data_7VXU
#
_model_server_result.job_id            Dewlwl8FrQfB8JieX4sqYg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-21 17:14:01' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          7vxu 
#
_model_server_params.name     atom_site 
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#
_entry.id    7VXU 
#
_exptl.entry_id    7VXU 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              351.64 
_entity.id                          19 
_entity.src_method                  syn 
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_entity.pdbx_description            'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
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_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    octadecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      18 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 19 S N N 
? 19 U N N 
? 19 V N N 
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? 19 BA N N 
? 19 CA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 E SG CYS 24 F CYS 24 1_555 E SG CYS 58 F CYS 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
covale ? covale1 P C HIS 127 Q HIS 117 1_555 P N 2MR 128 Q 2MR 118 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale2 P C 2MR 128 Q 2MR 118 1_555 P N GLY 129 Q GLY 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
metalc ? metalc1 A SG CYS 379 A CYS 379 1_555 S FE4 SF4 . A SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 382 A CYS 382 1_555 S FE1 SF4 . A SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 385 A CYS 385 1_555 S FE3 SF4 . A SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? 
metalc ? metalc4 A SG CYS 425 A CYS 425 1_555 S FE2 SF4 . A SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? 
metalc ? metalc5 B SG CYS 113 B CYS 113 1_555 U FE1 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? 
metalc ? metalc6 B SG CYS 116 B CYS 116 1_555 U FE2 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? 
metalc ? metalc7 B SG CYS 119 B CYS 119 1_555 U FE3 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? 
metalc ? metalc8 B SG CYS 123 B CYS 123 1_555 V FE1 SF4 . B SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc9 B SG CYS 152 B CYS 152 1_555 V FE2 SF4 . B SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? 
metalc ? metalc10 B SG CYS 155 B CYS 155 1_555 V FE4 SF4 . B SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? 
metalc ? metalc11 B SG CYS 158 B CYS 158 1_555 V FE3 SF4 . B SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? 
metalc ? metalc12 B SG CYS 162 B CYS 162 1_555 U FE4 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc13 C SG CYS 71 C CYS 71 1_555 W FE3 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? 
metalc ? metalc14 C SG CYS 71 C CYS 71 1_555 W FE2 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.542 ? 
metalc ? metalc15 C SG CYS 72 C CYS 72 1_555 W FE2 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? 
metalc ? metalc16 C SG CYS 136 C CYS 136 1_555 W FE4 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? 
metalc ? metalc17 C SG CYS 166 C CYS 166 1_555 W FE1 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? 
metalc ? metalc18 W FE3 SF4 . C SF4 301 1_555 P NE2 HIS 233 Q HIS 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.152 ? 
metalc ? metalc19 L SG CYS 64 M CYS 64 1_555 DA FE2 FES . M FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? 
metalc ? metalc20 L SG CYS 75 M CYS 75 1_555 DA FE2 FES . M FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? 
metalc ? metalc21 L SG CYS 78 M CYS 78 1_555 DA FE1 FES . M FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? 
metalc ? metalc22 L SG CYS 92 M CYS 92 1_555 DA FE1 FES . M FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc23 L NE2 HIS 124 M HIS 124 1_555 BA FE3 SF4 . M SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
metalc ? metalc24 L SG CYS 128 M CYS 128 1_555 BA FE2 SF4 . M SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? 
metalc ? metalc25 L SG CYS 131 M CYS 131 1_555 BA FE1 SF4 . M SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? 
metalc ? metalc26 L OE1 GLN 133 M GLN 133 1_555 EA MG MG . M MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? 
metalc ? metalc27 L SG CYS 137 M CYS 137 1_555 BA FE4 SF4 . M SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? 
metalc ? metalc28 L SG CYS 176 M CYS 176 1_555 CA FE4 SF4 . M SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc29 L SG CYS 179 M CYS 179 1_555 CA FE1 SF4 . M SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? 
metalc ? metalc30 L SG CYS 182 M CYS 182 1_555 CA FE3 SF4 . M SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? 
