data_7VCX
#
_model_server_result.job_id            8-UXHSHpQBffu04QQ8X73A 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-18 15:25:14' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7vcx 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"N","auth_seq_id":904}' 
#
_entry.id    7VCX 
#
_exptl.entry_id    7VCX 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    12 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7VCX 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7VCX 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    hexameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      6 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 H N N 
? 3 J N N 
? 3 L N N 
? 3 N N N 
? 3 P N N 
? 3 R N N 
? 3 T N N 
? 3 V N N 
? 3 X N N 
? 3 Z N N 
? 3 BA N N 
? 3 DA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OG1 THR 252 A THR 252 1_555 H MG MG . A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? 
metalc ? metalc2 A OG1 THR 525 A THR 525 1_555 J MG MG . A MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? 
metalc ? metalc3 G O2G AGS . A AGS 901 1_555 H MG MG . A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? 
metalc ? metalc4 G O2B AGS . A AGS 901 1_555 H MG MG . A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? 
metalc ? metalc5 I O2G AGS . A AGS 903 1_555 J MG MG . A MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? 
metalc ? metalc6 I O1B AGS . A AGS 903 1_555 J MG MG . A MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? 
metalc ? metalc7 I O1A AGS . A AGS 903 1_555 J MG MG . A MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.704 ? 
metalc ? metalc8 B OG1 THR 252 B THR 252 1_555 L MG MG . B MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? 
metalc ? metalc9 B OG1 THR 525 B THR 525 1_555 N MG MG . B MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? 
metalc ? metalc10 K O2G AGS . B AGS 901 1_555 L MG MG . B MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? 
metalc ? metalc11 K O2B AGS . B AGS 901 1_555 L MG MG . B MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? 
metalc ? metalc12 M O2G AGS . B AGS 903 1_555 N MG MG . B MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? 
metalc ? metalc13 M O1B AGS . B AGS 903 1_555 N MG MG . B MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? 
metalc ? metalc14 M O1A AGS . B AGS 903 1_555 N MG MG . B MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.704 ? 
metalc ? metalc15 C OG1 THR 252 C THR 252 1_555 P MG MG . C MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? 
metalc ? metalc16 C OG1 THR 525 C THR 525 1_555 R MG MG . C MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? 
metalc ? metalc17 O O2G AGS . C AGS 901 1_555 P MG MG . C MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? 
metalc ? metalc18 O O2B AGS . C AGS 901 1_555 P MG MG . C MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? 
metalc ? metalc19 Q O2G AGS . C AGS 903 1_555 R MG MG . C MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? 
metalc ? metalc20 Q O1B AGS . C AGS 903 1_555 R MG MG . C MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? 
metalc ? metalc21 Q O1A AGS . C AGS 903 1_555 R MG MG . C MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.704 ? 
metalc ? metalc22 D OG1 THR 252 D THR 252 1_555 T MG MG . D MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? 
metalc ? metalc23 D OG1 THR 525 D THR 525 1_555 V MG MG . D MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? 
metalc ? metalc24 S O2G AGS . D AGS 901 1_555 T MG MG . D MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? 
metalc ? metalc25 S O2B AGS . D AGS 901 1_555 T MG MG . D MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? 
metalc ? metalc26 U O2G AGS . D AGS 903 1_555 V MG MG . D MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? 
metalc ? metalc27 U O1B AGS . D AGS 903 1_555 V MG MG . D MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? 
metalc ? metalc28 U O1A AGS . D AGS 903 1_555 V MG MG . D MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.704 ? 
metalc ? metalc29 E OG1 THR 252 E THR 252 1_555 X MG MG . E MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? 
metalc ? metalc30 E OG1 THR 525 E THR 525 1_555 Z MG MG . E MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? 
metalc ? metalc31 W O2G AGS . E AGS 901 1_555 X MG MG . E MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? 
metalc ? metalc32 W O2B AGS . E AGS 901 1_555 X MG MG . E MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? 
metalc ? metalc33 Y O2G AGS . E AGS 903 1_555 Z MG MG . E MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? 
metalc ? metalc34 Y O1B AGS . E AGS 903 1_555 Z MG MG . E MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? 
metalc ? metalc35 Y O1A AGS . E AGS 903 1_555 Z MG MG . E MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.704 ? 
metalc ? metalc36 F OG1 THR 252 F THR 252 1_555 BA MG MG . F MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? 
metalc ? metalc37 F OG1 THR 525 F THR 525 1_555 DA MG MG . F MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? 
metalc ? metalc38 AA O2G AGS . F AGS 901 1_555 BA MG MG . F MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? 
metalc ? metalc39 AA O2B AGS . F AGS 901 1_555 BA MG MG . F MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? 
metalc ? metalc40 CA O2G AGS . F AGS 903 1_555 DA MG MG . F MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? 
metalc ? metalc41 CA O1B AGS . F AGS 903 1_555 DA MG MG . F MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? 
metalc ? metalc42 CA O1A AGS . F AGS 903 1_555 DA MG MG . F MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.704 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     7VCX 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
G 2 AGS A 1 901 807 AGS AGS . 
H 3 MG A 1 902 808 MG MG . 
I 2 AGS A 1 903 809 AGS AGS . 
J 3 MG A 1 904 810 MG MG . 
K 2 AGS B 1 901 807 AGS AGS . 
L 3 MG B 1 902 808 MG MG . 
M 2 AGS B 1 903 809 AGS AGS . 
N 3 MG B 1 904 810 MG MG . 
O 2 AGS C 1 901 807 AGS AGS . 
P 3 MG C 1 902 808 MG MG . 
Q 2 AGS C 1 903 809 AGS AGS . 
R 3 MG C 1 904 810 MG MG . 
S 2 AGS D 1 901 807 AGS AGS . 
T 3 MG D 1 902 808 MG MG . 
U 2 AGS D 1 903 809 AGS AGS . 
V 3 MG D 1 904 810 MG MG . 
W 2 AGS E 1 901 807 AGS AGS . 
X 3 MG E 1 902 808 MG MG . 
Y 2 AGS E 1 903 809 AGS AGS . 
Z 3 MG E 1 904 810 MG MG . 
AA 2 AGS F 1 901 807 AGS AGS . 
BA 3 MG F 1 902 808 MG MG . 
CA 2 AGS F 1 903 809 AGS AGS . 
DA 3 MG F 1 904 810 MG MG . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MG 
_atom_site.label_atom_id         MG 
_atom_site.label_comp_id         MG 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         N 
_atom_site.label_entity_id       3 
_atom_site.Cartn_x               194.023 
_atom_site.Cartn_y               155.306 
_atom_site.Cartn_z               144.815 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        29.11 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MG 
_atom_site.auth_comp_id          MG 
_atom_site.auth_seq_id           904 
_atom_site.auth_asym_id          B 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              19 
_model_server_stats.parse_time_ms           9 
_model_server_stats.create_model_time_ms    59 
_model_server_stats.query_time_ms           306 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           1 
#