data_7STL # _model_server_result.job_id adIwRpR1qsxiewfTXnKm5Q _model_server_result.datetime_utc '2025-07-04 20:34:25' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7stl # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":1203}' # _entry.id 7STL # _exptl.entry_id 7STL _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 748.065 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7STL _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7STL _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 H N N ? 2 I N N ? 2 J N N # _chem_comp.formula 'C41 H82 N O8 P' _chem_comp.formula_weight 748.065 _chem_comp.id 3PE _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE;1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOETHANOLAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag P O11 3PE sing 1 n n P O12 3PE sing 2 n n P O13 3PE sing 3 n n P O14 3PE doub 4 n n N C12 3PE sing 5 n n N HN1 3PE sing 6 n n N HN2 3PE sing 7 n n O11 C1 3PE sing 8 n n O13 C11 3PE sing 9 n n C11 C12 3PE sing 10 n n C11 H111 3PE sing 11 n n C11 H112 3PE sing 12 n n C12 H121 3PE sing 13 n n C12 H122 3PE sing 14 n n C1 C2 3PE sing 15 n n C1 H11 3PE sing 16 n n C1 H12 3PE sing 17 n n C2 C3 3PE sing 18 n n C2 O21 3PE sing 19 n n C2 H2 3PE sing 20 n n C3 O31 3PE sing 21 n n C3 H31 3PE sing 22 n n C3 H32 3PE sing 23 n n O31 C31 3PE sing 24 n n O32 C31 3PE doub 25 n n C31 C32 3PE sing 26 n n C32 C33 3PE sing 27 n n C32 H321 3PE sing 28 n n C32 H322 3PE sing 29 n n C33 C34 3PE sing 30 n n C33 H331 3PE sing 31 n n C33 H332 3PE sing 32 n n C34 C35 3PE sing 33 n n C34 H341 3PE sing 34 n n C34 H342 3PE sing 35 n n C35 C36 3PE sing 36 n n C35 H351 3PE sing 37 n n C35 H352 3PE sing 38 n n C36 C37 3PE sing 39 n n C36 H361 3PE sing 40 n n C36 H362 3PE sing 41 n n C37 C38 3PE sing 42 n n C37 H371 3PE sing 43 n n C37 H372 3PE sing 44 n n C38 C39 3PE sing 45 n n C38 H381 3PE sing 46 n n C38 H382 3PE sing 47 n n C39 C3A 3PE sing 48 n n C39 H391 3PE sing 49 n n C39 H392 3PE sing 50 n n C3A C3B 3PE sing 51 n n C3A H3A1 3PE sing 52 n n C3A H3A2 3PE sing 53 n n C3B C3C 3PE sing 54 n n C3B H3B1 3PE sing 55 n n C3B H3B2 3PE sing 56 n n C3C C3D 3PE sing 57 n n C3C H3C1 3PE sing 58 n n C3C H3C2 3PE sing 59 n n C3D C3E 3PE sing 60 n n C3D H3D1 3PE sing 61 n n C3D H3D2 3PE sing 62 n n C3E C3F 3PE sing 63 n n C3E H3E1 3PE sing 64 n n C3E H3E2 3PE sing 65 n n C3F C3G 3PE sing 66 n n C3F H3F1 3PE sing 67 n n C3F H3F2 3PE sing 68 n n C3G C3H 3PE sing 69 n n C3G H3G1 3PE sing 70 