data_7SBW # _model_server_result.job_id bQRilKZUz5pVdFFvH3sQog _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 08:35:21' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7sbw # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"OA","auth_seq_id":1401}' # _entry.id 7SBW # _exptl.entry_id 7SBW _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 12 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 KA N N ? 5 LA N N ? 5 MA N N ? 5 NA N N ? 5 OA N N ? 5 PA N N ? 5 QA N N ? 5 RA N N ? 5 TA N N ? 5 UA N N ? 5 VA N N ? 5 WA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 3 oligosaccharide 4 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 3 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n F NAG 1 C 1 NAG J 1562 NAG 3 n F NAG 2 C 2 NAG J 1563 NAG 3 n F BMA 3 C 3 BMA J 1584 BMA 3 n G NAG 1 D 1 NAG J 1565 NAG 3 n G NAG 2 D 2 NAG J 1583 NAG 3 n G BMA 3 D 3 BMA J 1586 BMA 4 n H NAG 1 E 1 NAG J 1567 NAG 4 n H NAG 2 E 2 NAG J 1589 NAG 4 n I NAG 1 F 1 NAG J 1569 NAG 4 n I NAG 2 F 2 NAG J 1587 NAG 3 n J NAG 1 G 1 NAG J 1570 NAG 3 n J NAG 2 G 2 NAG J 1571 NAG 3 n J BMA 3 G 3 BMA J 1588 BMA 4 n K NAG 1 I 1 NAG J 1573 NAG 4 n K NAG 2 I 2 NAG J 1591 NAG 4 n L NAG 1 K 1 NAG J 1574 NAG 4 n L NAG 2 K 2 NAG J 1575 NAG 3 n M NAG 1 M 1 NAG J 1576 NAG 3 n M NAG 2 M 2 NAG J 1577 NAG 3 n M BMA 3 M 3 BMA J 1578 BMA 4 n N NAG 1 N 1 NAG J 1579 NAG 4 n N NAG 2 N 2 NAG J 1585 NAG 4 n O NAG 1 O 1 NAG J 1580 NAG 4 n O NAG 2 O 2 NAG J 1581 NAG 4 n P NAG 1 P 1 NAG A 1562 NAG 4 n P NAG 2 P 2 NAG A 1563 NAG 3 n Q NAG 1 Q 1 NAG A 1565 NAG 3 n Q NAG 2 Q 2 NAG A 1607 NAG 3 n Q BMA 3 Q 3 BMA A 1614 BMA 3 n R NAG 1 R 1 NAG A 1569 NAG 3 n R NAG 2 R 2 NAG A 1604 NAG 3 n R BMA 3 R 3 BMA A 1615 BMA 4 n S NAG 1 S 1 NAG A 1570 NAG 4 n S NAG 2 S 2 NAG A 1571 NAG 3 n T NAG 1 T 1 NAG A 1573 NAG 3 n T NAG 2 T 2 NAG A 1611 NAG 3 n T BMA 3 T 3 BMA A 1612 BMA 4 n U NAG 1 U 1 NAG A 1574 NAG 4 n U NAG 2 U 2 NAG A 1575 NAG 3 n V NAG 1 V 1 NAG A 1576 NAG 3 n V NAG 2 V 2 NAG A 1577 NAG 3 n V BMA 3 V 3 BMA A 1578 BMA 4 n W NAG 1 W 1 NAG A 1579 NAG 4 n W NAG 2 W 2 NAG A 1608 NAG 4 n X NAG 1 X 1 NAG A 1580 NAG 4 n X NAG 2 X 2 NAG A 1610 NAG 3 n Y NAG 1 Y 1 NAG A 1602 NAG 3 n Y NAG 2 Y 2 NAG A 1603 NAG 3 n Y BMA 3 Y 3 BMA A 1613 BMA 4 n Z NAG 1 Z 1 NAG A 1605 NAG 4 n Z NAG 2 Z 2 NAG A 1606 NAG 4 n AA NAG 1 a 1 NAG B 1562 NAG 4 n AA NAG 2 a 2 NAG B 1563 NAG 4 n BA NAG 1 b 1 NAG B 1564 NAG 4 n BA NAG 2 b 2 NAG B 1588 NAG 3 n CA NAG 1 c 1 NAG B 1565 NAG 3 n CA NAG 2 c 2 NAG B 1583 NAG 3 n CA BMA 3 c 3 BMA B 1586 BMA 4 n DA NAG 1 d 1 NAG B 1567 NAG 4 n DA NAG 2 d 2 NAG B 1584 NAG 4 n EA NAG 1 e 1 NAG B 1570 NAG 4 n EA NAG 2 e 2 NAG B 1571 NAG 4 n FA NAG 1 f 1 NAG B 1573 NAG 4 n FA NAG 2 f 2 NAG B 1587 NAG 4 n GA NAG 1 g 1 NAG B 1574 NAG 4 n GA NAG 2 g 2 NAG B 1575 NAG 3 n HA NAG 1 h 1 NAG B 1576 NAG 3 n HA NAG 2 h 2 NAG B 1577 NAG 3 n HA BMA 3 h 3 BMA B 1578 BMA 4 n IA NAG 1 i 1 NAG B 1579 NAG 4 n IA NAG 2 i 2 NAG B 1585 NAG 4 n JA NAG 1 j 1 NAG B 1580 NAG 4 n JA NAG 2 j 2 NAG B 1581 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 C SG CYS 21 J CYS 21 1_555 C SG CYS 173 J CYS 173 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf2 C SG CYS 168 J CYS 168 1_555 C SG CYS 201 J CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf3 C SG CYS 180 J CYS 180 1_555 C SG CYS 260 J CYS 260 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf4 C SG CYS 298 J CYS 298 1_555 C SG CYS 308 J CYS 308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf5 C SG CYS 343 J CYS 343 1_555 C SG CYS 368 J CYS 368 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? disulf ? disulf6 C SG CYS 386 J CYS 386 1_555 C SG CYS 439 J CYS 439 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf7 C SG CYS 398 J CYS 398 1_555 C SG CYS 614 J CYS 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? disulf ? disulf8 C SG CYS 491 J CYS 491 1_555 C SG CYS 561 J CYS 561 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf9 C SG CYS 499 J CYS 499 1_555 C SG CYS 522 J CYS 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf10 C SG CYS 501 J CYS 501 1_555 C SG CYS 576 J CYS 576 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf11 C SG CYS 535 J CYS 535 1_555 C SG CYS 548 J CYS 548 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf12 C SG CYS 571 J CYS 571 1_555 C SG CYS 578 J CYS 578 