data_7T2R # _model_server_result.job_id 4s75WWhx-lNj4QHIumit6g _model_server_result.datetime_utc '2024-11-09 02:45:58' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7t2r # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"P","auth_seq_id":601}' # _entry.id 7T2R # _exptl.entry_id 7T2R _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 351.64 _entity.id 7 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'IRON/SULFUR CLUSTER' _entity.pdbx_number_of_molecules 12 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7T2R _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7T2R _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details decameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 10 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 L N N ? 7 M N N ? 7 N N N ? 7 O N N ? 7 P N N ? 7 U N N ? 7 W N N ? 7 X N N ? 7 Y N N ? 7 Z N N ? 7 AA N N ? 7 FA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 629 A CYS 629 1_555 A SG CYS 674 A CYS 674 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf2 C SG CYS 123 C CYS 123 1_555 C SG CYS 127 C CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.197 ? disulf ? disulf3 F SG CYS 629 F CYS 629 1_555 F SG CYS 674 F CYS 674 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf4 H SG CYS 123 H CYS 123 1_555 H SG CYS 127 H CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.197 ? metalc ? metalc1 A SG CYS 47 A CYS 47 1_555 K FE1 FES . A FES 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.616 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 50 A CYS 50 1_555 K FE2 FES . A FES 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 64 A CYS 64 1_555 K FE2 FES . A FES 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? metalc ? metalc4 A ND1 HIS 98 A HIS 98 1_555 O FE2 SF4 . A SF4 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.871 ? metalc ? metalc5 A SG CYS 100 A CYS 100 1_555 O FE4 SF4 . A SF4 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.978 ? metalc ? metalc6 A SG CYS 103 A CYS 103 1_555 O FE1 SF4 . A SF4 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? metalc ? metalc7 A SG CYS 109 A CYS 109 1_555 O FE3 SF4 . A SF4 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? metalc ? metalc8 A SG CYS 148 A CYS 148 1_555 L FE2 SF4 . A SF4 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.925 ? metalc ? metalc9 A SG CYS 154 A CYS 154 1_555 L FE3 SF4 . A SF4 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? metalc ? metalc10 A SG CYS 202 A CYS 202 1_555 L FE1 SF4 . A SF4 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc11 A SG CYS 236 A CYS 236 1_555 N FE4 SF4 . A SF4 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.926 ? metalc ? metalc12 B SG CYS 501 B CYS 501 1_555 P FE2 SF4 . B SF4 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.929 ? metalc ? metalc13 B SG CYS 531 B CYS 531 1_555 Q FE1 FES . B FES 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? metalc ? metalc14 C SG CYS 87 C CYS 87 1_555 R FE2 FES . C FES 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.148 ? metalc ? metalc15 C SG CYS 127 C CYS 127 1_555 R FE1 FES . C FES 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? metalc ? metalc16 D SG CYS 67 D CYS 67 1_555 T FE FCO . D FCO 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.56 ? metalc ? metalc17 D SG CYS 444 D CYS 444 1_555 S NI 3NI . D 3NI 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.641 ? metalc ? metalc18 D SG CYS 447 D CYS 447 1_555 S NI 3NI . D 3NI 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.915 ? metalc ? metalc19 D SG CYS 447 D CYS 447 1_555 T FE FCO . D FCO 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.657 ? metalc ? metalc20 E SG CYS 14 E CYS 14 1_555 U FE2 SF4 . E SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.949 ? metalc ? metalc21 E SG CYS 85 E CYS 85 1_555 U FE4 SF4 . E SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? metalc ? metalc22 F SG CYS 47 F CYS 47 1_555 V FE1 FES . F FES 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.616 ? metalc ? metalc23 F SG CYS 50 F CYS 50 1_555 V FE2 FES . F FES 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? metalc ? metalc24 F SG CYS 64 F CYS 64 1_555 V FE2 FES . F FES 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? metalc ? metalc25 F ND1 