data_7STL # _model_server_result.job_id 22nyaQd1fzif0vMyUacdmg _model_server_result.datetime_utc '2025-07-03 19:01:54' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7stl # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"I","auth_seq_id":1203}' # _entry.id 7STL # _exptl.entry_id 7STL _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 748.065 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7STL _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7STL _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 H N N ? 2 I N N ? 2 J N N # _chem_comp.formula 'C41 H82 N O8 P' _chem_comp.formula_weight 748.065 _chem_comp.id 3PE _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE;1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOETHANOLAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag P O11 3PE sing 1 n n P O12 3PE sing 2 n n P O13 3PE sing 3 n n P O14 3PE doub 4 n n N C12 3PE sing 5 n n N HN1 3PE sing 6 n n N HN2 3PE sing 7 n n O11 C1 3PE sing 8 n n O13 C11 3PE sing 9 n n C11 C12 3PE sing 10 n n C11 H111 3PE sing 11 n n C11 H112 3PE sing 12 n n C12 H121 3PE sing 13 n n C12 H122 3PE sing 14 n n C1 C2 3PE sing 15 n n C1 H11 3PE sing 16 n n C1 H12 3PE sing 17 n n C2 C3 3PE sing 18 n n C2 O21 3PE sing 19 n n C2 H2 3PE sing 20 n n C3 O31 3PE sing 21 n n C3 H31 3PE sing 22 n n C3 H32 3PE sing 23 n n O31 C31 3PE sing 24 n n O32 C31 3PE doub 25 n n C31 C32 3PE sing 26 n n C32 C33 3PE sing 27 n n C32 H321 3PE sing 28 n n C32 H322 3PE sing 29 n n C33 C34 3PE sing 30 n n C33 H331 3PE sing 31 n n C33 H332 3PE sing 32 n n C34 C35 3PE sing 33 n n C34 H341 3PE sing 34 n n C34 H342 3PE sing 35 n n C35 C36 3PE sing 36 n n C35 H351 3PE sing 37 n n C35 H352 3PE sing 38 n n C36 C37 3PE sing 39 n n C36 H361 3PE sing 40 n n C36 H362 3PE sing 41 n n C37 C38 3PE sing 42 n n C37 H371 3PE sing 43 n n C37 H372 3PE sing 44 n n C38 C39 3PE sing 45 n n C38 H381 3PE sing 46 n n C38 H382 3PE sing 47 n n C39 C3A 3PE sing 48 n n C39 H391 3PE sing 49 n n C39 H392 3PE sing 50 n n C3A C3B 3PE sing 51 n n C3A H3A1 3PE sing 52 n n C3A H3A2 3PE sing 53 n n C3B C3C 3PE sing 54 n n C3B H3B1 3PE sing 55 n n C3B H3B2 3PE sing 56 n n C3C C3D 3PE sing 57 n n C3C H3C1 3PE sing 58 n n C3C H3C2 3PE sing 59 n n C3D C3E 3PE sing 60 n n C3D H3D1 3PE sing 61 n n C3D H3D2 3PE sing 62 n n C3E C3F 3PE sing 63 n n C3E H3E1 3PE sing 64 n n C3E H3E2 3PE sing 65 n n C3F C3G 3PE sing 66 n n C3F H3F1 3PE sing 67 n n C3F H3F2 3PE sing 68 n n C3G C3H 3PE sing 69 n n C3G H3G1 