data_7VBY
#
_model_server_result.job_id            4K8FdBc4J8jLNfMWkATGpA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-29 15:11:19' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7vby 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"O","auth_seq_id":905}' 
#
_entry.id    7VBY 
#
_exptl.entry_id    7VBY 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              156.308 
_entity.id                          7 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            UNDECANE 
_entity.pdbx_number_of_molecules    12 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7VBY 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7VBY 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    decameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      10 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 7 N N N 
? 7 O N N 
? 7 Q N N 
? 7 S N N 
? 7 T N N 
? 7 U N N 
? 7 Y N N 
? 7 Z N N 
? 7 AA N N 
? 7 CA N N 
? 7 FA N N 
? 7 GA N N 
#
_chem_comp.formula           'C11 H24' 
_chem_comp.formula_weight    156.308 
_chem_comp.id                UND 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              UNDECANE 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     'LIPID FRAGMENT' 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 UND sing 497 n n 
C1 H11 UND sing 498 n n 
C1 H12 UND sing 499 n n 
C1 H13 UND sing 500 n n 
C2 C3 UND sing 501 n n 
C2 H21 UND sing 502 n n 
C2 H22 UND sing 503 n n 
C3 C4 UND sing 504 n n 
C3 H31 UND sing 505 n n 
C3 H32 UND sing 506 n n 
C4 C5 UND sing 507 n n 
C4 H41 UND sing 508 n n 
C4 H42 UND sing 509 n n 
C5 C6 UND sing 510 n n 
C5 H51 UND sing 511 n n 
C5 H52 UND sing 512 n n 
C6 C7 UND sing 513 n n 
C6 H61 UND sing 514 n n 
C6 H62 UND sing 515 n n 
C7 C8 UND sing 516 n n 
C7 H71 UND sing 517 n n 
C7 H72 UND sing 518 n n 
C8 C9 UND sing 519 n n 
C8 H81 UND sing 520 n n 
C8 H82 UND sing 521 n n 
C9 C10 UND sing 522 n n 
C9 H91 UND sing 523 n n 
C9 H92 UND sing 524 n n 
C10 C11 UND sing 525 n n 
C10 H101 UND sing 526 n n 
C10 H102 UND sing 527 n n 
C11 H111 UND sing 528 n n 
C11 H112 UND sing 529 n n 
C11 H113 UND sing 530 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     7VBY 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
K 6 PC1 B 1 901 401 PC1 PC1 . 
L 6 PC1 B 1 902 402 PC1 PC1 . 
M 6 PC1 B 1 903 403 PC1 PC1 . 
N 7 UND B 1 904 405 UND UND . 
O 7 UND B 1 905 407 UND UND . 
P 6 PC1 A 1 101 406 PC1 PC1 . 
Q 7 UND A 1 102 410 UND UND . 
R 6 PC1 D 1 101 404 PC1 PC1 . 
S 7 UND F 1 101 406 UND UND . 
T 7 UND G 1 101 101 UND UND . 
U 7 UND G 1 102 413 UND UND . 
V 6 PC1 I 1 901 401 PC1 PC1 . 
W 6 PC1 I 1 902 402 PC1 PC1 . 
X 6 PC1 I 1 903 403 PC1 PC1 . 
Y 7 UND I 1 904 409 UND UND . 
Z 7 UND I 1 905 411 UND UND . 
AA 7 UND I 1 906 412 UND UND . 
BA 6 PC1 H 1 201 404 PC1 PC1 . 
CA 7 UND H 1 202 201 UND UND . 
DA 6 PC1 C 1 201 405 PC1 PC1 . 
EA 6 PC1 C 1 202 407 PC1 PC1 . 
FA 7 UND C 1 203 408 UND UND . 