HIS 98 F HIS 98 1_555 Z FE2 SF4 . F SF4 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.871 ? metalc ? metalc26 F SG CYS 100 F CYS 100 1_555 Z FE4 SF4 . F SF4 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.978 ? metalc ? metalc27 F SG CYS 103 F CYS 103 1_555 Z FE1 SF4 . F SF4 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? metalc ? metalc28 F SG CYS 109 F CYS 109 1_555 Z FE3 SF4 . F SF4 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? metalc ? metalc29 F SG CYS 148 F CYS 148 1_555 W FE2 SF4 . F SF4 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.925 ? metalc ? metalc30 F SG CYS 154 F CYS 154 1_555 W FE3 SF4 . F SF4 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? metalc ? metalc31 F SG CYS 202 F CYS 202 1_555 W FE1 SF4 . F SF4 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc32 F SG CYS 236 F CYS 236 1_555 Y FE4 SF4 . F SF4 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.926 ? metalc ? metalc33 G SG CYS 501 G CYS 501 1_555 AA FE2 SF4 . G SF4 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.929 ? metalc ? metalc34 G SG CYS 531 G CYS 531 1_555 BA FE1 FES . G FES 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? metalc ? metalc35 H SG CYS 87 H CYS 87 1_555 CA FE2 FES . H FES 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.148 ? metalc ? metalc36 H SG CYS 127 H CYS 127 1_555 CA FE1 FES . H FES 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? metalc ? metalc37 I SG CYS 67 I CYS 67 1_555 EA FE FCO . I FCO 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.56 ? metalc ? metalc38 I SG CYS 444 I CYS 444 1_555 DA NI 3NI . I 3NI 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.641 ? metalc ? metalc39 I SG CYS 447 I CYS 447 1_555 DA NI 3NI . I 3NI 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.915 ? metalc ? metalc40 I SG CYS 447 I CYS 447 1_555 EA FE FCO . I FCO 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.657 ? metalc ? metalc41 J SG CYS 14 J CYS 14 1_555 FA FE2 SF4 . J SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.949 ? metalc ? metalc42 J SG CYS 85 J CYS 85 1_555 FA FE4 SF4 . J SF4 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? # _chem_comp.formula 'Fe4 S4' _chem_comp.formula_weight 351.64 _chem_comp.id SF4 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'IRON/SULFUR CLUSTER' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag FE1 S2 SF4 sing 298 n n FE1 S3 SF4 sing 299 n n FE1 S4 SF4 sing 300 n n FE2 S1 SF4 sing 301 n n FE2 S3 SF4 sing 302 n n FE2 S4 SF4 sing 303 n n FE3 S1 SF4 sing 304 n n FE3 S2 SF4 sing 305 n n FE3 S4 SF4 sing 306 n n FE4 S1 SF4 sing 307 n n FE4 S2 SF4 sing 308 n n FE4 S3 SF4 sing 309 n n # _atom_sites.entry_id 7T2R _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code K 6 FES A 1 701 701 FES FES . L 7 SF4 A 1 702 801 SF4 SF4 . M 7 SF4 A 1 703 901 SF4 SF4 . N 7 SF4 A 1 704 1001 SF4 SF4 . O 7 SF4 A 1 705 1101 SF4 SF4 . P 7 SF4 B 1 601 601 SF4 SF4 . Q 6 FES B 1 602 602 FES FES . R 6 FES C 1 501 501 FES FES . S 8 3NI D 1 601 601 3NI 3NI . T 9 FCO D 1 602 701 FCO FCO . U 7 SF4 E 1 201 201 SF4 SF4 . V 6 FES F 1 701 701 FES FES . W 7 SF4 F 1 702 801 SF4 SF4 . X 7 SF4 F 1 703 901 SF4 SF4 . Y 7 SF4 F 1 704 1001 SF4 SF4 . Z 7 SF4 F 1 705 1101 SF4 SF4 . AA 7 SF4 G 1 601 601 SF4 SF4 . BA 6 FES G 1 602 602 FES FES . CA 6 FES H 1 501 501 FES FES . DA 8 3NI I 1 601 601 3NI 3NI . EA 9 FCO I 1 602 701 FCO FCO . FA 7 SF4 J 1 201 201 SF4 SF4 . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 FE FE1 SF4 . . . P 7 95.392 132.506 124.688 1 63.61 ? FE1 SF4 601 B 1 HETATM 2 FE FE2 SF4 . . . P 7 94.942 133.451 122.174 1 63.61 ? FE2 SF4 601 B 1 HETATM 3 FE FE3 SF4 . . . P 7 96.652 131.369 122.571 1 63.61 ? FE3 SF4 601 B 1 HETATM 4 FE FE4 SF4 . . . P 7 97.351 133.874 123.376 1 63.61 ? FE4 SF4 601 B 1 HETATM 5 S S1 SF4 . . . P 7 96.997 133.181 121.241 1 63.61 ? S1 SF4 601 B 1 HETATM 6 S S2 SF4 . . . P 7 97.59 131.945 124.557 1 63.61 ? S2 SF4 601 B 1 HETATM 7 S S3 SF4 . . . P 7 95.334 134.683 124.044 1 63.61 ? S3 SF4 601 B 1 HETATM 8 S S4 SF4 . . . P 7 94.417 131.392 122.971 1 63.61 ? S4 SF4 601 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 15 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 34 _model_server_stats.query_time_ms 363 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 8 #