3PE sing 70 n n C3G H3G2 3PE sing 71 n n C3H C3I 3PE sing 72 n n C3H H3H1 3PE sing 73 n n C3H H3H2 3PE sing 74 n n C3I H3I1 3PE sing 75 n n C3I H3I2 3PE sing 76 n n C3I H3I3 3PE sing 77 n n O21 C21 3PE sing 78 n n O22 C21 3PE doub 79 n n C21 C22 3PE sing 80 n n C22 C23 3PE sing 81 n n C22 H221 3PE sing 82 n n C22 H222 3PE sing 83 n n C23 C24 3PE sing 84 n n C23 H231 3PE sing 85 n n C23 H232 3PE sing 86 n n C24 C25 3PE sing 87 n n C24 H241 3PE sing 88 n n C24 H242 3PE sing 89 n n C25 C26 3PE sing 90 n n C25 H251 3PE sing 91 n n C25 H252 3PE sing 92 n n C26 C27 3PE sing 93 n n C26 H261 3PE sing 94 n n C26 H262 3PE sing 95 n n C27 C28 3PE sing 96 n n C27 H271 3PE sing 97 n n C27 H272 3PE sing 98 n n C28 C29 3PE sing 99 n n C28 H281 3PE sing 100 n n C28 H282 3PE sing 101 n n C29 C2A 3PE sing 102 n n C29 H291 3PE sing 103 n n C29 H292 3PE sing 104 n n C2A C2B 3PE sing 105 n n C2A H2A1 3PE sing 106 n n C2A H2A2 3PE sing 107 n n C2B C2C 3PE sing 108 n n C2B H2B1 3PE sing 109 n n C2B H2B2 3PE sing 110 n n C2C C2D 3PE sing 111 n n C2C H2C1 3PE sing 112 n n C2C H2C2 3PE sing 113 n n C2D C2E 3PE sing 114 n n C2D H2D1 3PE sing 115 n n C2D H2D2 3PE sing 116 n n C2E C2F 3PE sing 117 n n C2E H2E1 3PE sing 118 n n C2E H2E2 3PE sing 119 n n C2F C2G 3PE sing 120 n n C2F H2F1 3PE sing 121 n n C2F H2F2 3PE sing 122 n n C2G C2H 3PE sing 123 n n C2G H2G1 3PE sing 124 n n C2G H2G2 3PE sing 125 n n C2H C2I 3PE sing 126 n n C2H H2H1 3PE sing 127 n n C2H H2H2 3PE sing 128 n n C2I H2I1 3PE sing 129 n n C2I H2I2 3PE sing 130 n n C2I H2I3 3PE sing 131 n n O12 H1 3PE sing 132 n n # _atom_sites.entry_id 7STL _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 3PE A 1 1201 1201 3PE PEH . D 2 3PE A 1 1202 1301 3PE PEH . E 2 3PE A 1 1203 1401 3PE PEH . F 2 3PE A 1 1204 1501 3PE PEH . G 2 3PE B 1 1201 1201 3PE PEH . H 2 3PE B 1 1202 1301 3PE PEH . I 2 3PE B 1 1203 1401 3PE PEH . J 2 3PE B 1 1204 1501 3PE PEH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P P 3PE . . . I 2 121.066 119.021 135.523 1 20 ? P 3PE 1203 B 1 HETATM 2 N N 3PE . . . I 2 118.561 116.252 138.887 1 20 ? N 3PE 1203 B 1 HETATM 3 O O11 3PE . . . I 2 119.739 119.719 134.839 1 20 ? O11 3PE 1203 B 1 HETATM 4 O O12 3PE . . . I 2 121.59 119.901 136.63 1 20 ? O12 3PE 1203 B 1 HETATM 5 O O13 3PE . . . I 2 120.616 117.572 136.162 1 20 ? O13 3PE 1203 B 1 HETATM 6 O O14 3PE . . . I 2 122.15 118.798 134.497 1 20 ? O14 3PE 1203 B 1 HETATM 7 C C11 3PE . . . I 2 119.78 117.613 137.282 1 20 ? C11 3PE 1203 B 1 