG . LA 6 PLM B 1 1411 1 PLM SAP . MA 6 PLM B 1 1412 1 PLM SAP . NA 5 NAG A 1 1401 1564 NAG NAG . OA 5 NAG A 1 1402 1567 NAG NAG . PA 5 NAG A 1 1403 1569 NAG NAG . QA 5 NAG A 1 1404 1572 NAG NAG . RA 5 NAG A 1 1405 1573 NAG NAG . SA 5 NAG A 1 1406 1574 NAG NAG . TA 5 NAG A 1 1407 1579 NAG NAG . UA 5 NAG A 1 1408 1580 NAG NAG . VA 5 NAG A 1 1409 1582 NAG NAG . WA 5 NAG A 1 1410 1603 NAG NAG . XA 6 PLM A 1 1411 1 PLM SAP . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . HA 5 138.491 186.417 147.137 1 190.93 ? C1 NAG 1407 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . HA 5 137.541 187.616 146.691 1 198.46 ? C2 NAG 1407 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . HA 5 138.115 188.226 145.362 1 203.43 ? C3 NAG 1407 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . HA 5 139.592 188.709 145.589 1 203.28 ? C4 NAG 1407 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . HA 5 140.464 187.492 146.079 1 200.26 ? C5 NAG 1407 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . HA 5 141.908 187.87 146.413 1 202.87 ? C6 NAG 1407 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . HA 5 135.15 187.247 147.307 1 194.66 ? C7 NAG 1407 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . HA 5 133.818 186.626 146.997 1 191.62 ? C8 NAG 1407 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . HA 5 136.18 187.056 146.465 1 193.59 ? N2 NAG 1407 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . HA 5 137.303 189.35 144.969 1 200.57 ? O3 NAG 1407 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . HA 5 140.115 189.215 144.357 1 198.98 ? O4 NAG 1407 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . HA 5 139.862 186.926 147.324 1 190.55 ? O5 NAG 1407 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . HA 5 142.729 186.717 146.616 1 191.09 ? O6 NAG 1407 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . HA 5 135.267 187.928 148.341 1 191.49 ? O7 NAG 1407 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 20 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 39 _model_server_stats.query_time_ms 308 _model_server_stats.encode_time_ms 7 _model_server_stats.element_count 14 #