data_7VCS # _model_server_result.job_id fbpRoDrrW1iK4T1Rzrb0UQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-29 17:20:30' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7vcs # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"OA","auth_seq_id":902}' # _entry.id 7VCS # _exptl.entry_id 7VCS _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 12 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 7VCS _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7VCS _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 N N N ? 3 Q N N ? 3 T N N ? 3 W N N ? 3 Z N N ? 3 CA N N ? 3 FA N N ? 3 IA N N ? 3 LA N N ? 3 OA N N ? 3 RA N N ? 3 UA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OG1 THR 252 A THR 252 1_555 N MG MG . A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.104 ? metalc ? metalc2 M O2G AGS . A AGS 901 1_555 N MG MG . A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc3 M O1B AGS . A AGS 901 1_555 N MG MG . A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? metalc ? metalc4 B OG1 THR 252 B THR 252 1_555 Q MG MG . B MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? metalc ? metalc5 P O2G AGS . B AGS 901 1_555 Q MG MG . B MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? metalc ? metalc6 P O1B AGS . B AGS 901 1_555 Q MG MG . B MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? metalc ? metalc7 C OG1 THR 252 C THR 252 1_555 T MG MG . C MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? metalc ? metalc8 S O2G AGS . C AGS 901 1_555 T MG MG . C MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? metalc ? metalc9 S O1B AGS . C AGS 901 1_555 T MG MG . C MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? metalc ? metalc10 D OG1 THR 252 D THR 252 1_555 W MG MG . D MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? metalc ? metalc11 V O2G AGS . D AGS 901 1_555 W MG MG . D MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? metalc ? metalc12 V O1B AGS . D AGS 901 1_555 W MG MG . D MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? metalc ? metalc13 E OG1 THR 252 E THR 252 1_555 Z MG MG . E MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? metalc ? metalc14 Y O2G AGS . E AGS 901 1_555 Z MG MG . E MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? metalc ? metalc15 Y O1B AGS . E AGS 901 1_555 Z MG MG . E MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? metalc ? metalc16 F OG1 THR 252 F THR 252 1_555 CA MG MG . F MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? metalc ? metalc17 BA O2G AGS . F AGS 901 1_555 CA MG MG . F MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? metalc ? metalc18 BA O1B AGS . F AGS 901 1_555 CA MG MG . F MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? metalc ? metalc19 G OG1 THR 252 G THR 252 1_555 FA MG MG . G MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? metalc ? metalc20 EA O2G AGS . G AGS 901 1_555 FA MG MG . G MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc21 EA O1B AGS . G AGS 901 1_555 FA MG MG . G MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? metalc ? metalc22 H OG1 THR 252 H THR 252 1_555 IA MG MG . H MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.104 ? metalc ? metalc23 HA O2G AGS . H AGS 901 1_555 IA MG MG . H MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc24 HA O1B AGS . H AGS 901 1_555 IA MG MG . H MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? metalc ? metalc25 I OG1 THR 252 I THR 252 1_555 LA MG MG . I MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.104 ? metalc ? metalc26 KA O2G AGS . I AGS 901 1_555 LA MG MG . I MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? metalc ? metalc27 KA O1B AGS . I AGS 901 1_555 LA MG MG . I MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? metalc ? metalc28 J OG1 THR 252 J THR 252 1_555 OA MG MG . J MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? metalc ? metalc29 NA O2G AGS . J AGS 901 1_555 OA MG MG . J MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? metalc ? metalc30 NA O1B AGS . J AGS 901 1_555 OA MG MG . J MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? metalc ? metalc31 K OG1 THR 252 K THR 252 1_555 RA MG MG . K MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.104 ? metalc ? metalc32 QA O2G AGS . K AGS 901 1_555 RA MG MG . K MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc33 QA O1B AGS . K AGS 901 1_555 RA MG MG . K MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? metalc ? metalc34 L OG1 THR 252 L THR 252 1_555 UA MG MG . L MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.104 ? metalc ? metalc35 TA O2G AGS . L AGS 901 1_555 UA MG MG . L MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? metalc ? metalc36 TA O1B AGS . L AGS 901 1_555 UA MG MG . L MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7VCS _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code M 2 AGS A 1 901 807 AGS AGS . N 3 MG A 1 902 808 MG MG . O 2 AGS A 1 903 809 AGS AGS . P 2 AGS B 1 901 807 AGS AGS . Q 3 MG B 1 902 808 MG MG . R 2 AGS B 1 903 809 AGS AGS . S 2 AGS C 1 901 807 AGS AGS . T 3 MG C 1 902 808 MG MG . U 2 AGS C 1 903 809 AGS AGS . V 2 AGS D 1 901 807 AGS AGS . W 3 MG D 1 902 808 MG MG . X 2 AGS D 1 903 809 AGS AGS . Y 2 AGS E 1 901 807 AGS AGS . Z 3 MG E 1 902 808 MG MG . AA 2 AGS E 1 903 809 AGS AGS . BA 2 AGS F 1 901 807 AGS AGS . CA 3 MG F 1 902 808 MG MG . DA 2 AGS F 1 903 809 AGS AGS . EA 2 AGS G 1 901 807 AGS AGS . FA 3 MG G 1 902 808 MG MG . GA 2 AGS G 1 903 809 AGS AGS . HA 2 AGS H 1 901 807 AGS AGS . IA 3 MG H 1 902 808 MG MG . JA 2 AGS H 1 903 809 AGS AGS . KA 2 AGS I 1 901 807 AGS AGS . LA 3 MG I 1 902 808 MG MG . MA 2 AGS I 1 903 809 AGS AGS . NA 2 AGS J 1 901 807 AGS AGS . OA 3 MG J 1 902 808 MG MG . PA 2 AGS J 1 903 809 AGS AGS . QA 2 AGS K 1 901 807 AGS AGS . RA 3 MG K 1 902 808 MG MG . SA 2 AGS K 1 903 809 AGS AGS . TA 2 AGS L 1 901 807 AGS AGS . UA 3 MG L 1 902 808 MG MG . VA 2 AGS L 1 903 809 AGS AGS . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id OA _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 177.927 _atom_site.Cartn_y 131.53 _atom_site.Cartn_z 90.189 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 88.87 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 902 _atom_site.auth_asym_id J _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 28 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 397 _model_server_stats.query_time_ms 339 _model_server_stats.encode_time_ms 11 _model_server_stats.element_count 1 #