data_7U19 # _model_server_result.job_id gy5ezLVmLKYTNQUdMATwkg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 16:16:54' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7u19 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"O","auth_seq_id":402}' # _entry.id 7U19 # _exptl.entry_id 7U19 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 11 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7U19 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7U19 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details undecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 11 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 11 M N N ? 11 O N N ? 11 Q N N ? 11 S N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OG1 THR 360 A THR 360 1_555 M MG MG . A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc2 L O3G AGS . A AGS 901 1_555 M MG MG . A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? metalc ? metalc3 L O1B AGS . A AGS 901 1_555 M MG MG . A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? metalc ? metalc4 B OG1 THR 56 B THR 56 1_555 O MG MG . B MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc5 N O3G AGS . B AGS 401 1_555 O MG MG . B MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? metalc ? metalc6 N O1B AGS . B AGS 401 1_555 O MG MG . B MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc7 C OG1 THR 60 C THR 60 1_555 Q MG MG . C MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? metalc ? metalc8 P O3G AGS . C AGS 401 1_555 Q MG MG . C MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? metalc ? metalc9 P O1B AGS . C AGS 401 1_555 Q MG MG . C MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? metalc ? metalc10 D OG1 THR 72 D THR 72 1_555 S MG MG . D MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? metalc ? metalc11 R O3G AGS . D AGS 401 1_555 S MG MG . D MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? metalc ? metalc12 R O2B AGS . D AGS 401 1_555 S MG MG . D MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.088 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 I N1 DG 1 I DG 1 1_555 J N3 DC 34 J DC 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 I N2 DG 1 I DG 1 1_555 J O2 DC 34 J DC 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 I O6 DG 1 I DG 1 1_555 J N4 DC 34 J DC 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 I N3 DC 2 I DC 2 1_555 J N1 DG 33 J DG 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 I N4 DC 2 I DC 2 1_555 J O6 DG 33 J DG 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 I O2 DC 2 I DC 2 1_555 J N2 DG 33 J DG 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 I N1 DA 3 I DA 3 1_555 J N3 DT 32 J DT 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 I N6 DA 3 I DA 3 1_555 J O4 DT 32 J DT 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 I N1 DG 4 I DG 4 1_555 J N3 DC 31 J DC 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 I N2 DG 4 I DG 4 1_555 J O2 DC 31 J DC 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 I O6 DG 4 I DG 4 1_555 J N4 DC 31 J DC 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 I N1 DA 5 I DA 5 1_555 J N3 DT 30 J DT 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 I N6 DA 5 I DA 5 1_555 J O4 DT 30 J DT 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog14 I N4 DC 6 I DC 6 1_555 J O6 DG 29 J DG 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog15 I N1 DA 7 I DA 7 1_555 J N3 DT 28 J DT 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 I N3 DC 8 I DC 8 1_555 J N1 DG 27 J DG 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 I N4 DC 8 I DC 8 1_555 J O6 DG 27 J DG 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 I O2 DC 8 I DC 8 1_555 J N2 DG 27 J DG 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DT-DA PAIR' hydrog19 I N3 DT 9 I DT 9 1_555 J N1 DA 26 J DA 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog20 I N1 DA 10 I DA 10 1_555 J N3 DT 25 J DT 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog21 I O2 DC 11 I DC 11 1_555 J N2 DG 24 J DG 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 I N1 DG 12 I DG 12 1_555 J N3 DC 23 J DC 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 I N2 DG 12 I DG 12 1_555 J O2 DC 23 J DC 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 I O6 DG 12 I DG 12 1_555 J N4 DC 23 J DC 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog25 I N1 DA 13 I DA 13 1_555 J N3 DT 22 J DT 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 I N1 DG 14 I DG 14 1_555 J N3 DC 21 J DC 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 I N2 DG 14 I DG 14 1_555 J O2 DC 21 J DC 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 I O6 DG 14 I DG 14 1_555 J N4 DC 21 J DC 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 I N3 DT 15 I DT 15 1_555 J N1 DA 20 J DA 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 I O4 DT 15 I DT 15 1_555 J N6 DA 20 J DA 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 I N1 DA 16 I DA 16 1_555 J N3 DT 19 J DT 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 I N6 DA 16 I DA 16 1_555 J O4 DT 19 J DT 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 I N3 DC 17 I DC 17 1_555 J N1 DG 18 J DG 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 I N4 DC 17 I DC 17 1_555 J O6 DG 18 J DG 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 I O2 DC 17 I DC 17 1_555 J N2 DG 18 J DG 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 J N1 DA 1 J DA 17 1_555 K N3 DT 13 K DT 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 J N6 DA 1 J DA 17 1_555 K O4 DT 13 K DT 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 J N3 DC 2 J DC 18 1_555 K N1 DG 12 K DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 J N4 DC 2 J DC 18 1_555 K O6 DG 12 K DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 J O2 DC 2 J DC 18 1_555 K N2 DG 12 K DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 J N1 DG 4 J DG 20 1_555 K N3 DC 10 K DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 J N2 DG 4 J DG 20 1_555 K O2 DC 10 K DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 J O6 DG 4 J DG 20 1_555 K N4 DC 10 K DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 J N1 DA 5 J DA 21 1_555 K N3 DT 9 K DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 J N6 DA 5 J DA 21 1_555 K O4 DT 9 K DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 J N3 DC 6 J DC 22 1_555 K N1 DG 8 K DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 J N4 DC 6 J DC 22 1_555 K O6 DG 8 K DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 J O2 DC 6 J DC 22 1_555 K N2 DG 8 K DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog49 J O2 DC 7 J DC 23 1_555 K N1 DG 7 K DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog50 J O2 DC 7 J DC 23 1_555 K N2 DG 8 K DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DT-DA PAIR' hydrog51 J N3 DT 8 J DT 24 1_555 K N1 DA 6 K DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 J N1 DA 9 J DA 25 1_555 K N3 DT 5 K DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 J N6 DA 9 J DA 25 1_555 K O4 DT 5 K DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 J N1 DA 10 J DA 26 1_555 K N3 DT 4 K DT 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 J N6 DA 10 J DA 26 1_555 K O4 DT 4 K DT 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 J N1 DG 11 J DG 27 1_555 K N3 DC 3 K DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 J N2 DG 11 J DG 27 1_555 K O2 DC 3 K DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 J O6 DG 11 J DG 27 1_555 K N4 DC 3 K DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 J N3 DT 12 J DT 28 1_555 K N1 DA 2 K DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 J O4 DT 12 J DT 28 1_555 K N6 DA 2 K DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7U19 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code L 10 AGS A 1 901 801 AGS AGS . M 11 MG A 1 902 811 MG MG . N 10 AGS B 1 401 802 AGS AGS . O 11 MG B 1 402 812 MG MG . P 10 AGS C 1 401 803 AGS AGS . Q 11 MG C 1 402 813 MG MG . R 10 AGS D 1 401 804 AGS AGS . S 11 MG D 1 402 814 MG MG . T 12 ADP E 1 401 805 ADP ADP . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id O _atom_site.label_entity_id 11 _atom_site.Cartn_x 144.605 _atom_site.Cartn_y 141.347 _atom_site.Cartn_z 157.981 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 54.95 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 402 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 15 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 27 _model_server_stats.query_time_ms 285 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 1 #