data_7T9B # _model_server_result.job_id 0TTEbUrzuPGxr9Qia8H9Bw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-24 10:37:18' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7t9b # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"LB","auth_seq_id":702}' # _entry.id 7T9B # _exptl.entry_id 7T9B _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 13 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 41 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetradecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 14 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 13 KA N N ? 13 LA N N ? 13 MA N N ? 13 NA N N ? 13 OA N N ? 13 PA N N ? 13 QA N N ? 13 RA N N ? 13 SA N N ? 13 TA N N ? 13 UA N N ? 13 VA N N ? 13 WA N N ? 13 XA N N ? 13 YA N N ? 13 ZA N N ? 13 AB N N ? 13 BB N N ? 13 CB N N ? 13 DB N N ? 13 EB N N ? 13 FB N N ? 13 GB N N ? 13 HB N N ? 13 IB N N ? 13 JB N N ? 13 KB N N ? 13 LB N N ? 13 MB N N ? 13 NB N N ? 13 OB N N ? 13 PB N N ? 13 QB N N ? 13 RB N N ? 13 SB N N ? 13 TB N N ? 13 UB N N ? 13 VB N N ? 13 WB N N ? 13 XB N N ? 13 YB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide 9 oligosaccharide 10 oligosaccharide 11 oligosaccharide 12 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 8 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 8 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 8 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 5 ? 9 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 9 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 7 ? 10 2 1 NAG NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing 8 ? 10 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 9 ? 10 4 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 10 ? 10 5 4 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 11 ? 10 6 4 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 12 ? 10 7 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 13 ? 11 2 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing 14 ? 12 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 15 ? 12 3 1 FUC NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 7 n O NAG 1 G 1 NAG A 1052 NAG 7 n O NAG 2 G 2 NAG A 1053 NAG 7 n P NAG 1 I 1 NAG A 1056 NAG 7 n P NAG 2 I 2 NAG A 1057 NAG 8 n Q NAG 1 Q 1 NAG A 1060 NAG 8 n Q NAG 2 Q 2 NAG A 1061 NAG 8 n Q BMA 3 Q 3 BMA A 1062 BMA 8 n Q MAN 4 Q 4 MAN A 1063 MAN 9 n R NAG 1 R 1 NAG A 1067 NAG 9 n R NAG 2 R 2 NAG A 1068 NAG 9 n R BMA 3 R 3 BMA A 1084 BMA 10 n S NAG 1 S 1 NAG A 1085 NAG 10 n S NAG 2 S 2 NAG A 1086 NAG 10 n S BMA 3 S 3 BMA A 1087 BMA 10 n S MAN 4 S 4 MAN A 1089 MAN 10 n S MAN 5 S 5 MAN A 1090 MAN 10 n S MAN 6 S 6 MAN A 1091 MAN 10 n S MAN 7 S 7 MAN A 1088 MAN 11 n T NAG 1 T 1 NAG B 663 NAG 11 n T FUC 2 T 2 FUC B 664 FUC 12 n U NAG 1 U 1 NAG B 667 NAG 12 n U NAG 2 U 2 NAG B 669 NAG 12 n U FUC 3 U 3 FUC B 668 FUC 7 n V NAG 1 V 1 NAG C 1047 NAG 7 n V NAG 2 V 2 NAG C 1069 NAG 7 n W NAG 1 W 1 NAG C 1052 NAG 7 n W NAG 2 W 2 NAG C 1053 NAG 7 n X NAG 1 X 1 NAG C 1056 NAG 7 n X NAG 2 X 2 NAG C 1057 NAG 8 n Y NAG 1 Y 1 NAG C 1060 NAG 8 n Y NAG 2 Y 2 NAG C 1061 NAG 8 n Y BMA 3 Y 3 BMA C 1062 BMA 8 n Y MAN 4 Y 4 MAN C 1063 MAN 7 n Z NAG 1 Z 1 NAG C 1067 NAG 7 n Z NAG 2 Z 2 NAG C 1068 NAG 11 n AA NAG 1 a 1 NAG D 663 NAG 11 n AA FUC 2 a 2 FUC D 664 FUC 12 n BA NAG 1 b 1 NAG D 667 NAG 12 n BA NAG 2 b 2 NAG D 669 NAG 12 n BA FUC 3 b 3 FUC D 668 FUC 7 n CA NAG 1 c 1 NAG E 1052 NAG 7 n CA NAG 2 c 2 NAG E 1053 NAG 7 n DA NAG 1 d 1 NAG E 1056 NAG 7 n DA NAG 2 d 2 NAG E 1057 NAG 8 n EA NAG 1 e 1 NAG E 1060 NAG 8 n EA NAG 2 e 2 NAG E 1061 NAG 8 n EA BMA 3 e 3 BMA E 1062 BMA 8 n EA MAN 4 e 4 MAN E 1063 MAN 7 n FA NAG 1 f 1 NAG E 1065 NAG 7 n FA NAG 2 f 2 NAG E 1074 NAG 7 n GA NAG 1 g 1 NAG E 1067 NAG 7 n GA NAG 2 g 2 NAG E 1068 NAG 9 n HA NAG 1 h 1 NAG E 1069 NAG 9 n HA NAG 2 h 2 NAG E 1070 NAG 9 n HA BMA 3 h 3 BMA E 1071 BMA 11 n IA NAG 1 i 1 NAG F 663 NAG 11 n IA FUC 2 i 2 FUC F 664 FUC 12 n JA NAG 1 j 1 NAG F 667 NAG 12 n JA NAG 2 j 2 NAG F 669 NAG 12 n JA FUC 3 j 3 FUC F 668 FUC # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 24 A CYS 54 1_555 A SG CYS 44 A CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 89 A CYS 119 1_555 A SG CYS 167 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 96 A CYS 126 1_555 A SG CYS 158 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 101 A CYS 131 1_555 A SG CYS 119 