n n C3G H3G2 3PE sing 71 n n C3H C3I 3PE sing 72 n n C3H H3H1 3PE sing 73 n n C3H H3H2 3PE sing 74 n n C3I H3I1 3PE sing 75 n n C3I H3I2 3PE sing 76 n n C3I H3I3 3PE sing 77 n n O21 C21 3PE sing 78 n n O22 C21 3PE doub 79 n n C21 C22 3PE sing 80 n n C22 C23 3PE sing 81 n n C22 H221 3PE sing 82 n n C22 H222 3PE sing 83 n n C23 C24 3PE sing 84 n n C23 H231 3PE sing 85 n n C23 H232 3PE sing 86 n n C24 C25 3PE sing 87 n n C24 H241 3PE sing 88 n n C24 H242 3PE sing 89 n n C25 C26 3PE sing 90 n n C25 H251 3PE sing 91 n n C25 H252 3PE sing 92 n n C26 C27 3PE sing 93 n n C26 H261 3PE sing 94 n n C26 H262 3PE sing 95 n n C27 C28 3PE sing 96 n n C27 H271 3PE sing 97 n n C27 H272 3PE sing 98 n n C28 C29 3PE sing 99 n n C28 H281 3PE sing 100 n n C28 H282 3PE sing 101 n n C29 C2A 3PE sing 102 n n C29 H291 3PE sing 103 n n C29 H292 3PE sing 104 n n C2A C2B 3PE sing 105 n n C2A H2A1 3PE sing 106 n n C2A H2A2 3PE sing 107 n n C2B C2C 3PE sing 108 n n C2B H2B1 3PE sing 109 n n C2B H2B2 3PE sing 110 n n C2C C2D 3PE sing 111 n n C2C H2C1 3PE sing 112 n n C2C H2C2 3PE sing 113 n n C2D C2E 3PE sing 114 n n C2D H2D1 3PE sing 115 n n C2D H2D2 3PE sing 116 n n C2E C2F 3PE sing 117 n n C2E H2E1 3PE sing 118 n n C2E H2E2 3PE sing 119 n n C2F C2G 3PE sing 120 n n C2F H2F1 3PE sing 121 n n C2F H2F2 3PE sing 122 n n C2G C2H 3PE sing 123 n n C2G H2G1 3PE sing 124 n n C2G H2G2 3PE sing 125 n n C2H C2I 3PE sing 126 n n C2H H2H1 3PE sing 127 n n C2H H2H2 3PE sing 128 n n C2I H2I1 3PE sing 129 n n C2I H2I2 3PE sing 130 n n C2I H2I3 3PE sing 131 n n O12 H1 3PE sing 132 n n # _atom_sites.entry_id 7STL _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 3PE A 1 1201 1201 3PE PEH . D 2 3PE A 1 1202 1301 3PE PEH . E 2 3PE A 1 1203 1401 3PE PEH . F 2 3PE A 1 1204 1501 3PE PEH . G 2 3PE B 1 1201 1201 3PE PEH . H 2 3PE B 1 1202 1301 3PE PEH . I 2 3PE B 1 1203 1401 3PE PEH . J 2 3PE B 1 1204 1501 3PE PEH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P P 3PE . . . E 2 112.22 114.24 135.518 1 20 ? P 3PE 1203 A 1 HETATM 2 N N 3PE . . . E 2 114.725 117.008 138.883 1 20 ? N 3PE 1203 A 1 HETATM 3 O O11 3PE . . . E 2 113.547 113.542 134.834 1 20 ? O11 3PE 1203 A 1 HETATM 4 O O12 3PE . . . E 2 111.696 113.359 136.625 1 20 ? O12 3PE 1203 A 1 HETATM 5 O O13 3PE . . . E 2 112.67 115.689 136.158 1 20 ? O13 3PE 1203 A 1 HETATM 6 O O14 3PE . . . E 2 111.136 114.463 134.492 1 20 ? O14 3PE 1203 A 1 HETATM 7 C C11 3PE . . . E 2 113.506 115.647 137.277 1 20 ? C11 3PE 1203 A 1 HETATM 8 