data_7TSP
#
_model_server_result.job_id            2JjZ5zdxEi2Zl15_b_pCkQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-11 01:25:36' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7tsp 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"X","auth_seq_id":509}' 
#
_entry.id    7TSP 
#
_exptl.entry_id    7TSP 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              157.25 
_entity.id                          8 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'GADOLINIUM ATOM' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90.62 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7TSP 
_cell.length_a            59.471 
_cell.length_b            152.71 
_cell.length_c            108.781 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7TSP 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,SA,TA 1 1 
C,D,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,UA,VA 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 8 N N N 
? 8 W N N 
? 8 X N N 
? 8 RA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A SG CYS 54 A CYS 94 1_555 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 59 A CYS 99 1_555 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 144 A CYS 184 1_555 E FE HEM . A HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? 
metalc ? metalc4 H O3 BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD . A GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.7 ? 
metalc ? metalc5 H O4 BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD . A GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.692 ? 
metalc ? metalc6 H N BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD . A GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.511 ? 
metalc ? metalc7 H O6 BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD . A GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.72 ? 
metalc ? metalc8 H O8 BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD . A GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.756 ? 
metalc ? metalc9 N GD GD . A GD 510 1_555 SA O HOH . A HOH 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.707 ? 
metalc ? metalc10 N GD GD . A GD 510 1_555 SA O HOH . A HOH 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.763 ? 
metalc ? metalc11 N GD GD . A GD 510 1_555 SA O HOH . A HOH 627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.774 ? 
metalc ? metalc12 N GD GD . A GD 510 1_555 SA O HOH . A HOH 659 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.801 ? 
metalc ? metalc13 N GD GD . A GD 510 1_555 SA O HOH . A HOH 661 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.751 ? 
metalc ? metalc14 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 B SG CYS 54 B CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.469 ? 
metalc ? metalc15 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 B SG CYS 59 B CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.47 ? 
metalc ? metalc16 B SG CYS 144 B CYS 184 1_555 P FE HEM . B HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? 
metalc ? metalc17 B O THR 279 B THR 319 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? 
metalc ? metalc18 B OE1 GLU 281 B GLU 321 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.73 ? 
metalc ? metalc19 S O3 BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? 
metalc ? metalc20 S O4 BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.629 ? 
metalc ? metalc21 S N BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.632 ? 
metalc ? metalc22 S O6 BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.791 ? 
metalc ? metalc23 S O8 BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? 
metalc ? metalc24 W GD GD . B GD 508 1_555 TA O HOH . B HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.699 ? 
metalc ? metalc25 W GD GD . B GD 508 1_555 UA O HOH . C HOH 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? 
metalc ? metalc26 X GD GD . B GD 509 1_555 TA O HOH . B HOH 657 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.75 ? 
metalc ? metalc27 X GD GD . B GD 509 1_555 BA O3 BTB . C BTB 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.536 ? 
metalc ? metalc28 X GD GD . B GD 509 1_555 BA N BTB . C BTB 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.716 ? 
metalc ? metalc29 X GD GD . B GD 509 1_555 BA O4 BTB . C BTB 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.62 ? 
metalc ? metalc30 X GD GD . B GD 509 1_555 BA O8 BTB . C BTB 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.743 ? 
metalc ? metalc31 X GD GD . B GD 509 1_555 BA O6 BTB . C BTB 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.742 ? 
metalc ? metalc32 X GD GD . B GD 509 1_555 UA O HOH . C HOH 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.641 ? 
metalc ? metalc33 X GD GD . B GD 509 1_555 UA O HOH . C HOH 693 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.786 ? 
metalc ? metalc34 C SG CYS 54 C CYS 94 1_555 JA ZN ZN . C ZN 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? 
metalc ? metalc35 C SG CYS 59 C CYS 99 1_555 JA ZN ZN . C ZN 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? 
metalc ? metalc36 C SG CYS 144 C CYS 184 1_555 Y FE HEM . C HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? 
metalc ? metalc37 JA ZN ZN . C ZN 512 1_555 D SG CYS 54 D CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? 
metalc ? metalc38 JA ZN ZN . C ZN 512 1_555 D SG CYS 59 D CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? 
metalc ? metalc39 D SG CYS 144 D CYS 184 1_555 KA FE HEM . D HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? 
metalc ? metalc40 D O THR 279 D THR 319 1_555 RA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.601 ? 
metalc ? metalc41 D OE1 GLU 281 D GLU 321 1_555 RA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.628 ? 
metalc ? metalc42 NA O3 BTB . D BTB 504 1_555 RA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.407 ? 
metalc ? metalc43 NA O4 BTB . D BTB 504 1_555 RA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.697 ? 
metalc ? metalc44 NA N BTB . D BTB 504 1_555 RA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? 
metalc ? metalc45 NA O6 BTB . D BTB 504 1_555 RA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.757 ? 
metalc ? metalc46 NA O8 BTB . D BTB 504 1_555 RA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.605 ? 