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 180 A CYS 218 1_555 A SG CYS 209 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 190 A CYS 228 1_555 A SG CYS 201 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 258 A CYS 296 1_555 A SG CYS 292 A CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 339 A CYS 378 1_555 A SG CYS 405 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 346 A CYS 385 1_555 A SG CYS 378 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 87 B CYS 598 1_555 B SG CYS 93 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf11 C SG CYS 22 J CYS 22 1_555 C SG CYS 96 J CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf12 D SG CYS 20 K CYS 23 1_555 D SG CYS 88 K CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf13 E SG CYS 24 C CYS 54 1_555 E SG CYS 44 C CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? disulf ? disulf14 E SG CYS 89 C CYS 119 1_555 E SG CYS 167 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf15 E SG CYS 96 C CYS 126 1_555 E SG CYS 158 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf16 E SG CYS 101 C CYS 131 1_555 E SG CYS 119 C CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf17 E SG CYS 180 C CYS 218 1_555 E SG CYS 209 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf18 E SG CYS 190 C CYS 228 1_555 E SG CYS 201 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf19 E SG CYS 258 C CYS 296 1_555 E SG CYS 292 C CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf20 E SG CYS 339 C CYS 378 1_555 E SG CYS 405 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf21 E SG CYS 346 C CYS 385 1_555 E SG CYS 378 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf22 E SG CYS 461 C CYS 501 1_555 F SG CYS 94 D CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf23 F SG CYS 87 D CYS 598 1_555 F SG CYS 93 D CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf24 G SG CYS 22 M CYS 22 1_555 G SG CYS 96 M CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf25 H SG CYS 20 N CYS 23 1_555 H SG CYS 88 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf26 I SG CYS 24 E CYS 54 1_555 I SG CYS 44 E CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? disulf ? disulf27 I SG CYS 89 E CYS 119 1_555 I SG CYS 167 E CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf28 I SG CYS 96 E CYS 126 1_555 I SG CYS 158 E CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf29 I SG CYS 101 E CYS 131 1_555 I SG CYS 119 E CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf30 I SG CYS 180 E CYS 218 1_555 I SG CYS 209 E CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? disulf ? disulf31 I SG CYS 190 E CYS 228 1_555 I SG CYS 201 E CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf32 I SG CYS 258 E CYS 296 1_555 I SG CYS 292 E CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf33 I SG CYS 339 E CYS 378 1_555 I SG CYS 405 E CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf34 I SG CYS 346 E CYS 385 1_555 I SG CYS 378 E CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf35 I SG CYS 461 E CYS 501 1_555 J SG CYS 94 F CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf36 J SG CYS 87 F CYS 598 1_555 J SG CYS 93 F CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf37 K SG CYS 22 O CYS 22 1_555 K SG CYS 96 O CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf38 L SG CYS 20 P CYS 23 1_555 L SG CYS 88 P CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf39 M SG CYS 22 H CYS 22 1_555 M SG CYS 98 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf40 N SG CYS 23 L CYS 23 1_555 N SG CYS 89 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.149 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 58 A ASN 88 1_555 KA C1 NAG . A NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 103 A ASN 133 1_555 VA C1 NAG . A NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.53 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 107 A ASN 137 1_555 MA C1 NAG . A NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 118 A ASN 156 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 122 A ASN 160 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 159 A ASN 197 1_555 UA C1 NAG . A NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 196 A ASN 234 1_555 LA C1 NAG . A NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 224 A ASN 262 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 238 A ASN 276 1_555 OA C1 NAG . A NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 257 A ASN 295 1_555 RA C1 NAG . A NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 263 A ASN 301 1_555 TA C1 NAG . A NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.529 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 293 A ASN 332 1_555 P C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 300 A ASN 339 1_555 QA C1 NAG . A NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 316 A ASN 355 1_555 NA C1 NAG . A NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 347 A ASN 386 1_555 O C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 353 A ASN 392 1_555 PA C1 NAG . A NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.525 ? covale ? covale17 A ND2 ASN 408 A ASN 448 1_555 SA C1 NAG . A NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.529 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 100 B ASN 611 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.42 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 107 B ASN 618 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 114 B ASN 625 1_555 XA C1 NAG . B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 126 B ASN 637 1_555 WA C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale22 E ND2 ASN 58 C ASN 88 1_555 YA C1 NAG . C NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale23 E ND2 ASN 103 C ASN 133 1_555 JB C1 NAG . C NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.525 ? covale ? covale24 E ND2 ASN 107 C ASN 137 1_555 AB C1 NAG . C NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale25 E ND2 ASN 118 C ASN 156 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale26 E ND2 ASN 122 C ASN 160 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale27 E ND2 ASN 159 C ASN 197 1_555 IB C1 NAG . C NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale28 E ND2 ASN 196 C ASN 234 1_555 ZA C1 NAG . C NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale29 E ND2 ASN 224 C ASN 262 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale30 E ND2 ASN 238 C ASN 276 1_555 CB C1 NAG . C NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale31 E ND2 ASN 257 C ASN 295 1_555 FB C1 NAG . C NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale32 E ND2 ASN 263 C ASN 301 1_555 HB C1 NAG . C NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.531 ? covale ? covale33 E ND2 ASN 293 C ASN 332 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale34 E ND2 ASN 300 C ASN 339 1_555 EB C1 NAG . C NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.525 ? covale ? covale35 E ND2 ASN 316 C ASN 355 1_555 BB C1 NAG . C NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? covale ? covale36 E ND2 ASN 347 C ASN 386 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale37 E ND2 ASN 353 C ASN 392 1_555 DB C1 NAG . C NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.529 ? covale ? covale38 E ND2 ASN 408 C ASN 448 1_555 GB C1 NAG . C NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale39 F ND2 ASN 100 D ASN 611 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? covale ? covale40 F ND2 ASN 107 D ASN 618 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale41 F ND2 ASN 114 D ASN 625 1_555 LB C1 NAG . D NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale42 F ND2 ASN 126 D ASN 637 1_555 KB C1 NAG . D NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale43 I ND2 ASN 58 E ASN 88 1_555 MB C1 NAG . E NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale44 I ND2 ASN 103 E ASN 133 1_555 WB C1 NAG . E NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale45 I ND2 ASN 107 E ASN 137 1_555 OB C1 NAG . E NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale46 I ND2 ASN 118 E ASN 156 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? covale ? covale47 I ND2 ASN 122 E ASN 160 1_555 HA C1 NAG . h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.423 ? covale ? covale48 I ND2 ASN 159 E ASN 197 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale49 I ND2 ASN 196 E ASN 234 1_555 NB C1 NAG . E NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale50 I ND2 ASN 224 E ASN 262 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale51 I ND2 ASN 238 E ASN 276 1_555 QB C1 NAG . E NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.53 ? covale ? covale52 I ND2 ASN 257 E ASN 295 1_555 TB C1 NAG . E NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.525 ? covale ? covale53 I ND2 ASN 263 E ASN 301 1_555 VB C1 NAG . E NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? covale ? covale54 I ND2 ASN 293 E ASN 332 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? covale ? covale55 I ND2 ASN 300 E ASN 339 1_555 SB C1 NAG . E NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale56 I ND2 ASN 316 E ASN 355 1_555 PB C1 NAG . E NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale57 I ND2 ASN 347 E ASN 386 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale58 I ND2 ASN 353 E ASN 392 1_555 RB C1 NAG . E NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? covale ? covale59 I ND2 ASN 408 E ASN 448 1_555 UB C1 NAG . E NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.529 ? covale ? covale60 J ND2 ASN 100 F ASN 611 1_555 JA C1 NAG . j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.42 ? covale ? covale61 J ND2 ASN 107 F ASN 618 1_555 IA C1 NAG . i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale62 J ND2 ASN 114 F ASN 625 1_555 XB C1 NAG . F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale63 J ND2 ASN 126 F ASN 637 1_555 YB C1 NAG . F NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale64 M C GLY 110 H GLY 100 1_555 M N TYS 111 H TYS 100 1_555 D ? ? E ? ? ? ? ? ? ? ? 1.348 ? covale ? covale65 M C TYS 111 H TYS 100 1_555 M N ASP 112 H ASP 100 1_555 E ? ? F ? ? ? ? ? ? ? ? 1.367 ? covale ? covale66 M C HIS 114 H HIS 100 1_555 M N TYS 115 H TYS 100 1_555 H ? ? I ? ? ? ? ? ? ? ? 1.36 ? covale ? covale67 M C TYS 115 H TYS 100 1_555 M N TYR 116 H TYR 100 1_555 I ? ? J ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? covale ? covale68 O O4 NAG . G NAG 1 1_555 O C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale69 P O4 NAG . I NAG 1 1_555 P C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale70 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale71 Q O4 NAG . Q NAG 2 1_555 Q C1 BMA . Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale ? covale72 Q O3 BMA . Q BMA 3 1_555 Q C1 MAN . Q MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale73 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale74 R O4 NAG . R NAG 2 1_555 R C1 BMA . R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale75 S O6 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale76 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale77 S O6 BMA . S BMA 3 1_555 S C1 MAN . S MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale78 S O3 BMA . S BMA 3 1_555 S C1 MAN . S MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale79 S O3 MAN . S MAN 4 1_555 S C1 MAN . S MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale80 S O6 MAN . S MAN 4 1_555 S C1 MAN . S MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale81 T O6 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 FUC . T FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? covale ? covale82 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale83 U O6 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 FUC . U FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale84 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale85 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale86 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? covale ? covale87 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale88 Y O4 NAG . Y NAG 2 1_555 Y C1 BMA . Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale89 Y O3 BMA . Y BMA 3 1_555 Y C1 MAN . Y MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale90 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale91 AA O6 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 FUC . a FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale92 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale93 BA O6 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 FUC . b FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale94 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale95 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale96 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale97 EA O4 NAG . e NAG 2 1_555 EA C1 BMA . e BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale98 EA O3 BMA . e BMA 3 1_555 EA C1 MAN . e MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale99 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale100 GA O4 