data_7TCI # _model_server_result.job_id YVprGVwJBIoo2EwGcfl4Tg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 14:05:45' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7tci # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":901}' # _entry.id 7TCI # _exptl.entry_id 7TCI _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 12 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7TCI _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7TCI _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 J N N ? 4 K N N ? 4 L N N ? 4 N N N ? 4 O N N ? 4 P N N ? 4 R N N ? 4 S N N ? 4 T N N ? 4 V N N ? 4 W N N ? 4 X N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 B OD2 ASP 25 B ASP 25 1_555 J CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.671 ? metalc ? metalc2 B O THR 27 B THR 27 1_555 J CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.566 ? metalc ? metalc3 B OD1 ASP 57 B ASP 57 1_555 K CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.775 ? metalc ? metalc4 B OD1 ASP 59 B ASP 59 1_555 K CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.615 ? metalc ? metalc5 B OD2 ASP 59 B ASP 59 1_555 K CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.916 ? metalc ? metalc6 B OD1 ASN 61 B ASN 61 1_555 K CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.503 ? metalc ? metalc7 B O THR 63 B THR 63 1_555 K CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.844 ? metalc ? metalc8 B OE1 GLU 68 B GLU 68 1_555 K CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.715 ? metalc ? metalc9 B OE2 GLU 68 B GLU 68 1_555 K CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.458 ? metalc ? metalc10 B O GLN 136 B GLN 136 1_555 L CA CA . B CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.086 ? metalc ? metalc11 D OD2 ASP 25 F ASP 25 1_555 N CA CA . F CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? metalc ? metalc12 D O THR 27 F THR 27 1_555 N CA CA . F CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.565 ? metalc ? metalc13 D OD1 ASP 57 F ASP 57 1_555 O CA CA . F CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.779 ? metalc ? metalc14 D OD1 ASP 59 F ASP 59 1_555 O CA CA . F CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.606 ? metalc ? metalc15 D OD2 ASP 59 F ASP 59 1_555 O CA CA . F CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.91 ? metalc ? metalc16 D OD1 ASN 61 F ASN 61 1_555 O CA CA . F CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.502 ? metalc ? metalc17 D O THR 63 F THR 63 1_555 O CA CA . F CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.872 ? metalc ? metalc18 D OE1 GLU 68 F GLU 68 1_555 O CA CA . F CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.704 ? metalc ? metalc19 D OE2 GLU 68 F GLU 68 1_555 O CA CA . F CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.46 ? metalc ? metalc20 D O GLN 136 F GLN 136 1_555 P CA CA . F CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.082 ? metalc ? metalc21 F OD2 ASP 25 D ASP 25 1_555 R CA CA . D CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.68 ? metalc ? metalc22 F O THR 27 D THR 27 1_555 R CA CA . D CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? metalc ? metalc23 F OD1 ASP 57 D ASP 57 1_555 S CA CA . D CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.772 ? metalc ? metalc24 F OD1 ASP 59 D ASP 59 1_555 S CA CA . D CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.614 ? metalc ? metalc25 F OD2 ASP 59 D ASP 59 1_555 S CA CA . D CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.921 ? metalc ? metalc26 F OD1 ASN 61 D ASN 61 1_555 S CA CA . D CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? metalc ? metalc27 F O THR 63 D THR 63 1_555 S CA CA . D CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.862 ? metalc ? metalc28 F OE1 GLU 68 D GLU 68 1_555 S CA CA . D CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.711 ? metalc ? metalc29 F OE2 GLU 68 D GLU 68 1_555 S CA CA . D CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? metalc ? metalc30 F O GLN 136 D GLN 136 1_555 T CA CA . D CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.085 ? metalc ? metalc31 H OD2 ASP 25 H ASP 25 1_555 V CA CA . H CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? metalc ? metalc32 H O THR 27 H THR 27 1_555 V CA CA . H CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.565 ? metalc ? metalc33 H OD1 ASP 57 H ASP 57 1_555 W CA CA . H CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.77 ? metalc ? metalc34 H OD1 ASP 59 H ASP 59 1_555 W CA CA . H CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.607 ? metalc ? metalc35 H OD2 ASP 59 H ASP 59 1_555 W CA CA . H CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.91 ? metalc ? metalc36 H OD1 ASN 61 H ASN 61 1_555 W CA CA . H CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.502 ? metalc ? metalc37 H O THR 63 H THR 63 1_555 W CA CA . H CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.84 ? metalc ? metalc38 H OE1 GLU 68 H GLU 68 1_555 W CA CA . H CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.712 ? metalc ? metalc39 H OE2 GLU 68 H GLU 68 1_555 W CA CA . H CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? metalc ? metalc40 H O GLN 136 H GLN 136 1_555 X CA CA . H CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.082 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7TCI _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 3 I0S A 1 701 601 I0S LIG . J 4 CA B 1 901 901 CA CA . K 4 CA B 1 902 902 CA CA . L 4 CA B 1 903 903 CA CA . M 3 I0S E 1 701 601 I0S LIG . N 4 CA F 1 901 901 CA CA . O 4 CA F 1 902 902 CA CA . P 4 CA F 1 903 903 CA CA . Q 3 I0S C 1 701 601 I0S LIG . R 4 CA D 1 901 901 CA CA . S 4 CA D 1 902 902 CA CA . T 4 CA D 1 903 903 CA CA . U 3 I0S G 1 701 601 I0S LIG . V 4 CA H 1 901 901 CA CA . W 4 CA H 1 902 902 CA CA . X 4 CA H 1 903 903 CA CA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id J _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 139.525 _atom_site.Cartn_y 176.801 _atom_site.Cartn_z 103.476 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 149.56 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 901 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 10 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 20 _model_server_stats.query_time_ms 240 _model_server_stats.encode_time_ms 8 _model_server_stats.element_count 1 #