HETATM 8 C C12 3PE . . . I 2 119.542 116.2 137.818 1 20 ? C12 3PE 1203 B 1 HETATM 9 C C1 3PE . . . I 2 119.683 119.966 133.462 1 20 ? C1 3PE 1203 B 1 HETATM 10 C C2 3PE . . . I 2 119.558 118.671 132.66 1 20 ? C2 3PE 1203 B 1 HETATM 11 C C3 3PE . . . I 2 118.198 118.004 132.877 1 20 ? C3 3PE 1203 B 1 HETATM 12 O O31 3PE . . . I 2 117.42 118.036 131.704 1 20 ? O31 3PE 1203 B 1 HETATM 13 O O32 3PE . . . I 2 116.817 120.12 132.238 1 20 ? O32 3PE 1203 B 1 HETATM 14 C C31 3PE . . . I 2 116.683 119.211 131.499 1 20 ? C31 3PE 1203 B 1 HETATM 15 C C32 3PE . . . I 2 115.696 119.346 130.339 1 20 ? C32 3PE 1203 B 1 HETATM 16 C C33 3PE . . . I 2 116.32 118.855 129.034 1 20 ? C33 3PE 1203 B 1 HETATM 17 C C34 3PE . . . I 2 115.298 118.944 127.901 1 20 ? C34 3PE 1203 B 1 HETATM 18 C C35 3PE . . . I 2 115.576 117.817 126.916 1 20 ? C35 3PE 1203 B 1 HETATM 19 C C36 3PE . . . I 2 114.678 117.874 125.682 1 20 ? C36 3PE 1203 B 1 HETATM 20 C C37 3PE . . . I 2 114.654 116.484 125.04 1 20 ? C37 3PE 1203 B 1 HETATM 21 C C38 3PE . . . I 2 113.977 116.513 123.674 1 20 ? C38 3PE 1203 B 1 HETATM 22 C C39 3PE . . . I 2 114.397 115.285 122.866 1 20 ? C39 3PE 1203 B 1 HETATM 23 C C3A 3PE . . . I 2 113.784 115.341 121.467 1 20 ? C3A 3PE 1203 B 1 HETATM 24 C C3B 3PE . . . I 2 114.348 116.524 120.683 1 20 ? C3B 3PE 1203 B 1 HETATM 25 O O21 3PE . . . I 2 119.703 118.966 131.303 1 20 ? O21 3PE 1203 B 1 HETATM 26 O O22 3PE . . . I 2 119.872 116.79 130.816 1 20 ? O22 3PE 1203 B 1 HETATM 27 C C21 3PE . . . I 2 120.194 117.897 130.549 1 20 ? C21 3PE 1203 B 1 HETATM 28 C C22 3PE . . . I 2 121.147 118.15 129.385 1 20 ? C22 3PE 1203 B 1 HETATM 29 C C23 3PE . . . I 2 120.657 117.381 128.161 1 20 ? C23 3PE 1203 B 1 HETATM 30 C C24 3PE . . . I 2 121.837 116.91 127.312 1 20 ? C24 3PE 1203 B 1 HETATM 31 C C25 3PE . . . I 2 122.388 118.014 126.412 1 20 ? C25 3PE 1203 B 1 HETATM 32 C C26 3PE . . . I 2 123.612 117.438 125.7 1 20 ? C26 3PE 1203 B 1 HETATM 33 C C27 3PE . . . I 2 123.831 118.09 124.333 1 20 ? C27 3PE 1203 B 1 HETATM 34 C C28 3PE . . . I 2 124.801 117.293 123.444 1 20 ? C28 3PE 1203 B 1 HETATM 35 C C29 3PE . . . I 2 124.469 115.805 123.256 1 20 ? C29 3PE 1203 B 1 HETATM 36 C C2A 3PE . . . I 2 123.11 115.592 122.585 1 20 ? C2A 3PE 1203 B 1 HETATM 37 C C2B 3PE . . . I 2 122.461 114.298 123.078 1 20 ? C2B 3PE 1203 B 1 HETATM 38 C C2C 3PE . . . I 2 121.121 114.129 122.358 1 20 ? C2C 3PE 1203 B 1 HETATM 39 C C2D 3PE . . . I 2 120.093 113.4 123.226 1 20 ? C2D 3PE 1203 B 1 HETATM 40 C