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 NAG . g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale101 HA O4 NAG . h NAG 1 1_555 HA C1 NAG . h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale102 HA O4 NAG . h NAG 2 1_555 HA C1 BMA . h BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale103 IA O6 NAG . i NAG 1 1_555 IA C1 FUC . i FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale104 JA O4 NAG . j NAG 1 1_555 JA C1 NAG . j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale105 JA O6 NAG . j NAG 1 1_555 JA C1 FUC . j FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 306 n n C1 O1 NAG sing 307 n n C1 O5 NAG sing 308 n n C1 H1 NAG sing 309 n n C2 C3 NAG sing 310 n n C2 N2 NAG sing 311 n n C2 H2 NAG sing 312 n n C3 C4 NAG sing 313 n n C3 O3 NAG sing 314 n n C3 H3 NAG sing 315 n n C4 C5 NAG sing 316 n n C4 O4 NAG sing 317 n n C4 H4 NAG sing 318 n n C5 C6 NAG sing 319 n n C5 O5 NAG sing 320 n n C5 H5 NAG sing 321 n n C6 O6 NAG sing 322 n n C6 H61 NAG sing 323 n n C6 H62 NAG sing 324 n n C7 C8 NAG sing 325 n n C7 N2 NAG sing 326 n n C7 O7 NAG doub 327 n n C8 H81 NAG sing 328 n n C8 H82 NAG sing 329 n n C8 H83 NAG sing 330 n n N2 HN2 NAG sing 331 n n O1 HO1 NAG sing 332 n n O3 HO3 NAG sing 333 n n O4 HO4 NAG sing 334 n n O6 HO6 NAG sing 335 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 7T9B _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code KA 13 NAG A 1 601 1046 NAG NAG . LA 13 NAG A 1 602 1048 NAG NAG . MA 13 NAG A 1 603 1049 NAG NAG . NA 13 NAG A 1 604 1050 NAG NAG . OA 13 NAG A 1 605 1051 NAG NAG . PA 13 NAG A 1 606 1054 NAG NAG . QA 13 NAG A 1 607 1055 NAG NAG . RA 13 NAG A 1 608 1058 NAG NAG . SA 13 NAG A 1 609 1059 NAG NAG . TA 13 NAG A 1 610 1064 NAG NAG . UA 13 NAG A 1 611 1065 NAG NAG . VA 13 NAG A 1 612 1066 NAG NAG . WA 13 NAG B 1 701 666 NAG NAG . XA 13 NAG B 1 702 670 NAG NAG . YA 13 NAG C 1 601 1046 NAG NAG . ZA 13 NAG C 1 602 1048 NAG NAG . AB 13 NAG C 1 603 1049 NAG NAG . BB 13 NAG C 1 604 1050 NAG NAG . CB 13 NAG C 1 605 1051 NAG NAG . DB 13 NAG C 1 606 1054 NAG NAG . EB 13 NAG C 1 607 1055 NAG NAG . FB 13 NAG C 1 608 1058 NAG NAG . GB 13 NAG C 1 609 1059 NAG NAG . HB 13 NAG C 1 610 1064 NAG NAG . IB 13 NAG C 1 611 1065 NAG NAG . JB 13 NAG C 1 612 1066 NAG NAG . KB 13 NAG D 1 701 666 NAG NAG . LB 13 NAG D 1 702 670 NAG NAG . MB 13 NAG E 1 601 1046 NAG NAG . NB 13 NAG E 1 602 1048 NAG NAG . OB 13 NAG E 1 603 1049 NAG NAG . PB 13 NAG E 1 604 1050 NAG NAG . QB 13 NAG E 1 605 1051 NAG NAG . RB 13 NAG E 1 606 1054 NAG NAG . SB 13 NAG E 1 607 1055 NAG NAG . TB 13 NAG E 1 608 1058 NAG NAG . UB 13 NAG E 1 609 1059 NAG NAG . VB 13 NAG E 1 610 1064 NAG NAG . WB 13 NAG E 1 611 1066 NAG NAG . XB 13 NAG F 1 701 665 NAG NAG . YB 13 NAG F 1 702 666 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . LB 13 173.967 209.783 157.42 1 30 ? C1 NAG 702 D 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . LB 13 174.713 209.982 156.102 1 30 ? C2 NAG 702 D 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . LB 13 174.684 211.449 155.713 1 30 ? C3 NAG 702 D 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . LB 13 173.242 211.918 155.635 1 30 ? C4 NAG 702 D 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . LB 13 172.545 211.661 156.961 1 30 ? C5 NAG 702 D 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . LB 13 171.078 212.041 156.852 1 30 ? C6 NAG 702 D 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . LB 13 176.507 208.347 155.774 1 30 ? C7 NAG 702 D 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . LB 13 177.978 208.094 155.892 1 30 ? C8 NAG 702 D 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . LB 13 176.096 209.545 156.191 1 30 ? N2 NAG 702 D 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . LB 13 175.314 211.619 154.44 1 30 ? O3 NAG 702 D 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . LB 13 173.201 213.316 155.331 1 30 ? O4 NAG 702 D 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . LB 13 172.634 210.279 157.29 1 30 ? O5 NAG 702 D 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . LB 13 170.504 211.283 155.785 1 30 ? O6 NAG 702 D 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . LB 13 175.741 207.505 155.334 1 30 ? O7 NAG 702 D 1 # _model_server_stats.io_time_ms 14 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 42 _model_server_stats.query_time_ms 291 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 14 #