metalc ? metalc31 L O ILE 223 M ILE 223 1_555 EA MG MG . M MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.929 ? 
metalc ? metalc32 L SG CYS 226 M CYS 226 1_555 CA FE2 SF4 . M SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc33 L O CYS 226 M CYS 226 1_555 EA MG MG . M MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.928 ? 
metalc ? metalc34 L O VAL 228 M VAL 228 1_555 EA MG MG . M MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.744 ? 
metalc ? metalc35 L O LEU 231 M LEU 231 1_555 EA MG MG . M MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.863 ? 
metalc ? metalc36 N SG CYS 135 O CYS 135 1_555 GA FE1 FES . O FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? 
metalc ? metalc37 N SG CYS 140 O CYS 140 1_555 GA FE1 FES . O FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? 
metalc ? metalc38 N SG CYS 176 O CYS 176 1_555 GA FE2 FES . O FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? 
metalc ? metalc39 N SG CYS 180 O CYS 180 1_555 GA FE2 FES . O FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? 
metalc ? metalc40 Q SG CYS 86 T CYS 86 1_555 HA ZN ZN . T ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? 
metalc ? metalc41 Q NE2 HIS 95 T HIS 95 1_555 HA ZN ZN . T ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? 
metalc ? metalc42 Q SG CYS 111 T CYS 111 1_555 HA ZN ZN . T ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
#
_chem_comp.formula           'Fe4 S4' 
_chem_comp.formula_weight    351.64 
_chem_comp.id                SF4 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     7VXU 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
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loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
S 19 SF4 A 1 501 501 SF4 SF4 . 
T 20 FMN A 1 502 502 FMN FMN . 
U 19 SF4 B 1 301 301 SF4 SF4 . 
V 19 SF4 B 1 302 302 SF4 SF4 . 
W 19 SF4 C 1 301 301 SF4 SF4 . 
X 21 PEE C 1 302 311 PEE PEE . 
Y 22 PLX C 1 303 312 PLX PLX . 
Z 23 8Q1 G 1 201 201 8Q1 8Q1 . 
AA 24 NDP J 1 401 401 NDP NDP . 
BA 19 SF4 M 1 801 801 SF4 SF4 . 
CA 19 SF4 M 1 802 802 SF4 SF4 . 
DA 25 FES M 1 803 803 FES FES . 
EA 26 MG M 1 804 805 MG MG . 
FA 27 CDL N 1 201 202 CDL CDL . 
GA 25 FES O 1 301 301 FES FES . 
HA 28 ZN T 1 201 150 ZN ZN . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 FE FE1 SF4 . . . BA 19 119.66 126.317 232.085 1 62.58 ? FE1 SF4 801 M 1 
HETATM 2 FE FE2 SF4 . . . BA 19 121.198 124.56 230.659 1 69.05 ? FE2 SF4 801 M 1 
HETATM 3 FE FE3 SF4 . . . BA 19 120.275 123.867 233.136 1 65.21 ? FE3 SF4 801 M 1 
HETATM 4 FE FE4 SF4 . . . BA 19 122.218 125.775 232.888 1 53.35 ? FE4 SF4 801 M 1 
HETATM 5 S S1 SF4 . . . BA 19 122.388 123.571 232.333 1 48.64 ? S1 SF4 801 M 1 
HETATM 6 S S2 SF4 . . . BA 19 120.362 125.876 234.206 1 51.1 ? S2 SF4 801 M 1 
HETATM 7 S S3 SF4 . . . BA 19 121.579 126.788 230.949 1 58.13 ? S3 SF4 801 M 1 
HETATM 8 S S4 SF4 . . . BA 19 119.022 124.283 231.28 1 63.81 ? S4 SF4 801 M 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              16 
_model_server_stats.parse_time_ms           13 
_model_server_stats.create_model_time_ms    41 
_model_server_stats.query_time_ms           298 
_model_server_stats.encode_time_ms          7 
_model_server_stats.element_count           8 
#