data_7VXU # _model_server_result.job_id d1VWx9oZJM_d3WRb4W756w _model_server_result.datetime_utc '2024-12-30 18:07:03' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 7vxu # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"EA","auth_seq_id":804}' # _entry.id 7VXU # _exptl.entry_id 7VXU _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 26 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 18 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 26 _struct_asym.id EA _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 E SG CYS 24 F CYS 24 1_555 E SG CYS 58 F CYS 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? covale ? covale1 P C HIS 127 Q HIS 117 1_555 P N 2MR 128 Q 2MR 118 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale2 P C 2MR 128 Q 2MR 118 1_555 P N GLY 129 Q GLY 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? metalc ? metalc1 A SG CYS 379 A CYS 379 1_555 S FE4 SF4 . A SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 382 A CYS 382 1_555 S FE1 SF4 . A SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 385 A CYS 385 1_555 S FE3 SF4 . A SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 425 A CYS 425 1_555 S FE2 SF4 . A SF4 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? metalc ? metalc5 B SG CYS 113 B CYS 113 1_555 U FE1 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc6 B SG CYS 116 B CYS 116 1_555 U FE2 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? metalc ? metalc7 B SG CYS 119 B CYS 119 1_555 U FE3 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? metalc ? metalc8 B SG CYS 123 B CYS 123 1_555 V FE1 SF4 . B SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc9 B SG CYS 152 B CYS 152 1_555 V FE2 SF4 . B SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? metalc ? metalc10 B SG CYS 155 B CYS 155 1_555 V FE4 SF4 . B SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc ? metalc11 B SG CYS 158 B CYS 158 1_555 V FE3 SF4 . B SF4 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc12 B SG CYS 162 B CYS 162 1_555 U FE4 SF4 . B SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc13 C SG CYS 71 C CYS 71 1_555 W FE3 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? metalc ? metalc14 C SG CYS 71 C CYS 71 1_555 W FE2 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.542 ? metalc ? metalc15 C SG CYS 72 C CYS 72 1_555 W FE2 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? metalc ? metalc16 C SG CYS 136 C CYS 136 1_555 W FE4 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? metalc ? metalc17 C SG CYS 166 C CYS 166 1_555 W FE1 SF4 . C SF4 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc18 W FE3 SF4 . C SF4 301 1_555 P NE2 HIS 233 Q HIS 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.152 ? metalc ? metalc19 L SG CYS 64 M CYS 64 1_555 DA FE2 FES . M FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? metalc ? metalc20 L SG CYS 75 M CYS 75 1_555 DA FE2 FES . M FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? metalc ? metalc21 L SG CYS 78 M CYS 78 1_555 DA FE1 FES . M FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? metalc ? metalc22 L SG CYS 92 M CYS 92 1_555 DA FE1 FES . M FES 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? metalc ? metalc23 L NE2 HIS 124 M HIS 124 1_555 BA FE3 SF4 . M SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? metalc ? metalc24 L SG CYS 128 M CYS 128 1_555 BA FE2 SF4 . M SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? metalc ? metalc25 L SG CYS 131 M CYS 131 1_555 BA FE1 SF4 . M SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? metalc ? metalc26 L OE1 GLN 133 M GLN 133 1_555 EA MG MG . M MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? metalc ? metalc27 L SG CYS 137 M CYS 137 1_555 BA FE4 SF4 . M SF4 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? metalc ? metalc28 L SG CYS 176 M CYS 176 1_555 CA FE4 SF4 . M SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc29 L SG CYS 179 M CYS 179 1_555 CA FE1 SF4 . M SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? metalc ? metalc30 L SG CYS 182 M CYS 182 1_555 CA FE3 SF4 . M SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? metalc ? metalc31 L O ILE 223 M ILE 223 1_555 EA MG MG . M MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.929 ? metalc ? metalc32 L SG CYS 226 M CYS 226 1_555 CA FE2 SF4 . M SF4 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc33 L O CYS 226 M CYS 226 1_555 EA MG MG . M MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.928 ? metalc ? metalc34 L O VAL 228 M VAL 228 1_555 EA MG MG . M MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.744 ? metalc ? metalc35 L O LEU 231 M LEU 231 1_555 EA MG MG . M MG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.863 ? metalc ? metalc36 N SG CYS 135 O CYS 135 1_555 GA FE1 FES . O FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? metalc ? metalc37 N SG CYS 140 O CYS 140 1_555 GA FE1 FES . O FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? metalc ? metalc38 N SG CYS 176 O CYS 176 1_555 GA FE2 FES . O FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? metalc ? metalc39 N SG CYS 180 O CYS 180 1_555 GA FE2 FES . O FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc40 Q SG CYS 86 T CYS 86 1_555 HA ZN ZN . T ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc41 Q NE2 HIS 95 T HIS 95 1_555 HA ZN ZN . T ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc42 Q SG CYS 111 T CYS 111 1_555 HA ZN ZN . T ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 7VXU _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code S 19 SF4 A 1 501 501 SF4 SF4 . T 20 FMN A 1 502 502 FMN FMN . U 19 SF4 B 1 301 301 SF4 SF4 . V 19 SF4 B 1 302 302 SF4 SF4 . W 19 SF4 C 1 301 301 SF4 SF4 . X 21 PEE C 1 302 311 PEE PEE . Y 22 PLX C 1 303 312 PLX PLX . Z 23 8Q1 G 1 201 201 8Q1 8Q1 . AA 24 NDP J 1 401 401 NDP NDP . BA 19 SF4 M 1 801 801 SF4 SF4 . CA 19 SF4 M 1 802 802 SF4 SF4 . DA 25 FES M 1 803 803 FES FES . EA 26 MG M 1 804 805 MG MG . FA 27 CDL N 1 201 202 CDL CDL . GA 25 FES O 1 301 301 FES FES . HA 28 ZN T 1 201 150 ZN ZN . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id EA _atom_site.label_entity_id 26 _atom_site.Cartn_x 120.332 _atom_site.Cartn_y 132.419 _atom_site.Cartn_z 237.89 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 18.97 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 804 _atom_site.auth_asym_id M _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 17 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 74 _model_server_stats.query_time_ms 338 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #