data_7UWE # _model_server_result.job_id xdMZpURiQeSVDSVq56rSdg _model_server_result.datetime_utc '2024-10-31 14:22:59' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7uwe # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":1501}' # _entry.id 7UWE # _exptl.entry_id 7UWE _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 9 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 9 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 9 _struct_asym.id J _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 C O3' A 18 R A 20 1_555 J MG MG . J MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.416 ? metalc ? metalc2 G SG CYS 70 J CYS 70 1_555 K ZN ZN . J ZN 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? metalc ? metalc3 G SG CYS 72 J CYS 72 1_555 K ZN ZN . J ZN 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? metalc ? metalc4 G N GLY 73 J GLY 73 1_555 K ZN ZN . J ZN 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? metalc ? metalc5 G N LYS 74 J LYS 74 1_555 K ZN ZN . J ZN 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc6 G OD1 ASP 460 J ASP 460 1_555 J MG MG . J MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? metalc ? metalc7 G OD1 ASP 462 J ASP 462 1_555 J MG MG . J MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? metalc ? metalc8 G OD2 ASP 462 J ASP 462 1_555 J MG MG . J MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc9 G OD1 ASP 464 J ASP 464 1_555 J MG MG . J MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.772 ? metalc ? metalc10 G OD2 ASP 464 J ASP 464 1_555 J MG MG . J MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.994 ? metalc ? metalc11 G SG CYS 814 J CYS 814 1_555 L ZN ZN . J ZN 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc12 G SG CYS 888 J CYS 888 1_555 L ZN ZN . J ZN 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc13 G SG CYS 895 J CYS 895 1_555 L ZN ZN . J ZN 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc14 G SG CYS 898 J CYS 898 1_555 L ZN ZN . J ZN 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N1 DG 1 A DG 1 1_555 B N3 DC 29 B DC 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N2 DG 1 A DG 1 1_555 B O2 DC 29 B DC 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O6 DG 1 A DG 1 1_555 B N4 DC 29 B DC 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog4 A O6 DG 2 A DG 2 1_555 B N4 DC 28 B DC 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog5 A N2 DG 3 A DG 3 1_555 B N3 DC 27 B DC 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog6 A O2 DC 4 A DC 4 1_555 B N2 DG 26 B DG 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog7 A N4 DC 18 A DC 18 1_555 B O6 DG 12 B DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog8 A N2 DG 19 A DG 19 1_555 B O2 DC 11 B DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DG MISPAIR' hydrog9 A O6 DG 20 A DG 20 1_555 B N1 DG 9 B DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog10 A O6 DG 20 A DG 20 1_555 B N4 DC 10 B DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N3 DC 21 A DC 21 1_555 B N1 DG 9 B DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A N4 DC 21 A DC 21 1_555 B O6 DG 9 B DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A O2 DC 21 A DC 21 1_555 B N2 DG 9 B DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A N1 DG 22 A DG 22 1_555 B N3 DC 8 B DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A N2 DG 22 A DG 22 1_555 B O2 DC 8 B DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A O6 DG 22 A DG 22 1_555 B N4 DC 8 B DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog17 A N1 DA 23 A DA 23 1_555 B N3 DT 7 B DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DA MISPAIR' hydrog18 A N6 DA 24 A DA 24 1_555 B N1 DA 5 B DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog19 A N1 DA 24 A DA 24 1_555 B N3 DT 6 B DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 A N1 DA 26 A DA 26 1_555 B N3 DT 4 B DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 A N6 DA 26 A DA 26 1_555 B O4 DT 4 B DT 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DT-A PAIR' hydrog22 B N3 DT 15 B DT 15 1_555 C N1 A 18 R A 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-U PAIR' hydrog23 B N1 DA 16 B DA 16 1_555 C N3 U 17 R U 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 B N3 DC 17 B DC 17 1_555 C N1 G 16 R G 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 B N4 DC 17 B DC 17 1_555 C O6 G 16 R G 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 B O2 DC 17 B DC 17 1_555 C N2 G 16 R G 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-G PAIR' hydrog27 B O2 DC 18 B DC 18 1_555 C N2 G 15 R G 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 B N3 DT 19 B DT 19 1_555 C N1 A 14 R A 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 B O4 DT 19 B DT 19 1_555 C N6 A 14 R A 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 B N3 DC 20 B DC 20 1_555 C N1 G 13 R G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 B N4 DC 20 B DC 20 1_555 C O6 G 13 R G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 B O2 DC 20 B DC 20 1_555 C N2 G 13 R G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 B N3 DT 21 B DT 21 1_555 C N1 A 12 R A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 B O4 DT 21 B DT 21 1_555 C N6 A 12 R A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 B N3 DC 22 B DC 22 1_555 C N1 G 11 R G 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 B N4 DC 22 B DC 22 1_555 C O6 G 11 R G 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 B O2 DC 22 B DC 22 1_555 C N2 G 11 R G 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 B N3 DC 23 B DC 23 1_555 C N1 G 10 R G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 B N4 DC 23 B DC 23 1_555 C O6 G 10 R G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 B O2 DC 23 B DC 23 1_555 C N2 G 10 R G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7UWE _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code J 9 MG J 1 1501 1501 MG MG . K 10 ZN J 1 1502 1501 ZN ZN . L 10 ZN J 1 1503 1502 ZN ZN . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id J _atom_site.label_entity_id 9 _atom_site.Cartn_x 135.315 _atom_site.Cartn_y 126.693 _atom_site.Cartn_z 145.643 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 13.06 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 1501 _atom_site.auth_asym_id J _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 17 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 43 _model_server_stats.query_time_ms 312 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #