data_7SJA
#
_model_server_result.job_id            '_RECy8hwt06s27dzIktVcQ' 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-26 18:02:49' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7sja 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"IA","auth_seq_id":501}' 
#
_entry.id    7SJA 
#
_exptl.entry_id    7SJA 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              523.18 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    12 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7SJA 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7SJA 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dodecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      12 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 M N N 
? 3 O N N 
? 3 Q N N 
? 3 S N N 
? 3 U N N 
? 3 W N N 
? 3 Y N N 
? 3 AA N N 
? 3 CA N N 
? 3 EA N N 
? 3 GA N N 
? 3 IA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OE2 GLU 77 A GLU 71 1_555 N MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.805 ? 
metalc ? metalc2 A OD2 ASP 104 A ASP 98 1_555 N MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? 
metalc ? metalc3 M O3G GTP . A GTP 501 1_555 N MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.684 ? 
metalc ? metalc4 M O3B GTP . A GTP 501 1_555 N MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.951 ? 
metalc ? metalc5 M O1B GTP . A GTP 501 1_555 N MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? 
metalc ? metalc6 M O2B GTP . A GTP 501 1_555 N MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.9 ? 
metalc ? metalc7 O O3G GTP . B GTP 501 1_555 P MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.862 ? 
metalc ? metalc8 O O3B GTP . B GTP 501 1_555 P MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
metalc ? metalc9 O O1B GTP . B GTP 501 1_555 P MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.013 ? 
metalc ? metalc10 O O2B GTP . B GTP 501 1_555 P MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.767 ? 
metalc ? metalc11 C OE2 GLU 77 C GLU 71 1_555 R MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.806 ? 
metalc ? metalc12 C OD2 ASP 104 C ASP 98 1_555 R MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? 
metalc ? metalc13 Q O3G GTP . C GTP 501 1_555 R MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.684 ? 
metalc ? metalc14 Q O3B GTP . C GTP 501 1_555 R MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.951 ? 
metalc ? metalc15 Q O1B GTP . C GTP 501 1_555 R MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? 
metalc ? metalc16 Q O2B GTP . C GTP 501 1_555 R MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.9 ? 
metalc ? metalc17 S O3G GTP . D GTP 501 1_555 T MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.862 ? 
metalc ? metalc18 S O3B GTP . D GTP 501 1_555 T MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
metalc ? metalc19 S O1B GTP . D GTP 501 1_555 T MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? 
metalc ? metalc20 S O2B GTP . D GTP 501 1_555 T MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.767 ? 
metalc ? metalc21 E OE2 GLU 77 E GLU 71 1_555 V MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.806 ? 
metalc ? metalc22 E OD2 ASP 104 E ASP 98 1_555 V MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.492 ? 
metalc ? metalc23 U O3G GTP . E GTP 501 1_555 V MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.683 ? 
metalc ? metalc24 U O3B GTP . E GTP 501 1_555 V MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.952 ? 
metalc ? metalc25 U O1B GTP . E GTP 501 1_555 V MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? 
metalc ? metalc26 U O2B GTP . E GTP 501 1_555 V MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.9 ? 
metalc ? metalc27 W O3G GTP . F GTP 501 1_555 X MG MG . F MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.863 ? 
metalc ? metalc28 W O3B GTP . F GTP 501 1_555 X MG MG . F MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
metalc ? metalc29 W O1B GTP . F GTP 501 1_555 X MG MG . F MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? 
metalc ? metalc30 W O2B GTP . F GTP 501 1_555 X MG MG . F MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? 
metalc ? metalc31 Y O3G GTP . G GTP 501 1_555 Z MG MG . G MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.862 ? 
metalc ? metalc32 Y O3B GTP . G GTP 501 1_555 Z MG MG . G MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
metalc ? metalc33 Y O1B GTP . G GTP 501 1_555 Z MG MG . G MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.013 ? 
metalc ? metalc34 Y O2B GTP . G GTP 501 1_555 Z MG MG . G MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? 
metalc ? metalc35 AA O3G GTP . H GTP 501 1_555 BA MG MG . H MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.862 ? 
metalc ? metalc36 AA O3B GTP . H GTP 501 1_555 BA MG MG . H MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
metalc ? metalc37 AA O1B GTP . H GTP 501 1_555 BA MG MG . H MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? 
metalc ? metalc38 AA O2B GTP . H GTP 501 1_555 BA MG MG . H MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.767 ? 
metalc ? metalc39 CA O3G GTP . I GTP 501 1_555 DA MG MG . I MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.862 ? 
metalc ? metalc40 CA O3B GTP . I GTP 501 1_555 DA MG MG . I MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
metalc ? metalc41 CA O1B GTP . I GTP 501 1_555 DA MG MG . I MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? 
metalc ? metalc42 CA O2B GTP . I GTP 501 1_555 DA MG MG . I MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? 
metalc ? metalc43 J OE2 GLU 77 J GLU 71 1_555 FA MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.807 ? 
metalc ? metalc44 J OD2 ASP 104 J ASP 98 1_555 FA MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.492 ? 
metalc ? metalc45 EA O3G GTP . J GTP 501 1_555 FA MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.683 ? 
