data_7SGC # _model_server_result.job_id S5xKSMp11S0Xv0gFvEYrEA _model_server_result.datetime_utc '2024-10-10 02:31:43' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7sgc # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":303}' # _entry.id 7SGC # _exptl.entry_id 7SGC _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 123.948 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7SGC _cell.length_a 109.161 _cell.length_b 83.051 _cell.length_c 74.349 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7SGC _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall 'C 2y' _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? trimeric 3 author_defined_assembly 1 ? dimeric 2 author_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,F,G,H,I,J,K 1 1 D,E 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 F N N ? 6 G N N ? 6 H N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 I O HOH . A HOH 102 1_555 G MG MG . C MG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? metalc ? metalc2 I O HOH . A HOH 103 1_555 F MG MG . C MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.81 ? metalc ? metalc3 C OE2 GLU 89 C GLU 77 1_555 G MG MG . C MG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? metalc ? metalc4 C OD1 ASP 93 C ASP 81 1_555 G MG MG . C MG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? metalc ? metalc5 G MG MG . C MG 302 1_555 K O HOH . C HOH 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.108 ? metalc ? metalc6 G MG MG . C MG 302 1_555 K O HOH . C HOH 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? metalc ? metalc7 G MG MG . C MG 302 1_555 K O HOH . C HOH 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.008 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N3 DC 1 A DC 1 1_555 B N1 DG 21 B DG 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N4 DC 1 A DC 1 1_555 B O6 DG 21 B DG 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O2 DC 1 A DC 1 1_555 B N2 DG 21 B DG 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N3 DC 2 A DC 2 1_555 B N1 DG 20 B DG 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N4 DC 2 A DC 2 1_555 B O6 DG 20 B DG 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O2 DC 2 A DC 2 1_555 B N2 DG 20 B DG 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N3 DT 3 A DT 3 1_555 B N1 DA 19 B DA 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A O4 DT 3 A DT 3 1_555 B N6 DA 19 B DA 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A N1 DG 4 A DG 4 1_555 B N3 DC 18 B DC 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N2 DG 4 A DG 4 1_555 B O2 DC 18 B DC 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A O6 DG 4 A DG 4 1_555 B N4 DC 18 B DC 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A N3 DT 5 A DT 5 1_555 B N1 DA 17 B DA 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A O4 DT 5 A DT 5 1_555 B N6 DA 17 B DA 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A N1 DG 6 A DG 6 1_555 B N3 DC 16 B DC 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A N2 DG 6 A DG 6 1_555 B O2 DC 16 B DC 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A O6 DG 6 A DG 6 1_555 B N4 DC 16 B DC 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A N1 DA 7 A DA 7 1_555 B N3 DT 15 B DT 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A N6 DA 7 A DA 7 1_555 B O4 DT 15 B DT 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A N3 DC 8 A DC 8 1_555 B N1 DG 14 B DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 A N4 DC 8 A DC 8 1_555 B O6 DG 14 B DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 A O2 DC 8 A DC 8 1_555 B N2 DG 14 B DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A N1 DA 9 A DA 9 1_555 B N3 DT 13 B DT 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A N6 DA 9 A DA 9 1_555 B O4 DT 13 B DT 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A N1 DA 10 A DA 10 1_555 B N3 DT 12 B DT 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 A N6 DA 10 A DA 10 1_555 B O4 DT 12 B DT 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 A N1 DA 11 A DA 11 1_555 B N3 DT 11 B DT 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 A N6 DA 11 A DA 11 1_555 B O4 DT 11 B DT 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 A N3 DT 12 A DT 12 1_555 B N1 DA 10 B DA 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 A O4 DT 12 A DT 12 1_555 B N6 DA 10 B DA 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 A N3 DT 13 A DT 13 1_555 B N1 DA 9 B DA 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 A O4 DT 13 A DT 13 1_555 B N6 DA 9 B DA 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 A N1 DG 14 A DG 14 1_555 B N3 DC 8 B DC 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 A N2 DG 14 A DG 14 1_555 B O2 DC 8 B DC 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 A O6 DG 14 A DG 14 1_555 B N4 DC 8 B DC 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 A N3 DC 15 A DC 15 1_555 B N1 DG 7 B DG 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 A N4 DC 15 A DC 15 1_555 B O6 DG 7 B DG 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 A O2 DC 15 A DC 15 1_555 B N2 DG 7 B DG 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 A N3 DC 16 A DC 16 1_555 B N1 DG 6 B DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 A N4 DC 16 A DC 16 1_555 B O6 DG 6 B DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 A O2 DC 16 A DC 16 1_555 B N2 DG 6 B DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 A N3 DC 17 A DC 17 1_555 B N1 DG 5 B DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 A N4 DC 17 A DC 17 1_555 B O6 DG 5 B DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 A O2 DC 17 A DC 17 1_555 B N2 DG 5 B DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 A N3 DT 18 A DT 18 1_555 B N1 DA 4 B DA 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 A O4 DT 18 A DT 18 1_555 B N6 DA 4 B DA 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 A N3 DC 19 A DC 19 1_555 B N1 DG 3 B DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 A N4 DC 19 A DC 19 1_555 B O6 DG 3 B DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 A O2 DC 19 A DC 19 1_555 B N2 DG 3 B DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 A N1 DA 20 A DA 20 1_555 B N3 DT 2 B DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 A N6 DA 20 A DA 20 1_555 B O4 DT 2 B DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 A N1 DG 21 A DG 21 1_555 B N3 DC 1 B DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 A N2 DG 21 A DG 21 1_555 B O2 DC 1 B DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 A O6 DG 21 A DG 21 1_555 B N4 DC 1 B DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7SGC _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009161 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.006167 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.012041 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.016214 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code F 6 MG C 1 301 1 MG MG . G 6 MG C 1 302 2 MG MG . H 6 MG C 1 303 3 MG MG . I 7 HOH A 1 101 24 HOH HOH . I 7 HOH A 2 102 37 HOH HOH . I 7 HOH A 3 103 25 HOH HOH . I 7 HOH A 4 104 14 HOH HOH . I 7 HOH A 5 105 7 HOH HOH . I 7 HOH A 6 106 28 HOH HOH . I 7 HOH A 7 107 34 HOH HOH . I 7 HOH A 8 108 26 HOH HOH . J 7 HOH B 1 101 11 HOH HOH . J 7 HOH B 2 102 19 HOH HOH . J 7 HOH B 3 103 27 HOH HOH . K 7 HOH C 1 401 20 HOH HOH . K 7 HOH C 2 402 17 HOH HOH . K 7 HOH C 3 403 4 HOH HOH . K 7 HOH C 4 404 16 HOH HOH . K 7 HOH C 5 405 32 HOH HOH . K 7 HOH C 6 406 29 HOH HOH . K 7 HOH C 7 407 6 HOH HOH . K 7 HOH C 8 408 8 HOH HOH . K 7 HOH C 9 409 18 HOH HOH . K 7 HOH C 10 410 10 HOH HOH . K 7 HOH C 11 411 13 HOH HOH . K 7 HOH C 12 412 15 HOH HOH . K 7 HOH C 13 413 38 HOH HOH . K 7 HOH C 14 414 23 HOH HOH . K 7 HOH C 15 415 36 HOH HOH . K 7 HOH C 16 416 3 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id H _atom_site.label_entity_id 6 _atom_site.Cartn_x 25.848 _atom_site.Cartn_y 20.914 _atom_site.Cartn_z 18.612 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 95.53 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 303 _atom_site.auth_asym_id C _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 0 _model_server_stats.parse_time_ms 15 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 279 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 1 #