C2E 3PE . . . I 2 120.215 111.885 123.085 1 20 ? C2E 3PE 1203 B 1 HETATM 41 C C2F 3PE . . . I 2 119.145 111.227 123.955 1 20 ? C2F 3PE 1203 B 1 HETATM 42 C C2G 3PE . . . I 2 119.204 109.709 123.793 1 20 ? C2G 3PE 1203 B 1 HETATM 43 H HN1 3PE . . . I 2 117.826 116.887 138.637 1 20 ? HN1 3PE 1203 B 1 HETATM 44 H HN2 3PE . . . I 2 118.175 115.336 139.003 1 20 ? HN2 3PE 1203 B 1 HETATM 45 H H111 3PE . . . I 2 118.83 118.045 136.984 1 20 ? H111 3PE 1203 B 1 HETATM 46 H H112 3PE . . . I 2 120.226 118.24 138.047 1 20 ? H112 3PE 1203 B 1 HETATM 47 H H121 3PE . . . I 2 119.169 115.565 137.023 1 20 ? H121 3PE 1203 B 1 HETATM 48 H H122 3PE . . . I 2 120.467 115.78 138.203 1 20 ? H122 3PE 1203 B 1 HETATM 49 H H11 3PE . . . I 2 120.577 120.496 133.149 1 20 ? H11 3PE 1203 B 1 HETATM 50 H H12 3PE . . . I 2 118.82 120.59 133.268 1 20 ? H12 3PE 1203 B 1 HETATM 51 H H2 3PE . . . I 2 120.341 117.984 132.96 1 20 ? H2 3PE 1203 B 1 HETATM 52 H H31 3PE . . . I 2 117.671 118.509 133.68 1 20 ? H31 3PE 1203 B 1 HETATM 53 H H32 3PE . . . I 2 118.353 116.969 133.163 1 20 ? H32 3PE 1203 B 1 HETATM 54 H H321 3PE . . . I 2 115.413 120.387 130.233 1 20 ? H321 3PE 1203 B 1 HETATM 55 H H322 3PE . . . I 2 114.811 118.755 130.552 1 20 ? H322 3PE 1203 B 1 HETATM 56 H H331 3PE . . . I 2 116.649 117.827 129.147 1 20 ? H331 3PE 1203 B 1 HETATM 57 H H332 3PE . . . I 2 117.176 119.474 128.789 1 20 ? H332 3PE 1203 B 1 HETATM 58 H H341 3PE . . . I 2 115.384 119.904 127.403 1 20 ? H341 3PE 1203 B 1 HETATM 59 H H342 3PE . . . I 2 114.297 118.819 128.298 1 20 ? H342 3PE 1203 B 1 HETATM 60 H H351 3PE . . . I 2 115.438 116.866 127.417 1 20 ? H351 3PE 1203 B 1 HETATM 61 H H352 3PE . . . I 2 116.604 117.907 126.591 1 20 ? H352 3PE 1203 B 1 HETATM 62 H H361 3PE . . . I 2 115.079 118.598 124.98 1 20 ? H361 3PE 1203 B 1 HETATM 63 H H362 3PE . . . I 2 113.672 118.162 125.97 1 20 ? H362 3PE 1203 B 1 HETATM 64 H H371 3PE . . . I 2 114.13 115.789 125.685 1 20 ? H371 3PE 1203 B 1 HETATM 65 H H372 3PE . . . I 2 115.669 116.133 124.9 1 20 ? H372 3PE 1203 B 1 HETATM 66 H H381 3PE . . . I 2 114.289 117.405 123.147 1 20 ? H381 3PE 1203 B 1 HETATM 67 H H382 3PE . . . I 2 112.898 116.522 123.793 1 20 ? H382 3PE 1203 B 1 HETATM 68 H H391 3PE . . . I 2 114.056 114.391 123.377 1 20 ? H391 3PE 1203 B 1 HETATM 69 H H392 3PE . . . I 2 115.478 115.264 122.778 1 20 ? H392 3PE 1203 B 1 HETATM 70 H H3A1 3PE . . . I 2 112.707 115.445 121.553 1 20 ? H3A1 3PE 1203 B 1 HETATM 71 H H3A2 3PE . . . I 2 114.014 114.421 