data_7TSN
#
_model_server_result.job_id            NQxeajW_m_g8_AH7nnVoiQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-11 01:19:01' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7tsn 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"L","auth_seq_id":508}' 
#
_entry.id    7TSN 
#
_exptl.entry_id    7TSN 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              92.094 
_entity.id                          6 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            GLYCEROL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90.66 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7TSN 
_cell.length_a            58.784 
_cell.length_b            151.035 
_cell.length_c            107.412 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7TSN 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,SA,TA 1 1 
C,D,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,UA,VA 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 6 K N N 
? 6 L N N 
? 6 U N N 
? 6 DA N N 
? 6 EA N N 
? 6 FA N N 
? 6 GA N N 
? 6 PA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A SG CYS 54 A CYS 94 1_555 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 59 A CYS 99 1_555 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.25 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 144 A CYS 184 1_555 E FE HEM . A HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? 
metalc ? metalc4 H O3 BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD . A GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.711 ? 
metalc ? metalc5 H O4 BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD . A GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.593 ? 
metalc ? metalc6 H N BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD . A GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.38 ? 
metalc ? metalc7 H O6 BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD . A GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.005 ? 
metalc ? metalc8 H O8 BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD . A GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.763 ? 
metalc ? metalc9 N GD GD . A GD 510 1_555 SA O HOH . A HOH 616 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.059 ? 
metalc ? metalc10 N GD GD . A GD 510 1_555 SA O HOH . A HOH 677 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? 
metalc ? metalc11 N GD GD . A GD 510 1_555 VA O HOH . D HOH 601 1_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.145 ? 
metalc ? metalc12 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 B SG CYS 54 B CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? 
metalc ? metalc13 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 B SG CYS 59 B CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? 
metalc ? metalc14 SA O HOH . A HOH 602 1_655 RA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.609 ? 
metalc ? metalc15 B SG CYS 144 B CYS 184 1_555 P FE HEM . B HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? 
metalc ? metalc16 B O THR 279 B THR 319 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.577 ? 
metalc ? metalc17 B OE1 GLU 281 B GLU 321 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.675 ? 
metalc ? metalc18 S O3 BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.004 ? 
metalc ? metalc19 S O4 BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.544 ? 
metalc ? metalc20 S N BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.711 ? 
metalc ? metalc21 S O6 BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.04 ? 
metalc ? metalc22 S O8 BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.738 ? 
metalc ? metalc23 W GD GD . B GD 508 1_555 TA O HOH . B HOH 737 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.586 ? 
metalc ? metalc24 W GD GD . B GD 508 1_555 UA O HOH . C HOH 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.666 ? 
metalc ? metalc25 TA O HOH . B HOH 707 1_555 IA GD GD . C GD 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.749 ? 
metalc ? metalc26 C SG CYS 54 C CYS 94 1_555 JA ZN ZN . C ZN 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? 
metalc ? metalc27 C SG CYS 59 C CYS 99 1_555 JA ZN ZN . C ZN 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? 
metalc ? metalc28 C SG CYS 144 C CYS 184 1_555 X FE HEM . C HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? 
metalc ? metalc29 AA O3 BTB . C BTB 504 1_555 IA GD GD . C GD 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? 
metalc ? metalc30 AA O4 BTB . C BTB 504 1_555 IA GD GD . C GD 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.665 ? 
metalc ? metalc31 AA N BTB . C BTB 504 1_555 IA GD GD . C GD 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.841 ? 
metalc ? metalc32 AA O6 BTB . C BTB 504 1_555 IA GD GD . C GD 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.731 ? 
metalc ? metalc33 AA O8 BTB . C BTB 504 1_555 IA GD GD . C GD 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.961 ? 
metalc ? metalc34 IA GD GD . C GD 512 1_555 UA O HOH . C HOH 652 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.713 ? 
metalc ? metalc35 IA GD GD . C GD 512 1_555 UA O HOH . C HOH 715 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.223 ? 
metalc ? metalc36 JA ZN ZN . C ZN 513 1_555 D SG CYS 54 D CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.451 ? 
metalc ? metalc37 JA ZN ZN . C ZN 513 1_555 D SG CYS 59 D CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? 
metalc ? metalc38 D SG CYS 144 D CYS 184 1_555 KA FE HEM . D HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.216 ? 
metalc ? metalc39 D O THR 279 D THR 319 1_555 RA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.561 ? 
metalc ? metalc40 D OE1 GLU 281 D GLU 321 1_555 RA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.674 ? 
metalc ? metalc41 NA O3 BTB . D BTB 504 1_555 RA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.711 ? 
metalc ? metalc42 NA O4 BTB . D BTB 504 1_555 RA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.632 ? 
metalc ? metalc43 NA N BTB . D BTB 504 1_555 RA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.832 ? 
metalc ? metalc44 NA O6 BTB . D BTB 504 1_555 RA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.815 ? 
metalc ? metalc45 NA O8 BTB . D BTB 504 1_555 RA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.738 ? 
metalc ? metalc46 RA GD GD . D GD 508 1_555 VA O HOH . D HOH 756 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.63 ? 