#
_chem_comp.formula           Gd 
_chem_comp.formula_weight    157.25 
_chem_comp.id                GD 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'GADOLINIUM ATOM' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     7TSP 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.016815 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000182 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.006548 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.009193 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 HEM A 1 501 500 HEM HEM . 
F 3 H4B A 1 502 600 H4B BH4 . 
G 4 K8O A 1 503 800 K8O 1V2 . 
H 5 BTB A 1 504 870 BTB TRB . 
I 5 BTB A 1 505 871 BTB TRB . 
J 5 BTB A 1 506 872 BTB TRB . 
K 6 GOL A 1 507 880 GOL GOL . 
L 6 GOL A 1 508 881 GOL GOL . 
M 7 CL A 1 509 885 CL CL . 
N 8 GD A 1 510 890 GD GD . 
O 9 ZN A 1 511 900 ZN ZN . 
P 2 HEM B 1 501 500 HEM HEM . 
Q 3 H4B B 1 502 600 H4B BH4 . 
R 4 K8O B 1 503 800 K8O 1V2 . 
S 5 BTB B 1 504 870 BTB TRB . 
T 5 BTB B 1 505 871 BTB TRB . 
U 6 GOL B 1 506 881 GOL GOL . 
V 7 CL B 1 507 885 CL CL . 
W 8 GD B 1 508 890 GD GD . 
X 8 GD B 1 509 890 GD GD . 
Y 2 HEM C 1 501 500 HEM HEM . 
Z 3 H4B C 1 502 600 H4B BH4 . 
AA 4 K8O C 1 503 800 K8O 1V2 . 
BA 5 BTB C 1 504 870 BTB TRB . 
CA 5 BTB C 1 505 871 BTB TRB . 
DA 5 BTB C 1 506 872 BTB TRB . 
EA 6 GOL C 1 507 880 GOL GOL . 
FA 6 GOL C 1 508 881 GOL GOL . 
GA 6 GOL C 1 509 882 GOL GOL . 
HA 6 GOL C 1 510 883 GOL GOL . 
IA 7 CL C 1 511 885 CL CL . 
JA 9 ZN C 1 512 900 ZN ZN . 
KA 2 HEM D 1 501 500 HEM HEM . 
LA 3 H4B D 1 502 600 H4B BH4 . 
MA 4 K8O D 1 503 800 K8O 1V2 . 
NA 5 BTB D 1 504 870 BTB TRB . 
OA 5 BTB D 1 505 871 BTB TRB . 
PA 6 GOL D 1 506 881 GOL GOL . 
QA 7 CL D 1 507 885 CL CL . 
RA 8 GD D 1 508 890 GD GD . 
SA 10 HOH A 1 601 312 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 2 602 314 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 3 603 332 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 4 604 322 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 5 605 83 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 6 606 333 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 7 607 313 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 8 608 309 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 9 609 44 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 10 610 330 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 11 611 132 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 12 612 54 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 13 613 338 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 14 614 36 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 15 615 334 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 16 616 66 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 17 617 329 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 18 618 99 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 19 619 254 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 20 620 21 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 21 621 215 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 22 622 65 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 23 623 263 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 24 624 300 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 25 625 117 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 26 626 317 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 27 627 264 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 28 628 318 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 29 629 335 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 30 630 153 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 31 631 299 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 32 632 119 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 33 633 135 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 34 634 67 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 35 635 139 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 36 636 70 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 37 637 192 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 38 638 382 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 39 639 337 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 40 640 265 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 41 641 189 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 42 642 208 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 43 643 25 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 44 644 151 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 45 645 82 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 46 646 214 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 47 647 52 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 48 648 111 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 49 649 121 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 50 650 193 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 51 651 252 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 52 652 274 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 53 653 171 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 54 654 308 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 55 655 298 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 56 656 301 HOH HOH . 
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UA 10 HOH C 54 654 245 HOH HOH . 
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VA 10 HOH D 1 601 320 HOH HOH . 
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