120.938 1 20 ? H3A2 3PE 1203 B 1 HETATM 72 H H221 3PE . . . I 2 122.141 117.822 129.661 1 20 ? H221 3PE 1203 B 1 HETATM 73 H H222 3PE . . . I 2 121.159 119.211 129.157 1 20 ? H222 3PE 1203 B 1 HETATM 74 H H231 3PE . . . I 2 120.023 118.034 127.573 1 20 ? H231 3PE 1203 B 1 HETATM 75 H H232 3PE . . . I 2 120.083 116.518 128.481 1 20 ? H232 3PE 1203 B 1 HETATM 76 H H241 3PE . . . I 2 121.513 116.082 126.69 1 20 ? H241 3PE 1203 B 1 HETATM 77 H H242 3PE . . . I 2 122.627 116.563 127.97 1 20 ? H242 3PE 1203 B 1 HETATM 78 H H251 3PE . . . I 2 122.68 118.874 127.006 1 20 ? H251 3PE 1203 B 1 HETATM 79 H H252 3PE . . . I 2 121.634 118.303 125.687 1 20 ? H252 3PE 1203 B 1 HETATM 80 H H261 3PE . . . I 2 123.454 116.373 125.591 1 20 ? H261 3PE 1203 B 1 HETATM 81 H H262 3PE . . . I 2 124.489 117.609 126.315 1 20 ? H262 3PE 1203 B 1 HETATM 82 H H271 3PE . . . I 2 124.262 119.071 124.501 1 20 ? H271 3PE 1203 B 1 HETATM 83 H H272 3PE . . . I 2 122.88 118.21 123.828 1 20 ? H272 3PE 1203 B 1 HETATM 84 H H281 3PE . . . I 2 125.787 117.361 123.892 1 20 ? H281 3PE 1203 B 1 HETATM 85 H H282 3PE . . . I 2 124.83 117.762 122.466 1 20 ? H282 3PE 1203 B 1 HETATM 86 H H291 3PE . . . I 2 124.484 115.297 124.212 1 20 ? H291 3PE 1203 B 1 HETATM 87 H H292 3PE . . . I 2 125.231 115.359 122.627 1 20 ? H292 3PE 1203 B 1 HETATM 88 H H2A1 3PE . . . I 2 123.249 115.535 121.509 1 20 ? H2A1 3PE 1203 B 1 HETATM 89 H H2A2 3PE . . . I 2 122.449 116.418 122.811 1 20 ? H2A2 3PE 1203 B 1 HETATM 90 H H2B1 3PE . . . I 2 122.295 114.375 124.147 1 20 ? H2B1 3PE 1203 B 1 HETATM 91 H H2B2 3PE . . . I 2 123.104 113.45 122.868 1 20 ? H2B2 3PE 1203 B 1 HETATM 92 H H2C1 3PE . . . I 2 121.271 113.581 121.436 1 20 ? H2C1 3PE 1203 B 1 HETATM 93 H H2C2 3PE . . . I 2 120.741 115.115 122.117 1 20 ? H2C2 3PE 1203 B 1 HETATM 94 H H2D1 3PE . . . I 2 119.098 113.69 122.904 1 20 ? H2D1 3PE 1203 B 1 HETATM 95 H H2D2 3PE . . . I 2 120.224 113.679 124.266 1 20 ? H2D2 3PE 1203 B 1 HETATM 96 H H2E1 3PE . . . I 2 121.2 111.565 123.406 1 20 ? H2E1 3PE 1203 B 1 HETATM 97 H H2E2 3PE . . . I 2 120.06 111.604 122.049 1 20 ? H2E2 3PE 1203 B 1 HETATM 98 H H2F1 3PE . . . I 2 118.166 111.585 123.653 1 20 ? H2F1 3PE 1203 B 1 HETATM 99 H H2F2 3PE . . . I 2 119.316 111.487 124.995 1 20 ? H2F2 3PE 1203 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 13 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 22 _model_server_stats.query_time_ms 319 _model_server_stats.encode_time_ms 10 _model_server_stats.element_count 99 #