#
_chem_comp.formula           'C3 H8 O3' 
_chem_comp.formula_weight    92.094 
_chem_comp.id                GOL 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              GLYCEROL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     GLYCERIN;PROPANE-1,2,3-TRIOL 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 GOL sing 161 n n 
C1 C2 GOL sing 162 n n 
C1 H11 GOL sing 163 n n 
C1 H12 GOL sing 164 n n 
O1 HO1 GOL sing 165 n n 
C2 O2 GOL sing 166 n n 
C2 C3 GOL sing 167 n n 
C2 H2 GOL sing 168 n n 
O2 HO2 GOL sing 169 n n 
C3 O3 GOL sing 170 n n 
C3 H31 GOL sing 171 n n 
C3 H32 GOL sing 172 n n 
O3 HO3 GOL sing 173 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7TSN 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.017011 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000195 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.006621 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.009311 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 HEM A 1 501 500 HEM HEM . 
F 3 H4B A 1 502 600 H4B BH4 . 
G 4 K7U A 1 503 800 K7U 1V1 . 
H 5 BTB A 1 504 870 BTB TRB . 
I 5 BTB A 1 505 871 BTB TRB . 
J 5 BTB A 1 506 872 BTB TRB . 
K 6 GOL A 1 507 880 GOL GOL . 
L 6 GOL A 1 508 881 GOL GOL . 
M 7 CL A 1 509 885 CL CL . 
N 8 GD A 1 510 890 GD GD . 
O 9 ZN A 1 511 900 ZN ZN . 
P 2 HEM B 1 501 500 HEM HEM . 
Q 3 H4B B 1 502 600 H4B BH4 . 
R 4 K7U B 1 503 800 K7U 1V1 . 
S 5 BTB B 1 504 870 BTB TRB . 
T 5 BTB B 1 505 871 BTB TRB . 
U 6 GOL B 1 506 881 GOL GOL . 
V 7 CL B 1 507 885 CL CL . 
W 8 GD B 1 508 890 GD GD . 
X 2 HEM C 1 501 500 HEM HEM . 
Y 3 H4B C 1 502 600 H4B BH4 . 
Z 4 K7U C 1 503 800 K7U 1V1 . 
AA 5 BTB C 1 504 870 BTB TRB . 
BA 5 BTB C 1 505 871 BTB TRB . 
CA 5 BTB C 1 506 872 BTB TRB . 
DA 6 GOL C 1 507 880 GOL GOL . 
EA 6 GOL C 1 508 881 GOL GOL . 
FA 6 GOL C 1 509 882 GOL GOL . 
GA 6 GOL C 1 510 883 GOL GOL . 
HA 7 CL C 1 511 885 CL CL . 
IA 8 GD C 1 512 890 GD GD . 
JA 9 ZN C 1 513 900 ZN ZN . 
KA 2 HEM D 1 501 500 HEM HEM . 
LA 3 H4B D 1 502 600 H4B BH4 . 
MA 4 K7U D 1 503 800 K7U 1V1 . 
NA 5 BTB D 1 504 870 BTB TRB . 
OA 5 BTB D 1 505 871 BTB TRB . 
PA 6 GOL D 1 506 881 GOL GOL . 
QA 7 CL D 1 507 885 CL CL . 
RA 8 GD D 1 508 890 GD GD . 
SA 10 HOH A 1 601 411 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 2 602 512 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 3 603 433 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 4 604 410 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 5 605 422 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 6 606 174 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 7 607 520 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 8 608 421 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 9 609 348 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 10 610 316 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 11 611 424 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 12 612 3 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 13 613 215 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 14 614 405 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 15 615 376 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 16 616 428 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 17 617 418 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 18 618 381 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 19 619 128 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 20 620 94 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 21 621 148 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 22 622 90 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 23 623 8 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 24 624 126 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 25 625 251 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 26 626 404 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 27 627 273 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 28 628 409 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 29 629 303 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 30 630 352 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 31 631 425 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 32 632 25 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 33 633 123 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 34 634 110 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 35 635 419 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 36 636 163 HOH HOH . 
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SA 10 HOH A 38 638 256 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 39 639 434 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 40 640 259 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 41 641 220 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 42 642 238 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 43 643 84 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 44 644 319 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 45 645 276 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 46 646 430 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 47 647 263 HOH HOH . 
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SA 10 HOH A 49 649 186 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 50 650 431 HOH HOH . 
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TA 10 HOH B 7 607 293 HOH HOH . 
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UA 10 HOH C 5 605 372 HOH HOH . 
UA 10 HOH C 6 606 471 HOH HOH . 
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UA 10 HOH C 54 654 137 HOH HOH . 
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