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf13 C SG CYS 591 J CYS 591 1_555 C SG CYS 597 J CYS 597 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf14 C SG CYS 630 J CYS 630 1_555 C SG CYS 683 J CYS 683 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? disulf ? disulf15 C SG CYS 708 J CYS 708 1_555 C SG CYS 732 J CYS 732 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf16 C SG CYS 747 J CYS 747 1_555 C SG CYS 756 J CYS 756 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf17 C SG CYS 825 J CYS 825 1_555 C SG CYS 847 J CYS 847 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf18 C SG CYS 830 J CYS 830 1_555 C SG CYS 836 J CYS 836 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf19 C SG CYS 937 J CYS 937 1_555 C SG CYS 948 J CYS 948 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf20 C SG CYS 1125 J CYS 1125 1_555 C SG CYS 1136 J CYS 1136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? disulf ? disulf21 C SG CYS 1175 J CYS 1175 1_555 C SG CYS 1220 J CYS 1220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf22 D SG CYS 21 A CYS 21 1_555 D SG CYS 173 A CYS 173 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf23 D SG CYS 168 A CYS 168 1_555 D SG CYS 201 A CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf24 D SG CYS 180 A CYS 180 1_555 D SG CYS 260 A CYS 260 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf25 D SG CYS 298 A CYS 298 1_555 D SG CYS 308 A CYS 308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf26 D SG CYS 343 A CYS 343 1_555 D SG CYS 368 A CYS 368 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? disulf ? disulf27 D SG CYS 386 A CYS 386 1_555 D SG CYS 439 A CYS 439 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf28 D SG CYS 398 A CYS 398 1_555 D SG CYS 614 A CYS 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf29 D SG CYS 491 A CYS 491 1_555 D SG CYS 561 A CYS 561 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? disulf ? disulf30 D SG CYS 499 A CYS 499 1_555 D SG CYS 522 A CYS 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf31 D SG CYS 501 A CYS 501 1_555 D SG CYS 576 A CYS 576 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf32 D SG CYS 535 A CYS 535 1_555 D SG CYS 548 A CYS 548 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf33 D SG CYS 571 A CYS 571 1_555 D SG CYS 578 A CYS 578 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf34 D SG CYS 591 A CYS 591 1_555 D SG CYS 597 A CYS 597 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf35 D SG CYS 630 A CYS 630 1_555 D SG CYS 683 A CYS 683 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? disulf ? disulf36 D SG CYS 708 A CYS 708 1_555 D SG CYS 732 A CYS 732 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf37 D SG CYS 747 A CYS 747 1_555 D SG CYS 756 A CYS 756 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf38 D SG CYS 825 A CYS 825 1_555 D SG CYS 847 A CYS 847 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? disulf ? disulf39 D SG CYS 830 A CYS 830 1_555 D SG CYS 836 A CYS 836 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf40 D SG CYS 937 A CYS 937 1_555 D SG CYS 948 A CYS 948 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? disulf ? disulf41 D SG CYS 1125 A CYS 1125 1_555 D SG CYS 1136 A CYS 1136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf42 D SG CYS 1175 A CYS 1175 1_555 D SG CYS 1220 A CYS 1220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf43 E SG CYS 21 B CYS 21 1_555 E SG CYS 173 B CYS 173 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf44 E SG CYS 168 B CYS 168 1_555 E SG CYS 201 B CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf45 E SG CYS 180 B CYS 180 1_555 E SG CYS 260 B CYS 260 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf46 E SG CYS 298 B CYS 298 1_555 E SG CYS 308 B CYS 308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf47 E SG CYS 343 B CYS 343 1_555 E SG CYS 368 B CYS 368 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.119 ? disulf ? disulf48 E SG CYS 386 B CYS 386 1_555 E SG CYS 439 B CYS 439 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf49 E SG CYS 398 B CYS 398 1_555 E SG CYS 614 B CYS 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf50 E SG CYS 491 B CYS 491 1_555 E SG CYS 561 B CYS 561 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf51 E SG CYS 499 B CYS 499 1_555 E SG CYS 522 B CYS 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf52 E SG CYS 501 B CYS 501 1_555 E SG CYS 576 B CYS 576 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf53 E SG CYS 535 B CYS 535 1_555 E SG CYS 548 B CYS 548 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? disulf ? disulf54 E SG CYS 571 B CYS 571 1_555 E SG CYS 578 B CYS 578 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf55 E SG CYS 591 B CYS 591 1_555 E SG CYS 597 B CYS 597 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf56 E SG CYS 630 B CYS 630 1_555 E SG CYS 683 B CYS 683 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf57 E SG CYS 708 B CYS 708 1_555 E SG CYS 732 B CYS 732 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf58 E SG CYS 747 B CYS 747 1_555 E SG CYS 756 B CYS 756 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf59 E SG CYS 825 B CYS 825 1_555 E SG CYS 847 B CYS 847 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf60 E SG CYS 830 B CYS 830 1_555 E SG CYS 836 B CYS 836 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf61 E SG CYS 937 B CYS 937 1_555 E SG CYS 948 B CYS 948 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? disulf ? disulf62 E SG CYS 1125 B CYS 1125 1_555 E SG CYS 1136 B CYS 1136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf63 E SG CYS 1175 B CYS 1175 1_555 E SG CYS 1220 B CYS 1220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? covale ? covale1 C ND2 ASN 63 J ASN 63 1_555 NA C1 NAG . J NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.403 ? covale ? covale2 C ND2 ASN 137 J ASN 137 1_555 F C1 NAG . C NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.401 ? covale ? covale3 C ND2 ASN 206 J ASN 206 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? covale ? covale4 C ND2 ASN 212 J ASN 212 1_555 KA C1 NAG . J NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? covale ? covale5 C ND2 ASN 371 J ASN 371 1_555 G C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.398 ? covale ? covale6 C ND2 ASN 449 J ASN 449 1_555 H C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.4 ? covale ? covale7 C ND2 ASN 648 J ASN 648 1_555 MA C1 NAG . J NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? covale ? covale8 C ND2 ASN 675 J ASN 675 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? covale ? covale9 C ND2 ASN 695 J ASN 695 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.391 ? covale ? covale10 C ND2 ASN 713 J ASN 713 1_555 I C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.41 ? covale ? covale11 C ND2 ASN 738 J ASN 738 1_555 J C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.398 ? covale ? covale12 C ND2 ASN 787 J ASN 787 1_555 LA C1 NAG . J NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.398 ? covale ? covale13 C ND2 ASN 936 J ASN 936 1_555 K C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.391 ? covale ? covale14 C ND2 ASN 1193 J ASN 1193 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.401 ? covale ? covale15 D ND2 ASN 63 A ASN 63 1_555 RA C1 NAG . A NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? covale ? covale16 D ND2 ASN 137 A ASN 137 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale17 D ND2 ASN 206 A ASN 206 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? covale ? covale18 D ND2 ASN 212 A ASN 212 1_555 OA C1 NAG . A NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? covale ? covale19 D ND2 ASN 371 A ASN 371 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.409 ? covale ? covale20 D ND2 ASN 449 A ASN 449 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.409 ? covale ? covale21 D ND2 ASN 648 A ASN 648 1_555 QA C1 NAG . A NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? covale ? covale22 D ND2 ASN 675 A ASN 675 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? covale ? covale23 D ND2 ASN 695 A ASN 695 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.388 ? covale ? covale24 D ND2 ASN 713 A ASN 713 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? covale ? covale25 D ND2 ASN 738 A ASN 738 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.397 ? covale ? covale26 D ND2 ASN 787 A ASN 787 1_555 PA C1 NAG . A NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? covale ? covale27 D ND2 ASN 936 A ASN 936 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.392 ? covale ? covale28 D ND2 ASN 1193 A ASN 1193 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? covale ? covale29 D ND2 ASN 1223 A ASN 1223 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? covale ? covale30 E ND2 ASN 63 B ASN 63 1_555 WA C1 NAG . B NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.398 ? covale ? covale31 E ND2 ASN 137 B ASN 137 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? covale ? covale32 E ND2 ASN 206 B ASN 206 1_555 HA C1 NAG . h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? covale ? covale33 E ND2 ASN 212 B ASN 212 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? covale ? covale34 E ND2 ASN 371 B ASN 371 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.4 ? covale ? covale35 E ND2 ASN 449 B ASN 449 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale36 E ND2 ASN 648 B ASN 648 1_555 VA C1 NAG . B NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale37 E ND2 ASN 675 B ASN 675 1_555 IA C1 NAG . i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.413 ? covale ? covale38 E ND2 ASN 695 B ASN 695 1_555 JA C1 NAG . j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? covale ? covale39 E ND2 ASN 713 B ASN 713 1_555 TA C1 NAG . B NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale40 E ND2 ASN 738 B ASN 738 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? covale ? covale41 E ND2 ASN 787 B ASN 787 1_555 UA C1 NAG . B NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.401 ? covale ? covale42 E ND2 ASN 936 B ASN 936 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.391 ? covale ? covale43 E ND2 ASN 1193 B ASN 1193 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale44 F O4 NAG . C NAG 1 1_555 F C1 NAG . C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale45 F O4 NAG . C NAG 2 1_555 F C1 BMA . C BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? covale ? covale46 G O4 NAG . D NAG 1 1_555 G C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? covale ? covale47 G O4 NAG . D NAG 2 1_555 G C1 BMA . D BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.473 ? covale ? covale48 H O4 NAG . E NAG 1 1_555 H C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? covale ? covale49 I O4 NAG . F NAG 1 1_555 I C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? covale ? covale50 J O4 NAG . G NAG 1 1_555 J C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale51 J O4 NAG . G NAG 2 1_555 J C1 BMA . G BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.48 ? covale ? covale52 K O4 NAG . I NAG 1 1_555 K C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.478 ? covale ? covale53 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale ? covale54 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.473 ? covale ? covale55 M O4 NAG . M NAG 2 1_555 M C1 BMA . M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.476 ? covale ? covale56 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? covale ? covale57 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? covale ? covale58 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.49 ? covale ? covale59 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? covale ? covale60 Q O4 NAG . Q NAG 2 1_555 Q C1 BMA . Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.476 ? covale ? covale61 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? covale ? covale62 R O4 NAG . R NAG 2 1_555 R C1 BMA . R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.479 ? covale ? covale63 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? covale ? covale64 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.478 ? covale ? covale65 T O4 NAG . T NAG 2 1_555 T C1 BMA . T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? covale ? covale66 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? covale ? covale67 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? covale ? covale68 V O4 NAG . V NAG 2 1_555 V C1 BMA . V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? covale ? covale69 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.47 ? covale ? covale70 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? covale ? covale71 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.47 ? covale ? covale72 Y O4 NAG . Y NAG 2 1_555 Y C1 BMA . Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.476 ? covale ? covale73 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.48 ? covale ? covale74 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? covale ? covale75 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.48 ? covale ? covale76 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? covale ? covale77 CA O4 NAG . c NAG 2 1_555 CA C1 BMA . c BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? covale ? covale78 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.476 ? covale ? covale79 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? covale ? covale80 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? covale ? covale81 GA O4 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 NAG . g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.47 ? covale ? covale82 HA O4 NAG . h NAG 1 1_555 HA C1 NAG . h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? covale ? covale83 HA O4 NAG . h NAG 2 1_555 HA C1 BMA . h BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.483 ? covale ? covale84 IA O4 NAG . i NAG 1 1_555 IA C1 NAG . i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? covale ? covale85 JA O4 NAG . j NAG 1 1_555 JA C1 NAG . j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.488 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 306 n n C1 O1 NAG sing 307 n n C1 O5 NAG sing 308 n n C1 H1 NAG sing 309 n n C2 C3 NAG sing 310 n n C2 N2 NAG sing 311 n n C2 H2 NAG sing 312 n n C3 C4 NAG sing 313 n n C3 O3 NAG sing 314 n n C3 H3 NAG sing 315 n n C4 C5 NAG sing 316 n n C4 O4 NAG sing 317 n n C4 H4 NAG sing 318 n n C5 C6 NAG sing 319 n n C5 O5 NAG sing 320 n n C5 H5 NAG sing 321 n n C6 O6 NAG sing 322 n n C6 H61 NAG sing 323 n n C6 H62 NAG sing 324 n n C7 C8 NAG sing 325 n n C7 N2 NAG sing 326 n n C7 O7 NAG doub 327 n n C8 H81 NAG sing 328 n n C8 H82 NAG sing 329 n n C8 H83 NAG sing 330 n n N2 HN2 NAG sing 331 n n O1 HO1 NAG sing 332 n n O3 HO3 NAG sing 333 n n O4 HO4 NAG sing 334 n n O6 HO6 NAG sing 335 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7SBW _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code KA 5 NAG J 1 1401 1564 NAG NAG . LA 5 NAG J 1 1402 1572 NAG NAG . MA 5 NAG J 1 1403 1582 NAG NAG . NA 5 NAG J 1 1404 1590 NAG NAG . OA 5 NAG A 1 1401 1564 NAG NAG . PA 5 NAG A 1 1402 1572 NAG NAG . QA 5 NAG A 1 1403 1582 NAG NAG . RA 5 NAG A 1 1404 1609 NAG NAG . SA 6 8Z9 A 1 1405 1 8Z9 SAP . TA 5 NAG B 1 1401 1569 NAG NAG . UA 5 NAG B 1 1402 1572 NAG NAG . VA 5 NAG B 1 1403 1582 NAG NAG . WA 5 NAG B 1 1404 1589 NAG NAG . XA 6 8Z9 B 1 1405 1 8Z9 SAP . YA 6 8Z9 B 1 1406 1 8Z9 SAP . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . OA 5 123.982 211.753 181.375 1 141.65 ? C1 NAG 1401 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . OA 5 122.829 211.859 180.408 1 132.65 ? C2 NAG 1401 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . OA 5 122.296 213.232 180.433 1 148.59 ? C3 NAG 1401 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . OA 5 121.824 213.526 181.896 1 148.8 ? C4 NAG 1401 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . OA 5 123.032 213.385 182.868 1 155.24 ? C5 NAG 1401 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . OA 5 122.634 213.677 184.288 1 162.46 ? C6 NAG 1401 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . OA 5 122.785 210.535 178.382 1 119.44 ? C7 NAG 1401 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . OA 5 123.4 210.257 177.053 1 144.61 ? C8 NAG 1401 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . OA 5 123.292 211.533 179.07 1 131.44 ? N2 NAG 1401 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . OA 5 121.212 213.352 179.478 1 138.14 ? O3 NAG 1401 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . OA 5 121.308 214.815 181.952 1 156.17 ? O4 NAG 1401 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . OA 5 123.541 212.049 182.818 1 148.21 ? O5 NAG 1401 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . OA 5 121.953 214.919 184.38 1 163.1 ? O6 NAG 1401 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . OA 5 121.84 209.866 178.813 1 147.79 ? O7 NAG 1401 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 17 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 48 _model_server_stats.query_time_ms 321 _model_server_stats.encode_time_ms 13 _model_server_stats.element_count 14 #