GA 7 UND J 1 101 102 UND UND . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 UND . . . O 7 97.871 106.321 137.898 1 20 ? C1 UND 905 B 1 
HETATM 2 C C2 UND . . . O 7 97.485 106.107 136.459 1 20 ? C2 UND 905 B 1 
HETATM 3 C C3 UND . . . O 7 96.071 105.631 136.278 1 20 ? C3 UND 905 B 1 
HETATM 4 C C4 UND . . . O 7 95.583 105.701 134.856 1 20 ? C4 UND 905 B 1 
HETATM 5 C C5 UND . . . O 7 94.396 104.824 134.567 1 20 ? C5 UND 905 B 1 
HETATM 6 C C6 UND . . . O 7 93.775 105.056 133.216 1 20 ? C6 UND 905 B 1 
HETATM 7 C C7 UND . . . O 7 93.086 103.849 132.642 1 20 ? C7 UND 905 B 1 
HETATM 8 C C8 UND . . . O 7 92.286 104.126 131.398 1 20 ? C8 UND 905 B 1 
HETATM 9 C C9 UND . . . O 7 92.112 102.927 130.505 1 20 ? C9 UND 905 B 1 
HETATM 10 C C10 UND . . . O 7 91.077 103.102 129.429 1 20 ? C10 UND 905 B 1 
HETATM 11 C C11 UND . . . O 7 91.187 102.081 128.323 1 20 ? C11 UND 905 B 1 
HETATM 12 H H11 UND . . . O 7 98.838 106.409 137.966 1 20 ? H11 UND 905 B 1 
HETATM 13 H H12 UND . . . O 7 97.578 105.562 138.43 1 20 ? H12 UND 905 B 1 
HETATM 14 H H13 UND . . . O 7 97.449 107.132 138.231 1 20 ? H13 UND 905 B 1 
HETATM 15 H H21 UND . . . O 7 98.094 105.447 136.062 1 20 ? H21 UND 905 B 1 
HETATM 16 H H22 UND . . . O 7 97.599 106.952 135.971 1 20 ? H22 UND 905 B 1 
HETATM 17 H H31 UND . . . O 7 95.48 106.175 136.841 1 20 ? H31 UND 905 B 1 
HETATM 18 H H32 UND . . . O 7 96.009 104.703 136.589 1 20 ? H32 UND 905 B 1 
HETATM 19 H H41 UND . . . O 7 96.317 105.444 134.259 1 20 ? H41 UND 905 B 1 
HETATM 20 H H42 UND . . . O 7 95.344 106.63 134.652 1 20 ? H42 UND 905 B 1 
HETATM 21 H H51 UND . . . O 7 93.715 104.977 135.256 1 20 ? H51 UND 905 B 1 
HETATM 22 H H52 UND . . . O 7 94.676 103.886 134.629 1 20 ? H52 UND 905 B 1 
HETATM 23 H H61 UND . . . O 7 94.474 105.344 132.592 1 20 ? H61 UND 905 B 1 
HETATM 24 H H62 UND . . . O 7 93.123 105.784 133.291 1 20 ? H62 UND 905 B 1 
HETATM 25 H H71 UND . . . O 7 92.488 103.475 133.323 1 20 ? H71 UND 905 B 1 
HETATM 26 H H72 UND . . . O 7 93.763 103.17 132.436 1 20 ? H72 UND 905 B 1 
HETATM 27 H H81 UND . . . O 7 92.73 104.836 130.888 1 20 ? H81 UND 905 B 1 
HETATM 28 H H82 UND . . . O 7 91.401 104.455 131.661 1 20 ? H82 UND 905 B 1 
HETATM 29 H H91 UND . . . O 7 91.862 102.157 131.058 1 20 ? H91 UND 905 B 1 
HETATM 30 H H92 UND . . . O 7 92.973 102.723 130.083 1 20 ? H92 UND 905 B 1 
HETATM 31 H H101 UND . . . O 7 91.169 104 129.043 1 20 ? H101 UND 905 B 1 
HETATM 32 H H102 UND . . . O 7 90.186 103.038 129.834 1 20 ? H102 UND 905 B 1 
HETATM 33 H H111 UND . . . O 7 90.369 102.084 127.796 1 20 ? H111 UND 905 B 1 
HETATM 34 H H112 UND . . . O 7 91.32 101.197 128.707 1 20 ? H112 UND 905 B 1 
HETATM 35 H H113 UND . . . O 7 91.941 102.302 127.75 1 20 ? H113 UND 905 B 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              136 
_model_server_stats.parse_time_ms           16 
_model_server_stats.create_model_time_ms    30 
_model_server_stats.query_time_ms           395 
_model_server_stats.encode_time_ms          3 
_model_server_stats.element_count           35 
#