data_7W2B
#
_model_server_result.job_id            jbZLPpI3xJMPF_SAC1EWSQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-17 00:47:26' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          7w2b 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"GA","auth_seq_id":303}' 
#
_entry.id    7W2B 
#
_exptl.entry_id    7W2B 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              292.369 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'octyl beta-D-glucopyranoside' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    9 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          92.44 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            7W2B 
_cell.length_a            86.718 
_cell.length_b            148.45 
_cell.length_c            172.137 
_cell.Z_PDB               24 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 7W2B 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? trimeric 3 author_defined_assembly 1 
? trimeric 3 author_defined_assembly 2 
? trimeric 3 author_defined_assembly 3 
? trimeric 3 author_defined_assembly 4 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,M,N,O,P,Q,R,S,T,U 1 1 
D,E,F,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA 2 1 
G,H,I,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA 3 1 
J,K,L,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA 4 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 O N N 
? 3 R N N 
? 3 U N N 
? 3 X N N 
? 3 AA N N 
? 3 DA N N 
? 3 GA N N 
? 3 JA N N 
? 3 OA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A SG CYS 95 A CYS 91 1_555 M AU AU . A AU 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.574 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 95 A CYS 91 1_555 N AU AU . A AU 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? 
metalc ? metalc3 B SG CYS 95 C CYS 91 1_555 P AU AU . C AU 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.52 ? 
metalc ? metalc4 B SG CYS 95 C CYS 91 1_555 Q AU AU . C AU 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.697 ? 
metalc ? metalc5 C SG CYS 95 E CYS 91 1_555 S AU AU . E AU 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? 
metalc ? metalc6 C SG CYS 95 E CYS 91 1_555 T AU AU . E AU 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? 
metalc ? metalc7 D SG CYS 95 D CYS 91 1_555 V AU AU . D AU 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.452 ? 
metalc ? metalc8 D SG CYS 95 D CYS 91 1_555 W AU AU . D AU 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.601 ? 
metalc ? metalc9 E SG CYS 95 F CYS 91 1_555 Y AU AU . F AU 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? 
metalc ? metalc10 E SG CYS 95 F CYS 91 1_555 Z AU AU . F AU 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? 
metalc ? metalc11 F SG CYS 95 B CYS 91 1_555 BA AU AU . B AU 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.517 ? 
metalc ? metalc12 F SG CYS 95 B CYS 91 1_555 CA AU AU . B AU 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.428 ? 
metalc ? metalc13 G SG CYS 95 G CYS 91 1_555 EA AU AU . G AU 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? 
metalc ? metalc14 G SG CYS 95 G CYS 91 1_555 FA AU AU . G AU 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? 
metalc ? metalc15 H SG CYS 95 H CYS 91 1_555 HA AU AU . H AU 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.613 ? 
metalc ? metalc16 H SG CYS 95 H CYS 91 1_555 IA AU AU . H AU 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.618 ? 
metalc ? metalc17 I SG CYS 95 I CYS 91 1_555 KA AU AU . I AU 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.713 ? 
metalc ? metalc18 I SG CYS 95 I CYS 91 1_555 LA AU AU . I AU 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? 
metalc ? metalc19 J SG CYS 95 J CYS 91 1_555 MA AU AU . J AU 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.891 ? 
metalc ? metalc20 J SG CYS 95 J CYS 91 1_555 NA AU AU . J AU 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? 
metalc ? metalc21 K SG CYS 95 K CYS 91 1_555 PA AU AU . K AU 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.559 ? 
metalc ? metalc22 K SG CYS 95 K CYS 91 1_555 QA AU AU . K AU 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.665 ? 
metalc ? metalc23 L SG CYS 95 L CYS 91 1_555 RA AU AU . L AU 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.522 ? 
metalc ? metalc24 L SG CYS 95 L CYS 91 1_555 SA AU AU . L AU 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.587 ? 