C C12 3PE . . . E 2 113.744 117.06 137.814 1 20 ? C12 3PE 1203 A 1 HETATM 9 C C1 3PE . . . E 2 113.603 113.296 133.457 1 20 ? C1 3PE 1203 A 1 HETATM 10 C C2 3PE . . . E 2 113.727 114.591 132.655 1 20 ? C2 3PE 1203 A 1 HETATM 11 C C3 3PE . . . E 2 115.087 115.258 132.872 1 20 ? C3 3PE 1203 A 1 HETATM 12 O O31 3PE . . . E 2 115.865 115.226 131.699 1 20 ? O31 3PE 1203 A 1 HETATM 13 O O32 3PE . . . E 2 116.468 113.142 132.232 1 20 ? O32 3PE 1203 A 1 HETATM 14 C C31 3PE . . . E 2 116.602 114.052 131.494 1 20 ? C31 3PE 1203 A 1 HETATM 15 C C32 3PE . . . E 2 117.589 113.917 130.333 1 20 ? C32 3PE 1203 A 1 HETATM 16 C C33 3PE . . . E 2 116.965 114.408 129.029 1 20 ? C33 3PE 1203 A 1 HETATM 17 C C34 3PE . . . E 2 117.987 114.32 127.895 1 20 ? C34 3PE 1203 A 1 HETATM 18 C C35 3PE . . . E 2 117.708 115.447 126.911 1 20 ? C35 3PE 1203 A 1 HETATM 19 C C36 3PE . . . E 2 118.606 115.391 125.677 1 20 ? C36 3PE 1203 A 1 HETATM 20 C C37 3PE . . . E 2 118.63 116.781 125.035 1 20 ? C37 3PE 1203 A 1 HETATM 21 C C38 3PE . . . E 2 119.307 116.752 123.669 1 20 ? C38 3PE 1203 A 1 HETATM 22 C C39 3PE . . . E 2 118.886 117.98 122.861 1 20 ? C39 3PE 1203 A 1 HETATM 23 C C3A 3PE . . . E 2 119.499 117.925 121.462 1 20 ? C3A 3PE 1203 A 1 HETATM 24 C C3B 3PE . . . E 2 118.935 116.742 120.678 1 20 ? C3B 3PE 1203 A 1 HETATM 25 O O21 3PE . . . E 2 113.582 114.296 131.298 1 20 ? O21 3PE 1203 A 1 HETATM 26 O O22 3PE . . . E 2 113.413 116.472 130.812 1 20 ? O22 3PE 1203 A 1 HETATM 27 C C21 3PE . . . E 2 113.091 115.365 130.544 1 20 ? C21 3PE 1203 A 1 HETATM 28 C C22 3PE . . . E 2 112.138 115.112 129.38 1 20 ? C22 3PE 1203 A 1 HETATM 29 C C23 3PE . . . E 2 112.627 115.882 128.157 1 20 ? C23 3PE 1203 A 1 HETATM 30 C C24 3PE . . . E 2 111.447 116.353 127.308 1 20 ? C24 3PE 1203 A 1 HETATM 31 C C25 3PE . . . E 2 110.896 115.249 126.408 1 20 ? C25 3PE 1203 A 1 HETATM 32 C C26 3PE . . . E 2 109.672 115.825 125.696 1 20 ? C26 3PE 1203 A 1 HETATM 33 C C27 3PE . . . E 2 109.453 115.173 124.329 1 20 ? C27 3PE 1203 A 1 HETATM 34 C C28 3PE . . . E 2 108.483 115.971 123.44 1 20 ? C28 3PE 1203 A 1 HETATM 35 C C29 3PE . . . E 2 108.815 117.459 123.253 1 20 ? C29 3PE 1203 A 1 HETATM 36 C C2A 3PE . . . E 2 110.173 117.672 122.581 1 20 ? C2A 3PE 1203 A 1 HETATM 37 C C2B 3PE . . . E 2 110.822 118.966 123.075 1 20 ? C2B 3PE 1203 A 1 HETATM 38 C C2C 3PE . . . E 2 112.162 119.135 122.355 1 20 ? C2C 3PE 1203 A 1 HETATM 39 C C2D 3PE . . . E 2 113.19 119.864 123.223 1 20 ? C2D 3PE 1203 A 1 HETATM 