data_7T2R
#
_model_server_result.job_id            TyfybWS3pwnhvrgGH_1eVg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-09 02:30:51' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7t2r 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"CA","auth_seq_id":501}' 
#
_entry.id    7T2R 
#
_exptl.entry_id    7T2R 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              175.82 
_entity.id                          6 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7T2R 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7T2R 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    decameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      10 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 6 K N N 
? 6 Q N N 
? 6 R N N 
? 6 V N N 
? 6 BA N N 
? 6 CA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 629 A CYS 629 1_555 A SG CYS 674 A CYS 674 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf2 C SG CYS 123 C CYS 123 1_555 C SG CYS 127 C CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.197 ? 
disulf ? disulf3 F SG CYS 629 F CYS 629 1_555 F SG CYS 674 F CYS 674 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf4 H SG CYS 123 H CYS 123 1_555 H SG CYS 127 H CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.197 ? 
metalc ? metalc1 A SG CYS 47 A CYS 47 1_555 K FE1 FES . A FES 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.616 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 50 A CYS 50 1_555 K FE2 FES . A FES 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 64 A CYS 64 1_555 K FE2 FES . A FES 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? 
metalc ? metalc4 A ND1 HIS 98 A HIS 98 1_555 O FE2 SF4 . A SF4 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.871 ? 
metalc ? metalc5 A SG CYS 100 A CYS 100 1_555 O FE4 SF4 . A SF4 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.978 ? 
metalc ? metalc6 A SG CYS 103 A CYS 103 1_555 O FE1 SF4 . A SF4 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? 
metalc ? metalc7 A SG CYS 109 A CYS 109 1_555 O FE3 SF4 . A SF4 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
metalc ? metalc8 A SG CYS 148 A CYS 148 1_555 L FE2 SF4 . A SF4 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.925 ? 
metalc ? metalc9 A SG CYS 154 A CYS 154 1_555 L FE3 SF4 . A SF4 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? 
metalc ? metalc10 A SG CYS 202 A CYS 202 1_555 L FE1 SF4 . A SF4 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? 
metalc ? metalc11 A SG CYS 236 A CYS 236 1_555 N FE4 SF4 . A SF4 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.926 ? 
metalc ? metalc12 B SG CYS 501 B CYS 501 1_555 P FE2 SF4 . B SF4 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.929 ? 
metalc ? metalc13 B SG CYS 531 B CYS 531 1_555 Q FE1 FES . B FES 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? 
metalc ? metalc14 C SG CYS 87 C CYS 87 1_555 R FE2 FES . C FES 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.148 ? 
metalc ? metalc15 C SG CYS 127 C CYS 127 1_555 R FE1 FES . C FES 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? 
metalc ? metalc16 D SG CYS 67 D CYS 67 1_555 T FE FCO . D FCO 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.56 ? 
metalc ? metalc17 D SG CYS 444 D CYS 444 1_555 S NI 3NI . D 3NI 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.641 ? 
metalc ? metalc18 D SG CYS 447 D CYS 447 1_555 S NI 3NI . D 3NI 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.915 ? 
metalc ? metalc19 D SG CYS 447 D CYS 447 1_555 T FE FCO . D FCO 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.657 ? 
metalc ? metalc20 E SG CYS 14 E CYS 14 1_555 U FE2 SF4 . E SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.949 ? 
metalc ? metalc21 E SG CYS 85 E CYS 85 1_555 U FE4 SF4 . E SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? 
metalc ? metalc22 F SG CYS 47 F CYS 47 1_555 V FE1 FES . F FES 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.616 ? 
metalc ? metalc23 F SG CYS 50 F CYS 50 1_555 V FE2 FES . F FES 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? 
metalc ? metalc24 F SG CYS 64 F CYS 64 1_555 V FE2 FES . F FES 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? 
metalc ? metalc25 F ND1 HIS 98 F HIS 98 1_555 Z FE2 SF4 . F SF4 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.871 ? 
metalc ? metalc26 F SG CYS 100 F CYS 100 1_555 Z FE4 SF4 . F SF4 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.978 ? 
metalc ? metalc27 F SG CYS 103 F CYS 103 1_555 Z FE1 SF4 . F SF4 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? 