#
_chem_comp.formula           'C14 H28 O6' 
_chem_comp.formula_weight    292.369 
_chem_comp.id                BOG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              'octyl beta-D-glucopyranoside' 
_chem_comp.type              d-saccharide 
_chem_comp.pdbx_synonyms     'Beta-Octylglucoside;octyl beta-D-glucoside;octyl D-glucoside;octyl glucoside' 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 BOG sing 70 n n 
C1 C2 BOG sing 71 n n 
C1 O5 BOG sing 72 n n 
C1 H1 BOG sing 73 n n 
O1 C1' BOG sing 74 n n 
C2 O2 BOG sing 75 n n 
C2 C3 BOG sing 76 n n 
C2 H2 BOG sing 77 n n 
O2 HO2 BOG sing 78 n n 
C3 O3 BOG sing 79 n n 
C3 C4 BOG sing 80 n n 
C3 H3 BOG sing 81 n n 
O3 HO3 BOG sing 82 n n 
C4 O4 BOG sing 83 n n 
C4 C5 BOG sing 84 n n 
C4 H4 BOG sing 85 n n 
O4 HO4 BOG sing 86 n n 
C5 O5 BOG sing 87 n n 
C5 C6 BOG sing 88 n n 
C5 H5 BOG sing 89 n n 
C6 O6 BOG sing 90 n n 
C6 H61 BOG sing 91 n n 
C6 H62 BOG sing 92 n n 
O6 HO6 BOG sing 93 n n 
C1' C2' BOG sing 94 n n 
C1' "H1'1" BOG sing 95 n n 
C1' "H1'2" BOG sing 96 n n 
C2' C3' BOG sing 97 n n 
C2' "H2'1" BOG sing 98 n n 
C2' "H2'2" BOG sing 99 n n 
C3' C4' BOG sing 100 n n 
C3' "H3'1" BOG sing 101 n n 
C3' "H3'2" BOG sing 102 n n 
C4' C5' BOG sing 103 n n 
C4' "H4'1" BOG sing 104 n n 
C4' "H4'2" BOG sing 105 n n 
C5' C6' BOG sing 106 n n 
C5' "H5'1" BOG sing 107 n n 
C5' "H5'2" BOG sing 108 n n 
C6' C7' BOG sing 109 n n 
C6' "H6'1" BOG sing 110 n n 
C6' "H6'2" BOG sing 111 n n 
C7' C8' BOG sing 112 n n 
C7' "H7'1" BOG sing 113 n n 
C7' "H7'2" BOG sing 114 n n 
C8' "H8'1" BOG sing 115 n n 
C8' "H8'2" BOG sing 116 n n 
C8' "H8'3" BOG sing 117 n n 
#
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id            BOG 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier         b-octylglucoside 
_pdbx_chem_comp_identifier.type               'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' 
_pdbx_chem_comp_identifier.program            PDB-CARE 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version    1 
#
_atom_sites.entry_id                     7W2B 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.011532 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000491 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.006736 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.005815 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
M 2 AU A 1 301 301 AU AU . 
N 2 AU A 1 302 302 AU AU . 
O 3 BOG A 1 303 501 BOG BOG . 
P 2 AU C 1 301 301 AU AU . 
Q 2 AU C 1 302 302 AU AU . 
R 3 BOG C 1 303 501 BOG BOG . 
S 2 AU E 1 301 301 AU AU . 
T 2 AU E 1 302 302 AU AU . 
U 3 BOG E 1 303 501 BOG BOG . 
V 2 AU D 1 301 301 AU AU . 
W 2 AU D 1 302 302 AU AU . 
X 3 BOG D 1 303 501 BOG BOG . 
Y 2 AU F 1 301 301 AU AU . 
Z 2 AU F 1 302 302 AU AU . 
AA 3 BOG F 1 303 501 BOG BOG . 
BA 2 AU B 1 301 301 AU AU . 
CA 2 AU B 1 302 302 AU AU . 
DA 3 BOG B 1 303 501 BOG BOG . 