40 C C2E 3PE . . . E 2 113.068 121.379 123.082 1 20 ? C2E 3PE 1203 A 1 HETATM 41 C C2F 3PE . . . E 2 114.138 122.037 123.952 1 20 ? C2F 3PE 1203 A 1 HETATM 42 C C2G 3PE . . . E 2 114.079 123.555 123.791 1 20 ? C2G 3PE 1203 A 1 HETATM 43 H HN1 3PE . . . E 2 115.46 116.373 138.632 1 20 ? HN1 3PE 1203 A 1 HETATM 44 H HN2 3PE . . . E 2 115.111 117.924 138.999 1 20 ? HN2 3PE 1203 A 1 HETATM 45 H H111 3PE . . . E 2 114.456 115.216 136.979 1 20 ? H111 3PE 1203 A 1 HETATM 46 H H112 3PE . . . E 2 113.06 115.02 138.042 1 20 ? H112 3PE 1203 A 1 HETATM 47 H H121 3PE . . . E 2 114.116 117.696 137.019 1 20 ? H121 3PE 1203 A 1 HETATM 48 H H122 3PE . . . E 2 112.819 117.48 138.199 1 20 ? H122 3PE 1203 A 1 HETATM 49 H H11 3PE . . . E 2 112.709 112.766 133.144 1 20 ? H11 3PE 1203 A 1 HETATM 50 H H12 3PE . . . E 2 114.466 112.672 133.263 1 20 ? H12 3PE 1203 A 1 HETATM 51 H H2 3PE . . . E 2 112.944 115.278 132.955 1 20 ? H2 3PE 1203 A 1 HETATM 52 H H31 3PE . . . E 2 115.614 114.753 133.675 1 20 ? H31 3PE 1203 A 1 HETATM 53 H H32 3PE . . . E 2 114.932 116.293 133.158 1 20 ? H32 3PE 1203 A 1 HETATM 54 H H321 3PE . . . E 2 117.872 112.876 130.227 1 20 ? H321 3PE 1203 A 1 HETATM 55 H H322 3PE . . . E 2 118.474 114.508 130.546 1 20 ? H322 3PE 1203 A 1 HETATM 56 H H331 3PE . . . E 2 116.636 115.436 129.142 1 20 ? H331 3PE 1203 A 1 HETATM 57 H H332 3PE . . . E 2 116.109 113.789 128.784 1 20 ? H332 3PE 1203 A 1 HETATM 58 H H341 3PE . . . E 2 117.901 113.36 127.397 1 20 ? H341 3PE 1203 A 1 HETATM 59 H H342 3PE . . . E 2 118.988 114.445 128.292 1 20 ? H342 3PE 1203 A 1 HETATM 60 H H351 3PE . . . E 2 117.846 116.398 127.412 1 20 ? H351 3PE 1203 A 1 HETATM 61 H H352 3PE . . . E 2 116.68 115.357 126.586 1 20 ? H352 3PE 1203 A 1 HETATM 62 H H361 3PE . . . E 2 118.205 114.667 124.975 1 20 ? H361 3PE 1203 A 1 HETATM 63 H H362 3PE . . . E 2 119.612 115.103 125.964 1 20 ? H362 3PE 1203 A 1 HETATM 64 H H371 3PE . . . E 2 119.154 117.476 125.68 1 20 ? H371 3PE 1203 A 1 HETATM 65 H H372 3PE . . . E 2 117.615 117.132 124.895 1 20 ? H372 3PE 1203 A 1 HETATM 66 H H381 3PE . . . E 2 118.995 115.86 123.142 1 20 ? H381 3PE 1203 A 1 HETATM 67 H H382 3PE . . . E 2 120.386 116.743 123.788 1 20 ? H382 3PE 1203 A 1 HETATM 68 H H391 3PE . . . E 2 119.227 118.874 123.373 1 20 ? H391 3PE 1203 A 1 HETATM 69 H H392 3PE . . . E 2 117.805 118.001 122.774 1 20 ? H392 3PE 1203 A 1 HETATM 70 H H3A1 3PE . . . E 2 120.576 117.821 121.548 1 20 ? H3A1 3PE 1203 A 1 HETATM 71 H H3A2 3PE . . . E 2 