metalc ? metalc28 F SG CYS 109 F CYS 109 1_555 Z FE3 SF4 . F SF4 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
metalc ? metalc29 F SG CYS 148 F CYS 148 1_555 W FE2 SF4 . F SF4 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.925 ? 
metalc ? metalc30 F SG CYS 154 F CYS 154 1_555 W FE3 SF4 . F SF4 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? 
metalc ? metalc31 F SG CYS 202 F CYS 202 1_555 W FE1 SF4 . F SF4 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? 
metalc ? metalc32 F SG CYS 236 F CYS 236 1_555 Y FE4 SF4 . F SF4 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.926 ? 
metalc ? metalc33 G SG CYS 501 G CYS 501 1_555 AA FE2 SF4 . G SF4 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.929 ? 
metalc ? metalc34 G SG CYS 531 G CYS 531 1_555 BA FE1 FES . G FES 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? 
metalc ? metalc35 H SG CYS 87 H CYS 87 1_555 CA FE2 FES . H FES 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.148 ? 
metalc ? metalc36 H SG CYS 127 H CYS 127 1_555 CA FE1 FES . H FES 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? 
metalc ? metalc37 I SG CYS 67 I CYS 67 1_555 EA FE FCO . I FCO 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.56 ? 
metalc ? metalc38 I SG CYS 444 I CYS 444 1_555 DA NI 3NI . I 3NI 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.641 ? 
metalc ? metalc39 I SG CYS 447 I CYS 447 1_555 DA NI 3NI . I 3NI 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.915 ? 
metalc ? metalc40 I SG CYS 447 I CYS 447 1_555 EA FE FCO . I FCO 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.657 ? 
metalc ? metalc41 J SG CYS 14 J CYS 14 1_555 FA FE2 SF4 . J SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.949 ? 
metalc ? metalc42 J SG CYS 85 J CYS 85 1_555 FA FE4 SF4 . J SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? 
#
_chem_comp.formula           'Fe2 S2' 
_chem_comp.formula_weight    175.82 
_chem_comp.id                FES 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
FE1 S1 FES sing 89 n n 
FE1 S2 FES sing 90 n n 
FE2 S1 FES sing 91 n n 
FE2 S2 FES sing 92 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7T2R 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
K 6 FES A 1 701 701 FES FES . 
L 7 SF4 A 1 702 801 SF4 SF4 . 
M 7 SF4 A 1 703 901 SF4 SF4 . 
N 7 SF4 A 1 704 1001 SF4 SF4 . 
O 7 SF4 A 1 705 1101 SF4 SF4 . 
P 7 SF4 B 1 601 601 SF4 SF4 . 
Q 6 FES B 1 602 602 FES FES . 
R 6 FES C 1 501 501 FES FES . 
S 8 3NI D 1 601 601 3NI 3NI . 
T 9 FCO D 1 602 701 FCO FCO . 
U 7 SF4 E 1 201 201 SF4 SF4 . 
V 6 FES F 1 701 701 FES FES . 
W 7 SF4 F 1 702 801 SF4 SF4 . 
X 7 SF4 F 1 703 901 SF4 SF4 . 
Y 7 SF4 F 1 704 1001 SF4 SF4 . 
Z 7 SF4 F 1 705 1101 SF4 SF4 . 
AA 7 SF4 G 1 601 601 SF4 SF4 . 
BA 6 FES G 1 602 602 FES FES . 
CA 6 FES H 1 501 501 FES FES . 
DA 8 3NI I 1 601 601 3NI 3NI . 
EA 9 FCO I 1 602 701 FCO FCO . 
FA 7 SF4 J 1 201 201 SF4 SF4 . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 FE FE1 FES . . . CA 6 161.527 140.181 101.501 1 92.77 ? FE1 FES 501 H 1 
HETATM 2 FE FE2 FES . . . CA 6 159.33 142.044 102.517 1 92.77 ? FE2 FES 501 H 1 
HETATM 3 S S1 FES . . . CA 6 159.35 140.373 101.051 1 92.77 ? S1 FES 501 H 1 
HETATM 4 S S2 FES . . . CA 6 161.473 142.32 102.034 1 92.77 ? S2 FES 501 H 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              16 
_model_server_stats.parse_time_ms           9 
_model_server_stats.create_model_time_ms    55 
_model_server_stats.query_time_ms           323 
_model_server_stats.encode_time_ms          5 
_model_server_stats.element_count           4 
#