EA 2 AU G 1 301 301 AU AU . 
FA 2 AU G 1 302 302 AU AU . 
GA 3 BOG G 1 303 501 BOG BOG . 
HA 2 AU H 1 301 301 AU AU . 
IA 2 AU H 1 302 302 AU AU . 
JA 3 BOG H 1 303 501 BOG BOG . 
KA 2 AU I 1 301 301 AU AU . 
LA 2 AU I 1 302 302 AU AU . 
MA 2 AU J 1 301 301 AU AU . 
NA 2 AU J 1 302 302 AU AU . 
OA 3 BOG J 1 303 501 BOG BOG . 
PA 2 AU K 1 301 301 AU AU . 
QA 2 AU K 1 302 302 AU AU . 
RA 2 AU L 1 301 301 AU AU . 
SA 2 AU L 1 302 302 AU AU . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 BOG . . . GA 3 -14.453 18.111 -50.916 1 70.31 ? C1 BOG 303 G 1 
HETATM 2 O O1 BOG . . . GA 3 -14.572 16.816 -51.325 1 70.31 ? O1 BOG 303 G 1 
HETATM 3 C C2 BOG . . . GA 3 -13.549 18.842 -51.896 1 70.31 ? C2 BOG 303 G 1 
HETATM 4 O O2 BOG . . . GA 3 -12.224 18.286 -51.829 1 70.31 ? O2 BOG 303 G 1 
HETATM 5 C C3 BOG . . . GA 3 -13.473 20.294 -51.609 1 70.31 ? C3 BOG 303 G 1 
HETATM 6 O O3 BOG . . . GA 3 -12.681 20.922 -52.65 1 70.31 ? O3 BOG 303 G 1 
HETATM 7 C C4 BOG . . . GA 3 -14.838 20.908 -51.562 1 70.31 ? C4 BOG 303 G 1 
HETATM 8 O O4 BOG . . . GA 3 -14.724 22.276 -51.162 1 70.31 ? O4 BOG 303 G 1 
HETATM 9 C C5 BOG . . . GA 3 -15.737 20.177 -50.564 1 70.31 ? C5 BOG 303 G 1 
HETATM 10 O O5 BOG . . . GA 3 -15.818 18.735 -50.851 1 70.31 ? O5 BOG 303 G 1 
HETATM 11 C C6 BOG . . . GA 3 -17.116 20.761 -50.589 1 70.31 ? C6 BOG 303 G 1 
HETATM 12 O O6 BOG . . . GA 3 -17.473 21.081 -51.903 1 70.31 ? O6 BOG 303 G 1 
HETATM 13 C C1' BOG . . . GA 3 -15.479 16.052 -50.579 1 70.31 ? C1' BOG 303 G 1 
HETATM 14 C C2' BOG . . . GA 3 -15.51 14.627 -51.14 1 70.31 ? C2' BOG 303 G 1 
HETATM 15 C C3' BOG . . . GA 3 -15.863 14.683 -52.621 1 70.31 ? C3' BOG 303 G 1 
HETATM 16 C C4' BOG . . . GA 3 -17.202 13.988 -52.834 1 70.31 ? C4' BOG 303 G 1 
HETATM 17 C C5' BOG . . . GA 3 -17.751 14.347 -54.206 1 70.31 ? C5' BOG 303 G 1 
HETATM 18 C C6' BOG . . . GA 3 -19.117 14.995 -54.042 1 70.31 ? C6' BOG 303 G 1 
HETATM 19 C C7' BOG . . . GA 3 -19.911 14.836 -55.336 1 70.31 ? C7' BOG 303 G 1 
HETATM 20 C C8' BOG . . . GA 3 -21.345 15.313 -55.109 1 70.31 ? C8' BOG 303 G 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              46 
_model_server_stats.parse_time_ms           36 
_model_server_stats.create_model_time_ms    26 
_model_server_stats.query_time_ms           315 
_model_server_stats.encode_time_ms          3 
_model_server_stats.element_count           20 
#