119.269 118.845 120.934 1 20 ? H3A2 3PE 1203 A 1 HETATM 72 H H221 3PE . . . E 2 111.144 115.44 129.657 1 20 ? H221 3PE 1203 A 1 HETATM 73 H H222 3PE . . . E 2 112.126 114.052 129.152 1 20 ? H222 3PE 1203 A 1 HETATM 74 H H231 3PE . . . E 2 113.261 115.229 127.568 1 20 ? H231 3PE 1203 A 1 HETATM 75 H H232 3PE . . . E 2 113.201 116.745 128.477 1 20 ? H232 3PE 1203 A 1 HETATM 76 H H241 3PE . . . E 2 111.771 117.181 126.686 1 20 ? H241 3PE 1203 A 1 HETATM 77 H H242 3PE . . . E 2 110.657 116.7 127.966 1 20 ? H242 3PE 1203 A 1 HETATM 78 H H251 3PE . . . E 2 110.605 114.389 127.002 1 20 ? H251 3PE 1203 A 1 HETATM 79 H H252 3PE . . . E 2 111.65 114.96 125.683 1 20 ? H252 3PE 1203 A 1 HETATM 80 H H261 3PE . . . E 2 109.83 116.89 125.587 1 20 ? H261 3PE 1203 A 1 HETATM 81 H H262 3PE . . . E 2 108.795 115.654 126.311 1 20 ? H262 3PE 1203 A 1 HETATM 82 H H271 3PE . . . E 2 109.022 114.192 124.497 1 20 ? H271 3PE 1203 A 1 HETATM 83 H H272 3PE . . . E 2 110.404 115.054 123.824 1 20 ? H272 3PE 1203 A 1 HETATM 84 H H281 3PE . . . E 2 107.497 115.902 123.888 1 20 ? H281 3PE 1203 A 1 HETATM 85 H H282 3PE . . . E 2 108.454 115.502 122.462 1 20 ? H282 3PE 1203 A 1 HETATM 86 H H291 3PE . . . E 2 108.8 117.966 124.209 1 20 ? H291 3PE 1203 A 1 HETATM 87 H H292 3PE . . . E 2 108.052 117.905 122.624 1 20 ? H292 3PE 1203 A 1 HETATM 88 H H2A1 3PE . . . E 2 110.034 117.729 121.506 1 20 ? H2A1 3PE 1203 A 1 HETATM 89 H H2A2 3PE . . . E 2 110.835 116.846 122.807 1 20 ? H2A2 3PE 1203 A 1 HETATM 90 H H2B1 3PE . . . E 2 110.988 118.889 124.144 1 20 ? H2B1 3PE 1203 A 1 HETATM 91 H H2B2 3PE . . . E 2 110.179 119.814 122.865 1 20 ? H2B2 3PE 1203 A 1 HETATM 92 H H2C1 3PE . . . E 2 112.012 119.684 121.433 1 20 ? H2C1 3PE 1203 A 1 HETATM 93 H H2C2 3PE . . . E 2 112.542 118.15 122.113 1 20 ? H2C2 3PE 1203 A 1 HETATM 94 H H2D1 3PE . . . E 2 114.185 119.575 122.9 1 20 ? H2D1 3PE 1203 A 1 HETATM 95 H H2D2 3PE . . . E 2 113.059 119.585 124.263 1 20 ? H2D2 3PE 1203 A 1 HETATM 96 H H2E1 3PE . . . E 2 112.083 121.699 123.403 1 20 ? H2E1 3PE 1203 A 1 HETATM 97 H H2E2 3PE . . . E 2 113.223 121.661 122.046 1 20 ? H2E2 3PE 1203 A 1 HETATM 98 H H2F1 3PE . . . E 2 115.117 121.68 123.65 1 20 ? H2F1 3PE 1203 A 1 HETATM 99 H H2F2 3PE . . . E 2 113.967 121.777 124.992 1 20 ? H2F2 3PE 1203 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 113 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 16 _model_server_stats.query_time_ms 218 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 99 #