metalc ? metalc46 EA O3B GTP . J GTP 501 1_555 FA MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.951 ? 
metalc ? metalc47 EA O1B GTP . J GTP 501 1_555 FA MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? 
metalc ? metalc48 EA O2B GTP . J GTP 501 1_555 FA MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.899 ? 
metalc ? metalc49 K OE2 GLU 77 K GLU 71 1_555 HA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.807 ? 
metalc ? metalc50 K OD2 ASP 104 K ASP 98 1_555 HA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.492 ? 
metalc ? metalc51 GA O3G GTP . K GTP 501 1_555 HA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.683 ? 
metalc ? metalc52 GA O3B GTP . K GTP 501 1_555 HA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.951 ? 
metalc ? metalc53 GA O1B GTP . K GTP 501 1_555 HA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? 
metalc ? metalc54 GA O2B GTP . K GTP 501 1_555 HA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.9 ? 
metalc ? metalc55 L OE2 GLU 77 L GLU 71 1_555 JA MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.805 ? 
metalc ? metalc56 L OD2 ASP 104 L ASP 98 1_555 JA MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? 
metalc ? metalc57 IA O3G GTP . L GTP 501 1_555 JA MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.684 ? 
metalc ? metalc58 IA O3B GTP . L GTP 501 1_555 JA MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.951 ? 
metalc ? metalc59 IA O1B GTP . L GTP 501 1_555 JA MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? 
metalc ? metalc60 IA O2B GTP . L GTP 501 1_555 JA MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.899 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H16 N5 O14 P3' 
_chem_comp.formula_weight    523.18 
_chem_comp.id                GTP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PG O1G GTP doub 129 n n 
PG O2G GTP sing 130 n n 
PG O3G GTP sing 131 n n 
PG O3B GTP sing 132 n n 
O2G HOG2 GTP sing 133 n n 
O3G HOG3 GTP sing 134 n n 
O3B PB GTP sing 135 n n 
PB O1B GTP doub 136 n n 
PB O2B GTP sing 137 n n 
PB O3A GTP sing 138 n n 
O2B HOB2 GTP sing 139 n n 
O3A PA GTP sing 140 n n 
PA O1A GTP doub 141 n n 
PA O2A GTP sing 142 n n 
PA O5' GTP sing 143 n n 
O2A HOA2 GTP sing 144 n n 
O5' C5' GTP sing 145 n n 
C5' C4' GTP sing 146 n n 
C5' H5' GTP sing 147 n n 
C5' "H5''" GTP sing 148 n n 
C4' O4' GTP sing 149 n n 
C4' C3' GTP sing 150 n n 
C4' H4' GTP sing 151 n n 
O4' C1' GTP sing 152 n n 
C3' O3' GTP sing 153 n n 
C3' C2' GTP sing 154 n n 
C3' H3' GTP sing 155 n n 
O3' HO3' GTP sing 156 n n 
C2' O2' GTP sing 157 n n 
C2' C1' GTP sing 158 n n 
C2' H2' GTP sing 159 n n 
O2' HO2' GTP sing 160 n n 
C1' N9 GTP sing 161 n n 
C1' H1' GTP sing 162 n n 
N9 C8 GTP sing 163 n y 
N9 C4 GTP sing 164 n y 
C8 N7 GTP doub 165 n y 
C8 H8 GTP sing 166 n n 
N7 C5 GTP sing 167 n y 
C5 C6 GTP sing 168 n n 
C5 C4 GTP doub 169 n y 
C6 O6 GTP doub 170 n n 
C6 N1 GTP sing 171 n n 
N1 C2 GTP sing 172 n n 
N1 HN1 GTP sing 173 n n 
C2 N2 GTP sing 174 n n 
C2 N3 GTP doub 175 n n 
N2 HN21 GTP sing 176 n n 
N2 HN22 GTP sing 177 n n 
N3 C4 GTP sing 178 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7SJA 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
M 3 GTP A 1 501 501 GTP GTP . 
N 4 MG A 1 502 502 MG MG . 
O 3 GTP B 1 501 491 GTP GTP . 
P 4 MG B 1 502 492 MG MG . 
Q 3 GTP C 1 501 501 GTP GTP . 
R 4 MG C 1 502 502 MG MG . 
S 3 GTP D 1 501 491 GTP GTP . 
T 4 MG D 1 502 492 MG MG . 
U 3 GTP E 1 501 501 GTP GTP . 
V 4 MG E 1 502 502 MG MG . 
W 3 GTP F 1 501 491 GTP GTP . 
X 4 MG F 1 502 492 MG MG . 
Y 3 GTP G 1 501 491 GTP GTP . 
Z 4 MG G 1 502 492 MG MG . 
AA 3 GTP H 1 501 491 GTP GTP . 
BA 4 MG H 1 502 492 MG MG . 
CA 3 GTP I 1 501 491 GTP GTP . 
DA 4 MG I 1 502 492 MG MG . 
EA 3 GTP J 1 501 501 GTP GTP . 
FA 4 MG J 1 502 502 MG MG . 
GA 3 GTP K 1 501 501 GTP GTP . 
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